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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2026-05-02 |
Integrating bulk RNA-seq and ScRNA-seq to identify manganese metabolism-related subtypes and immunoregulatory mechanisms in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jan, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1298
PMID:42064840
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研究论文 | 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,识别肝细胞癌中锰代谢相关亚型及免疫调控机制 | 首次将锰代谢基因与肝细胞癌亚型分类和预后模型相结合,利用单细胞数据分析免疫细胞通讯 | 未明确提及外部验证或机制实验验证,可能依赖公共数据库的回顾性分析 | 研究锰代谢在肝细胞癌中的分子亚型及免疫调控机制,以指导精准诊断和免疫治疗 | 肝细胞癌肿瘤样本(来自TCGA和GEO数据库) | 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, 多变量Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的多个肝细胞癌样本(具体数量未提及) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1202 | 2026-05-02 |
Integrative Machine Learning and Experimental Validation Identify MYBL2 as a Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Hepatocellular Carcinoma
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075284
PMID:42065054
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research paper | 通过整合机器学习和实验验证,确定MYBL2作为肝细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点 | 系统验证了MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,利用多种机器学习及实验技术,并揭示了miR-29a对MYBL2的调控机制 | 研究主要基于公开数据集和有限体外实验,临床应用验证不足 | 验证MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,阐明其功能及上游调控机制 | 肝细胞癌样本、细胞系及小鼠模型 | machine learning | liver cancer | RNA-seq, single-cell transcriptomics, iTRAQ proteomics, CRISPR knockout | LASSO | transcriptomic data, proteomic data, clinical data | TCGA和GEO队列样本 | Illumina | RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO平台的RNA-seq数据 |
| 1203 | 2026-05-02 |
Identify MTDH as a Key Gene of Radio-Resistance in Colorectal Cancer Based on Multi-Omics and Experimental Validation
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075314
PMID:42065055
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research paper | 基于多组学和实验验证,确定MTDH为结直肠癌放疗抵抗的关键基因 | 结合14种机器学习算法和SHAP可解释性分析,从多组学数据中识别MTDH与放疗抵抗的关联,并通过单细胞RNA测序和临床样本验证其在恶性二倍体单细胞亚群中的上调表达 | 未提及具体局限性 | 探究MTDH在结直肠癌放疗抵抗中的精确作用机制 | MTDH基因及其在结直肠癌放疗抵抗中的作用 | machine learning | colorectal cancer | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data, single-cell transcriptomic data | 82名直肠癌患者的组织样本 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1204 | 2026-05-02 |
Navigating the Labyrinth of Hepatocellular Carcinoma: Leveraging AI/ML for Precision Oncology
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074185
PMID:42065059
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综述 | 系统评估人工智能与机器学习在肝细胞癌精准肿瘤学中整合多组学数据、识别生物标志物和优化治疗决策的作用 | 创新性提出了AI驱动框架在解码肿瘤微环境相互作用和空间异质性中的转化潜力,特别是结合空间转录组学、数字病理学和单细胞技术的综合策略 | 文中未明确讨论具体局限,但综述性质可能受限于当前AI模型的可解释性、数据标准化及临床验证不足 | 评估AI/ML作为整合工具在肝细胞癌管理中转化高维多组学数据为临床可操作见解的能力 | 肝细胞癌的分子靶点、组合治疗策略、多组学数据(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学) | 机器学习 | 肝癌 | NA | NA | 文本、图像(数字病理学)、空间转录组学数据、单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 数字病理学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1205 | 2026-05-02 |
CDKN1A/p21 Influences the Survival and Expansion of Breast Cancer Stem Cells after Oxidative Damage
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074965
PMID:42065068
|
研究论文 | 本研究探讨了CDKN1A/p21在氧化损伤后乳腺癌干细胞存活与扩增中的作用 | 首次揭示CDKN1A/p21通过直接结合CD44、SPP1和TMSB10启动子调控其表达,影响乳腺癌干细胞存活,为克服治疗耐药和转移提供了新靶点 | 研究主要基于体外三维模型,缺乏体内验证,且未深入探讨p21调控的具体信号通路机制 | 探索CDKN1A/p21在乳腺癌干细胞存活和扩增中的功能及其分子机制 | 乳腺癌干细胞(BCSCs) | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学,染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于基因表达谱分析 |
| 1206 | 2026-05-02 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third-trimester pregnancy
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70096
PMID:42065097
|
研究论文 | 利用多组学技术研究妊娠晚期CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组变化 | 首次通过高维多组学方法(包括流式细胞术和单细胞RNA测序结合CITE-seq)系统分析了妊娠晚期外周血和蜕膜中CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组,揭示了IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 研究仅针对足月妊娠(>37周),未涵盖早孕期或中孕期;样本量较小;未对非妊娠对照组进行纵向追踪 | 理解妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白表达和转录组变化,为胎盘发育和妊娠并发症的免疫调节提供机制见解 | 足月妊娠(>37周)女性的外周血和蜕膜中的CD4+ T细胞以及非妊娠女性的外周血CD4+ T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 妊高症、胎儿生长受限、死产 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq | NA | 蛋白质表达数据、转录组数据 | 足月妊娠女性与非妊娠女性(具体数量未明确提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、CITE-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序结合CITE-seq抗体(>130种条形码抗体) |
| 1207 | 2026-05-02 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
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研究论文 | 该文章揭示了SPOP抑制剂作为分子胶水降解剂通过稳定STING增强黑色素瘤免疫治疗效果的作用机制 | 首次发现SPOP抑制剂不仅阻断SPOP与STING的识别,还能作为分子胶水重定向SPOP降解新底物CBX4,通过DNA损伤激活STING通路,增强先天免疫应答 | 研究主要基于黑色素瘤模型,尚需在其他肿瘤类型中验证;单细胞RNA-seq分析仅在异种移植模型中进行,缺乏临床样本验证 | 探讨SPOP在肿瘤免疫中的作用及其抑制剂作为分子胶水降解剂的潜在治疗价值 | 黑色素瘤B16肿瘤模型、小鼠模型、CAR.CD19-T细胞疗法 | 机器学习和数字病理 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 异种移植黑色素瘤B16肿瘤模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1208 | 2026-05-02 |
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67033-8
PMID:41390483
|
研究论文 | 该研究通过基因工程小鼠模型和人类膀胱癌样本,发现APOBEC3通过IL-1A/AP-1信号通路促进鳞状分化 | 首次揭示APOBEC3在膀胱癌中通过IL-1α和AP-1信号通路驱动鳞状分化的功能性作用,并鉴定APOBEC3A是人类中唯一与鳞状分化相关的家族成员 | 未明确提及,但可能涉及小鼠模型与人类疾病的完全一致性需进一步验证 | 探究APOBEC3家族在膀胱癌鳞状分化中的作用机制 | 基因工程小鼠模型(Pten和Trp53条件敲除并过表达小鼠Apobec3)及人类膀胱癌样本 | 癌症生物学 | 膀胱癌(尿路上皮癌) | 条件基因敲除、过表达、RNA测序、单细胞测序、空间转录组学 | 基因工程小鼠模型 | RNA测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 小鼠膀胱肿瘤样本及人类膀胱癌样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 1209 | 2026-05-02 |
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011665
PMID:41386973
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研究论文 | 本文研究原位DC启动疫苗联合CD137激动剂通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+T细胞应答诱导持久抗肿瘤免疫 | 首次揭示原位疫苗与CD137激动剂联合治疗通过cDC1细胞依赖性增强肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞应答,并实现Treg细胞功能重塑以减轻免疫抑制 | 研究局限于小鼠移植瘤模型,未验证在人类肿瘤微环境中的疗效及长期安全性 | 评估原位DC启动疫苗联合CD137激动剂在肺癌和结肠癌小鼠模型中的治疗潜力及免疫机制 | 肺癌和结肠癌小鼠移植瘤模型 | 免疫学 | 肺癌, 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 植入性小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1210 | 2026-05-02 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to attenuate cortical excitability during TDP-43-related neurodegeneration
