单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2026-04-21 |
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Apr-17, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115789
PMID:42002019
|
研究论文 | 本研究通过实验性上调Lancl1基因，探究其在体内促进视神经损伤后轴突再生的作用 | 首次发现Lancl1作为轴突再生促进因子，并通过体内实验验证其神经保护和轴突再生能力，揭示了其治疗中枢神经系统损伤的潜力 | 未发现Lancl1转基因激活mTOR通路的pS6标记，其下游作用机制尚需进一步研究 | 探究Lancl1基因在视神经损伤后轴突再生中的作用及其治疗潜力 | 视网膜神经节细胞（RGCs）和视神经损伤模型 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、功能获得性实验、转基因技术 | NA | 基因表达数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1202 | 2026-04-21 |
Single-cell Analysis Reveals a LAMB3-dependent Immunosuppressive Environment in Gallbladder Neck/Cystic Duct Carcinoma
2026-Apr-17, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101860
PMID:42002036
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胆囊癌中不同解剖起源（胆囊底/体 vs 胆囊颈/胆囊管）的肿瘤微环境异质性，并识别了LAMB3在免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了胆囊癌不同解剖亚型的肿瘤微环境特征，并发现LAMB3是胆囊颈/胆囊管癌免疫抑制微环境的核心调控因子 | 样本量相对有限（共55例），且主要基于转录组数据，功能验证仍需进一步深入 | 探究胆囊癌不同解剖亚型的肿瘤微环境异质性及其免疫调控机制 | 胆囊癌患者组织样本（38例胆囊底/体癌和17例胆囊颈/胆囊管癌） | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组测序, 全外显子组测序, 多重免疫组化, 单细胞TCR测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 55例胆囊癌样本（38例GBCF/B, 17例GBCN/CD），共569,736个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1203 | 2026-04-21 |
Intrahepatic T cell analysis reveals Th17 and MAIT17 enrichment in primary sclerosing cholangitis
2026-Apr-17, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101857
PMID:42002038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合T细胞受体测序，揭示了原发性硬化性胆管炎（PSC）肝内T细胞中Th17和MAIT17细胞的富集现象 | 首次在PSC中通过多模态分析发现肝内Th17和MAIT17细胞的显著富集，并验证了其TCR克隆型在血液中的累积频率 | 样本量相对较小（PSC 12例，PBC 9例，ALD 3例），且依赖疾病对照组，可能限制结果的普适性 | 深入表征PSC肝内T细胞的免疫特征，以阐明T细胞在疾病中的作用 | 肝内T细胞，包括Th17和MAIT17细胞亚群 | 单细胞组学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），T细胞受体测序（TCR-seq），流式细胞术，免疫组织化学（IHC） | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，流式细胞数据，免疫组化图像 | 24例肝移植样本（12例PSC，9例PBC，3例ALD），外加37例验证队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq，TCR-seq | NA | NA |
| 1204 | 2026-04-21 |
UHRF1-mediated DNA 5-mC modification drives super-enhancer redistribution and impedes osteogenesis via TGM2-regulated autophagic flux in senile osteoporosis
2026-Apr-17, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.042
PMID:42002028
|
研究论文 | 本研究揭示了UHRF1介导的DNA 5-mC修饰通过调控超增强子重分布和TGM2调节的自噬流，从而阻碍间充质干细胞成骨分化，导致老年性骨质疏松的机制 | 首次揭示了DNA 5-mC修饰、超增强子景观和自噬流在MSC成骨过程中的相互作用，并明确了UHRF1缺陷在SOP中的核心作用 | 机制研究主要在体外细胞模型中进行，体内验证主要依赖小鼠模型，人类样本的直接验证可能有限 | 探究老年性骨质疏松中MSC成骨能力受损的内在机制，并寻找潜在治疗靶点 | 老年性骨质疏松患者的间充质干细胞、SOP小鼠模型 | 表观遗传学、骨生物学 | 老年性骨质疏松 | WGBS, CUT&Tag, scRNA-seq, bulk RNA-seq, 免疫共沉淀, 蛋白质印迹, 透射电镜, 免疫荧光 | NA | 基因组学数据、表观基因组学数据、转录组学数据、蛋白质数据、图像数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，涉及SOP患者MSC和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 批量RNA测序, CUT&Tag | NA | NA |
| 1205 | 2026-04-21 |
Therapy-driven clonal dynamics in chronic lymphocytic leukemia
2026-Apr-17, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.04.001
PMID:42002058
|
综述 | 本文综述了慢性淋巴细胞白血病中克隆演化与治疗耐药机制的当前知识，并讨论了新兴技术及未来研究方向 | 总结了从传统化疗免疫疗法向靶向治疗转变背景下，CLL克隆动力学和耐药机制的最新进展，并强调了单细胞测序和多组学整合等新兴技术的重要性 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行总结，未提供新的原始实验数据或临床研究结果 | 深入理解CLL的克隆演化过程，以开发个性化治疗策略并改善患者长期预后 | 慢性淋巴细胞白血病 | NA | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序，多组学整合方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1206 | 2026-04-21 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveal CST6 + epithelial-SPP1+ macrophage crosstalk driving lung adenocarcinoma metastasis
2026-Apr-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152105
PMID:42002169
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了CST6+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用驱动肺腺癌转移的新机制 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和多色免疫组化技术，系统描绘了肺腺癌原发灶与多部位转移灶的肿瘤微环境，并发现了CST6+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞这一新的促转移细胞轴 | 研究主要基于观察性数据和体外实验，缺乏体内功能验证实验来完全证实该细胞轴在活体中的促转移作用 | 阐明肺腺癌转移的微环境驱动因素 | 肺腺癌（LUAD）患者的原发肿瘤及淋巴结、胸膜、脑等多部位转移病灶 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫组织化学（mIHC），体外共培养实验，分泌组分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，图像数据 | NA（文中未明确说明具体样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1207 | 2026-04-21 |
Common potential drug targets for ischemic stroke and coronary heart disease: CYR61, IL2RB, and ST3GAL2 are identified as key regulatory proteins
2026-Apr-16, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152034
PMID:41999825
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法，揭示了缺血性卒中与冠心病之间的双向遗传关联，并识别出CYR61、IL2RB和ST3GAL2作为共享的潜在药物靶点 | 采用双向双样本孟德尔随机化结合共定位分析，整合血浆蛋白质组QTLs和单细胞转录组数据，首次系统性地识别了缺血性卒中与冠心病共有的关键调控蛋白 | 研究主要基于GWAS汇总统计数据，可能受限于样本异质性和潜在混杂因素；体内实验仅提供了表达水平验证，功能机制和药理作用需进一步探索 | 阐明缺血性卒中与冠心病之间的双向遗传关系，并优先筛选共享的候选蛋白质作为潜在治疗靶点或生物标志物 | 缺血性卒中与冠心病患者群体及相关遗传与蛋白质数据 | 基因组学与生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组学、分子动力学模拟 | NA | 遗传汇总统计数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1208 | 2026-04-21 |
scRNA-seq based gene and cell dynamics behind the formation of the non-caseating granulomas
2026-Apr-16, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析，揭示了非干酪样肉芽肿形成的遗传和免疫学基础 | 首次通过单细胞RNA测序数据系统分析非干酪样肉芽肿的基因表达和细胞动态，识别了506个肉芽肿相关基因和10个关键的免疫信号通路 | 分析基于单细胞RNA测序驱动的计算机模拟，需要在更大、特征明确的队列中并通过独立实验方法进行验证 | 阐明非干酪样肉芽肿形成的分子机制 | 结节病和纹身葡萄膜炎患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 慢性肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 健康对照、活动性结节病患者以及活动性和非活动性纹身葡萄膜炎患者的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1209 | 2026-04-21 |
Neuroinflammation in Spinal Cord Injury: Cellular and Molecular Mechanisms
2026-Apr-16, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
|
综述 | 本文综述了脊髓损伤后神经炎症的细胞与分子机制，重点关注不同阶段免疫反应的作用及单细胞和空间转录组学的新发现 | 超越传统的二元模型，利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示状态特异性和区域特异性的免疫程序，并识别致病性和修复性回路 | 需要未来研究优先验证体内因果免疫节点，并开发基于生物标志物、阶段特异性的免疫疗法 | 阐明脊髓损伤后神经炎症的细胞与分子机制，以支持精准免疫调节 | 脊髓损伤后的神经炎症过程，涉及小胶质细胞、浸润巨噬细胞、星形胶质细胞、中性粒细胞、树突状细胞以及T和B淋巴细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1210 | 2026-04-21 |
Spatial and single-cell transcriptomic atlas of human suprachiasmatic nucleus
2026-Apr-15, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.032
PMID:41720090
