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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1201 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Validation of Myelin Water Fraction as a Myelin-Specific MRI Biomarker
2025-Sep-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.27.25334582
PMID:40950466
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研究论文 | 通过多组学方法验证髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的有效性 | 首次将高级MRI方法与高通量血浆蛋白质组学和空间转录组学整合,验证MWF的生物学特异性 | 研究仅针对成人主要白质和深部灰质区域,样本来源和数量有限 | 验证髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的生物学相关性 | 成人主要白质和深部灰质区域 | 神经影像学 | 神经系统疾病 | BMC-mcDESPOT成像、血浆蛋白质组学、空间转录组学 | 贝叶斯蒙特卡洛分析 | MRI图像、蛋白质组数据、基因表达数据 | NA | SomaLogic, Allen Institute | 血浆蛋白质组学、空间转录组学 | SomaScan 7k, Allen Human Brain Atlas | SomaScan 7k蛋白质组分析平台、Allen人脑图谱空间基因表达数据 |
1202 | 2025-10-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Solid Tumors and Sarcomas: Heterogeneity, Function, and Therapeutic Implications
2025-Sep-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171398
PMID:40940809
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综述 | 本文系统探讨了实体瘤和肉瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、功能及治疗意义 | 首次系统比较了上皮性肿瘤与肉瘤中CAF的异同,提出了CAF分型在肉瘤中的身份界定难题 | 肉瘤中CAF研究相对不足,恶性与非恶性成纤维细胞界限模糊 | 探索CAF在不同肿瘤类型中的异质性、可塑性及其治疗靶向策略 | 癌症相关成纤维细胞(CAF)及其在实体瘤和肉瘤中的亚型 | 肿瘤微环境研究 | 实体瘤和肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1203 | 2025-10-05 |
Analysis of Microarray and Single-Cell RNA-Seq Finds Gene Co-Expression and Tumor Environment Associated with Extracellular Matrix in Epithelial-Mesenchymal Transition in Prostate Cancer
2025-Sep-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178575
PMID:40943497
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研究论文 | 通过分析微阵列和单细胞RNA测序数据,研究前列腺癌上皮-间质转化中基因共表达和肿瘤微环境与细胞外基质的关系 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据重建前列腺癌EMT相关差异表达基因网络 | NA | 阐明前列腺癌EMT中差异表达基因的分子特征和通路,识别潜在生物标志物 | 前列腺癌上皮-间质转化相关基因 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
1204 | 2025-10-05 |
Inflammatory Milieu by Crosstalk between Glomerulus and Proximal Tubular Cells in Type 2 Diabetes Mellitus Kidney Disease
2025-Sep, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2024.0535
PMID:40160027
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析诱导型2型糖尿病肾病模型,揭示了肾小球与近端肾小管细胞间相互作用导致CXCL12介导的T细胞浸润机制 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于诱导型而非基因修饰的2型糖尿病肾病模型,并发现CXCL12在介导T细胞招募中的关键作用 | 研究基于动物模型,人类样本验证有限,需要进一步临床研究确认 | 探索2型糖尿病肾病中肾小球与近端肾小管细胞间的相互作用机制 | 诱导型2型糖尿病肾病小鼠模型和人类肾脏活检组织 | 单细胞测序分析 | 2型糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、组织学分析、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学图像、流式细胞数据 | 诱导型T2DKD小鼠模型和对照小鼠,人类肾脏活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1205 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell transcriptomics, molecular docking, and dynamics simulations to characterize protein kinase X-linked mechanisms in osteosarcoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147335
PMID:40907924
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、分子对接和动力学模拟,揭示了PRKX-CDC37相互作用在骨肉瘤中的机制,并发现麦角胺可作为潜在抑制剂 | 首次结合单细胞RNA测序与分子动力学模拟揭示PRKX-CDC37在骨肉瘤中的变构调控机制,并发现麦角胺作为新型抑制剂 | 研究主要基于计算模拟和体外实验,缺乏体内实验验证 | 解码PRKX的激活机制并评估其作为骨肉瘤生物标志物和治疗靶点的临床潜力 | 骨肉瘤细胞、PRKX激酶、CDC37分子 | 计算生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、siRNA敲低 | AlphaFold预测模型、分子动力学模型 | 基因表达数据、蛋白质结构数据 | GSE152048数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1206 | 2025-10-05 |
From Pathophysiology to Innovative Therapies in Eye Diseases: A Brief Overview
2025-Sep-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178496
PMID:40943417
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综述 | 本文概述了眼科疾病从病理生理学到创新疗法的进展,重点介绍分子影像技术和精准治疗方法 | 整合分子影像技术与人工智能分析,探索基因治疗、干细胞再生和靶向分子疗法在眼科疾病中的应用 | 这些技术需要进一步验证、监管批准和长期安全性评估才能应用于常规临床护理 | 探讨分子影像和精准疗法在眼科疾病诊断和治疗中的转化应用 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、青光眼和葡萄膜炎等致盲性眼病 | 数字病理 | 眼科疾病 | 光学相干断层扫描、OCT血管成像、MALDI-MSI、空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、机器学习 | 机器学习 | 影像数据、分子数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
1207 | 2025-10-05 |
