单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 12261 - 12280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12261 | 2024-08-05 |
GLI1+ Cells Contribute to Vascular Remodeling in Pulmonary Hypertension
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323736
PMID:38639105
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研究论文 | 这篇文章探讨了GLI1+细胞在肺动脉高压中对血管重塑的贡献 | 阐明了GLI1+细胞作为肺动脉高压中血管平滑肌细胞的新来源，并探索了其信号通路的潜在治疗作用 | 尚未完全阐明GLI1+细胞在动态血管重塑过程中的具体机制 | 研究GLI1+细胞在肺动脉高压中的作用及其在血管重塑中的重要性 | 主要研究GLI1+细胞在肺动脉高压小鼠模型中的表型和功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 使用了GLI1Cre-ERT2; tdTomatoflox小鼠进行实验分析 |
| 12262 | 2024-08-04 |
Analysis of synthetic cellular barcodes in the genome and transcriptome with BARtab and bartools
2024-May-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100763
PMID:38670101
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研究论文 | 本文介绍了一种用于细胞条形码分析的工具BARtab和bartools | 提出了一个综合的端到端细胞条形码分析工具包，包含多个功能以简化数据提取和分析 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞条形码在基因组和转录组中的应用 | 针对细胞条形码的网络状况进行分析，包含人群水平、单细胞和空间转录组实验 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | 多个示例样本，包括大样本、单细胞及空间转录组实验 |
| 12263 | 2024-08-04 |
Semaglutide ameliorates obesity-induced cardiac inflammation and oxidative stress mediated via reduction of neutrophil Cxcl2, S100a8, and S100a9 expression
2024-May, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04784-2
PMID:37318712
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研究论文 | 本研究探讨了塞马鲁肽在肥胖导致的心脏炎症和氧化压力中的作用。 | 揭示了塞马鲁肽通过降低中性粒细胞Cxcl2、S100a8和S100a9表达来减轻肥胖引起的心脏炎症和氧化压力的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理情况。 | 探究肥胖引起的心肌损伤机制及塞马鲁肽的心脏保护影响。 | 肥胖小鼠模型及其心脏组织和血清中的炎症和氧化压力水平。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血清和心脏组织样本 | 肥胖小鼠模型 |
| 12264 | 2024-08-04 |
Enhancing Vasculogenesis in Dental Pulp Development: DPSCs-ECs Communication via FN1-ITGA5 Signaling
2024-May, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10695-6
PMID:38418738
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研究论文 | 研究牙髓再生治疗中血管形成的调控机制 | 首次揭示DPSCs与ECs之间通过FN1-ITGA5信号通路的细胞间通讯在牙髓发育中的重要性 | 研究未涉及不同类型牙髓的长期效果及其临床应用 | 探讨人类牙髓发育中血管形成的调控机制以促进相关治疗 | 开发中和成熟牙髓中的牙髓干细胞（DPSCs）和血管内皮细胞（ECs） | 数字病理 | NA | 单细胞测序分析、免疫组化、西方印迹、实时定量PCR | NA | 基因表达数据、细胞生物学实验数据 | 使用小鼠进行动物实验，具体样本量未说明 |
| 12265 | 2024-08-04 |
The guardians of pulmonary harmony: alveolar macrophages orchestrating the symphony of lung inflammation and tissue homeostasis
2024-Apr-30, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0263-2023
PMID:38811033
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综述 | 该文章全面论述了肺泡巨噬细胞在肺部炎症和组织稳态中的重要作用 | 整合了单细胞测序、细胞和组织成像技术等多项最新研究，提供了肺泡巨噬细胞功能可塑性的综合视角 | 未提供具体的实验数据或样本分析结果 | 探讨肺泡巨噬细胞在维持肺部健康和应对疾病环境中的作用 | 主要研究肺泡巨噬细胞及其相应的信号通路和功能特点 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、细胞成像技术 | NA | NA | NA |
| 12266 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the Wnt/Ca2+ signaling pathway with inflammation, apoptosis in nucleus pulposus degeneration
2024-Apr-23, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-07368-3
PMID:38654287
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研究论文 | 本研究揭示了正常与退变的人类髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的差异表达 | 首次通过单细胞RNA测序分析发现人类退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异 | 研究主要集中在特定人群的细胞，样本的多样性和广泛性可能会影响结果的普适性 | 研究正常与退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异及其机制 | 正常与退变的人类髓核细胞 | 数字病理学 | 脊椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12267 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of Drosophila miranda testis reveals the evolution and trajectory of germline sex chromosome regulation
2024-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002605
PMID:38687805
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研究论文 | 这篇文章揭示了发育中性染色体的调控及其对性染色体结构演化的影响 | 本研究利用D. miranda的年轻性染色体，展示了以前的常染色体是如何获得特定于性染色体的调控程序 | 本研究主要集中在D. miranda的性染色体，可能不适用于其他物种 | 研究性染色体的演变及生殖系调控机制 | 使用单细胞和大规模RNA测序分析D. miranda的生殖细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12268 | 2024-08-04 |
Studying plant vascular development using single-cell approaches
2024-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102526
PMID:38479078
|
研究论文 | 研究通过单细胞方法理解植物血管发育 | 总结和反思了最近使用单细胞转录组技术研究血管细胞类型的新进展 | NA | 理解血管细胞发育中的转录调控 | 植物血管细胞及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 12269 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics analysis identifies context-specific gene regulatory gates and mechanisms
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae180
PMID:38653489
|
研究论文 | 该研究介绍了一种名为scGATE的新计算工具，用于推断特定细胞类型或状态的转录因子与基因之间的调控关系 | scGATE通过使用贝叶斯框架推断布尔规则，无需为每个布尔规则单独进行公式和可能性计算，从而显著减少了时间复杂度 | NA | 推断特定细胞类型或状态的基因调控网络 | 转录因子与基因的相互作用网络 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 使用小鼠组织和人血的合成及真实单细胞数据 |
| 12270 | 2024-08-04 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
|
研究论文 | 总结了非编码基因组在肌肉萎缩侧索硬化症（ALS）中的贡献 | 提出细胞特异性功能注释对于发现ALS相关遗传变异的重要性 | 缺乏针对大多数ALS患者的特定遗传驱动因素的理解 | 探索非编码基因组中的遗传风险变异对ALS的影响 | ALS患者的非编码基因组遗传变异 | 数字病理学 | 肌肉萎缩侧索硬化症 | 单细胞表观遗传学分析和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 12271 | 2024-08-04 |
Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17
PMID:38819570
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组技术(ST)的比较方法。 | 提出了通过比较不同基因组或转录组参考对ST实验结果影响的新见解。 | 研究中只集中于Visium平台提供的分析软件，未涵盖其他可能的ST平台。 | 分析空间转录组实验中的基因表达特征并优化分析流程。 | 研究对象包括使用ST技术的细胞群体及其基因表达数据。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 图像和基因表达数据 | 使用了不同点的多组RNA读取数据 |
| 12272 | 2024-08-04 |
Dynamic changes of immunocyte subpopulations in thermogenic activation of adipose tissues
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375138
PMID:38812501
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研究论文 | 本研究探讨了不同冷暴露期间脂肪组织内免疫细胞的动态变化 | 识别了几种新的免疫细胞亚群，这些亚群可能有助于脂肪组织在冷暴露下的产热激活 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全反映人类的情况 | 探讨冷暴露对热生成脂肪组织内免疫细胞的整体变化 | 不同冷暴露期间的热生成性脂肪组织中的免疫细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 定量实时PCR | NA | 免疫细胞数据 | 使用了两个不同类型的热生成性脂肪组织的样本 |
| 12273 | 2024-08-04 |
Dissecting Spatiotemporal Structures in Spatial Transcriptomics via Diffusion-Based Adversarial Learning
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0390
PMID:38812530
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架PearlST，用于准确推断空间转录组数据中的时空结构 | 提出了结合偏微分方程增强对抗图自编码器的新方法，显著提升从空间转录组数据中提取特征的能力 | 未知所涉及的具体技术限制和数据集限制 | 研究空间转录组数据中的时空结构推断 | 空间转录组数据及其相关生物学背景 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对抗图自编码器 | Wasserstein对抗正则化图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 |
| 12274 | 2024-08-05 |
Autoimmune CD8+ T cells in type 1 diabetes: from single-cell RNA sequencing to T-cell receptor redirection
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1377322
PMID:38800484
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评论 | 本文探讨了1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其T细胞受体的机制。 | 提出了通过调节自身反应性CD8+ T细胞来治疗或显著改善1型糖尿病的潜在策略。 | 缺乏对CD8+ T细胞的精确和稳定靶向治疗的机制探讨。 | 探讨1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其TCR的作用机制。 | 自身免疫CD8+ T细胞和T细胞受体。 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, CAR-T | NA | NA | NA |
| 12275 | 2024-08-05 |
Genetic and Functional Analyses of Cutibacterium Acnes Isolates Reveal the Association of a Linear Plasmid with Skin Inflammation
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.029
PMID:37478901
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研究论文 | 本研究分析了不同Cutibacterium acnes菌株与皮肤炎症的关系 | 发现了与皮肤炎症相关的线性质粒及其在不同菌株中的作用 | 该研究未能完全解析菌株类型与疾病之间的相关性 | 理解不同菌株如何导致皮肤炎症 | 从健康及痤疮患者的皮肤拭子中提取的C. acnes菌株 | 数字病理学 | 痤疮 | 全基因组测序 | NA | 细菌样本 | 从健康个体和痤疮患者中提取的多个菌株 |
| 12276 | 2024-08-04 |
Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06354-4
PMID:37369348
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研究论文 | 这项研究展示了人类多能干细胞被触发自我组织成三维结构，重现早期人类胚胎发育的一些关键时空事件 | 提供了一种可重复、易于处理和可扩展的实验平台以理解人类发育的基本细胞和分子机制 | 未建立胎盘细胞类型，局限于人胚胎发育的特定阶段 | 探索人类发育的基本细胞和分子机制 | 人类多能干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维自组织模型 | 细胞状态无特定类型 | NA |
| 12277 | 2024-08-05 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.09.557001
PMID:37745469
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研究论文 | 本研究探讨了神经胶质瘤中对KIF11抑制剂的耐药性 | 首次使用多重谱系追踪条形码和单细胞RNA测序分析患者来源的神经胶质瘤细胞对药物耐药性的时间过程 | 研究主要集中在患者来源细胞的体外实验，临床转化的经历尚不明确 | 研究KIF11抑制剂在神经胶质瘤中的耐药机制 | 患者来源的神经胶质瘤神经球 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 患者来源的神经胶质瘤神经球 |
| 12278 | 2024-08-05 |
Evaluating the transcriptional landscape and cell-cell communication networks in chronically irradiated parotid glands
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106660
PMID:37168562
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研究论文 | 本文探讨了长期辐射后唾液腺的转录组景观和细胞间通信网络 | 识别了特定表达的分泌细胞群体，可能是腺泡细胞前体，并展示了放射治疗后免疫参与的转录影响 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理情况 | 揭示辐射导致的慢性唾液功能低下的转录机制，以帮助识别损伤机制和开发再生疗法 | 采用了来自对照组和经过辐射的鼠类唾液腺的单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 对照组和辐射组的小鼠唾液腺样本，具体数量未说明 |
| 12279 | 2024-08-05 |
Genetic and Molecular Contributors in Eosinophilic Esophagitis
2023-05, Current allergy and asthma reports
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s11882-023-01075-0
PMID:37084008
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综述 | 本文旨在提供关于嗜酸性食管炎的遗传和分子进展的历史和最新更新 | 文章总结了最近的遗传和分子进展，强调了多种发现对理解该疾病的影响 | 没有明确提及具体的限制 | 旨在深入理解嗜酸性食管炎的遗传和分子机制 | 研究嗜酸性食管炎的遗传和分子因素 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 新一代测序技术，包括全基因组关联研究、全外显子测序和RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12280 | 2024-08-05 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Apr-28, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
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研究论文 | 本研究展示了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞以进行单细胞RNA测序的方案 | 提出了一种新的方案来有效分离人类皮肤中的免疫细胞，以克服其屏障特性带来的挑战 | 该研究未提供关于该协议在其它类型皮肤或疾病背景下的验证 | 研究旨在开发从人类皮肤中分离可用于单细胞RNA测序的免疫细胞的技术 | 本研究的对象为人类皮肤的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 皮肤活检样本 |