2025-Dec-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.016
PMID:40975067
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研究论文 | 该论文揭示了在TDP-43相关神经退行性变中,杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用来减弱皮质过度兴奋 | 首次发现杆状小胶质细胞亚群及其在神经退行性变中通过重塑兴奋性突触输入来保护神经元的机制,并阐明了TREM2在其中的关键作用 | 具体局限性未在摘要中提及 | 研究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性变中调控皮质兴奋性的作用 | rNLS8转基因小鼠模型中的小胶质细胞和神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 多通道探针记录、纵向体内钙成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、钙成像数据、基因表达数据 | rNLS8小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 1211 | 2026-05-02 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
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研究论文 | 使用BARseq高通量原位测序技术,对小鼠大脑皮层1030万个细胞进行基因表达分析,揭示皮层区域身份与转录组特征的关系 | 首次利用大规模原位测序技术BARseq在单细胞分辨率下揭示皮层区域身份与转录组类型组成高度相关,并发现外周输入可调控区域内转录组身份 | 仅检测了104个细胞类型标记基因,未覆盖全转录组;研究仅针对小鼠模型,需进一步验证在其他物种中的适用性 | 探究大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中,以及这些特征在发育中如何建立 | 小鼠大脑皮层九个半球中的4194658个皮层神经元 | 数字病理学 | NA | 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 1030万个细胞,包含9个小鼠前脑半球 | NA | 单细胞RNA测序 | BARseq | BARseq高通量原位测序技术 |
| 1212 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: Advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1213 | 2026-05-02 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis through Inhibition of Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9-Mediated Low-density Lipoprotein Receptor Degradation
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 通过抑制PCSK9介导的低密度脂蛋白受体降解,靶向肝脏Epsins可改善动脉粥样硬化中的血脂异常 | 首次揭示肝脏Epsins通过其泛素相互作用基序(UIM)与LDLR结合,促进PCSK9介导的LDLR降解,从而加剧动脉粥样硬化,并提出了靶向Epsins的纳米颗粒siRNA疗法 | 主要基于小鼠模型,未在人体中验证疗效;长期安全性和副作用需进一步研究 | 探究肝脏Epsins是否及如何通过调节PCSK9介导的LDLR内吞和降解,影响LDL-C清除和动脉粥样硬化进程 | 肝脏特异性Epsin敲除的动脉粥样硬化小鼠模型(ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导) | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型:ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导的肝脏特异性Epsin敲除小鼠,西方饮食喂养 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1214 | 2026-05-02 |
Simulating paired and longitudinal single-cell RNA sequencing data with rescueSim
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf442
PMID:40811017
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研究论文 | 介绍一种模拟配对和纵向单细胞RNA测序数据的新方法rescueSim | 首次在gamma-Poisson框架中引入样本间和受试者间变异性,实现对配对/纵向scRNA-seq数据的模拟 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够模拟配对/纵向scRNA-seq数据的方法,支持研究规划和功效分析 | 单细胞RNA测序数据中的时间依赖性转录组变化 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq模拟 | gamma-Poisson框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1215 | 2026-05-02 |
Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs
2025-07-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205
PMID:40209410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序探索孕期氟氯氰菊酯暴露对子代神经发育毒性的影响,揭示神经干细胞命运决定的关键作用 | 首次构建了孕期氟氯氰菊酯暴露后子代大脑海马区的单细胞图谱,并通过体内外实验验证了神经干细胞分化方向、增殖和凋亡水平改变是毒性主因 | NA | 阐明孕期氟氯氰菊酯暴露导致子代神经发育毒性的机制 | 不同年龄段的子代大鼠(新生儿、幼年等)及其海马组织 | 机器学习 | 神经发育毒性 | 单细胞RNA测序、差异表达分析、细胞间通讯分析、拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生儿大鼠海马组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1216 | 2026-05-02 |
Elucidating brain transport pathways and cell type-dependent gene silencing of a durable lipid-siRNA conjugate administered into cerebrospinal fluid
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf600
PMID:40598893
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研究论文 | 本研究开发了一种脂质-siRNA偶联物(L2-siRNA),注入脑脊液后可有效运输至大脑,实现区域性和细胞类型依赖的基因沉默 | 首次详细阐述了脂质-siRNA偶联物在脑脊液到大脑转运中的特性,展示了单次注射后长达5个月的持续基因沉默效果,并通过单细胞RNA测序构建了细胞类型特异性敲除图谱 | 未提供 | 阐明脂质-siRNA偶联物通过脑脊液给药后的大脑运输途径和细胞类型依赖性基因沉默机制 | 小鼠和大鼠的大脑组织及细胞 | 机器学习 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 测序数据 | 小鼠和大鼠样本 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 1217 | 2026-05-02 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2025-Jun, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003193
PMID:40554460
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,构建小鼠卵巢排卵过程中的时空图谱,揭示卵巢细胞类型的时间依赖性转录状态和空间分布 | 首次在单细胞分辨率下详细描述排卵的精确时间窗口,并结合空间转录组学提供细胞类型的空间定位信息,同时发现新的配体-受体互作对 | 该研究仅基于小鼠模型,人类排卵机制可能存在差异,且细胞互作分析需进一步验证 | 揭示小鼠卵巢排卵过程中细胞类型的时空动态变化及其调控机制 | 小鼠卵巢细胞(包括卵母细胞、颗粒细胞、基质细胞等) | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的小鼠卵巢配对样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1218 | 2026-05-02 |
scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia
2025-05-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97958
PMID:40371706
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示支持细胞通过阶段特异性通讯介导非阻塞性无精子症的生殖障碍 | 首次在非阻塞性无精子症中鉴定出三种新型支持细胞亚型表型(SC4/未成熟、SC7/成熟、SC8/进一步成熟),并发现生殖细胞亚型与支持细胞亚型之间的阶段特异性匹配交互模式,由Notch1/2/3信号通路调控 | NA | 探究非阻塞性无精子症中生殖障碍的细胞类型特异性异常机制 | 阻塞性无精子症和非阻塞性无精子症患者的睾丸组织 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1219 | 2026-05-02 |
Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401475R
PMID:40270323
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素A4/FPR2信号通过NRF2依赖通路减轻肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次揭示脂氧素A4通过FPR2/NRF2通路特异性抑制肺泡上皮细胞铁死亡,从而保护肺移植后缺血再灌注损伤的分子机制 | 主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床验证尚有限;未深入探讨FPR2下游其他潜在信号通路 | 阐明脂氧素A4在肺缺血再灌注损伤中通过NRF2依赖途径抑制铁死亡的保护机制 | 肺移植患者术后肺组织、C57BL/6小鼠(野生型、Fpr2敲除、Nrf2敲除)、肺泡II型上皮细胞(ATII) | 分子生物学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、脂质组学数据 | 肺移植患者样本(具体数量未说明)、小鼠(野生型、Fpr2敲除、Nrf2敲除)、体外ATII细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1220 | 2026-05-02 |
Impdh1 was identified as a key protein promotes diabetic vasculopathy by intervention of vascular endothelial cell pyroptosis
2025-03-13, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04604-z
PMID:40082765
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研究论文 | 通过scRNA-seq和bulk RNA-seq分析,鉴定Impdh1为关键蛋白,通过干预血管内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序联合分析,鉴定Impdh1为与糖尿病血管病变相关的焦亡关键分子,并验证其在血管内皮细胞焦亡中的保护作用 | 未明确提及临床验证,且样本来源于小鼠模型和公共数据集,可能不完全代表人体病理过程 | 探索糖尿病血管病变中血管内皮细胞焦亡的分子机制及关键蛋白Impdh1的作用 | 糖尿病小鼠模型及GSE169332数据集中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病血管病变 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量逆转录PCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | GSE169332数据集(scRNA-seq数据)及糖尿病小鼠主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |