单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 12301 - 12320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12301 | 2024-08-05 |
Zebrafish neuromesodermal progenitors undergo a critical state transition in vivo
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105216
PMID:36274939
|
研究论文 | 本文评估了斑马鱼神经中胚层祖细胞在脊肠和旁轴中胚层分化前的转变状态模型 | 本研究通过构建复合基因表达图谱，展示了细胞群体异质性在关键时间点的变化，为转变状态模型提供了支持 | 研究仅集中于斑马鱼，可能无法直接推广到其他物种 | 探讨神经中胚层祖细胞的基因表达变化与分化之间的关系 | 斑马鱼神经中胚层祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了一个18ss的单细胞RNA测序数据集 |
| 12302 | 2024-08-05 |
Differential dynamics of peripheral immune responses to acute SARS-CoV-2 infection in older adults
2021-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00127-2
PMID:37118336
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研究论文 | 本研究考察了COVID-19患者外周血单核细胞的表型、转录组和功能特征，以揭示年龄、时间和疾病严重程度的特定适应性 | 提出了年龄对COVID-19免疫反应影响的新见解，特别是在老年患者中观察到的B细胞和T细胞反应的特征 | 研究未提及样本的地理和种族多样性以及潜在变量的控制 | 研究老年人群体在急性SARS-CoV-2感染中外周免疫反应的动态变化 | 年轻和老年的COVID-19患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞类型相关数据 | 年轻和老年COVID-19患者的外周血样本 |
| 12303 | 2024-08-05 |
Single-cell gene profiling and lineage tracing analyses revealed novel mechanisms of endothelial repair by progenitors
2020-Dec, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03480-4
PMID:32166394
|
研究论文 | 本研究揭示了干/祖细胞在大血管内皮修复中的新机制 | 展示了c-Kit谱系细胞在主动脉内皮更新和替代中的关键作用 | 未详细探讨细胞内在机制和其他类型祖细胞的潜在功能 | 阐明内源性血管干/祖细胞在大血管内皮修复中的角色 | 内源性c-Kit细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验和细胞样本分析 |
| 12304 | 2024-08-05 |
Helicobacter pylori infection and gastric cancer biology: tempering a double-edged sword
2019-Jul, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-019-03044-1
PMID:30783683
|
研究论文 | 本研究探讨了幽门螺杆菌感染与胃癌生物学之间的关系 | 提出幽门螺杆菌研究可作为微生物相关致癌模型的范例，并探讨其在胃癌中的复杂性 | 尚未完全阐明幽门螺杆菌感染对胃癌的机制及难以运用于更难处理的器官 | 研究幽门螺杆菌在胃癌发病机制中的作用 | 幽门螺杆菌对胃及其他器官的致癌影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | 三维类器官模型 | 分子生物学数据 | NA |
| 12305 | 2024-08-04 |
NTCdb: Single-cell transcriptome database of human inflammatory-associated diseases
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.057
PMID:38765608
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研究论文 | 提出了一个人类炎症相关疾病的单细胞转录组数据库NTCdb | 集成了来自17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞的开放数据，填补了关于免疫细胞数据的空白 | 目前数据库可能仍缺乏广泛的临床样本或特定疾病的细胞数据 | 建立一个关于炎症相关疾病的单细胞转录组数据库，以支持疾病机制的研究 | 单细胞转录组数据，特别是来自炎症相关疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 来源于17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞 |
| 12306 | 2024-08-05 |
Integration of multiomics analyses reveals unique insights into CD24-mediated immunosuppressive tumor microenvironment of breast cancer
2024-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01882-9
PMID:38622285
|
研究论文 | 本研究揭示了CD24介导的乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的独特见解 | 使用多组学分析方法深入探索了CD24与免疫细胞的相互作用及其对预后模型的影响 | 未探讨所有可能的免疫标志物，可能限制了研究的全面性 | 探讨CD24在乳腺癌中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | CD24相关基因及其与免疫细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq和MQIF | 机器学习预后模型 | 基因表达数据 | 基于 bulk RNA-seq 数据构建的风险模型包含1488个差异基因 |
| 12307 | 2024-08-04 |
IGF2BP3 promotes glutamine metabolism of endometriosis by interacting with UCA1 to enhances the mRNA stability of GLS1
2024-May-17, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00834-7
PMID:38760723
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研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP3在内膜异位症中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了IGF2BP3与UCA1相互作用并增强GLS1 mRNA稳定性对谷氨酰胺代谢的影响。 | 该研究主要在体外和小动物模型中进行，可能无法完全反映人类病理特征。 | 研究IGF2BP3对内膜异位症发生和发展的影响及其分子机制。 | 内异症相关的间质细胞及其谷氨酰胺代谢的相关过程。 | 数字病理学 | 内膜异位症 | RNA免疫沉淀、RNA拉下实验、荧光原位杂交、单细胞空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 异位内膜病变与正常内膜组织的比较分析 |
| 12308 | 2024-08-04 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-May-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
|
研究论文 | 本研究旨在识别与脓毒症相关的线粒体基因并进行分析 | 首次发现四个与脓毒症生存负相关的线粒体基因，提供了脓毒症免疫机制的新见解 | 样本量较小，仅涉及20例脓毒症和12例系统性炎症反应综合征 | 阐明脓毒症患者的线粒体基因机制并为临床治疗提供新思路 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合征患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 32个患者（20例脓毒症，12例SIRS） |
| 12309 | 2024-08-05 |
Four centrosome-related genes to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with colon cancer
2024-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i5.1908
PMID:38764831
|
研究论文 | 本研究探索了中心体相关基因在结肠癌中的作用。 | 构建了一个由四个基因组成的中心体相关预后特征，能够准确预测结肠癌患者的预后。 | 未详细说明研究的限制因素。 | 研究中心体相关基因在结肠癌中的作用及其对预后的预测能力。 | 结肠癌患者及其相关的中心体相关基因。 | 生物信息学 | 结肠癌 | 生物信息学分析 | Cox回归模型 | 基因组数据 | 726个中心体相关基因 |
| 12310 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-sequencing data reveal molecular subtypes based on lactylation-related genes and prognosis and therapeutic response in glioma
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30726
PMID:38765164
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸化在胶质瘤中的作用，建立了基于乳酸化相关基因的分子亚型和预后模型 | 首次结合单细胞和散装RNA测序数据，识别出基于乳酸化相关基因的胶质瘤分子亚型及其预后关联 | 本研究的数据主要来源于公共数据库，可能存在样本偏差及外部验证缺乏的问题 | 研究乳酸化在胶质瘤中的作用，识别分子亚型及其预后意义 | 胶质瘤患者，重点关注乳酸化相关基因的表达与生存预测 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类 | 基因表达数据 | NA |
| 12311 | 2024-08-05 |
Identifying the miRNA-gene networks contributes to exploring paravertebral muscle degeneration's underlying pathogenesis and therapy strategy
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30517
PMID:38765163
|
研究论文 | 本研究探讨了与脊椎旁肌肉退化相关的miRNA-基因网络及其潜在病理机制和治疗策略 | 通过构建miRNA-基因网络，揭示了脊椎旁肌肉退化的病理过程，提供了新的诊断和治疗方法 | 尚未详尽说明miRNA-mRNA之间具体的调控机制 | 探索脊椎旁肌肉退化的病理机制与治疗策略 | 聚焦于脊椎旁肌肉退化与低背痛的关系 | 数字病理学 | 低背痛 | RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及多个免疫细胞及76个差异表达基因和106个差异表达miRNA |
| 12312 | 2024-08-04 |
A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01687-w
PMID:38627596
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研究论文 | 本研究生成了小鼠胆汁淤积损伤和修复过程中的高分辨率时空基因表达图谱 | 结合空间增强分辨率组学测序和单细胞转录组学，揭示了胆管细胞驱动信号在损伤-修复反应中的关键作用 | 没有明确提到本研究的具体局限性 | 探索胆汁淤积损伤中细胞动态和分子机制，以期为胆道疾病的发展提供治疗途径 | 小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 空间增强分辨率组学测序，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中进行的实验，具体样本数量未给出 |
| 12313 | 2024-08-05 |
Single-cell mtDNA dynamics in tumors is driven by coregulation of nuclear and mitochondrial genomes
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01724-8
PMID:38741018
|
研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤中细胞间线粒体DNA (mtDNA) 副本数量和基因型的变化及其表型和演化后果 | 采用无扩增的单细胞全基因组测序技术，揭示了mtDNA和nuDNA之间的共同调控关系 | 研究主要集中于细胞系和患者衍生的异种移植模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究肿瘤中mtDNA副本数量的变异及其与细胞大小的关系 | 从来自永生细胞系、患者衍生异种移植和原发人类肿瘤的72,275个单细胞中进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组测序（DLP+） | NA | 基因组数据 | 72,275个单细胞 |
| 12314 | 2024-08-04 |
A transcriptomics-based RNAi screen for regulators of meiosis and early stages of oocyte development in Drosophila melanogaster
2024-04-03, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkae028
PMID:38333961
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研究论文 | 该研究通过转录组学方法识别果蝇卵巢中与减数分裂和早期卵母细胞发育相关的调控基因 | 采用转录组学分析结合已发表的单细胞RNA-seq数据，找到2743个共表达基因，其中许多与减数分裂和卵母细胞发育相关 | 研究主要集中在已知的基因上，可能忽略了其他未被充分阐明的基因的功能 | 识别早期卵母细胞发育和减数分裂中涉及的基因 | 以果蝇卵巢为对象，分析早期发育过程中的基因表达与功能 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 分析了3个已发表的单细胞RNA-seq数据集，共测试了526条RNAi线路 |
| 12315 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-Apr, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31175
PMID:38214142
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研究论文 | 本研究对人类颈动脉体瘤的单细胞转录组进行分析，揭示了肿瘤微环境的异质性和高血管生成特征 | 首次对颈动脉体瘤的单细胞转录组进行全面特征描述，提供了形成机制的新见解 | 尚未提及研究的具体限制 | 解析颈动脉体瘤的微环境组成及分子复杂性 | 人类颈动脉体瘤的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12316 | 2024-08-05 |
State transition and intercellular communication of synovial fibroblasts in response to chronic and acute shoulder injuries unveiled by single-cell transcriptomic analyses
2024-01, Connective tissue research
IF:2.8Q1
DOI:10.1080/03008207.2023.2295322
PMID:38090785
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研究论文 | 本研究揭示了滑膜成纤维细胞在慢性与急性肩部损伤反应中的状态转变和细胞间通讯的异质性 | 首次利用单细胞转录组学分析揭示了肩部滑膜成纤维细胞的异质性及其细胞状态转变的潜力 | 研究未明确提及样本的具体来源及数量限制 | 探讨滑膜成纤维细胞的异质性及其在细胞状态转变中的潜力 | 滑膜成纤维细胞及其在肩部慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折中的作用 | 数字病理学 | 肩部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折患者的样本 |
| 12317 | 2024-08-04 |
TIMP1 is an early biomarker for detection and prognosis of lung cancer
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1391
PMID:37759102
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研究论文 | 本文研究了TIMP1作为肺癌早期生物标志物的潜力 | 首次将TIMP1确定为肺癌早期生物标志物，并验证其在临床样本中的有效性 | 研究主要依赖于小鼠模型和已公开的数据，可能需要更大范围的人类临床验证 | 确定TIMP1在肺癌早期检测和预后中的作用 | KrasG12D/+; Lkb1f/f小鼠模型及肺癌患者的血浆样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学(IHC)、单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | 小鼠模型 | 血浆、肿瘤组织 | 包含小鼠模型与临床样本 |
| 12318 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2023-May-23, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00407-0
PMID:37221625
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研究论文 | 本研究使用scRNA-seq分析前列腺癌的肿瘤微环境异质性与淋巴结转移相关的免疫抑制状态 | 本研究揭示了MYC途径在前列腺癌进展和肿瘤微环境免疫抑制中的作用 | 样本数量较少，可能影响研究结果的普遍性 | 探索前列腺癌淋巴结转移的机制 | 前列腺癌组织样本中的细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 32,766个细胞来自四个前列腺癌组织样本 |
| 12319 | 2024-08-04 |
Spatial mapping of the total transcriptome by in situ polyadenylation
2023-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01517-6
PMID:36329320
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研究论文 | 本文展示了一种酶促原位多腺苷酸化RNA的方法，以便检测全范围的RNA。 | 文章首次扩展了基于测序的空间转录组学，能够捕获所有类型的RNA，包括编码RNA、非编码RNA和病毒RNA。 | NA | 研究空间转录组学方法，以捕捉全转录组信息。 | 本文应用空间总RNA测序方法研究骨骼肌再生和病毒诱导的心肌炎。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 12320 | 2024-08-05 |
Immature natural killer cells promote progression of triple-negative breast cancer
2023-03-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl4414
PMID:36888695
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研究论文 | 这篇文章研究了不成熟的自然杀伤细胞在三阴性乳腺癌进展中的作用 | 识别了一种仅存在于三阴性乳腺癌样本中的不成熟NK细胞亚群，且其促进肿瘤进展的机制新颖 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床转化需要进一步的验证 | 探讨自然杀伤细胞在三阴性乳腺癌中的潜在作用及机制 | 以多种三阴性乳腺癌和基底肿瘤样本为研究对象 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 多个三阴性乳腺癌和基底肿瘤样本 |