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学、单核RNA测序和基于深度学习的组织学分析，构建了成人人类视交叉上核的全面分子和细胞图谱 | 首次创建了人类视交叉上核的空间和单细胞转录组图谱，揭示了七种神经元亚型及其空间分布，并比较了人类、小鼠和非人灵长类动物的功能保守性 | 研究主要基于成年人类样本，可能未涵盖发育或衰老过程中的变化，且样本数量有限 | 理解人类视交叉上核的神经和分子机制，以揭示昼夜节律钟的调控基础 | 成人人类视交叉上核组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序, 深度学习 | 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 组织图像 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1211 | 2026-04-21 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2026-Apr-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101560
PMID:41903535
|
研究论文 | 本文比较了单细胞RNA测序分析中两个主流软件包Seurat和Scanpy的算法差异及其对分析结果的影响 | 首次系统量化了Seurat和Scanpy在单细胞RNA-seq分析各步骤中的输出差异，并发现软件版本更新会显著影响差异表达分析结果 | 研究主要基于模拟和基准数据集，未全面评估所有分析参数组合或真实临床样本的适用性 | 评估单细胞RNA-seq分析软件包选择及版本控制对分析结果可重复性的影响 | 单细胞RNA测序数据分析流程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1212 | 2026-04-21 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals novel lncRNA macromolecules associated with PARP11, LMF1, and RRM2 regulatory axes in non-small cell lung cancer
2026-Apr-15, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151932
PMID:41997320
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了非小细胞肺癌中与PARP11、LMF1和RRM2调控轴相关的新型lncRNA大分子及其在肿瘤异质性和免疫微环境中的作用 | 发现了新型lncRNA大分子（AC005842.1、AC009041.2、AC007240.1）及其与癌症通路（如EMT、缺氧）的关联，并开发了开源工具lncScape用于单细胞数据中的lncRNA分析 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，实验验证仅限于qRT-PCR，未涉及更深入的体内或功能机制研究 | 探索非小细胞肺癌中lncRNA大分子在肿瘤异质性和免疫微环境中的调控作用 | 非小细胞肺癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量实时PCR（qRT-PCR） | 无监督聚类、伪时间轨迹建模 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，涉及非小细胞肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1213 | 2026-04-21 |
Transcriptional programming of early-forming memory B cells arises independently of cognate CD4+ T-cell interactions
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag054
PMID:42001515
|
研究论文 | 本研究探讨了早期形成记忆B细胞的转录编程是否独立于特异性CD4+ T细胞相互作用 | 通过使用MHCII-KO小鼠模型，揭示了记忆B细胞的形成和多样性可以在没有特异性CD4+ T细胞帮助的情况下发生 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类免疫系统的复杂性 | 探究CD4+ T细胞对记忆B细胞分子编程和多样性的影响 | 记忆B细胞在流感感染中的形成机制 | 免疫学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MHCII-KO和野生型小鼠的记忆B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1214 | 2026-04-21 |
Identification of Drug-resistant Cell Subpopulations in Colorectal Cancer Through Single-cell Analysis and Exploration of Potential Therapeutic Strategies
2026-Apr-14, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了结直肠癌中对奥沙利铂耐药的细胞亚群EpC2，并探索了其耐药机制及潜在治疗策略 | 首次在结直肠癌中通过单细胞分析识别出特定的奥沙利铂耐药上皮细胞亚群EpC2，并整合多组学与cMAP数据库分析预测了候选干预药物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床样本验证；耐药机制的实验验证不足 | 识别结直肠癌中的奥沙利铂耐药细胞亚群，阐明其耐药机制，并寻找潜在的治疗策略 | 结直肠癌患者样本的单细胞RNA测序数据、奥沙利铂耐药细胞系数据、TCGA队列数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Monocle2, CellChat | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集、GSE76092耐药细胞系数据集、TCGA队列、GSE179784数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1215 | 2026-04-21 |
Multi-Omics Analysis Reveals DNASE1L3 in Hepatocellular Carcinoma Prognosis, Immune Microenvironment, and Immunotherapy Response
2026-Apr-14, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了DNASE1L3在肝细胞癌预后、免疫微环境和免疫治疗反应中的作用 | 首次通过整合转录组和蛋白质组数据集，结合WGCNA和Lasso回归分析，系统性地揭示了DNASE1L3在肝细胞癌中的临床诊断意义及其与免疫治疗反应性的关联 | 研究主要基于TCGA等公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性临床队列验证，且DNASE1L3的具体分子机制尚未通过实验阐明 | 探究DNASE1L3在肝细胞癌中的表达特征、预后价值及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关系 | 肝细胞癌患者样本及相关公共数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、WGCNA、Lasso回归分析 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 基于TCGA等公共数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1216 | 2026-04-21 |
Revealing Metabolic Reprogramming Genes as Biomarkers of Rheumatoid Arthritis: A Bioinformatics Study Based on Ensemble Learning Approach and Single Cell RNA Sequencing
2026-Apr-13, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法，结合集成学习模型和单细胞RNA测序，系统研究了类风湿关节炎中代谢重编程与免疫失调的分子相互作用，并鉴定了新的诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次系统整合代谢重编程基因集、机器学习模型和单细胞RNA测序数据，全面揭示RA中代谢与免疫的交互作用，并开发了高性能的集成诊断模型 | 研究主要基于生物信息学分析，临床样本验证规模较小（RA n=5；对照 n=6），且单细胞数据仅来自一名RA患者，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 系统研究类风湿关节炎中代谢重编程与免疫失调的分子相互作用，并鉴定诊断生物标志物和治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和对照个体的基因表达数据，包括批量RNA测序数据集和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR | LASSO回归, XGBoost, 集成学习模型 | 基因表达数据 | 批量RNA-seq数据集：GSE93272（232 RA/43对照）和GSE110169（84 RA/77对照）；单细胞RNA-seq数据集：GSE159117（1名RA患者）；qPCR验证：RA患者5名，对照6名 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1217 | 2026-04-21 |
DestinyNet: A deep-learning framework for cell-fate analysis from lineage-tracing single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101471
PMID:42005385
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为DestinyNet的多任务深度学习框架，用于从谱系追踪单细胞RNA测序数据中进行细胞命运分析 | DestinyNet通过细胞关系三元组实现端到端的细胞表示学习，并能够处理静态、累积和动态条形码等多种LT-scSeq数据类型 | NA | 开发一个准确、稳健且可扩展的细胞命运分析框架，以解析细胞发育动态，包括谱系承诺、分化和疾病进展 | 谱系追踪单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1218 | 2026-04-21 |
Protocol for generating and characterizing Matrigel-free prostate cancer patient-derived organoids
2026-Apr-07, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104486
PMID:41955100
|
研究论文 | 本文介绍了一种在无Matrigel条件下生成前列腺癌患者来源类器官（PCa PDOs）的方案 | 开发了无需Matrigel的前列腺癌患者来源类器官生成方法，并整合了单细胞RNA测序分析指南 | NA | 建立前列腺癌患者来源类器官的生成、维持和表征方案 | 前列腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1219 | 2026-04-21 |
A novel deep learning-driven framework for improving lncRNA comprehensive annotation with LncADeep 2.0
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag162
PMID:41923359
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为LncADeep 2.0的集成深度学习框架，旨在提高长链非编码RNA（lncRNA）的识别和功能注释的准确性 | 在识别模块中整合了新型肽特征、序列和结构信息，并通过迁移学习策略利用以lncRNA为中心的相互作用网络和基因本体术语进行功能注释，提升了在有限功能数据下的注释性能 | 未明确说明 | 提高lncRNA的识别和功能注释的准确性 | 长链非编码RNA（lncRNA） | 自然语言处理 | NA | RNA-seq | 深度学习 | 序列数据、RNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1220 | 2026-04-21 |
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716237
PMID:41993456
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Halo的预训练模型，用于从空间转录组学中的核染色图像进行全细胞分割 | Halo通过整合核形态与RNA转录本的空间分布，将转录本坐标转换为分子密度图，并与DAPI图像联合处理，采用Cellpose-SAM分割架构，无需针对新数据集进行额外训练 | NA | 开发一种可扩展且可重复的全细胞分割方法，以改进空间转录组学中的单细胞转录组重建 | 空间转录组学数据，包括核染色图像和RNA转录本坐标 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Cellpose-SAM | 图像，分子密度图 | 来自12种组织类型的多模态Xenium数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | 多模态Xenium数据 |