单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 12321 - 12340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12321 | 2024-08-05 |
The IRG1-itaconate axis protects from cholesterol-induced inflammation and atherosclerosis
2024-Apr-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2400675121
PMID:38564634
|
研究论文 | 本研究测试了IRG1-itaconate轴在治疗人类动脉粥样硬化方面的潜力 | 本研究首次揭示了IRG1-itaconate轴在动脉粥样硬化中的免疫调节作用，并且使用4-OI进行补充能够改善淋巴结病变 | 本研究主要集中在小鼠模型和体外实验上，人类临床应用效果需要进一步验证 | 探讨IRG1-itaconate轴作为动脉粥样硬化治疗策略的有效性 | 研究对象包括人类患有动脉粥样硬化的患者及小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和CyTOF | NA | 血液样本 | 本研究使用了心血管疾病患者的外周血单核细胞样本 |
| 12322 | 2024-08-04 |
Alveolar macrophage-expressed Plet1 is a driver of lung epithelial repair after viral pneumonia
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44421-6
PMID:38167746
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研究论文 | 本研究探讨了Plet1在病毒性肺炎后对肺上皮修复的作用 | 首次揭示了Plet1在肺修复中的重要投射及其作为治疗潜力的作用 | 未能具体说明Plet1在其他类型的肺损伤中的效果 | 研究Plet1在肺上皮细胞增殖和修复过程中的作用 | 研究对象为经历IAV感染的骨髓衍生巨噬细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 高维单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 12323 | 2024-08-04 |
MicroRNAs: exploring their role in farm animal disease and mycotoxin challenges
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1372961
PMID:38803799
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综述 | 本综述文章总结了微小RNA（miRNA）在农场动物疾病和霉菌毒素挑战中的作用 | 该文章创新地展示了miRNA在特定农场动物疾病中的作用，强调它们作为生物标志物和减缓策略的潜力 | 目前只有少量的miRNA在农场动物中被功能性特征化，尚需更专注的研究 | 探讨miRNA在农场动物疾病及霉菌毒素中的潜在角色和应用 | 研究涉及多种农场动物疾病，包括病毒和细菌感染及霉菌中毒 | 数字病理学 | 农场动物疾病 | CRISPR-Cas9筛查、单细胞测序、综合多组学方法 | NA | 文献综述 | NA |
| 12324 | 2024-08-04 |
Single cells and TRUST4 reveal immunological features of the HFRS transcriptome
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1403335
PMID:38803345
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研究论文 | 本研究利用TRUST4工具揭示了HFRS转录组的免疫特征 | 通过单细胞RNA测序数据进行免疫细胞克隆性和多样性的深入分析，探索了免疫细胞亚群和细胞间相互作用的机制 | 现有的T细胞受体和B细胞受体库的测序技术存在成本高和局限性 | 阐明HFRS发病过程中的免疫细胞动态变化 | 来自HFRS患者的外周血样本中提取的单细胞免疫细胞 | 数字病理学 | 肾综合征出血热 | RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从HFRS患者的外周血样本中提取的11种细胞亚群 |
| 12325 | 2024-08-05 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
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研究论文 | 本研究揭示了难治性无抗体型重症肌无力的免疫病理，强调了以B细胞为中心的免疫失调和可溶性CD22水平降低 | 首次使用单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析研究无抗体型重症肌无力的病理机制 | 样本量较小，仅涉及30名患者，可能影响结果的普遍性 | 阐明难治性无抗体型重症肌无力的病理机制 | 对30名女性患者（健康对照、早发AChR阳性MG和难治性早发无抗体型MG患者）的外周血样本进行分析 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序，血浆蛋白组分析 | NA | 血液样本 | 30名女性患者，包括10名健康对照，10名早发AChR阳性MG患者，10名难治性早发无抗体型MG患者 |
| 12326 | 2024-08-05 |
Novel insights into the ontogeny of basophils
2024, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2024.1402841
PMID:38803659
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综述 | 本文总结了小鼠和人类嗜碱性粒细胞的发育新发现 | 提出了嗜碱性粒细胞分化与红细胞/巨核细胞相关的观点，并发现了小鼠骨髓中新型嗜碱性粒细胞祖细胞 | 主要集中在小鼠模型和scRNA-seq技术，限制了对其他物种或技术的广泛应用 | 探讨嗜碱性粒细胞的发育过程及其相关机制 | 嗜碱性粒细胞及其祖细胞 | 数字病理学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 12327 | 2024-08-05 |
Benchmarking single-cell hashtag oligo demultiplexing methods
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad086
PMID:37829177
|
研究论文 | 本研究对七种HTO去复用工具的性能进行了评估 | 首次比较了七种HTO去复用工具的性能，并引入了对比基于遗传变异的数据 | 部分方法在较低质量数据下表现不佳 | 评估多种HTO去复用工具在单细胞RNA测序中的性能 | 七种HTO去复用工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 七种工具，在多个样本中使用遗传变异进行比较 |
| 12328 | 2024-08-05 |
Spatial Single Cell Analysis of Proteins in 2D Human Gastruloids Using Iterative Immunofluorescence
2023-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.915
PMID:37882990
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研究论文 | 本文描述了一种迭代免疫荧光协议和计算管道，用于在2D人类胚层模型中分析蛋白质的空间模式形成 | 提出的迭代免疫荧光协议实现了比标准免疫荧光技术更高的多重测量能力，并能够同时分析27种蛋白质 | 未详细讨论方法在实际生物样本中的应用限制 | 揭示细胞信号如何在时间和空间上共同指示细胞命运 | 主要研究2D人类胚层的细胞及其在不同信号通路下的蛋白质表达 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光 | NA | 图像 | 超过27种蛋白质的单细胞表达聚类分析 |
| 12329 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.008
PMID:36921674
|
研究论文 | 本研究揭示了胃信号环细胞癌（GSRCC）肿瘤免疫微环境的特征及其临床意义 | 提供了GSRCC肿瘤免疫微环境特征的全面分子图谱，并指出CXCL13在适应性免疫无反应中的中介作用 | 样本量有限，仅包含32名晚期GC患者，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨胃信号环细胞癌的肿瘤免疫微环境特征及其对临床结果的影响 | 纳入32名不同亚型的晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 针对抗体面板的质量细胞计数 | NA | RNA, 蛋白质 | 32名晚期胃癌患者 |
| 12330 | 2024-08-05 |
Functional characterization of age-dependent p16 epimutation reveals biological drivers and therapeutic targets for colorectal cancer
2023-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02689-y
PMID:37143122
|
研究论文 | 本文探讨了与年龄相关的p16表观突变在结直肠癌中的角色及其潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了年龄依赖的p16表观突变在肠道肿瘤发生中的生物驱动因素和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性需要进一步验证 | 改善结直肠癌患者的临床治疗 | 对携带Apc突变和p16表观突变的小鼠进行肿瘤发展与进展的研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肿瘤和结肠上皮细胞样本 |
| 12331 | 2024-08-04 |
Computational modeling for deciphering tissue microenvironment heterogeneity from spatially resolved transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.028
PMID:38800634
|
研究论文 | 本文探讨了如何通过空间转录组学技术解读组织微环境的异质性 | 将空间转录组学数据分析的方法分类为机器学习方法、概率模型方法和深度学习方法，并讨论每种方法的优缺点 | 未涉及具体的实验验证或应用案例 | 开发计算方法以揭示组织微环境的异质性 | 空间转录组学数据，特别是细胞类型分布和空间功能区域的识别 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 机器学习模型, 概率模型, 深度学习模型 | 组学数据 | NA |
| 12332 | 2024-08-05 |
Novel insights into the protective effects of leonurine against acute kidney injury: Inhibition of ER stress-associated ferroptosis via regulating ATF4/CHOP/ACSL4 pathway
2024-May-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2024.111016
PMID:38670420
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研究论文 | 本研究探讨了药用成分leonurine在急性肾损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示了leonurine通过调节ATF4/CHOP/ASCL4信号通路抑制与内质网应激关联的铁死亡 | 未提及该研究的具体局限性 | 研究leonurine对急性肾损伤的益处及其作用机制 | 急性肾损伤模型中的leonurine的治疗效果 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | NA | NA | 组织学数据，单细胞RNA测序数据 | NA |
| 12333 | 2024-08-05 |
Benchmarking mapping algorithms for cell-type annotating in mouse brain by integrating single-nucleus RNA-seq and Stereo-seq data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae250
PMID:38796691
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研究论文 | 本文评估了九种映射算法在小鼠大脑空间转录组数据的细胞类型注释中的应用 | 提出了一种评估映射算法适用性的工作流，能够提高空间数据注释的效率和准确性 | 关于这些算法在Stereo-seq ST数据上的准确性评估仍未解决 | 阐明小鼠大脑区域中空间转录组数据的细胞类型注释问题 | 使用不同分辨率的10个ST数据集和24个伪ST数据集进行算法比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间转录组数据 | 10个ST数据集和24个伪ST数据集 |
| 12334 | 2024-08-04 |
A Galectin-9-Driven CD11chigh Decidual Macrophage Subset Suppresses Uterine Vascular Remodeling in Preeclampsia
2024-May-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了CD11chigh胎盘巨噬细胞亚群在先兆子痫的形成中抑制子宫血管重塑的作用 | 发现了一个独特的CD11chigh dMφ亚群，其通过抑制子宫螺旋动脉重塑发挥作用，并阐明了其与胎盘来源的galectin-9的关系 | 临床实验证据需要进一步验证以确认galectin-9作为预测先兆子痫的生物标志物的有效性 | 探讨CD11chigh dMφ在先兆子痫中的作用及其潜在机制 | 研究对象包括孕妇和小鼠模型，以及相关的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠和一种新的先兆子痫小鼠模型 | 生物样本 | 多个独立的先兆子痫小鼠模型以及一项回顾性先兆子痫队列研究 |
| 12335 | 2024-08-04 |
LINC00330/CCL2 axis-mediated ESCC TAM reprogramming affects tumor progression
2024-May-20, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-024-00592-8
PMID:38769475
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研究论文 | 本研究探讨了LINC00330/CCL2轴介导的肿瘤相关巨噬细胞（TAM）重编程在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 揭示了LINC00330通过破坏CCL2/CCR2轴和其下游信号通路来抑制ESCC进展的新机制 | 在研究中未提及样本容量和具体的实验设计限制 | 研究LINC00330在ESCC进展中对TAM重编程的影响 | 食管鳞状细胞癌相关的长期非编码RNA和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 转录组测序 | NA | 临床样本和单细胞测序数据 | NA |
| 12336 | 2024-08-05 |
Serglycin secreted by late-stage nucleus pulposus cells is a biomarker of intervertebral disc degeneration
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44313-9
PMID:38167807
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研究论文 | 本文探讨了晚期髓核细胞分泌的serglycin作为椎间盘退变的生物标志物 | 首次识别了晚期髓核细胞并确认了serglycin如何调节椎间盘退变的潜在机制 | 样本量较小，仅包含三名男性和四名女性 | 研究serglycin在椎间盘退变中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 晚期髓核细胞及其分泌的serglycin | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 七个（男性三名，女性四名） |
| 12337 | 2024-08-04 |
PANoptosis and Autophagy-Related Molecular Signature and Immune Landscape in Ulcerative Colitis: Integrated Analysis and Experimental Validation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S455862
PMID:38800594
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研究论文 | 本研究调查了与PANoptosis和自噬相关的溃疡性结肠炎(UC)的分子特征和免疫微环境 | 本研究首次识别并验证了与UC相关的PANoptosis和自噬的新分子特征，可能影响免疫失调和伤口愈合 | 研究中对候选基因的验证主要基于小鼠模型，缺乏大规模临床样本支持 | 探讨溃疡性结肠炎中PANoptosis和自噬相关基因的分子特征及免疫微环境 | 溃疡性结肠炎患者及小鼠模型的相关基因和免疫细胞渗透 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了UC数据集GSE206285，验证了小鼠模型中的关键候选基因表达 |
| 12338 | 2024-08-05 |
Unveiling the molecular complexity of proliferative diabetic retinopathy through scRNA-seq, AlphaFold 2, and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1382896
PMID:38800474
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、非负矩阵因式分解、机器学习和AlphaFold 2方法探索增殖性糖尿病视网膜病变的分子水平 | 创新点在于结合多种高科技手段对PDR的细胞和分子特征进行深入研究 | 本研究可能受到样本量和研究设计的限制 | 探究增殖性糖尿病视网膜病变的复杂分子病理机制 | 针对增殖性糖尿病视网膜病变患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), AlphaFold 2, 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 包含增殖性糖尿病视网膜病变患者与健康对照者的样本 |
| 12339 | 2024-08-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 本研究描述了一种针对小鼠调节性B细胞的分离协议，以进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的小鼠调节性B细胞的分离和分析方法，拓展了对调节性B细胞生物学的理解 | 研究主要集中于小鼠模型，可能在转化到人类时存在局限性 | 研究调节性B细胞在健康和疾病中的生物学特征 | 以易患狼疮的小鼠（MRL/lpr小鼠）为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12340 | 2024-08-05 |
Lysyl Oxidase Regulates Epithelial Differentiation and Barrier Integrity in Eosinophilic Esophagitis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.025
PMID:38340809
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研究论文 | 本研究探讨了赖氨酸氧化酶（LOX）在嗜酸性食管炎中的作用，尤其是在上皮细胞分化和屏障完整性方面 | 本研究首次揭示了LOX在食管上皮中的非经典角色，作为重要的信号分子参与上皮稳态调节 | 本研究主要基于体外实验，临床应用的直接证据有限 | 研究LOX在嗜酸性食管炎中的功能作用及其对上皮细胞分化和屏障完整性的影响 | 人类嗜酸性食管炎患者来源的类器官和细胞文化模型 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | 三维类器官模型 | 基因组数据 | 使用了患者来源的类器官 |