单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 12181 - 12200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12181 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals distinct immune cell features in cutaneous lesions of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid
2024-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110219
PMID:38631594
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了天疱疮和大疱性类天疱疮皮肤损伤中的免疫细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞VDJ测序详细分析了BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞组成和状态 | 对皮肤损伤中的免疫特征的认识仍然有限，可能需要更大的样本量和其他生物标志物的验证 | 探究BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞特征和转录谱 | 大疱性类天疱疮和天疱疮患者的皮肤病变 | 数字病理学 | 大疱性类天疱疮，天疱疮 | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ测序 | NA | 细胞转录组数据 | 涉及BP和PV患者的皮肤损伤样本 |
| 12182 | 2024-08-04 |
Cell-mediated cytotoxicity within CSF and brain parenchyma in spinal muscular atrophy unaltered by nusinersen treatment
2024-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48195-3
PMID:38750052
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研究论文 | 这篇文章探讨了在脊髓性肌萎缩症(SMA)中细胞介导的细胞毒性及首个抗体nusinersen治疗的影响 | 该研究首次通过单细胞转录组学揭示了SMA患者脑脊液中的NK细胞和CD8+ T细胞扩张以及与疾病相关的细胞毒性特征 | 样本数量较小，且未能在nusinersen治疗后观察到具体的免疫反应变化 | 本研究旨在探索脊髓性肌萎缩症中的局部免疫反应及其对nusinersen治疗的影响 | 研究对象包括SMA患者和对照组的脑脊液样本 | 自然语言处理 | 脊髓性肌萎缩症 | 单细胞转录组学，多重免疫组织化学 | NA | 脑脊液样本 | SMA: N = 9 对照组: N = 9 |
| 12183 | 2024-08-05 |
Machine-learning developed an iron, copper, and sulfur-metabolism associated signature predicts lung adenocarcinoma prognosis and therapy response
2024-May-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02839-6
PMID:38745285
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研究论文 | 本研究提出了一个与铁、铜和硫代谢相关的特征，可以预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次将铁、铜和硫代谢相关基因结合在一起，构建预后特征，填补了以往研究的空白 | 未提及其他潜在影响因素和机制的详细探讨 | 探讨铁、铜和硫代谢在肺腺癌中的作用，并开发相关预后指标 | 1564名肺腺癌患者及1249名非小细胞肺癌(NCSLC)患者 | 机器学习 | 肺癌 | 机器学习方法 | 无监督集群分析 | 基因组数据 | 1564名肺腺癌患者、1249名非小细胞肺癌患者以及超过1万名其他癌症类型患者 |
| 12184 | 2024-08-05 |
Multi-omics integration of scRNA-seq time series data predicts new intervention points for Parkinson's disease
2024-05-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61844-3
PMID:38744869
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研究论文 | 该研究通过分析时间序列的scRNA-seq数据揭示了帕金森病早期发展的新干预点 | 提出了一种基于非负矩阵三因子分解的新数据整合方法，整合不同的数据集与分子相互作用网络 | 研究主要依赖于文献支持的基因，未涵盖所有可能的PD相关基因 | 揭示帕金森病早期发展的关键基因和分子机制 | 来自患者来源的诱导多能干细胞分化获得的中脑多巴胺能神经元的时间序列scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | scRNA-seq | 非负矩阵三因子分解 | 基因表达数据 | 涉及来自患者的诱导多能干细胞分化的中脑多巴胺能神经元样本 |
| 12185 | 2024-08-04 |
Exploring the immune escape mechanisms in gastric cancer patients based on the deep AI algorithms and single-cell sequencing analysis
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18379
PMID:38752750
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研究论文 | 本研究旨在开发胃癌患者的预后模型，并探讨免疫逃逸机制 | 通过深度机器学习和单细胞测序分析，利用101种算法构建了预测模型，并识别了潜在靶向药物 | 尚未提及具体的研究限制 | 提升胃癌患者的临床管理和个性化治疗 | 胃癌患者及其免疫逃逸机制 | 计算机视觉 | 胃癌 | 单细胞测序分析 | 深度机器学习 | 基因组数据 | NA |
| 12186 | 2024-08-05 |
Single-cell atlas reveals the immunosuppressive microenvironment and Treg cells landscapes in recurrent Glioblastoma
2024-May, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00740-4
PMID:38429367
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研究论文 | 本研究揭示了复发性胶质母细胞瘤的免疫抑制性微环境及调节性T细胞的分布 | 首次在单细胞水平上分析复发性胶质母细胞瘤与脑脊液的免疫微环境，并发现S100A9作为潜在生物标志物 | 样本量较小，仅包含来自两名患者的四个临床样本 | 揭示复发性胶质母细胞瘤的免疫微环境及潜在脑脊液生物标志物 | 复发性胶质母细胞瘤与非恶性脑肿瘤患者的临床样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床样本 | 四个临床样本，来自两名患者 |
| 12187 | 2024-08-05 |
Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2
2024-Apr-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006
PMID:38518781
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研究论文 | 本文探讨了转录因子SOX17和FGF2在诱导人类多能干细胞转化为内皮前体的作用 | 发现SOX17的过表达能够显著提高CD34和血管内皮钙粘蛋白（VEC）阳性细胞的比例，从而揭示了SOX17在内皮前体分化中的新功能 | NA | 明确SOX17在内皮前体分化中的作用机制 | 人类多能干细胞及其衍生的内皮前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas13d | NA | 细胞 | 使用诱导的人类多能干细胞系进行实验 |
| 12188 | 2024-08-05 |
Immunoregulatory and neutrophil-like monocyte subsets with distinct single-cell transcriptomic signatures emerge following brain injury
2024-Feb-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03032-8
PMID:38310257
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研究论文 | 本研究揭示了脑损伤后单核细胞亚群的免疫调节特性及其单细胞转录组特征 | 首次表明创伤导致特定CD115/Ly6C单核细胞群体的释放，并与神经保护相关 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床应用需要进一步验证 | 探索脑损伤后单核细胞的免疫反应和潜在的神经保护机制 | 小鼠模型中观察到的单核细胞亚群及其转录组特征 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中观察的单核细胞数目未具体说明 |
| 12189 | 2024-08-05 |
WNT signaling in the tumor microenvironment promotes immunosuppression in murine pancreatic cancer
2023-01-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220503
PMID:36239683
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研究论文 | 研究了WNT信号传导在小鼠胰腺癌肿瘤微环境中的作用。 | 首次探讨了WNT信号传导如何调控胰腺癌的肿瘤微环境。 | WNT信号抑制由于毒性限制了治疗窗口，而PD-L1阻断在胰腺癌中无效。 | 探讨WNT信号在胰腺癌免疫微环境中的作用和潜在的治疗策略。 | 胰腺导管腺癌（PDA）和小鼠模型中的T细胞。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA数据 | 使用小鼠模型进行实验，具体样本量未说明 |
| 12190 | 2024-08-05 |
Role of Matrix Gla Protein in Transforming Growth Factor-β Signaling and Nonalcoholic Steatohepatitis in Mice
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.08.007
PMID:37611662
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研究论文 | 本文分析了基因在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中作用的关键因子，即基质Gla蛋白（MGP） | 提出MGP在肝纤维化和TGF-β信号传导中的调控作用，是NASH病理机制的新见解 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全泛化到人类疾病中 | 探讨MGP在非酒精性脂肪性肝炎发病机制中的作用 | 使用基因多样性小鼠群体分析NASH表型及其相关基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据，转录组数据，表型数据 | 使用的样本包括多种小鼠模型和人类患者的肝组织 |
| 12191 | 2024-08-05 |
Transcriptional and functional analyses of neoantigen-specific CD4 T cells during a profound response to anti-PD-L1 in metastatic Merkel cell carcinoma
2022-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005328
PMID:36252564
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研究论文 | 本研究探讨了在转移性梅克尔细胞癌中对抗PD-L1的显著反应期间，特异性针对新抗原的CD4 T细胞的转录和功能分析 | 这是首次报告梅克尔细胞癌中针对新抗原的特异性T细胞反应的研究 | 研究仅关注一名病毒阴性梅克尔细胞癌患者，样本量较小 | 本研究的目的在于分析特异性针对新抗原的CD4 T细胞的功能和转录特征 | 研究对象为一位中年女性梅克尔细胞癌患者及其血液中的T细胞 | 数字病理学 | 梅克尔细胞癌 | 全外显子测序（WES）、ELISpot、流式细胞术和单细胞RNA序列分析 | NA | 血液样本 | 1名患者 |
| 12192 | 2024-08-05 |
Single Cell Analysis of Blood Mononuclear Cells Stimulated Through Either LPS or Anti-CD3 and Anti-CD28
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.636720
PMID:33815388
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研究论文 | 本研究开发了一种成本效益高的多重单细胞RNA测序方法，以研究不同激活因子对人类外周血单核细胞的影响 | 首次通过CITE-seq方法系统研究了不同激活因子对外周血单核细胞组成和转录特征的影响 | 本研究的范围可能受到样本数量和来源的限制 | 探讨经典T细胞和单核细胞激活因子如何改变外周血单核细胞的组成和转录谱 | 健康人供体的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | RNA测序 | 来自健康人供体的外周血单核细胞 |
| 12193 | 2024-08-05 |
Antibody targeting of B7-H4 enhances the immune response in urothelial carcinoma
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1744897
PMID:32363111
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研究论文 | 该文章探讨了抗B7-H4抗体在尿路上皮癌中增强免疫反应的作用 | 阐明了B7-H4在小鼠癌症模型中的新表达，以及其在促进T细胞活性的潜力 | 缺乏对其他种类肿瘤模型中的B7-H4表现的综合分析 | 识别新的治疗靶点以改善尿路上皮癌患者的生存率 | 研究对象包括小鼠癌症模型和人类膀胱癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，免疫质量细胞术 | NA | 肿瘤样本 | 包括小鼠模型及人类膀胱癌样本 |
| 12194 | 2024-08-04 |
Reconstructing developmental trajectories using latent dynamical systems and time-resolved transcriptomics
2024-May-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.004
PMID:38754365
|
研究论文 | 本文提出了一种新框架，以克服单细胞转录组学在研究细胞命运决策动态性方面的挑战 | 引入了sci-FATE2优化的代谢标记方法和两个阶段的动态建模框架VelvetVAE和VelvetSDE，显著提高了数据质量和动态建模能力 | 目前的方法在时间分辨率和数据质量方面仍存在一定限制 | 研究细胞在发育过程中的命运决策动态性 | 45,000个分化成神经管身份的胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 代谢标记 | 变分自编码器(VAE)和神经随机微分方程(nSDE) | 转录组数据 | 45,000个胚胎干细胞 |
| 12195 | 2024-08-04 |
Single-Cell Multi-Omics Map of Cell Type-Specific Mechanistic Drivers of Multiple Sclerosis Lesions
2024-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200213
PMID:38564686
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研究论文 | 该文章探讨了多发性硬化损伤的细胞类型特异性机制驱动因素 | 首次使用单细胞多组学技术揭示了多发性硬化特异性少突胶质细胞遗传特征及其与铁摄取信号的关联 | 研究样本数量较少，仅涉及6名多发性硬化患者和3名非神经病对照 | 研究多发性硬化中的细胞动态及其在病变中的作用 | 使用来自6名渐进性多发性硬化患者的脑白质损伤样本 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单核RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 9个病变样本和3个对照样本来自6名患者 |
| 12196 | 2024-08-04 |
Characterization of the Nucleus Pulposus Progenitor Cells via Spatial Transcriptomics
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303752
PMID:38311573
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研究论文 | 本研究建立了椎间盘的空间转录组图谱，探讨了核髓细胞前体细胞的特征 | 首次生成了小鼠椎间盘的空间转录组图谱，为骨生物学提供了公共资源 | 由于核髓来源细胞的脆弱性，传统转录组方法的应用受限 | 研究核髓细胞前体细胞的分化序列及其相关标记 | 小鼠模型中的核髓细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12197 | 2024-08-04 |
Integration Analysis of Single-Cell Multi-Omics Reveals Prostate Cancer Heterogeneity
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305724
PMID:38483933
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研究论文 | 该研究揭示了前列腺癌微环境中细胞异质性及其与疾病进展的相互作用 | 整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和ATAC序列分析，详细描绘了前列腺癌的细胞多样性 | 尚未完全理解肿瘤与基质细胞之间的异质性形成机制 | 研究前列腺癌的细胞异质性及其在微环境中的相互作用 | 来自前列腺癌患者及健康对照者的单细胞样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、ATAC序列分析 | 机器学习 | 细胞数据 | 多名前列腺癌患者及健康对照者的细胞样本 |
| 12198 | 2024-08-05 |
Generation of complex bone marrow organoids from human induced pluripotent stem cells
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02172-2
PMID:38374263
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研究论文 | 本文展示了一种从人类诱导多能干细胞生成复杂骨髓类器官的方法 | 创新之处在于生成了模拟人类骨髓微环境的复杂三维骨髓类器官 | 没有提到具体的局限性 | 研究与人类骨髓微环境相关的造血发展和疾病 | 从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 |
| 12199 | 2024-08-05 |
sciCSR infers B cell state transition and predicts class-switch recombination dynamics using single-cell transcriptomic data
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02060-1
PMID:37932398
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研究论文 | 本文介绍了sciCSR，一个分析B细胞类转变和动态的计算管道 | sciCSR能够利用单细胞RNA测序数据分析类转变事件，并构建马尔可夫状态模型推断CSR的动态和方向 | 未提及具体限制 | 分析B细胞成熟过程中类转变重组的动态 | 采用单细胞RNA测序数据，研究B细胞的类转变和动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 马尔可夫状态模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 |
| 12200 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13592
PMID:38158643
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综述 | 本文讨论了癌症相关成纤维细胞的异质性，重点关注单细胞RNA测序技术的应用 | 提出了利用单细胞RNA测序技术整合多模态单细胞平台的新策略，以深入理解CAF的异质性 | 未具体说明在不同肿瘤类型中CAF研究的限制 | 探讨癌症相关成纤维细胞的异质性及其在癌症治疗中的潜在应用 | 癌症相关成纤维细胞的不同亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |