单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 12301 - 12320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12301 | 2024-08-05 |
Investigation of cellular communication and signaling pathways in tumor microenvironment for high TP53-expressing osteosarcoma cells through single-cell RNA sequencing
2024-Mar-25, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02318-4
PMID:38526643
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨高TP53表达骨肉瘤细胞在肿瘤微环境中的细胞间通信和信号通路 | 探究了高TP53表达骨肉瘤细胞与肿瘤微环境内相邻细胞类型之间的细胞间动态，识别了重要的信号通路 | 对细胞间通信网络的理解仍需更深入的研究 | 阐明骨肉瘤TME内细胞间通信网络的复杂性 | 高TP53表达骨肉瘤细胞及其周围的巨噬细胞、单核细胞、内皮细胞和PVLs | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 12302 | 2024-08-04 |
Resolving cellular dynamics using single-cell temporal transcriptomics
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103060
PMID:38194753
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综述 | 本文讨论了通过单细胞时间转录组学解决细胞动态的方法 | 介绍了非破坏性活细胞转录组学方法，并探讨了其与计算模型的互补性质 | 未具体提及研究的限制 | 加深对细胞动态及其在发育过程和疾病进展中作用的理解 | 单细胞转录组学及其在细胞状态动态重建中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 转录组数据 | NA |
| 12303 | 2024-08-05 |
Computing Minimal Boolean Models of Gene Regulatory Networks
2024-02, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0122
PMID:37889991
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研究论文 | 文章提出了一种算法，用于优化基因调控网络的数据拟合和噪声消除。 | 提出了一种新的方法，将实验数据整合并通过优化线性目标函数在约束下寻找最佳一致结构。 | 对于基因调控的复杂性和实验技术的局限性，所需的逻辑规则未经预先确认。 | 开发一种算法，以最佳方式找到适合数据的基因调控网络。 | 对基因调控网络模型的构建与优化进行研究。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | 布尔网络 | 模拟数据和公开的scRNA-Seq数据集 | NA |
| 12304 | 2024-08-05 |
Development and verification of a manganese metabolism- and immune-related genes signature for prediction of prognosis and immune landscape in gastric cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1377472
PMID:38807601
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种与锰代谢和免疫相关的基因标志，以预测胃癌的预后和免疫环境 | 首次利用锰代谢和免疫相关基因来识别胃癌的预后相关基因 | 未提及此研究的具体局限性 | 研究旨在预测胃癌患者的临床结果并指导未来的免疫治疗干预 | 胃癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，基因表达组数据库分析 | 未提供 | 转录组信息，临床数据 | 未提供具体样本数量 |
| 12305 | 2024-08-05 |
Quantitative Modeling of Stemness in Single-Cell RNA Sequencing Data: A Nonlinear One-Class Support Vector Machine Method
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0484
PMID:38010500
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的干性量化模型。 | 创新性地使用一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM)来定义和量化细胞的干性。 | NA | 研究单细胞的干性量化，以评估自我更新和分化的潜力。 | 主要研究对象包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM) | 数据集，包括细胞转录组数据 | 涉及多个数据集，包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞 |
| 12306 | 2024-08-05 |
Evaluation of Therapeutic Mechanism of Hedyotis Diffusa Willd (HDW)‒ Scutellaria Barbata (SB) in Clear Cell Renal Cell Carcinoma via Singlecell RNA Sequencing and Network Pharmacology
2024, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究旨在探讨Hedyotis diffusa Willd (HDW)和Scutellaria barbata (SB)在透明细胞肾癌(ccRCC)中的治疗机制 | 通过单细胞RNA测序和网络药理学识别了29个针对ccRCC的关键基因，揭示了其在诊断和预后中的良好表现 | 未提及具体的临床实验数据来进一步验证发现 | 研究HDW-SB在ccRCC中的治疗机制 | Hedyotis diffusa Willd和Scutellaria barbata的活性成分及其在ccRCC中的靶点基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用两个不同的数据集进行分析，其中GSE53757和GSE121638 |
| 12307 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-Dec-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
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研究论文 | 本文探讨了新生小鼠子宫上皮的单细胞转录组分析 | 揭示了子宫上皮成熟、谱系分叉和分化的轨迹分析，并识别了新的腺体上皮表达基因 | 所研究的模型仅限于新生小鼠，可能无法完全代表其他生物或成年状态 | 阐明子宫上皮发育过程中的细胞和分子机制 | 新生小鼠的子宫上皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组学 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 子宫上皮细胞样本 |
| 12308 | 2024-08-04 |
Re-convolving the compositional landscape of primary and recurrent glioblastoma reveals prognostic and targetable tissue states
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38186-1
PMID:37142563
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研究论文 | 本文研究了原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞组成和转录状态 | 通过研究特定亚群体之间的共居模式识别了三种组成性组织状态，并提出了针对GBM微环境相互依赖性的治疗方案 | 未说明样本数量和研究范围的具体限制 | 本研究旨在确定原发性和复发性胶质母细胞瘤的细胞组成及其转录状态 | 研究对象为原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞类型及其相互关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 12309 | 2024-08-05 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2023-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.01.530562
PMID:36993439
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研究论文 | 本研究探讨了Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化机制 | 揭示了Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用及其在肾脏内皮细胞中的表达模式 | 未详细研究Esm-1在所有成熟组织中的表达及其潜在的生物学效应 | 研究Esm-1在糖尿病肾病中的表达和功能 | 研究对象包括成年人和小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞，及20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 |
| 12310 | 2024-08-04 |
Buyang Huanwu decoction promotes angiogenesis after cerebral ischemia through modulating caveolin-1-mediated exosome MALAT1/YAP1/HIF-1α axis
2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155609
PMID:38677273
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研究论文 | 本文探讨了补阳还五汤通过调节腔蛋白1介导的外泌体MALAT1/YAP1/HIF-1α通路来促进脑缺血后的血管生成 | 研究首次通过单细胞测序及基因敲除小鼠系统性验证BHD在脑缺血治疗中的作用机制 | 尚未充分探索BHD在临床应用中的长期效果 | 研究补阳还五汤促进脑缺血后血管生成的机制 | 使用中膜动脉阻塞模型的小鼠对BHD的作用进行评估 | 数字病理学 | 脑缺血 | 单细胞测序 | 基因敲除小鼠 | 生物样本数据 | 多个剂量的BHD处理的小鼠组 |
| 12311 | 2024-08-05 |
Macrophage-Derived GSDMD Plays an Essential Role in Atherosclerosis and Cross Talk Between Macrophages via the Mitochondria-STING-IRF3/NF-κB Axis
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320612
PMID:38695170
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞衍生的GSDMD在动脉粥样硬化及巨噬细胞之间的相互作用中的关键作用 | 揭示了GSDMD在动脉粥样硬化进程中的新机制，并提出GSDMD作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 本研究主要使用小鼠模型，尚需在人类样本中验证其发现 | 研究巨噬细胞衍生的GSDMD如何影响动脉粥样硬化及其机制 | 使用ApoE-/-和Gsdmd-/- ApoE-/-小鼠及其骨髓移植模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 使用了ApoE-/-和Gsdmd-/- ApoE-/-小鼠的样本 |
| 12312 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the contribution of laminin γ2 -CD44 to the immune resistance in lymphocyte-infiltrated squamous lung cancer subtype
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31299
PMID:38803944
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研究论文 | 本文分析了LUSC中间质微环境的异质性及其导致免疫耐受的分子机制 | 识别了LUSC中一种淋巴细胞浸润亚型CS3，以及LAMC2和CD44的共同高表达与免疫耐受的关系 | 本研究为回顾性分析，可能受到样本选择偏差的影响 | 旨在探讨导致LUSC患者免疫耐受的特征和分子机制，以改善免疫疗法的效果 | 包含513个LUSC样本的RNA测序数据及其单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 513个LUSC样本 |
| 12313 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomic brain imaging reveals the effects of immunomodulation therapy on specific regional brain cells in a mouse dementia model
2024-May-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10434-8
PMID:38796425
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析了免疫调节治疗对小鼠痴呆模型中大脑特定区域细胞的影响 | 开发了一个适用于条形码空间转录组学的分析工作流，并提供了名为STquantool的定制分析管道 | 未提及具体的样本大小和实验限制 | 研究免疫调节治疗在阿尔茨海默病中的有效性及其对大脑细胞的影响 | 小鼠阿尔茨海默病模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 10x Genomics Visium | NA | 转录组数据 | NA |
| 12314 | 2024-08-05 |
irGSEA: the integration of single-cell rank-based gene set enrichment analysis
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae243
PMID:38801700
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研究论文 | irGSEA是一个R包，用于评估不同基因集评分方法在单细胞RNA测序数据中的结果。 | 该包整合了六种基于基因表达排名的评分方法，并使用稳健的排名聚合算法汇总结果。 | 未提及具体的限制 | 评估多种基因集评分方法在单细胞RNA测序数据的表现。 | 单细胞RNA测序数据中的基因集评分方法。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 表达矩阵 | NA |
| 12315 | 2024-08-04 |
Bi-allelic variants in chromatoid body protein TDRD6 cause spermiogenesis defects and severe oligoasthenoteratozoospermia in humans
2024-May-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109766
PMID:38341271
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研究论文 | 本研究探讨了TDRD6变异与人类不孕症之间的关联。 | 首次识别出五名中国不育男性中的双等位TDRD6变异，并揭示其在精子发生中的关键角色。 | 仅涉及五名患者，样本量较小，结果可能无法普遍适用。 | 研究TDRD6变异与人类精子发生缺陷之间的关系。 | 不孕男性及其变异的TDRD6基因。 | 数字病理学 | 生育障碍 | 全外显子测序，单细胞RNA测序，定量RT-PCR | CRISPR-Cas9系统的小鼠模型 | 基因组数据，RNA数据 | 5名不育男性 |
| 12316 | 2024-08-05 |
Malignant transformation of white sponge nevus: a case report of a novel keratin 4 mutation
2024-May-21, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-04300-y
PMID:38773401
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病例报告 | 本文报告了一例白色海绵痣的恶性转化，并识别出KRT4基因的独特突变 | 识别出一种新的KRT4基因插入突变，并提出其可能与白色海绵痣的恶性转化相关 | 仅基于单例病例的观察，缺乏更大样本的验证研究 | 探讨白色海绵痣的恶性转化及其潜在的遗传因素 | 一例70岁男性患者的白色海绵痣病例 | NA | 口腔疾病 | 外显子测序以及单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1例 |
| 12317 | 2024-08-04 |
Role of ferroptosis in neuroimmunity and neurodegeneration in multiple sclerosis revealed by multi-omics data
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18396
PMID:38801304
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研究论文 | 本文探讨了铁死亡在多发性硬化症中的神经免疫和神经退行性病变中的作用 | 研究首次定义并验证了铁死亡水平的计算指标，并利用多组学数据揭示其在多发性硬化症中的双重作用 | 研究可能受到样本量和病理复杂性的限制 | 了解铁死亡在多发性硬化症中的具体作用 | 多发性硬化症患者的铁死亡水平及其与神经免疫和神经退行的关系 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | snRNA-seq, 空间转录组学, 空间蛋白组学 | NA | 基因表达数据 | 七个不同白质病变的取样区域 |
| 12318 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the intra-tumoral heterogeneity and SQSTM1/P62 and Wnt/β-catenin mediated epithelial to mesenchymal transition and stemness of triple-negative breast cancer
2024-May-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114032
PMID:38583856
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和相关信号通路的角色 | 本研究首次系统分析了SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在三阴性乳腺癌中介导上皮-间质转化及干性中的作用 | 虽然SQSTM1/P62对细胞存活并非至关重要，但其在EMT及干性标志物的分子修饰中的作用仍需进一步验证 | 探讨SQSTM1/P62和Wnt/β-catenin在三阴性乳腺癌进展中的机制 | 三阴性乳腺癌及正常患者来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因和蛋白表达数据 | 三阴性乳腺癌和正常患者来源的样本 |
| 12319 | 2024-08-04 |
Exploring the potential relationship between short sleep risks and cognitive function from the perspective of inflammatory biomarkers and cellular pathways: Insights from population-based and mice studies
2024-May, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14783
PMID:38797980
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研究论文 | 本研究探讨了短睡眠、炎症生物标志物与认知功能之间的关系。 | 本研究首次从炎症生物标志物和细胞通路的角度系统性揭示了短睡眠对认知功能的影响机制。 | 本研究的局限性在于未能探索其他因素对短睡眠与认知功能之间关系的影响。 | 研究短睡眠对人群和小鼠的认知功能影响及其分子机制。 | 针对美国人群的NHANES数据和小鼠模型进行研究。 | 生物医学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 生物标志物数据，基因表达数据 | NHANES数据（2011-2014），以及小鼠研究样本 |
| 12320 | 2024-08-05 |
FCRL3 expression is upregulated and closely correlates with TIGIT expression in regulatory T cells of patients with systemic lupus erythematosus
2024-May, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350739
PMID:38461541
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮患者调节性T细胞中FCRL3和TIGIT的表达关系 | 发现FCRL3在系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞中表达上调，并与TIGIT表达呈正相关 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 研究FCRL3和TIGIT在调节性T细胞中的共表达情况 | 系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序与流式细胞术 | NA | NA | NA |