本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12181 | 2024-12-31 | Selenium promotes neural development through the regulation of GPX4 and SEPP1 in an iPSC-derived neuronal model 
          2025-May, Biomaterials
          
          IF:12.8Q1
          
         | 研究论文 | 本研究探讨了硒通过调控GPX4和SEPP1在iPSC衍生的神经元模型中对神经发育的促进作用 | 首次使用高生物利用度的硒纳米颗粒(SeNPs@LNT)在iPSC衍生的神经元模型中干预不同阶段的神经发育,并揭示了其通过激活PI3K/Akt/Nrf2信号通路调控硒蛋白的机制 | 研究主要基于体外模型,未在体内验证硒纳米颗粒的作用 | 探讨硒蛋白在不同神经元发育阶段的具体作用和机制 | iPSC衍生的神经元模型 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍(ASD) | 单细胞RNA测序 | iPSC-iNeuron模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12182 | 2024-12-31 | Tumor-derived CCL15 regulates RNA m6A methylation in cancer-associated fibroblasts to promote hepatocellular carcinoma growth 
          2024-Dec-27, Cancer letters
          
          IF:9.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.canlet.2024.217420
          PMID:39734010
         | 研究论文 | 本文揭示了CCL15在肝细胞癌(HCC)进展中的关键作用,通过调节癌症相关成纤维细胞(CAFs)中的RNA m6A甲基化促进HCC生长 | 首次发现CCL15通过STAT3通路诱导CAFs中FTO的表达,进而调控CEBPA mRNA的m6A甲基化,揭示了CCL15在HCC细胞与CAFs之间的新型调控轴 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探讨CCL15在HCC生长中的具体作用和机制 | 肝细胞癌(HCC)细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、共培养实验、类器官模型、异种移植模型、m6A测序、RNA测序 | NA | RNA测序数据、免疫荧光图像 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12183 | 2024-12-31 | Targeting UBE2T suppresses breast cancer stemness through CBX6-mediated transcriptional repression of SOX2 and NANOG 
          2024-Dec-21, Cancer letters
          
          IF:9.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.canlet.2024.217409
          PMID:39716485
         | 研究论文 | 本文揭示了UBE2T通过CBX6介导的转录抑制调控乳腺癌干细胞(BCSC)干性的机制,并提出了潜在的治疗策略 | 首次发现UBE2T通过TRIM25介导的CBX6泛素化降解调控SOX2和NANOG的转录,从而影响BCSC干性 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究UBE2T在乳腺癌干细胞干性调控中的作用及其潜在治疗策略 | 乳腺癌干细胞(BCSCs) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),干性指数分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12184 | 2024-12-31 | Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns of vulnerability to pathology in a transgenic α-synucleinopathy model 
          2024-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.07.31.606032
          PMID:39372781
         | 研究论文 | 本文利用成像空间转录组学技术,研究了转基因α-突触核蛋白病模型中分子模式对病理的脆弱性 | 首次结合成像空间转录组学和免疫荧光技术,在同一组织切片中识别出易受α-突触核蛋白磷酸化病理影响的神经元亚型,并揭示了其转录基础 | 研究仅限于转基因小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病情况 | 探讨帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白病理的分子机制 | 转基因人α-突触核蛋白过表达小鼠的皮质和海马神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 成像空间转录组学(IST)、免疫荧光 | 转基因小鼠模型 | 图像、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12185 | 2024-12-31 | Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution 
          2024-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
          
         
          DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
          PMID:39393164
         | 综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用 | 强调了单细胞RNA测序技术在揭示非模式生物对环境污染反应的分子机制中的潜力 | 主要基于已发表文献的分析,缺乏新的实验数据 | 探讨单细胞RNA测序技术在非模式生物污染暴露研究中的应用 | 非模式生物 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12186 | 2024-12-31 | Differential Response to Cisplatin between Co-cultured Cells and Pure Cultured Cells Based on Single-cell RNA Sequencing of Three-dimensional-cultured Breast Cancer Cells 
          2024-Nov-29, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
          
         
          DOI:10.31083/j.fbl2912406
          PMID:39735986
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了三维培养的乳腺癌细胞在共培养和纯培养条件下对顺铂的不同反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析三维共培养的乳腺癌细胞对顺铂的反应,揭示了共培养模型与纯培养模型在药物反应上的差异 | 研究仅针对MCF-7细胞,未涉及其他类型的乳腺癌细胞,且实验时间较短,可能无法完全反映长期药物反应 | 开发一种实验方法,用于直接共培养三维乳腺癌细胞,并研究其对顺铂的反应 | MCF-7细胞、人乳腺成纤维细胞和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 三维细胞共培养模型 | RNA测序数据 | 四组细胞培养:未处理的MCF-7细胞组、MCF-7细胞加顺铂组、未处理的共培养组、共培养加顺铂组 | NA | NA | NA | NA | 
| 12187 | 2024-12-31 | Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation 
          2024-Jul, Journal of orthopaedic translation
          
          IF:5.9Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010
          PMID:39027343
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了骨愈合过程中骨重塑的细胞和分子机制,并发现了一种新的破骨细胞亚群——骨稳态细胞(OSCs) | 首次发现并命名了骨稳态细胞(OSCs),揭示了其在骨重塑中的关键作用,特别是在骨吸收和骨形成之间的逆转阶段 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证,且对OSCs的具体功能机制仍需进一步探索 | 阐明骨髓炎后骨愈合的细胞和分子机制,特别是骨重塑过程中的逆转阶段 | 人类皮质骨、小鼠胫骨骨折模型、骨髓炎相关胫骨骨折模型 | 数字病理 | 骨髓炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、实时PCR、免疫荧光染色、基因集富集分析(GSEA)、CellChat、transwell实验、共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像 | 人类皮质骨样本、小鼠胫骨骨折模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 12188 | 2024-12-31 | Defining predictors of responsiveness to advanced therapies in Crohn's disease and ulcerative colitis: protocol for the IBD-RESPONSE and nested CD-metaRESPONSE prospective, multicentre, observational cohort study in precision medicine 
          2024-04-17, BMJ open
          
          IF:2.4Q1
          
         
          DOI:10.1136/bmjopen-2023-073639
          PMID:38631839
         | 研究论文 | 本文介绍了一项前瞻性、多中心、观察性队列研究,旨在通过多组学数据创建预测工具,以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应 | 该研究首次整合了肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据,以创建预测模型,并计划进行跨治疗比较和独立复制队列研究 | 研究的主要局限性在于其观察性设计,可能无法完全控制混杂因素,且样本量相对较小(1325名参与者) | 研究目标是识别和验证预测模型,以预测克罗恩病和溃疡性结肠炎患者对先进疗法的反应 | 研究对象为开始接受先进疗法的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 | 精准医学 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎 | 多组学数据分析 | 预测模型 | 多组学数据(肠道微生物组、代谢组、单细胞转录组、人类基因组、饮食和临床数据) | 1325名参与者 | NA | NA | NA | NA | 
| 12189 | 2024-12-30 | Mouse Tail-Skin Dissociation and Preparation of Live Single-Cell Suspension for Downstream Analysis of Melanocytes 
          2025-Jan, Pigment cell & melanoma research
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.1111/pcmr.13216
          PMID:39625901
         | 研究论文 | 本文开发了一种从小鼠尾皮中高效分离高质量活单细胞的方法,用于下游的黑色素细胞及其相互作用细胞的研究 | 开发了一种新的两阶段酶解步骤,结合碎片去除和活细胞富集,从小鼠尾皮中高效生成高活性的单细胞悬液 | 该方法主要针对小鼠尾皮,可能不适用于其他类型的皮肤组织 | 研究小鼠尾皮中黑色素细胞及其相互作用细胞的单细胞转录组分析 | 小鼠尾皮中的角质形成细胞、黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞测序 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12190 | 2024-12-30 | scRNA + BCR-seq identifies proportions and characteristics of dual BCR B cells in the peritoneal cavity of mice and peripheral blood of healthy human donors across different ages 
          2024-Dec-28, Immunity & ageing : I & A
          
          IF:5.2Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12979-024-00493-6
          PMID:39732722
         | 研究论文 | 本研究利用scRNA-seq和scBCR-seq技术,探讨了小鼠腹膜和健康志愿者外周血中双受体B细胞的存在及其与年龄的关系 | 首次揭示了老年小鼠和健康志愿者中双受体B细胞的比例和特性,并发现这些细胞在老年个体中显著增加 | 研究样本主要来自小鼠和健康志愿者,未涉及疾病状态下的双受体B细胞 | 探讨双受体B细胞在不同年龄个体中的存在及其特性 | 小鼠腹膜和健康志愿者外周血中的B细胞 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, B细胞受体测序数据 | 小鼠和不同年龄的健康志愿者 | NA | NA | NA | NA | 
| 12191 | 2024-12-30 | TIM3 on natural killer cells regulates antibody-dependent cellular cytotoxicity in HER2-positive gastric cancer 
          2024-Dec-24, Cancer letters
          
          IF:9.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.canlet.2024.217412
          PMID:39722406
         | 研究论文 | 本研究探讨了TIM3在自然杀伤细胞(NK细胞)上对HER2阳性胃癌(GC)中抗体依赖性细胞毒性(ADCC)的调节作用 | 首次揭示了TIM3在NK细胞中的表达与CD16的相关性,并提出了抗TIM3抗体与曲妥珠单抗联合治疗HER2阳性胃癌的新策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证其效果 | 研究HER2阳性胃癌中NK细胞的免疫检查点分子与曲妥珠单抗诱导的ADCC之间的关系 | HER2阳性胃癌患者和HER2转染的胃癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和免疫组织化学 | 小鼠HER2阳性胃癌模型 | 基因表达数据和免疫组化数据 | HER2阳性胃癌患者和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 12192 | 2024-12-30 | Single-cell transcriptome profiling identifies the activation of type I interferon signaling in ossified posterior longitudinal ligament 
          2024-Dec, Frontiers of medicine
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.1007/s11684-024-1075-5
          PMID:39441507
         | 研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了I型干扰素信号在OPLL患者骨化韧带中的激活,并探讨了其在骨化过程中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了I型干扰素信号在OPLL骨化过程中的激活,并验证了其在体外促进成骨分化的作用 | 研究主要基于体外实验,尚未在体内模型中验证I型干扰素信号阻断对OPLL的预防效果 | 探讨OPLL的分子机制及潜在预防干预措施 | OPLL患者的骨化韧带 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | OPLL患者的骨化韧带样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 12193 | 2024-12-30 | Immunological face of megakaryocytes 
          2024-Dec, Frontiers of medicine
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.1007/s11684-024-1087-1
          PMID:39542989
         | 综述 | 本文综述了巨核细胞(MKs)在免疫系统中的新兴角色及其在生理和病理环境中的功能 | 揭示了巨核细胞作为独特免疫细胞的多样化能力,并发现了具有免疫调节功能的‘免疫巨核细胞’亚群 | 需要进一步研究确定巨核细胞的免疫功能是由整个巨核细胞群体还是特定亚群执行 | 探讨巨核细胞在免疫系统中的功能及其在生理和病理环境中的作用 | 巨核细胞及其免疫功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12194 | 2024-12-30 | The prognostic value and immunological role of calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) in pan-cancer study 
          2024-Oct-11, Medicine
          
          IF:1.3Q2
          
         
          DOI:10.1097/MD.0000000000040072
          PMID:39465821
         | 研究论文 | 本文通过整合多组学和临床数据,全面评估了钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2(CAMKK2)在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用 | 首次在泛癌研究中全面评估CAMKK2的分子景观,并发现其在不同癌症类型中的异常表达与生存结果相关 | 研究结果基于特定癌症队列,可能无法推广到所有癌症类型 | 评估CAMKK2在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用 | 多种癌症类型中的CAMKK2基因 | 癌症研究 | 泛癌 | 多组学分析、单细胞转录组分析 | NA | 多组学数据、临床数据 | 多个癌症队列(如IMvigor210、GSE176307、GSE78220等) | NA | NA | NA | NA | 
| 12195 | 2024-12-29 | CXC chemokine receptor 4 - mediated immune modulation and tumor microenvironment heterogeneity in gastric cancer: Utilizing multi-omics approaches to identify potential therapeutic targets 
          2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
          
         
          DOI:10.1002/biof.2130
          PMID:39431668
         | 研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性 | 首次全面揭示了CXCR4在胃癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其与T细胞耗竭的关系 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内实验验证 | 探索CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性,寻找潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和SNU-1 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、ELISA、PCR、CCK8实验、细胞划痕实验、集落形成实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 两种胃癌细胞系(AGS和SNU-1) | NA | NA | NA | NA | 
| 12196 | 2024-12-29 | Construction of mitochondrial quality regulation genes-related prognostic model based on bulk-RNA-seq analysis in multiple myeloma 
          2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
          
         
          DOI:10.1002/biof.2135
          PMID:39446019
         | 研究论文 | 本文基于批量RNA测序分析,构建了与线粒体质量调控基因相关的多发性骨髓瘤预后模型 | 开发了一个与线粒体质量调控基因相关的预后模型,并利用多种生物信息学工具进行综合分析 | NA | 构建多发性骨髓瘤患者的线粒体质量调控基因相关预后模型 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、突变分析、免疫浸润分析 | RiskScore模型 | RNA测序数据、突变数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 12197 | 2024-12-29 | Navigating the immune landscape with plasma cells: A pan-cancer signature for precision immunotherapy 
          2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
          
         
          DOI:10.1002/biof.2142
          PMID:39495620
         | 研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序分析,发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig,能够显著预测患者对免疫治疗的反应 | 发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig,并通过机器学习算法验证了其在预测免疫治疗反应中的优越性 | 未提及具体的研究局限性 | 提高对肿瘤微环境中内在和外在免疫景观的理解,并为更精确的生物标志物引导的免疫治疗方法铺平道路 | 癌症患者 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 多个队列的癌症患者 | NA | NA | NA | NA | 
| 12198 | 2024-12-29 | Unveiling chemotherapy-induced immune landscape remodeling and metabolic reprogramming in lung adenocarcinoma by scRNA-sequencing 
          2024-Dec-27, eLife
          
          IF:6.4Q1
          
         
          DOI:10.7554/eLife.95988
          PMID:39729352
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了化疗对肺腺癌免疫景观和代谢重编程的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析化疗对肺腺癌免疫细胞和代谢的影响,并识别了两种巨噬细胞亚型 | 样本量较小,仅涉及9名患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨化疗和免疫治疗对肺腺癌患者的影响,特别是免疫景观和代谢重编程 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, 流式细胞术, 免疫荧光, Seahorse检测, 肿瘤异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名肺腺癌患者的83,622个细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 12199 | 2024-12-29 | Organoids as a model system for researching human neuroendocrine tumor of the breast 
          2024-Dec-27, Cancer cell international
          
          IF:5.3Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12935-024-03621-w
          PMID:39731167
         | 研究论文 | 本文首次建立了乳腺神经内分泌肿瘤(NETB)的类器官模型,并用于组织学染色、药物筛选和单细胞RNA测序 | 首次建立NETB的类器官模型,为临床研究提供了坚实的基础 | 样本量较小,仅基于一名中国女性患者的样本 | 研究乳腺神经内分泌肿瘤的发病机制和有效治疗方法 | 乳腺神经内分泌肿瘤(NETB) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 组织学染色、药物筛选、单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本、RNA测序数据 | 一名中国女性患者的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 12200 | 2024-12-29 | Long-term in vitro expansion of a human fetal pancreas stem cell that generates all three pancreatic cell lineages 
          2024-Dec-26, Cell
          
          IF:45.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cell.2024.10.044
          PMID:39626658
         | 研究论文 | 本文报道了从8-17周胎儿胰腺样本中衍生出18种人类胎儿胰腺类器官(hfPO)系,并发现其中4种能够在优化培养条件下长期扩展并生成胰腺的三种细胞谱系 | 首次报道了能够长期体外扩展并生成胰腺三种细胞谱系的人类胎儿三能干细胞/祖细胞 | 研究仅限于胎儿胰腺样本,未涉及成体胰腺或其他器官 | 研究人类胎儿胰腺干细胞的长期体外扩展及其多向分化能力 | 人类胎儿胰腺样本 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 18种人类胎儿胰腺类器官(hfPO)系 | NA | NA | NA | NA |