Comprehensive analysis of a lipid metabolism-related gene signature for ulcerative colitis
2025-Aug-31, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-161
PMID:40949920
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研究论文 | 本研究通过综合分析脂质代谢相关基因特征,开发溃疡性结肠炎的新型诊断工具 | 首次整合差异表达分析、WGCNA和机器学习方法识别UC相关的关键脂质代谢基因,并利用单细胞RNA测序验证基因表达 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别溃疡性结肠炎诊断和治疗的有效生物标志物,阐明脂质代谢在UC发病机制中的分子机制 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照者的组织和血液样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 差异表达分析, WGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的UC患者和健康对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1208 | 2025-10-05 |
Identification of metabolic driver genes and targeted drug screening for lung adenocarcinoma metastasis at the single-cell resolution
2025-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-484
PMID:40950658
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺腺癌转移的代谢驱动基因,并构建预后风险模型进行靶向药物筛选 | 首次在单细胞分辨率下系统识别肺腺癌转移的代谢驱动基因,并基于此开发预后风险模型和筛选靶向药物 | 研究主要基于计算分析,实验验证相对有限,需要更多临床前和临床研究进一步验证 | 解析肺腺癌转移过程中的代谢驱动机制,优化预后预测并筛选特异性靶向药物 | 肺腺癌肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1209 | 2025-10-05 |
Thyroid differentiation score-related genes and prognostic model for thyroid cancer
2025-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-460
PMID:40950686
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研究论文 | 本研究构建了甲状腺分化评分相关的四基因风险模型用于甲状腺癌预后预测 | 首次将甲状腺分化评分与基因表达特征结合构建甲状腺癌预后模型,并发现UST基因通过p53信号通路调控CD4+记忆细胞的新机制 | 研究基于TCGA单一数据库,缺乏外部验证队列 | 构建甲状腺分化评分相关的预后风险模型并探索潜在生物标志物 | 甲状腺癌患者 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, LASSO回归, Cox回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | TCGA-THCA数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
1210 | 2025-10-05 |
Identification of mechanosensitive ion channel-related molecular subtypes and key genes for ovarian cancer
2025-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1219
PMID:40950697
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研究论文 | 本研究从机械敏感性离子通道角度识别卵巢癌的分子亚型和关键基因 | 首次从机械敏感性离子通道角度对卵巢癌进行分子分型并识别关键基因 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 阐明机械敏感性离子通道在卵巢癌中的功能 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO,Cox回归 | RNA测序数据,临床数据 | TCGA数据库中的卵巢癌样本 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
1211 | 2025-10-05 |
BIRC5 expression correlates with immunosuppressive phenotype and predicts inferior response to immunotherapy in lung adenocarcinoma
2025-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-216
PMID:40950902
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研究论文 | 本研究探讨BIRC5表达与肺腺癌免疫抑制表型及免疫治疗疗效的关系 | 首次系统揭示BIRC5表达与肺腺癌免疫微环境特征及免疫检查点抑制剂疗效的关联 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 研究BIRC5对肺腺癌临床特征、肿瘤微环境及预后的影响 | 肺腺癌患者组织样本和接受免疫检查点抑制剂治疗的非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 转录组测序,单细胞测序,免疫浸润分析 | Cox回归分析,log-rank检验 | 转录组数据,临床数据 | 535例肺腺癌样本,59例正常肺组织,54例接受免疫治疗的NSCLC患者 | NA | 转录组测序,单细胞测序 | NA | NA |
1212 | 2025-10-05 |
Cross-platform transcriptomic data integration identifies an overactive neuro-immune signature in human osteoarthritis synovium
2025-Aug-30, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.013
PMID:40889615
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研究论文 | 通过跨平台转录组数据整合分析,鉴定出人类骨关节炎滑膜中过度活跃的神经免疫特征 | 首次通过整合多个公共基因表达数据集,系统识别骨关节炎滑膜中的神经免疫相互作用特征,并构建了滑膜-背根神经节相互作用网络 | 研究主要基于公开数据集,样本量相对有限(139例),且主要关注终末期骨关节炎 | 表征骨关节炎滑膜的转录表型,特别关注与疼痛相关的信号通路 | 人类非骨关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 加权Z检验,基因集富集分析,细胞类型富集分析,调控网络分析 | 基因表达数据 | 153名受试者(质量控制后139名) | NA | 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1213 | 2025-10-05 |
Machine learning integration of bulk and single-cell RNA-seq data reveals glycolytic heterogeneity in colorectal cancer
2025-Aug-30, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03007-6
PMID:40884604
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学数据分析揭示结直肠癌中糖酵解代谢异质性 | 首次系统整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合五种特征选择算法识别糖酵解核心调控基因,发现具有高糖酵解状态的肿瘤亚群 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证调控基因的功能机制 | 探索结直肠癌中糖酵解代谢的调控机制和细胞异质性 | 结直肠癌组织和细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习特征选择算法 | 基因表达数据 | 多中心队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1214 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic biomarkers in colorectal cancer through multi-omics profiling of programmed cell death pathways
2025-Aug-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2024-861
PMID:40950352
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研究论文 | 通过多组学分析程序性细胞死亡通路,识别结直肠癌预后生物标志物 | 整合多组学数据和动态网络生物标志物模型,揭示PCD通路在结直肠癌中的阶段特异性关键转变 | NA | 分析程序性细胞死亡通路在结直肠癌中的作用及其预后价值 | 结直肠癌组织和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞测序,空间转录组学,GSVA,ssGSEA,Cox回归,LASSO回归 | 动态网络生物标志物模型 | 基因组数据,转录组数据 | TCGA数据库结直肠癌样本 | NA | 单细胞测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
1215 | 2025-10-05 |
Liposomal Doxorubicin, but Not Platinum-Taxane, Supports MHC-II Expression and Immune Maturation in the Ovarian Tumor Microenvironment
2025-Aug-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172827
PMID:40940927
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序评估不同化疗方案对卵巢癌肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 首次发现脂质体阿霉素能选择性上调肿瘤细胞MHC-II表达并促进免疫成熟 | 研究基于小鼠模型,临床相关性需进一步验证 | 评估化疗药物与免疫系统的相互作用机制 | 卵巢癌小鼠模型和患者肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1216 | 2025-10-05 |
TGFB2/IGFBP5 activated by transcription factors STAT2 and SMAD3 initiate granulosa cell degeneration and cause follicular atresia in chickens
2025-Aug-28, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105747
PMID:40902342
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研究论文 | 本研究通过鉴定TGFB2和IGFBP5基因的启动子区域,揭示了STAT2和SMAD3转录因子在鸡卵泡闭锁过程中调控颗粒细胞退化的分子机制 | 首次发现STAT2是TGFB2和IGFBP5的共同转录因子,并揭示了JAK/STAT与TGF-β/SMAD信号通路在卵泡闭锁中的协同调控作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内功能验证实验 | 阐明鸡卵泡闭锁过程中颗粒细胞退化的分子调控机制 | 鸡卵泡颗粒细胞 | 分子生物学 | 生殖系统疾病 | DNA pull-down, 质谱分析, 单细胞RNA测序, SCENIC分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1217 | 2025-10-05 |
Immune profiling in oncology: bridging the gap between technology and treatment
2025-Aug-26, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03002-x
PMID:40856894
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综述 | 本文探讨免疫分析技术在肿瘤学中的发展及其在临床实践中的应用与挑战 | 整合质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、空间转录组学和液体活检等前沿技术,结合人工智能模型进行多组学数据分析 | 存在成本高昂、通量限制、标准化不足、样本变异性和数据整合等挑战 | 研究免疫分析技术在肿瘤精准医疗中的应用与发展 | 肿瘤免疫相互作用及治疗反应预测 | 生物信息学 | 肿瘤 | 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学, 液体活检, 多组学整合 | 人工智能(AI)驱动模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 液体活检 | NA | NA |
1218 | 2025-10-05 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19相关肺损伤肺移植患者的免疫特征 | 首次揭示肺移植患者中RBD特异性抗体显著降低,并鉴定出三种在CALI肺移植患者中扩增的免疫细胞亚群 | 样本量有限,未明确这些免疫特征变化的长期临床意义 | 探究SARS-CoV-2感染和肺移植共同作用下的免疫特征变化 | COVID-19相关肺损伤肺移植患者、非移植COVID-19患者和血清阴性对照 | 单细胞组学 | COVID-19相关肺损伤 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据,细胞因子数据 | 未明确具体样本数量,包括CALI肺移植患者、非移植COVID-19组和血清阴性对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1219 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals metastatic and immunosuppressive characteristics in meningioma brain-tumor interface
2025-Aug-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06935-z
PMID:40826459
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示脑膜瘤脑肿瘤界面的转移和免疫抑制特征 | 首次在脑膜瘤脑肿瘤界面识别出具有促上皮间质转化特征的肿瘤细胞群及其生物标志物ANXA2和COL5A1,并揭示了由SPP1+巨噬细胞、ACKR1high内皮细胞和THY1high周细胞组成的免疫抑制微环境 | NA | 识别脑膜瘤早期转移的生物标志物并发现潜在治疗靶点 | 脑膜瘤脑肿瘤界面的细胞群体 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1220 | 2025-10-05 |
Focused ultrasound-induced blood-brain barrier opening promotes glioprotective phenotypes in ACSA-II+ murine astrocytes
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113173
PMID:40948563
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术探究聚焦超声诱导血脑屏障开放对海马星形胶质细胞表型的影响 | 首次揭示FUS-BBBO通过诱导星形胶质细胞呈现神经保护表型,促进突触修饰、神经发生和神经元发育相关基因表达 | 研究仅观察了2、4、7天三个时间点,未涵盖更长期的细胞反应;机制研究尚不完善 | 探究FUS-BBBO对星形胶质细胞表型影响的细胞机制 | 老年野生型和阿尔茨海默病模型小鼠的海马ACSA-II+星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 老年WT和AD模型小鼠,在FUS-BBBO后2、4、7天三个时间点采集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |