单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
12281	2024-08-04	A time-resolved multi-omics atlas of transcriptional regulation in response to high-altitude hypoxia across whole-body tissues 2024-May-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48261-w PMID:38730227	研究论文	本研究探讨了高海拔缺氧对整体生理调节的转录调控机制	通过生成多组学数据，揭示了不同组织对缺氧的转录响应及调控基因	研究主要基于绵羊模型，可能不完全适用于其他物种	澄清高海拔缺氧适应过程中的遗传机制	使用绵羊作为模型动物研究多组织的转录变化	数字病理学	NA	全基因组测序，RNA-Seq，ATAC-Seq，单细胞RNA-Seq	NA	基因组数据，转录组数据，表型数据	20个生物指标的表型数据
12282	2024-08-05	Single-cell transcriptomic analysis of decidual immune cell landscape in the occurrence of adverse pregnancy outcomes induced by Toxoplasma gondii infection 2024-May-10, Parasites & vectors IF:3.0Q1 DOI:10.1186/s13071-024-06266-w PMID:38730500	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析了Toxoplasma gondii感染下的母体-胎儿微环境中蜕膜免疫细胞的变化	首次揭示了在T. gondii感染后蜕膜免疫细胞中一些未知分子的变化	尚未探讨感染的具体机制和细胞间相互作用	研究T. gondii感染对母体-胎儿微环境中的蜕膜免疫细胞的影响	人类蜕膜免疫细胞	数字病理学	孕产相关疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
12283	2024-08-05	An atlas of spider development at single-cell resolution provides new insights into arthropod embryogenesis 2024-May-10, EvoDevo IF:4.1Q1 DOI:10.1186/s13227-024-00224-4 PMID:38730509	研究论文	本研究创建了一个蛛形纲动物发育单细胞解析图谱，为节肢动物胚胎发生提供新见解	首次对家蜘蛛的胚胎进行单细胞RNA测序，识别了20个细胞簇及其基因表达特征	尚未探讨所有基因的功能，可能无法全面反映细胞的所有命运	研究蜘蛛胚胎的细胞组成及其基因表达	常见家蜘蛛Parasteatoda tepidariorum的胚胎	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	18500个细胞
12284	2024-08-05	Single-cell analysis defines highly specific leukemia-induced neutrophils and links MMP8 expression to recruitment of tumor associated neutrophils during FGFR1 driven leukemogenesis 2024-May-10, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1 DOI:10.1186/s40164-024-00514-6 PMID:38730491	研究论文	该文章定义了特异性的白血病诱导中性粒细胞，并将MMP8表达与肿瘤相关中性粒细胞的招募联系起来	研究识别出基于独特基因表达谱的特定白血病响应中性粒细胞亚群，并探讨了MMP基因上调在中性粒细胞发育中的重要作用	缺乏对其他可能影响中性粒细胞表现的因素的分析	研究FGFR1驱动的白血病发病过程中免疫细胞组成的变化	小鼠模型中的白血病相关中性粒细胞	数字病理学	白血病	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	基因表达数据	NA
12285	2024-08-04	Multimodal cortical neuronal cell type classification 2024-May, Pflugers Archiv : European journal of physiology DOI:10.1007/s00424-024-02923-2 PMID:38376567	研究论文	本文总结了近年来对皮层神经元细胞类型分类的新见解	提出可靠的皮层细胞类型并进行了分类，包括兴奋性和抑制性神经元的不同亚群	尚未明确哪些转录组细胞类型会转化为真实的细胞类型	深入理解皮层神经元细胞类型及其功能	兴奋性（谷氨酸能）和抑制性（GABA能）神经元	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	NA	NA
12286	2024-08-04	YBX1 promotes stemness and cisplatin insensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma via the AKT/β-catenin axis 2024-May, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3689 PMID:38676365	研究论文	本研究探讨了YBX1在肝内胆管癌中的角色及其对干性和顺铂耐药性的影响	该研究揭示了YBX1通过调节AKT/β-β-catenin通路促进肝内胆管癌的干性和顺铂耐受性，为改善肝内胆管癌预后提供了新的潜在治疗靶点	未提及该研究的具体限制	研究YBX1在肝内胆管癌中的作用及其机制	肝内胆管癌细胞和临床样本	数字病理学	肝内胆管癌	RNA-seq，肿瘤球和克隆形成实验	NA	临床样本，转录组数据	三个RNA-seq数据集和多个临床样本
12287	2024-08-05	Integrated analysis of single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization identifies lactate dehydrogenase B as a target of melatonin in ischemic stroke 2024-05, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14741 PMID:38702940	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析确定乳酸脱氢酶B作为缺血性中风的靶标	研究首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化结合，发现LDHB在缺血性中风中的新作用	尚未在大规模样本中验证LDHB作为生物标志物的临床应用	探索不同基因表达对缺血性中风的因果作用	研究确定的2339个在10个细胞群中表达不同的基因	数字病理学	缺血性中风	单细胞RNA测序、孟德尔随机化	NA	基因表达数据	10个细胞群中的2339个基因
12288	2024-08-05	Unveiling the Dynamics behind Glioblastoma Multiforme Single-Cell Data Heterogeneity 2024-Apr-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25094894 PMID:38732140	研究论文	本研究揭示了危及生命的多形性胶质母细胞瘤的单细胞数据异质性的动态特征	提出了通过随机固定点和吸引子领域的轨迹解释单细胞RNA测序数据的异质性	未提到具体的样本数量和实际研究限制	研究胶质母细胞瘤的癌症动态及其在单细胞RNA序列数据中的表现	聚焦于胶质母细胞瘤的单细胞RNA-seq数据	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	随机模拟	RNA序列数据	NA
12289	2024-08-05	CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis 2024-Apr-29, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25094865 PMID:38732082	研究论文	该文章探讨了中枢神经系统的常驻先天免疫细胞及其在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用	文章创新性地阐述了常驻免疫细胞在多发性硬化的免疫病理中的核心作用	文章未提及具体的实验研究或数据支持	探讨常驻免疫细胞在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用	常驻先天免疫细胞及其表型	数字病理学	多发性硬化	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
12290	2024-08-05	Identifying Candidate Gene Drivers Associated with Relapse in Pediatric T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Using a Gene Co-Expression Network Approach 2024-Apr-25, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers16091667 PMID:38730619	研究论文	本研究通过基因共表达网络分析识别与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的候选驱动基因。	该研究提出了新的潜在复发相关基因，并生成了三种模型基因签名，以识别复发患者。	研究中仅使用了三个配对样本，样本数量较小可能影响结果的泛化性。	寻找与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的治疗靶点和标志物。	重点研究与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的基因。	数字病理学	儿科T细胞急性淋巴细胞白血病	单细胞RNA测序	稀疏部分最小二乘判别分析	转录组数据	3个配对样本
12291	2024-08-05	Modification of Seurat v4 for the Development of a Phase Assignment Tool Able to Distinguish between G2 and Mitotic Cells 2024-Apr-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25094589 PMID:38731808	研究论文	本文探讨了改进Seurat v4以开发能够区分G2和有丝分裂细胞的阶段分配工具	该研究实现了对G2和M相细胞的区分，有效填补了现有工具的空白	尚未评估该工具在其他细胞类型或不同实验条件下的适用性	研究旨在开发一种方法，以便在scRNAseq数据集中精确分配细胞周期阶段	研究对象为分离的有丝分裂细胞和间期细胞	数字病理学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	使用荧光激活细胞分选分离的有丝分裂和间期细胞
12292	2024-08-05	Gli1+ Progenitors Mediate Glucocorticoid-Induced Osteoporosis In Vivo 2024-Apr-16, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25084371 PMID:38673956	研究论文	本研究探讨了Gli1+前体细胞在糖皮质激素诱导的骨质疏松中的作用	首次揭示了Gli1形态骨母细胞亚群在糖皮质激素影响下的反应性及其在骨形成中的潜在作用	研究中尚未全面识别所有糖皮质激素诱导骨质疏松的目标细胞群	研究糖皮质激素如何通过影响Gli1+前体细胞来诱导骨质疏松	研究聚焦于 Gli1+ 骨母细胞亚群及其对糖皮质激素的反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
12293	2024-08-04	Stigmasterol alleviates neuropathic pain by reducing Schwann cell-macrophage cascade in DRG by modulating IL-34/CSF1R 2024-04, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14657 PMID:38572785	研究论文	本研究探讨了甾醇在治疗神经性疼痛中的潜在治疗应用	首先揭示了甾醇通过调节IL-34/CSF1R轴减少Schwann细胞-巨噬细胞级联反应的机制	该研究主要集中在动物实验上，尚需在人类中进一步验证	研究甾醇在治疗神经性疼痛中的有效性和机制	主要针对 male Sprague-Dawley 大鼠进行实验	数字病理学	神经性疼痛	单细胞测序分析，ELISA，免疫组化，西方印迹	NA	细胞，血清	32只雄性Sprague-Dawley大鼠
12294	2024-08-05	SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma 2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht) DOI:10.1007/s13402-023-00880-z PMID:38055116	研究论文	本文研究了SUMO化抑制剂在肝细胞癌模型中激活抗肿瘤免疫的机制	发现SUMO化抑制剂可以通过重塑免疫微环境来改善肝细胞癌的免疫应答	该研究限于小鼠模型，尚需在人类肝细胞癌患者中验证有效性	探索新的小分子疗法治疗肝细胞癌	评估SUMO化抑制剂在预临床小鼠肝细胞癌模型中的应用	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质量细胞术（CyTOF）、流式细胞术和多重免疫荧光（mIF）	NA	细胞样本	使用了多种肝细胞癌小鼠模型进行研究
12295	2024-08-05	Molecular mechanism analyses of post-traumatic epilepsy and hereditary epilepsy based on 10× single-cell transcriptome sequencing technology 2024-04, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14702 PMID:38572804	研究论文	本研究基于10×单细胞转录组测序技术分析了创伤后癫痫和遗传性癫痫的分子机制	首次分析了创伤性颞叶癫痫患者不同细胞中的转录组差异	样本量较少，仅包括一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者	研究创伤后癫痫与遗传性癫痫患者在单细胞层面上的不同	一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者的海马组织	数字病理学	癫痫	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	2个样本（1名创伤后癫痫患者和1名遗传性癫痫患者）
12296	2024-08-05	Terminally differentiated cytotoxic CD4+ T cells were clonally expanded in the brain lesion of radiation-induced brain injury 2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14682 PMID:38499993	研究论文	本研究调查了放射性脑损伤中细胞毒性CD4+ T细胞的存在及其潜在作用	首次描述了放射性脑损伤病变中克隆扩增的CD4+ CTL亚群	样本规模仅限于四名RIBI患者，可能影响结果的普遍性	旨在更全面地理解放射性脑损伤中适应性免疫的作用	重点研究放射性脑损伤(RIBI)患者的细胞毒性CD4+ T细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞数据	3934个CD4+ T细胞来自四名RIBI患者
12297	2024-08-04	Neural cell diversity in the light of single-cell transcriptomics 2023 Jun-Oct, Transcription DOI:10.1080/21541264.2023.2295044 PMID:38229529	review	本文总结了单细胞转录组学如何改变我们对人脑细胞多样性的看法	探讨了单细胞转录组学对以前认为同质的细胞类型的重新审视，揭示了性别、年龄和脑部位置等因素的影响	NA	介绍单细胞转录组学对神经退行性疾病研究的潜在影响	人脑中的细胞多样性及其调控程序	NA	神经退行性疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
12298	2024-08-05	Pancreatic islet cell type-specific transcriptomic changes during pregnancy and postpartum 2023-Apr-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.106439 PMID:37020962	研究论文	研究发现孕期及产后胰岛细胞特定的转录组变化	首次通过单细胞RNA测序揭示了β细胞及其他胰岛细胞在孕期和产后特有的转录特征	研究只针对小鼠模型，结果可能不适用于人类	理解在孕期和产后胰岛细胞转录变化的驱动因素	对处于不同生理阶段的小鼠胰岛细胞进行分析	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	从处女、小鼠孕晚期及早期产后小鼠的胰岛中获取样本
12299	2024-08-05	Omega-3/Omega-6 Long-Chain Fatty Acid Imbalance in Phase I Retinopathy of Prematurity 2022-Mar-23, Nutrients IF:4.8Q1 DOI:10.3390/nu14071333 PMID:35405946	研究论文	本研究探讨了ω-3和ω-6长链多不饱和脂肪酸在早产儿童第I期视网膜病变中的作用	研究首次揭示了ω-3和ω-6长链脂肪酸在保护视网膜神经血管功能中的重要性	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理反应	探讨ω-3和ω-6长链脂肪酸对早产儿童第I期视网膜病变的影响	研究对象为糖尿病相关的早产小鼠模型	数字病理学	早产视网膜病变	单细胞转录组学	小鼠模型	生物学数据	NA
12300	2024-08-04	Exploring the molecular mechanisms and shared gene signatures between celiac disease and ulcerative colitis based on bulk RNA and single-cell sequencing: Experimental verification 2024-May-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112059 PMID:38615385	研究论文	本研究探讨了乳糜泻（CeD）和溃疡性结肠炎（UC）之间的分子机制和共享基因特征	识别了REG4作为UC和CeD的共享基因，并提出它可能是一个潜在的生物标志物和治疗靶点	对疾病病因及免疫病理机制的理解仍不完全	进一步阐明UC和CeD之间的关系	研究乳糜泻和溃疡性结肠炎的毫无例外的共享基因表达特征	数字病理学	乳糜泻与溃疡性结肠炎	单细胞RNA测序与基因表达谱分析	LASSO分析	基因表达数据	使用了两个数据库的基因表达数据集，具体样本量未详细说明