单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 12281 - 12300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12281 | 2024-08-05 |
IL-1β inhibition partially negates the beneficial effects of diet-induced lipid lowering
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562255
PMID:37873280
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的脂质降低效果的部分抵消作用 | 研究揭示了IL-1β在饮食诱导的斑块负担减少和斑块稳定性提高中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全适用于人类 | 探讨饮食改变对动脉粥样硬化病变的影响及其机制 | 采用Apoe-/-小鼠作为研究对象，以分析饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, CyTOF, 免疫染色, 高分辨率共聚焦显微镜z堆叠分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠，18周喂养西方饮食后切换到低脂饮食 |
| 12282 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9984
PMID:37418531
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研究论文 | 该文章研究了与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 通过单细胞转录组分析，揭示了骨骼肌巨噬细胞的新型转录程序和其在肌肉病中的作用 | 未详细讨论巨噬细胞在不同类型肌病中的具体功能 | 探讨巨噬细胞在肌肉疾病发展中作用机制 | 骨骼肌中的健康和病变的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 发现六个巨噬细胞群体，涉及不同的肌肉病变样本 |
| 12283 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analyses show that long non-coding RNAs are conspicuously expressed in Schistosoma mansoni gamete and tegument progenitor cell populations
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.924877
PMID:36204320
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研究论文 | 该研究分析了Schistosoma mansoni的单细胞RNA测序数据，发现长非编码RNA在生殖细胞和外表细胞群体中显著表达 | 首次揭示了Schistosoma mansoni中长非编码RNA的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要依赖公开的数据，可能存在数据质量和完整性的问题 | 探索Schistosoma mansoni中长非编码RNA的表达模式及其潜在的治疗靶点 | Schistosoma mansoni的成人细胞类型及其长非编码RNA表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 8023个长非编码RNA |
| 12284 | 2024-08-05 |
Next-generation molecular diagnosis: single-cell sequencing from bench to bedside
2017-03, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-016-2368-x
PMID:27738745
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综述 | 本综述提供了单细胞测序在基因组医学中诊断应用的现状和前景概述 | 该文章强调了单细胞测序在新生物标志物识别和靶向治疗中的潜力，促进了基因组医学的下一步发展 | NA | 简要说明单细胞测序在早期疾病检测和诊断中的应用 | 单细胞测序在胚前基因诊断、非侵入性产前诊断和循环肿瘤细胞分析中的使用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12285 | 2024-08-05 |
NK Cell-Monocyte Cross-talk Underlies NK Cell Activation in Severe COVID-19
2024-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300731
PMID:38578283
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研究论文 | 这篇文章探讨了重症COVID-19患者外周血中的NK细胞与单核细胞之间的相互作用及其对NK细胞激活和功能障碍的影响 | 首次结合了细胞间通讯分析与体外原代细胞共培养实验，以揭示COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 仅在体外模型中进行验证，尚未在活体系统中进行全面观察 | 了解重症COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 重症COVID-19患者的NK细胞和单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 细胞数据 | 健康供体的NK细胞与来自重症COVID-19患者或健康供体的单核细胞共培养 |
| 12286 | 2024-08-04 |
Transcriptomic profiling and regulatory pathways of cardiac resident macrophages in aging
2024-May-20, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05235-x
PMID:38763956
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研究论文 | 本研究探讨了衰老对心脏常驻巨噬细胞的转录组特征及其调控通路 | 揭示了衰老过程中心脏常驻巨噬细胞亚群的功能差异，特别是 CCR2 巨噬细胞在炎症反应中的作用 | 仅使用了老鼠模型，结果可能不适用于人类 | 探究衰老对心脏常驻巨噬细胞的影响及其与心血管疾病的关系 | 老龄小鼠的心脏常驻巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | Smart-Seq | NA | 基因表达数据 | 20 个月大的老鼠 |
| 12287 | 2024-08-05 |
Decoding the complexity of delayed wound healing following Enterococcus faecalis infection
2024-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95113
PMID:38767331
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研究论文 | 本文研究了肠球菌感染后延迟伤口愈合的复杂性 | 通过单细胞RNA测序创建了感染伤口的综合单细胞图谱，揭示了感染时细胞和转录组的独特变化 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能限制了对人类伤口愈合的直接适用性 | 探讨肠球菌感染对伤口愈合过程的影响和分子机制 | 对比感染与未感染的伤口，分析超过23000个细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 超过23000个细胞 |
| 12288 | 2024-08-07 |
Correction: ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2024-May-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00517-3
PMID:38769580
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12289 | 2024-08-04 |
Single-cell approaches define two groups of mammalian oligodendrocyte precursor cells and their evolution over developmental time
2024-May-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.03.002
PMID:38579710
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序等技术，对小鼠皮层的前髓鞘细胞进行特征描绘 | 识别和描述了两组局部差异化且具有转录和表观遗传学特征的前髓鞘细胞 | 缺乏对成年前髓鞘细胞在不同环境中行为的深入研究 | 探索前髓鞘细胞在后出生生活中的发育和演变 | 小鼠皮层中的前髓鞘细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，单细胞空间转录组学 | NA | RNA，表观遗传数据 | NA |
| 12290 | 2024-08-05 |
[Dental pulp stem cells in tooth regeneration: advancement and emerging directions]
2024-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文回顾了牙髓干细胞和人类脱落乳牙干细胞在牙齿再生中的应用。 | 提出了单细胞RNA测序和器官样培养系统在精准和可控再生中的应用潜力。 | 再生效率不稳定，仍需进一步研究。 | 探讨牙齿再生领域的最新进展和临床转化应用。 | 牙髓干细胞(DPSC)和人类脱落乳牙干细胞(SHED)。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12291 | 2024-08-05 |
Blimp-1 and c-Maf regulate immune gene networks to protect against distinct pathways of pathobiont-induced colitis
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01814-z
PMID:38609547
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Blimp-1和c-Maf如何共同调控IL-10来保护免疫网络，防止由病原体引起的结肠炎。 | 揭示了Blimp-1和c-Maf在调控IL-10以及抑制促炎细胞因子中的共同作用，提供了新的见解 | 研究未深入探讨其他转录因子的影响和机制 | 研究Blimp-1和c-Maf在肠道免疫反应中的作用 | 小鼠模型，特别是双缺失Prdm1MafCd4小鼠与感染的反应 | 数字病理学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，RNA测序，ATAC测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠样本涉及不同基因缺失类型 |
| 12292 | 2024-08-05 |
Thioredoxin is a metabolic rheostat controlling regulatory B cells
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01798-w
PMID:38553615
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研究论文 | 本研究揭示了硫氧还蛋白在调节性B细胞分化和功能中的角色 | 首次揭示了硫氧还蛋白通过调节线粒体电子运输和活性氧水平影响调节性B细胞的分化与功能 | 研究主要集中于系统性红斑狼疮患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索调节性B细胞分化和功能的代谢需求 | 研究调节性B细胞的代谢过程及其在系统性红斑狼疮中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12293 | 2024-08-04 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和空间转录组学，识别慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的配体-受体相互作用 | 创建了一个整合分析框架，以更全面地分析在慢性肾病和MASH中的细胞特异性配体-受体相互作用 | 研究主要基于两个人体群体的数据，可能存在样本偏倚 | 探索慢性肾病和MASH中细胞特异性配体-受体相互作用的分子机制 | 主要研究细胞之间的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 两个可用的人体队列 |
| 12294 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome revealed dysregulated RNA-binding protein expression patterns and functions in human ankylosing spondylitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1369341
PMID:38770048
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研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎（AS）不同免疫细胞类型中 RNA 结合蛋白（RBP）的表达特征和调控模式。 | 揭示了 AS 患者不同免疫细胞中 RBP 的特定表达特点及其在病理过程中的关键作用。 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 研究 RBPs 在强直性脊柱炎发生和发展中的潜在关键作用。 | 研究对象为健康对照组（HC）和强直性脊柱炎（AS）患者的外周血单核细胞（PBMC）样本。 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | scRNA-seq 和大规模 RNA-seq | NA | RNA 数据 | HC 29 例，AS 10 例，此外还有 NC 3 例，AS 5 例 |
| 12295 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing to Identify an Immunogenic Cell Death-Related 5-Gene Prognostic Signature in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S449419
PMID:38770169
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，识别出与免疫原性细胞死亡相关的5基因预后标志在肝细胞癌中的应用 | 提出了一种新的预后模型，基于免疫原性细胞死亡相关基因的表达来评估HCC患者对免疫治疗的敏感性 | 研究可能受到样本数量和来源的限制，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨免疫原性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用及其与预后的关系 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境中的细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了肝细胞癌样本及细胞系进行验证 |
| 12296 | 2024-08-04 |
Lung tumor-infiltrating Treg have divergent transcriptional profiles and function linked to checkpoint blockade response
2023-09-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg1487
PMID:37713507
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润性调节性T细胞的转录组特征及其在免疫检查点阻断反应中的作用 | 发现了十种人类肿瘤浸润性调节性T细胞的亚群，并揭示了一种特定亚群在抑制PD-1阻断反应中的关键作用 | 研究主要集中在非小细胞肺癌，可能不适用于其他癌症类型 | 旨在理解调节性T细胞在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 主要研究对免疫检查点阻断治疗反应的非小细胞肺癌患者中的调节性T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序/ T细胞受体测序 | NA | NA | 超过73,000个肿瘤浸润性T细胞 |
| 12297 | 2024-08-04 |
Generative modeling of single-cell gene expression for dose-dependent chemical perturbations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100817
PMID:37602218
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研究论文 | 本文介绍了一种新的模型scVIDR，用于预测细胞对化学干扰的单剂量和多剂量反应 | 提出了一种基于变分自编码器的新模型，能够更好地预测剂量依赖性的基因表达变化 | 未提及具体样本的限制或本研究的潜在局限性 | 旨在改进对单细胞基因表达在化学干扰下的预测 | 研究小鼠肝细胞、人类血细胞和癌细胞系的细胞反应 | 数字病理学 | 癌症 | 变分自编码器 | VAE | 基因表达数据 | 包括小鼠肝细胞、人类血细胞和癌细胞系的样本 |
| 12298 | 2024-08-04 |
Nextflow Pipeline for Visium and H&E Data from Patient-Derived Xenograft Samples
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550727
PMID:37546876
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研究论文 | 我们开发了一个自动化数据处理流程，以量化来自患者衍生异种移植样本的鼠和人数据 | 该文章的创新点在于设计了一个基于Nextflow DSL2的流程，首次组合了空间转录组学数据和对应的H&E染色全序列图像的数据处理 | 文章未提及具体的局限性 | 本研究旨在优化对患者衍生异种移植癌症标本的空间转录组学数据和H&E图像的同时处理 | 研究对象为来自四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本的数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学和H&E染色成像 | NA | 图像和基因表达数据 | 四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本 |
| 12299 | 2024-08-05 |
Probe-based bacterial single-cell RNA sequencing predicts toxin regulation
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01348-4
PMID:37012420
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研究论文 | 本研究开发了一种基于探针的细菌单细胞RNA测序方法，以研究细菌的转录变异性 | 创新点在于开发了ProBac-seq方法，利用DNA探针库和现有的商业微流体平台进行细菌单细胞RNA测序 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细菌在单细胞水平的转录变异性和相关性 | 研究对象包括拟杆菌和大肠杆菌，以及在病原过程中应用于梭状芽孢杆菌 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次实验测序数千个个体细菌细胞 |
| 12300 | 2024-08-05 |
Preparation of Drosophila Ovarioles for Single-Cell RNA Sequencing
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2970-3_17
PMID:36715913
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研究论文 | 本文描述了为单细胞RNA测序准备果蝇卵巢的过程 | 提出了一种新的孤立和准备果蝇卵巢以进行单细胞RNA测序的协议 | 研究主要集中在建立方法上，未涉及具体的生物学发现 | 旨在提高果蝇卵巢单细胞RNA测序的准备效率 | 果蝇卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |