单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 12301 - 12320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12301 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals cell type-specific variation and development in HLA expression of human skin
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112070
PMID:38640716
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研究论文 | 该研究揭示了人类皮肤中HLA基因表达的细胞类型特异性变化与发育过程 | 首次全面分析了皮肤不同细胞类型中HLA基因表达的变异，特别关注了基质细胞的角色 | 研究中对免疫细胞和基质细胞的比较可能存在偏差，且样本量相对较少 | 该研究旨在揭示皮肤不同细胞类型中HLA表达的特征及其在皮肤发育中的动态变化 | 研究对象为人类皮肤中的多个细胞类型，包括正常成人皮肤、胎儿皮肤及毛囊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖成人和胎儿皮肤样本，及15、17和22孕周的胎儿皮肤 |
| 12302 | 2024-08-04 |
Large-scale deorphanization of Nematostella vectensis neuropeptide G protein-coupled receptors supports the independent expansion of bilaterian and cnidarian peptidergic systems
2024-May-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90674
PMID:38727714
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研究论文 | 本研究对海葵中的神经肽G蛋白偶联受体进行了大规模去孤儿化，揭示了腔肠动物和双侧动物神经肽系统的独立扩展 | 研究发现了31个受体被特定的神经肽激活，并揭示了腔肠动物中神经肽信号传导的独立扩展 | 没有直接的双侧动物神经肽系统的同源性支持 | 探索腔肠动物中神经肽及其受体的扩展 | 海葵中的神经肽及其G蛋白偶联受体 | NA | NA | 药理学筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 64个肽，来自33个前体 |
| 12303 | 2024-08-05 |
Aberrant cell state plasticity mediated by developmental reprogramming precedes colorectal cancer initiation
2023-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf0927
PMID:36989360
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研究论文 | 该文章探讨了细胞状态可塑性的改变如何在结直肠癌发生之前发挥作用 | 提出了通过再生活性和发育重编程介导的异常细胞状态可塑性在癌症发生前的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用需进一步验证 | 研究细胞状态可塑性在结直肠癌发生中的角色 | 基因工程和致癌物诱导的小鼠模型和患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 来自小鼠模型的前癌变病变和一个患者的样本 |
| 12304 | 2024-08-05 |
Dysregulated miRNAs modulate tumor microenvironment associated signaling networks in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad004
PMID:37007745
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研究论文 | 该文章探讨了微调miRNAs在胰腺导管腺癌(Tumor Microenvironment, TME)中的作用 | 本文创新性地重点分析了miRNAs如何影响胰腺导管腺癌微环境的信号网络，并提出了它们作为潜在的诊断和预后生物标志物的应用 | 研究主要集中于PDAC的miRNA表达，限制了对其他癌症类型的比较和理解 | 旨在深入理解miRNAs对胰腺导管腺癌微环境重塑的影响 | 主要研究来自胰腺导管腺癌患者的plasma和肿瘤组织中的miRNAs及其调控的信号通路 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, miRNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 在研究中涉及了PDAC患者的plasma和肿瘤组织样本 |
| 12305 | 2024-08-05 |
Culture shock: microglial heterogeneity, activation, and disrupted single-cell microglial networks in vitro
2022-03-28, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00531-1
PMID:35346293
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在离体培养条件下的异质性和激活情况 | 揭示了培养的微胶质细胞在转录上表现出显著的异质性，并且在激活的表型与其正常状态之间转变的关键驱动因素 | 离体培养的微胶质细胞不能完全代表体内的微胶质细胞特性 | 研究离体培养的微胶质细胞是否能够再现体内微胶质细胞的特征 | 基于单细胞RNA测序比较从大脑新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | CAUSAL PREDICTIVE NETWORK MODELS | 基因表达数据 | 比较了新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物的样本 |
| 12306 | 2024-08-05 |
Lysosomal exocytosis of HSP70 stimulates monocytic BMP6 expression in Sjögren's syndrome
2022-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152780
PMID:35113815
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研究论文 | 本研究揭示了HSP70的溶酶体外排对干燥综合症中的BMP6表达的刺激作用 | 首次确认HSP70作为TLR4的内源性配体，揭示了LAMP3/HSP70/BMP6在干燥综合症中的作用机制 | 研究主要依赖于细胞实验和小鼠模型，缺乏大规模临床验证 | 探讨干燥综合症中BMP6的产生机制及其调控因子 | 主要研究SS患者的唾液腺以及与之相关的细胞机制 | 数字病理学 | 干燥综合症 | RNA测序, 反转录PCR | NA | RNA | 使用SS患者的唾液腺样本及小鼠实验 |
| 12307 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals expression profiles of Trypanosoma brucei sexual stages
2022-03, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010346
PMID:35255094
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研究论文 | 本研究揭示了植物瘤虫Trypanosoma brucei性阶段的表达谱。 | 使用单细胞RNA测序技术分析了感染了茧蝇的三种不同组织中的植物瘤虫，通过电子基因表达来识别组织特异性细胞类型 | 需要进一步实验以确定未知功能的蛋白质是否在配子形成和/或融合中起到作用 | 本研究旨在探索植物瘤虫的性生殖分子特征及其进化 | 研究对象为388个来自感染茧蝇的不同组织的单个植物瘤虫 | 生物信息学 | 非洲锥虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 388个植物瘤虫样本 |
| 12308 | 2024-08-05 |
Endothelial Reprogramming by Disturbed Flow Revealed by Single-Cell RNA and Chromatin Accessibility Study
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108491
PMID:33326796
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研究论文 | 这篇文章研究了受扰流对内皮细胞的重编程影响 | 该研究揭示了扰流如何导致内皮细胞从抗动脉粥样硬化表型转变为促动脉粥样硬化表型及其潜在的新型免疫细胞样表型 | NA | 深入理解扰流对内皮细胞基因表达的机制 | 来自小鼠部分颈动脉结扎模型的内皮细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 细胞数据 | 来自左侧和右侧颈动脉的内皮细胞 |
| 12309 | 2024-08-04 |
The role of FERMT2 in the tumor microenvironment and immunotherapy in pan-cancer using comprehensive single-cell and bulk sequencing
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30505
PMID:38726194
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研究论文 | 该文章探讨了FERMT2在肿瘤微环境及免疫治疗中的作用 | 该研究结合单细胞和大规模测序技术，首次全面分析了FERMT2在不同癌症类型中的免疫特征和预后意义 | 研究的具体方法和样本数量在摘要中未提及，可能影响结果的普适性 | 本研究旨在评估FERMT2在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 研究对象为在肿瘤微环境中表达FERMT2的不同癌症类型的细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序、复合免疫荧光染色 | NA | 组织切片数据 | NA |
| 12310 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis for the prognostic and immunological role of CD47: interact with TNFRSF9 inducing CD8 + T cell exhaustion
2024-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00951-z
PMID:38720108
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研究论文 | 本研究探讨了CD47在癌症免疫治疗中的作用及其与CD8+ T细胞耗竭的关系 | 揭示了CD47影响多种癌症类型中CD8+ T细胞耗竭的机制，并提出将CD47和TNFRSF9作为免疫治疗的新靶点 | 未详细讨论CD47在不同癌症微环境中的具体作用机制 | 阐明CD47在癌症免疫微环境中的预后和免疫学相关性 | 本研究对象包括多种癌症类型的患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的患者队列 |
| 12311 | 2024-08-05 |
Transcriptomic imputation of genetic risk variants uncovers novel whole-blood biomarkers of Parkinson's disease
2024-May-08, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00698-y
PMID:38719867
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研究论文 | 本研究探讨了基因表达特征作为帕金森病生物标志物的潜力 | 发现PATL2基因作为临床和前驱性帕金森病的潜在生物标志物 | 未在不同人群中验证结果的广泛性 | 通过转录组插补发现新的全血生物标志物用于帕金森病 | 转录组插补生成的全血基因表达签名 | 数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序 | 随机森林分类器 | 基因表达数据 | 1176个帕金森病患者、254个前驱症状患者和860个健康对照 |
| 12312 | 2024-08-05 |
Molecular Basis of Neuronal and Microglial States in the Aging Brain and Impact on Cerebral Blood Vessels
2024-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084443
PMID:38674028
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综述 | 本文介绍了神经元和胶质细胞在衰老过程中的变化及其对大脑微环境的影响 | 探讨了单细胞RNA测序和蛋白质组学等技术在研究大脑衰老过程中动态变化的应用 | 未明确指出具体的研究限制 | 理解大脑衰老过程中神经元和胶质细胞的状态变化 | 研究大脑衰老中神经元、胶质细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12313 | 2024-08-04 |
Integrating bulk and single-cell sequencing data to construct a Scissor+ dendritic cells prognostic model for predicting prognosis and immune responses in ESCC
2024-Apr-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03683-9
PMID:38619620
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研究论文 | 该文章主要构建了一种Scissor+树突状细胞预后模型，以预测食管鳞状细胞癌患者的预后和免疫反应 | 文章首次结合大规模与单细胞测序数据，提供了树突状细胞在食管鳞状细胞癌中的重要性及其子群体的分层 | 文章中未明确提及模型在其他类型癌症中的适用性和泛化能力 | 研究旨在揭示食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其与预后的关系 | 研究对象为60名食管鳞状细胞癌患者的单细胞数据和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 未适用 | 细胞数据 | 包含60名患者的192,078个单细胞数据 |
| 12314 | 2024-08-05 |
Cell-type-specific and disease-associated expression quantitative trait loci in the human lung
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01702-0
PMID:38548990
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研究论文 | 研究人类肺部特定细胞类型和疾病相关的表达数量性状位点 | 首次在38种细胞类型中绘制了表达数量性状位点(eQTL)，揭示了细胞特异性调控效应 | 研究仅涉及肺纤维化患者和未受影响供体，可能限制了结果的普遍性 | 阐明遗传变异如何影响组织特定基因表达与疾病的机制 | 对66名肺纤维化患者和48名未受影响供体的肺组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66名肺纤维化患者和48名未受影响供体 |
| 12315 | 2024-08-05 |
Neutrophil extracellular traps promoting fibroblast activation and aggravating limb ischemia through Wnt5a pathway
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/SQOC7984
PMID:38726275
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肢体缺血病理进展中的作用 | 首次揭示了NETs通过Wnt5a通路在肢体缺血中促进成纤维细胞激活的机制 | 尚未在人类样本中验证结果的临床相关性 | 研究NETs在肢体缺血中的功能及其与成纤维细胞的相互作用 | 主要研究对象为缺血小鼠模型中的成纤维细胞和光滑肌细胞 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞RNA测序，免疫组化，西方印迹 | NA | 组织样本 | 9个不同细胞簇 |
| 12316 | 2024-08-05 |
Cancer cell-derived extracellular vesicles drive pre-metastatic niche formation of lymph node via IFNGR1/JAK1/STAT1-activated-PD-L1 expression on FRCs in head and neck cancer
2023-10, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究评估了癌细胞来源的细胞外囊泡（CEVs）调节的成纤维网状细胞（FRCs）在淋巴结（LN）前转移生态位形成中的作用 | 发现癌细胞来源的细胞外囊泡通过IFNGR1/JAK1/STAT1通路促进FRCs上PD-L1的表达，进而导致CD8+ T细胞耗竭 | 本研究仅基于有限的样本数量，需进一步验证 | 评估癌细胞来源的细胞外囊泡在前转移生态位形成中的角色 | 来自20例癌症患者的60个新鲜颈部淋巴结中的FRCs | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、质谱分析、蛋白质印迹法 | NA | 细胞、蛋白质 | 60个颈部淋巴结样本来自20位患者 |
| 12317 | 2024-08-04 |
Enrichment of carcinogen-driven "mitochondria-primed" human skin stem cells and their identification using single-cell analyses
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102545
PMID:37690024
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研究论文 | 该文描述了富集和鉴定“线粒体启动”的人类皮肤干细胞的协议 | 创新点在于提出了通过环境致癌物富集和表征线粒体启动的干细胞的新方法 | 该研究未提及样本规模和是否可推广应用于其他类型的干细胞 | 研究旨在富集和鉴定皮肤干细胞中的线粒体启动特性 | 研究对象为环境致癌物影响下的人类皮肤干细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学和单细胞显微镜分析 | NA | NA | 涉及环境致癌物2,3,7,8-四氯二苯并对二恶英的实验样本 |
| 12318 | 2024-08-05 |
Lymphoid tissues contribute to viral clonotypes present in plasma at early post-ATI in SIV-infected rhesus macaques
2023-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542512
PMID:37398418
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗干预后早期对血浆中病毒克隆型的贡献 | 通过使用条形码SIVmac239M感染狒狒，监测病毒条形码克隆型的动态，这为减小复发病毒储存库提供了新见解 | 样本量有限，仅涉及七只狒狒，并且在某些情况下血浆病毒RNA仍然低于检测阈值 | 探究抗逆转录病毒治疗干预后，病毒群体的细胞和组织来源以及动态变化 | 感染了SIV的狒狒，具体分析了其血液和多种淋巴及非淋巴组织样本 | 数字病理学 | NA | 条形码测序、完整前病毒DNA检测、单细胞RNA测序、结合CODEX/RNAscope/杂交 | NA | 血液和组织样本 | 七只狒狒 |
| 12319 | 2024-08-05 |
Senolysis induced by 25-hydroxycholesterol targets CRYAB in multiple cell types
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103848
PMID:35198901
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研究论文 | 这篇文章探讨了25-羟基胆固醇诱导的衰老细胞自杀，并确定了CRYAB作为潜在的靶标 | 首次识别出CRYAB作为一个重要的衰老诱导基因，并发现25-羟基胆固醇是一个有效的衰老细胞自杀药物 | 尚未在临床试验中验证25-羟基胆固醇的疗效和安全性 | 探索靶向衰老细胞的药物，寻找能够消除衰老细胞的新方法 | 以小鼠和人类细胞为研究对象，探讨25-羟基胆固醇的作用 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠和人类细胞群体 |
| 12320 | 2024-08-05 |
Development of human alveolar epithelial cell models to study distal lung biology and disease
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103780
PMID:35169685
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研究论文 | 本文开发了人类肺泡上皮细胞模型以研究远端肺生物学和疾病 | 本文创新性地使用去标识的肾移植人肺建立肺泡上皮细胞系，并展示了2D和3D培养对细胞特性的影响 | 研究中未具体提及样本的多样性和长期培育的潜在影响 | 研究肺泡上皮细胞模型以更好地模拟和研究远端肺的疾病 | 建立和分析人类肺泡上皮细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养 | 使用了去标识的人类肾移植肺样本 |