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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1201 | 2025-09-18 |
Author Correction: Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2025-Sep-16, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02077-z
PMID:40958041
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1202 | 2025-10-05 |
5-FU Resistance Facilitates Immune Evasion in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through ADAM10-Mediated PD-L1 Shedding and Tumour Microenvironment Remodelling
2025-Sep-16, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70038
PMID:40958168
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研究论文 | 本研究揭示了5-FU耐药通过ADAM10介导的PD-L1脱落和肿瘤微环境重塑促进食管鳞状细胞癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现5-FU耐药通过上调ADAM10促进可溶性PD-L1释放,从而驱动免疫抑制和肿瘤微环境重塑 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,需要进一步临床验证 | 探索5-FU耐药在食管鳞状细胞癌中促进免疫逃逸的分子机制 | 5-FU耐药的AKR小鼠食管鳞状细胞癌细胞系及其亲代细胞系 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 第三代DNA测序,蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | 异种移植模型 | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 5-FU耐药和亲代AKR小鼠ESCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1203 | 2025-10-05 |
Spatial Crosstalk Modeling of the Tumor Microenvironment Identifies CCR5-Mediated Glia-to-Glia Signaling as a Key Regulator of Brain Metastatic Progression
2025-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0237
PMID:40960488
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了脑转移微环境中胶质细胞间信号传导机制,并发现靶向CCR5可有效抑制脑转移进展 | 首次系统揭示胶质细胞间特异性信号传导网络在脑转移中的作用,并验证FDA批准药物maraviroc通过靶向CCL4-CCR5信号轴治疗脑转移的新策略 | 未明确说明研究样本的具体数量及动物模型类型 | 探究脑转移微环境中胶质细胞间信号传导机制及其在肿瘤进展中的作用 | 星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞在脑转移不同阶段的转录组特征 | 空间转录组学 | 脑转移瘤 | RNA测序, 空间转录组学, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1204 | 2025-10-05 |
Depleting IL1R2+ Tumor-Infiltrating Regulatory T Cells with an ADCC-Prone Nanobody Construct Boosts the Efficacy of Anti-PD1 Immunotherapy
2025-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3095
PMID:40960523
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研究论文 | 本研究开发了一种ADCC倾向性纳米抗体构建体,可特异性清除肿瘤浸润调节性T细胞,增强抗PD1免疫治疗效果 | 首次发现IL1R2可作为高度活化抑制性tiTregs的表面标志物,并开发了ADCC优化的纳米抗体特异性清除这些细胞 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类数据集,需要进一步临床验证 | 开发特异性靶向肿瘤浸润调节性T细胞的方法以增强免疫治疗效果 | 三阴性乳腺癌和结直肠癌小鼠模型及人类数据集中的肿瘤浸润调节性T细胞 | 免疫治疗 | 三阴性乳腺癌,结直肠癌 | CITE-seq,单细胞RNA测序,ADCC技术 | NA | 单细胞测序数据,元分析数据 | 小鼠模型和人类TNBC/CRC数据集 | NA | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | NA |
1205 | 2025-10-05 |
Robust and adaptive non-parametric tests for detecting general distributional shifts in gene expression
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101147
PMID:40902592
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研究论文 | 提出一种名为QRscore的非参数统计框架,用于检测基因表达中的分布变化 | 扩展Mann-Whitney检验,通过负二项和零膨胀负二项分布推导模型权重,能同时检测均值和方差变化 | NA | 开发能检测基因表达中一般分布变化的统计方法 | 基因表达数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | 非参数统计模型,负二项分布,零膨胀负二项分布 | 基因表达数据 | GTEx项目和大亚洲免疫多样性图谱(AIDA)数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
1206 | 2025-10-05 |
Biomarker Analysis and Treatment Dynamics Following Preoperative Ipilimumab plus Nivolumab in Locally Advanced Urothelial Cancer from the Phase IB NABUCCO Study
2025-Sep-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0419
PMID:40489082
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研究论文 | 本研究通过分析NABUCCO IB期临床试验数据,探索了局部晚期尿路上皮癌患者术前使用伊匹单抗联合纳武利尤单抗治疗的生物标志物和肿瘤微环境动态变化 | 首次在局部晚期尿路上皮癌中系统分析伊匹单抗联合纳武利尤单抗治疗的生物标志物,并通过单细胞RNA测序发现TCF7+CD8+ T细胞在治疗应答者肿瘤微环境中的积累 | 样本量有限(特别是单细胞RNA测序仅分析了两名应答者),需要更大规模研究验证发现 | 探索伊匹单抗联合纳武利尤单抗在局部晚期尿路上皮癌中的应答生物标志物和肿瘤微环境治疗动态 | III期尿路上皮癌患者 | 癌症免疫治疗 | 尿路上皮癌 | PD-L1免疫组化, 全外显子测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | PD-L1 IHC分析51例, 测序分析53例, CD8+ T细胞分析51例基线样本和42例膀胱切除样本, scRNA-seq分析2例应答者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 转录组测序 | NA | NA |
1207 | 2025-10-05 |
Spatial dissimilarity analysis in single-cell transcriptomics
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101141
PMID:40840441
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研究论文 | 开发空间差异分析方法用于揭示单细胞和空间转录组数据中的复杂双变量关系 | 提出空间差异分析方法,能够检测选择性剪接和等位基因特异性表达,在神经元和肿瘤细胞分析中展现出比现有工具更高的准确性和灵敏度 | NA | 开发分析单细胞和空间转录组数据的新方法,揭示细胞异质性和基因表达动态 | 神经元、肿瘤细胞、人类细胞图谱中的正常细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1208 | 2025-10-05 |
Cellular cholesterol metabolism rewiring through SREBP2-LXR-mTOR signaling convergence orchestrates T cell fate and keratinocyte apoptosis in oral lichen planus
2025-Sep-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115457
PMID:40957169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台验证揭示了口腔扁平苔藓中T细胞胆固醇代谢失调通过SREBP2-LXR-mTOR信号轴调控T细胞命运和角质形成细胞凋亡的机制 | 首次发现OLP中T细胞胆固醇代谢异常通过SREBP2-LXR轴失衡和mTOR-SREBP2双向串扰驱动疾病进展 | 研究主要基于体外细胞实验,需要更多体内实验验证;样本量有限 | 探究T细胞胆固醇代谢在口腔扁平苔藓发病机制中的作用 | 口腔扁平苔藓患者T细胞、Jurkat T细胞系、角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 流式细胞术, PCR, 免疫共沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1209 | 2025-10-05 |
Comparison of single-cell RNA-seq methods to enable transcriptome profiling of neutrophils in clinical samples
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101173
PMID:40957400
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研究论文 | 比较三种单细胞RNA测序方法在临床样本中性粒细胞转录组分析中的性能 | 首次系统评估10× Genomics、PARSE Biosciences和HIVE三种平台在临床样本中性粒细胞scRNA-seq分析中的表现 | 仅评估了三种特定平台,可能不适用于其他单细胞测序技术 | 建立临床样本中性粒细胞可靠的scRNA-seq工作流程 | 人血液来源的中性粒细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Biotechnologies | 单细胞RNA-seq | NA | 10× Genomics、PARSE Biosciences和HIVE单细胞RNA测序平台 |
1210 | 2025-10-05 |
Single-cell multiome and spatial profiling reveals pancreas cell type-specific gene regulatory programs of type 1 diabetes progression
2025-Sep-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady0080
PMID:40929272
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研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学分析揭示1型糖尿病进展过程中胰腺细胞类型特异性基因调控程序 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术,系统分析1型糖尿病进展过程中胰腺细胞类型特异性调控程序,揭示表观遗传驱动因素和细胞间信号变化 | 样本数量相对有限(最多32名供者),主要关注胰腺组织,未涉及其他可能相关的组织或器官 | 阐明1型糖尿病在胰腺中的细胞类型特异性调控机制和疾病进展过程 | 非糖尿病患者、自身抗体阳性个体和1型糖尿病患者的胰腺组织 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、空间转录组数据 | 32名供者(包括非糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病患者),853,005个细胞 | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
1211 | 2025-10-05 |
Restoring mitochondrial quantity and quality to reverse the Warburg effect and drive neuroblastoma differentiation
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502483122
PMID:40911595
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研究论文 | 本研究通过恢复线粒体功能来逆转Warburg效应并驱动神经母细胞瘤分化 | 首次联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂协同恢复线粒体功能,建立以线粒体为中心的治疗策略诱导肿瘤分化 | 研究主要基于神经母细胞瘤模型,在其他肿瘤类型中的适用性需进一步验证 | 探索恢复肿瘤中线粒体数量和质量是否能驱动肿瘤分化 | 神经母细胞瘤 | 癌症研究 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 原位神经母细胞瘤异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1212 | 2025-10-05 |
Tumor-expressed GPNMB orchestrates Siglec-9+ TAM polarization and EMT to promote metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503081122
PMID:40892920
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤表达的GPNMB通过调控Siglec-9+ TAM极化和上皮间质转化促进三阴性乳腺癌转移的分子机制 | 首次发现GPNMB通过前馈放大环路促进单核细胞向TAM极化,并阐明不同糖基化形式的GPNMB差异识别Siglec-9的机制 | 研究主要基于体外共培养和小鼠模型,人体内验证仍需进一步研究 | 探究GPNMB在三阴性乳腺癌转移中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、单核细胞 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、体外共培养、bulk RNA-seq、去卷积分析 | NA | 基因表达数据 | 来自公共数据库的三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1213 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Validation of Myelin Water Fraction as a Myelin-Specific MRI Biomarker
2025-Sep-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.27.25334582
PMID:40950466
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研究论文 | 通过多组学方法验证髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的有效性 | 首次将高级MRI方法与高通量血浆蛋白质组学和空间转录组学整合,验证MWF的生物学特异性 | 研究仅针对成人主要白质和深部灰质区域,样本来源和数量有限 | 验证髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的生物学相关性 | 成人主要白质和深部灰质区域 | 神经影像学 | 神经系统疾病 | BMC-mcDESPOT成像、血浆蛋白质组学、空间转录组学 | 贝叶斯蒙特卡洛分析 | MRI图像、蛋白质组数据、基因表达数据 | NA | SomaLogic, Allen Institute | 血浆蛋白质组学、空间转录组学 | SomaScan 7k, Allen Human Brain Atlas | SomaScan 7k蛋白质组分析平台、Allen人脑图谱空间基因表达数据 |
1214 | 2025-10-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Solid Tumors and Sarcomas: Heterogeneity, Function, and Therapeutic Implications
2025-Sep-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171398
PMID:40940809
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综述 | 本文系统探讨了实体瘤和肉瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、功能及治疗意义 | 首次系统比较了上皮性肿瘤与肉瘤中CAF的异同,提出了CAF分型在肉瘤中的身份界定难题 | 肉瘤中CAF研究相对不足,恶性与非恶性成纤维细胞界限模糊 | 探索CAF在不同肿瘤类型中的异质性、可塑性及其治疗靶向策略 | 癌症相关成纤维细胞(CAF)及其在实体瘤和肉瘤中的亚型 | 肿瘤微环境研究 | 实体瘤和肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1215 | 2025-10-05 |
Analysis of Microarray and Single-Cell RNA-Seq Finds Gene Co-Expression and Tumor Environment Associated with Extracellular Matrix in Epithelial-Mesenchymal Transition in Prostate Cancer
2025-Sep-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178575
PMID:40943497
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研究论文 | 通过分析微阵列和单细胞RNA测序数据,研究前列腺癌上皮-间质转化中基因共表达和肿瘤微环境与细胞外基质的关系 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据重建前列腺癌EMT相关差异表达基因网络 | NA | 阐明前列腺癌EMT中差异表达基因的分子特征和通路,识别潜在生物标志物 | 前列腺癌上皮-间质转化相关基因 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
1216 | 2025-10-05 |
Inflammatory Milieu by Crosstalk between Glomerulus and Proximal Tubular Cells in Type 2 Diabetes Mellitus Kidney Disease
2025-Sep, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2024.0535
PMID:40160027
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析诱导型2型糖尿病肾病模型,揭示了肾小球与近端肾小管细胞间相互作用导致CXCL12介导的T细胞浸润机制 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于诱导型而非基因修饰的2型糖尿病肾病模型,并发现CXCL12在介导T细胞招募中的关键作用 | 研究基于动物模型,人类样本验证有限,需要进一步临床研究确认 | 探索2型糖尿病肾病中肾小球与近端肾小管细胞间的相互作用机制 | 诱导型2型糖尿病肾病小鼠模型和人类肾脏活检组织 | 单细胞测序分析 | 2型糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、组织学分析、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学图像、流式细胞数据 | 诱导型T2DKD小鼠模型和对照小鼠,人类肾脏活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1217 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell transcriptomics, molecular docking, and dynamics simulations to characterize protein kinase X-linked mechanisms in osteosarcoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147335
PMID:40907924
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、分子对接和动力学模拟,揭示了PRKX-CDC37相互作用在骨肉瘤中的机制,并发现麦角胺可作为潜在抑制剂 | 首次结合单细胞RNA测序与分子动力学模拟揭示PRKX-CDC37在骨肉瘤中的变构调控机制,并发现麦角胺作为新型抑制剂 | 研究主要基于计算模拟和体外实验,缺乏体内实验验证 | 解码PRKX的激活机制并评估其作为骨肉瘤生物标志物和治疗靶点的临床潜力 | 骨肉瘤细胞、PRKX激酶、CDC37分子 | 计算生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、siRNA敲低 | AlphaFold预测模型、分子动力学模型 | 基因表达数据、蛋白质结构数据 | GSE152048数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1218 | 2025-10-05 |
From Pathophysiology to Innovative Therapies in Eye Diseases: A Brief Overview
2025-Sep-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178496
PMID:40943417
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综述 | 本文概述了眼科疾病从病理生理学到创新疗法的进展,重点介绍分子影像技术和精准治疗方法 | 整合分子影像技术与人工智能分析,探索基因治疗、干细胞再生和靶向分子疗法在眼科疾病中的应用 | 这些技术需要进一步验证、监管批准和长期安全性评估才能应用于常规临床护理 | 探讨分子影像和精准疗法在眼科疾病诊断和治疗中的转化应用 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、青光眼和葡萄膜炎等致盲性眼病 | 数字病理 | 眼科疾病 | 光学相干断层扫描、OCT血管成像、MALDI-MSI、空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、机器学习 | 机器学习 | 影像数据、分子数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
1219 | 2025-10-05 |
Comprehensive analysis of a lipid metabolism-related gene signature for ulcerative colitis
2025-Aug-31, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-161
PMID:40949920
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研究论文 | 本研究通过综合分析脂质代谢相关基因特征,开发溃疡性结肠炎的新型诊断工具 | 首次整合差异表达分析、WGCNA和机器学习方法识别UC相关的关键脂质代谢基因,并利用单细胞RNA测序验证基因表达 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别溃疡性结肠炎诊断和治疗的有效生物标志物,阐明脂质代谢在UC发病机制中的分子机制 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照者的组织和血液样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 差异表达分析, WGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的UC患者和健康对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1220 | 2025-10-05 |
Identification of metabolic driver genes and targeted drug screening for lung adenocarcinoma metastasis at the single-cell resolution
2025-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-484
PMID:40950658
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺腺癌转移的代谢驱动基因,并构建预后风险模型进行靶向药物筛选 | 首次在单细胞分辨率下系统识别肺腺癌转移的代谢驱动基因,并基于此开发预后风险模型和筛选靶向药物 | 研究主要基于计算分析,实验验证相对有限,需要更多临床前和临床研究进一步验证 | 解析肺腺癌转移过程中的代谢驱动机制,优化预后预测并筛选特异性靶向药物 | 肺腺癌肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |