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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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12241 | 2024-08-04 |
YBX1 promotes stemness and cisplatin insensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma via the AKT/β-catenin axis
2024-May, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3689
PMID:38676365
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研究论文 | 本研究探讨了YBX1在肝内胆管癌中的角色及其对干性和顺铂耐药性的影响 | 该研究揭示了YBX1通过调节AKT/β-β-catenin通路促进肝内胆管癌的干性和顺铂耐受性,为改善肝内胆管癌预后提供了新的潜在治疗靶点 | 未提及该研究的具体限制 | 研究YBX1在肝内胆管癌中的作用及其机制 | 肝内胆管癌细胞和临床样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | RNA-seq,肿瘤球和克隆形成实验 | NA | 临床样本,转录组数据 | 三个RNA-seq数据集和多个临床样本 |
12242 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization identifies lactate dehydrogenase B as a target of melatonin in ischemic stroke
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14741
PMID:38702940
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析确定乳酸脱氢酶B作为缺血性中风的靶标 | 研究首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化结合,发现LDHB在缺血性中风中的新作用 | 尚未在大规模样本中验证LDHB作为生物标志物的临床应用 | 探索不同基因表达对缺血性中风的因果作用 | 研究确定的2339个在10个细胞群中表达不同的基因 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据 | 10个细胞群中的2339个基因 |
12243 | 2024-08-05 |
Unveiling the Dynamics behind Glioblastoma Multiforme Single-Cell Data Heterogeneity
2024-Apr-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094894
PMID:38732140
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研究论文 | 本研究揭示了危及生命的多形性胶质母细胞瘤的单细胞数据异质性的动态特征 | 提出了通过随机固定点和吸引子领域的轨迹解释单细胞RNA测序数据的异质性 | 未提到具体的样本数量和实际研究限制 | 研究胶质母细胞瘤的癌症动态及其在单细胞RNA序列数据中的表现 | 聚焦于胶质母细胞瘤的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 随机模拟 | RNA序列数据 | NA |
12244 | 2024-08-05 |
CNS Resident Innate Immune Cells: Guardians of CNS Homeostasis
2024-Apr-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094865
PMID:38732082
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研究论文 | 该文章探讨了中枢神经系统的常驻先天免疫细胞及其在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用 | 文章创新性地阐述了常驻免疫细胞在多发性硬化的免疫病理中的核心作用 | 文章未提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨常驻免疫细胞在中枢神经系统稳态和病理性神经炎症中的作用 | 常驻先天免疫细胞及其表型 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
12245 | 2024-08-05 |
Identifying Candidate Gene Drivers Associated with Relapse in Pediatric T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Using a Gene Co-Expression Network Approach
2024-Apr-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16091667
PMID:38730619
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析识别与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的候选驱动基因。 | 该研究提出了新的潜在复发相关基因,并生成了三种模型基因签名,以识别复发患者。 | 研究中仅使用了三个配对样本,样本数量较小可能影响结果的泛化性。 | 寻找与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的治疗靶点和标志物。 | 重点研究与儿科T细胞急性淋巴细胞白血病复发相关的基因。 | 数字病理学 | 儿科T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 稀疏部分最小二乘判别分析 | 转录组数据 | 3个配对样本 |
12246 | 2024-08-05 |
Modification of Seurat v4 for the Development of a Phase Assignment Tool Able to Distinguish between G2 and Mitotic Cells
2024-Apr-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094589
PMID:38731808
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研究论文 | 本文探讨了改进Seurat v4以开发能够区分G2和有丝分裂细胞的阶段分配工具 | 该研究实现了对G2和M相细胞的区分,有效填补了现有工具的空白 | 尚未评估该工具在其他细胞类型或不同实验条件下的适用性 | 研究旨在开发一种方法,以便在scRNAseq数据集中精确分配细胞周期阶段 | 研究对象为分离的有丝分裂细胞和间期细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用荧光激活细胞分选分离的有丝分裂和间期细胞 |
12247 | 2024-08-05 |
Gli1+ Progenitors Mediate Glucocorticoid-Induced Osteoporosis In Vivo
2024-Apr-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084371
PMID:38673956
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研究论文 | 本研究探讨了Gli1+前体细胞在糖皮质激素诱导的骨质疏松中的作用 | 首次揭示了Gli1形态骨母细胞亚群在糖皮质激素影响下的反应性及其在骨形成中的潜在作用 | 研究中尚未全面识别所有糖皮质激素诱导骨质疏松的目标细胞群 | 研究糖皮质激素如何通过影响Gli1+前体细胞来诱导骨质疏松 | 研究聚焦于 Gli1+ 骨母细胞亚群及其对糖皮质激素的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
12248 | 2024-08-04 |
Stigmasterol alleviates neuropathic pain by reducing Schwann cell-macrophage cascade in DRG by modulating IL-34/CSF1R
2024-04, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14657
PMID:38572785
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研究论文 | 本研究探讨了甾醇在治疗神经性疼痛中的潜在治疗应用 | 首先揭示了甾醇通过调节IL-34/CSF1R轴减少Schwann细胞-巨噬细胞级联反应的机制 | 该研究主要集中在动物实验上,尚需在人类中进一步验证 | 研究甾醇在治疗神经性疼痛中的有效性和机制 | 主要针对 male Sprague-Dawley 大鼠进行实验 | 数字病理学 | 神经性疼痛 | 单细胞测序分析,ELISA,免疫组化,西方印迹 | NA | 细胞,血清 | 32只雄性Sprague-Dawley大鼠 |
12249 | 2024-08-05 |
SUMOylation inhibitors activate anti-tumor immunity by reshaping the immune microenvironment in a preclinical model of hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00880-z
PMID:38055116
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研究论文 | 本文研究了SUMO化抑制剂在肝细胞癌模型中激活抗肿瘤免疫的机制 | 发现SUMO化抑制剂可以通过重塑免疫微环境来改善肝细胞癌的免疫应答 | 该研究限于小鼠模型,尚需在人类肝细胞癌患者中验证有效性 | 探索新的小分子疗法治疗肝细胞癌 | 评估SUMO化抑制剂在预临床小鼠肝细胞癌模型中的应用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质量细胞术(CyTOF)、流式细胞术和多重免疫荧光(mIF) | NA | 细胞样本 | 使用了多种肝细胞癌小鼠模型进行研究 |
12250 | 2024-08-05 |
Molecular mechanism analyses of post-traumatic epilepsy and hereditary epilepsy based on 10× single-cell transcriptome sequencing technology
2024-04, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14702
PMID:38572804
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研究论文 | 本研究基于10×单细胞转录组测序技术分析了创伤后癫痫和遗传性癫痫的分子机制 | 首次分析了创伤性颞叶癫痫患者不同细胞中的转录组差异 | 样本量较少,仅包括一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者 | 研究创伤后癫痫与遗传性癫痫患者在单细胞层面上的不同 | 一名创伤后癫痫患者和一名遗传性癫痫患者的海马组织 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2个样本(1名创伤后癫痫患者和1名遗传性癫痫患者) |
12251 | 2024-08-05 |
Terminally differentiated cytotoxic CD4+ T cells were clonally expanded in the brain lesion of radiation-induced brain injury
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14682
PMID:38499993
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研究论文 | 本研究调查了放射性脑损伤中细胞毒性CD4+ T细胞的存在及其潜在作用 | 首次描述了放射性脑损伤病变中克隆扩增的CD4+ CTL亚群 | 样本规模仅限于四名RIBI患者,可能影响结果的普遍性 | 旨在更全面地理解放射性脑损伤中适应性免疫的作用 | 重点研究放射性脑损伤(RIBI)患者的细胞毒性CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 3934个CD4+ T细胞来自四名RIBI患者 |
12252 | 2024-08-04 |
Neural cell diversity in the light of single-cell transcriptomics
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2295044
PMID:38229529
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review | 本文总结了单细胞转录组学如何改变我们对人脑细胞多样性的看法 | 探讨了单细胞转录组学对以前认为同质的细胞类型的重新审视,揭示了性别、年龄和脑部位置等因素的影响 | NA | 介绍单细胞转录组学对神经退行性疾病研究的潜在影响 | 人脑中的细胞多样性及其调控程序 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
12253 | 2024-08-05 |
Pancreatic islet cell type-specific transcriptomic changes during pregnancy and postpartum
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106439
PMID:37020962
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研究论文 | 研究发现孕期及产后胰岛细胞特定的转录组变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了β细胞及其他胰岛细胞在孕期和产后特有的转录特征 | 研究只针对小鼠模型,结果可能不适用于人类 | 理解在孕期和产后胰岛细胞转录变化的驱动因素 | 对处于不同生理阶段的小鼠胰岛细胞进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从处女、小鼠孕晚期及早期产后小鼠的胰岛中获取样本 |
12254 | 2024-08-05 |
Omega-3/Omega-6 Long-Chain Fatty Acid Imbalance in Phase I Retinopathy of Prematurity
2022-Mar-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu14071333
PMID:35405946
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研究论文 | 本研究探讨了ω-3和ω-6长链多不饱和脂肪酸在早产儿童第I期视网膜病变中的作用 | 研究首次揭示了ω-3和ω-6长链脂肪酸在保护视网膜神经血管功能中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全代表人类的生理反应 | 探讨ω-3和ω-6长链脂肪酸对早产儿童第I期视网膜病变的影响 | 研究对象为糖尿病相关的早产小鼠模型 | 数字病理学 | 早产视网膜病变 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 生物学数据 | NA |
12255 | 2024-08-04 |
Exploring the molecular mechanisms and shared gene signatures between celiac disease and ulcerative colitis based on bulk RNA and single-cell sequencing: Experimental verification
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112059
PMID:38615385
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研究论文 | 本研究探讨了乳糜泻(CeD)和溃疡性结肠炎(UC)之间的分子机制和共享基因特征 | 识别了REG4作为UC和CeD的共享基因,并提出它可能是一个潜在的生物标志物和治疗靶点 | 对疾病病因及免疫病理机制的理解仍不完全 | 进一步阐明UC和CeD之间的关系 | 研究乳糜泻和溃疡性结肠炎的毫无例外的共享基因表达特征 | 数字病理学 | 乳糜泻与溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序与基因表达谱分析 | LASSO分析 | 基因表达数据 | 使用了两个数据库的基因表达数据集,具体样本量未详细说明 |
12256 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals cell type-specific variation and development in HLA expression of human skin
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112070
PMID:38640716
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研究论文 | 该研究揭示了人类皮肤中HLA基因表达的细胞类型特异性变化与发育过程 | 首次全面分析了皮肤不同细胞类型中HLA基因表达的变异,特别关注了基质细胞的角色 | 研究中对免疫细胞和基质细胞的比较可能存在偏差,且样本量相对较少 | 该研究旨在揭示皮肤不同细胞类型中HLA表达的特征及其在皮肤发育中的动态变化 | 研究对象为人类皮肤中的多个细胞类型,包括正常成人皮肤、胎儿皮肤及毛囊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖成人和胎儿皮肤样本,及15、17和22孕周的胎儿皮肤 |
12257 | 2024-08-04 |
Large-scale deorphanization of Nematostella vectensis neuropeptide G protein-coupled receptors supports the independent expansion of bilaterian and cnidarian peptidergic systems
2024-May-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90674
PMID:38727714
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研究论文 | 本研究对海葵中的神经肽G蛋白偶联受体进行了大规模去孤儿化,揭示了腔肠动物和双侧动物神经肽系统的独立扩展 | 研究发现了31个受体被特定的神经肽激活,并揭示了腔肠动物中神经肽信号传导的独立扩展 | 没有直接的双侧动物神经肽系统的同源性支持 | 探索腔肠动物中神经肽及其受体的扩展 | 海葵中的神经肽及其G蛋白偶联受体 | NA | NA | 药理学筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 64个肽,来自33个前体 |
12258 | 2024-08-05 |
Aberrant cell state plasticity mediated by developmental reprogramming precedes colorectal cancer initiation
2023-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf0927
PMID:36989360
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研究论文 | 该文章探讨了细胞状态可塑性的改变如何在结直肠癌发生之前发挥作用 | 提出了通过再生活性和发育重编程介导的异常细胞状态可塑性在癌症发生前的作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床应用需进一步验证 | 研究细胞状态可塑性在结直肠癌发生中的角色 | 基因工程和致癌物诱导的小鼠模型和患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 来自小鼠模型的前癌变病变和一个患者的样本 |
12259 | 2024-08-05 |
Dysregulated miRNAs modulate tumor microenvironment associated signaling networks in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad004
PMID:37007745
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研究论文 | 该文章探讨了微调miRNAs在胰腺导管腺癌(Tumor Microenvironment, TME)中的作用 | 本文创新性地重点分析了miRNAs如何影响胰腺导管腺癌微环境的信号网络,并提出了它们作为潜在的诊断和预后生物标志物的应用 | 研究主要集中于PDAC的miRNA表达,限制了对其他癌症类型的比较和理解 | 旨在深入理解miRNAs对胰腺导管腺癌微环境重塑的影响 | 主要研究来自胰腺导管腺癌患者的plasma和肿瘤组织中的miRNAs及其调控的信号通路 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, miRNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 在研究中涉及了PDAC患者的plasma和肿瘤组织样本 |
12260 | 2024-08-05 |
Culture shock: microglial heterogeneity, activation, and disrupted single-cell microglial networks in vitro
2022-03-28, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00531-1
PMID:35346293
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在离体培养条件下的异质性和激活情况 | 揭示了培养的微胶质细胞在转录上表现出显著的异质性,并且在激活的表型与其正常状态之间转变的关键驱动因素 | 离体培养的微胶质细胞不能完全代表体内的微胶质细胞特性 | 研究离体培养的微胶质细胞是否能够再现体内微胶质细胞的特征 | 基于单细胞RNA测序比较从大脑新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | CAUSAL PREDICTIVE NETWORK MODELS | 基因表达数据 | 比较了新鲜分离的微胶质细胞与初级微胶质细胞培养物的样本 |