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当前共找到 39637 篇文献,本页显示第 1201 - 1220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1201 2026-05-08
MatriSpace: Identification and visualization of spatially resolved ECM gene expression patterns in health and disease
2026-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍了一个名为MatriSpace的计算框架,用于识别和可视化健康与疾病中空间分辨的细胞外基质基因表达模式 开发了一个专门针对ECM基因的空间转录组数据挖掘框架,提供两种操作模式(用户上传数据集或探索公共数据集),并能从单基因到组织微环境和功能ECM单元等多个层面生成空间分辨的基因表达图谱 论文未明确说明限制,但可能包括对数据质量或计算资源的依赖 利用空间转录组学识别不同细胞群体对ECM生产的空间贡献,并用于治疗目的 健康与疾病样本中的细胞外基质基因表达模式 计算生物学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1202 2026-05-08
Integrative multi-omics analysis identifies key ubiquitination regulators in prostate cancer
2026-Apr-28, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和GWAS数据,识别并验证了前列腺癌中关键泛素化调控基因POLI和TRIM8的因果作用和生物学功能 首次通过整合scRNA-seq和GWAS数据的多组学分析方法,系统性地鉴定前列腺癌中与泛素化过程相关的关键因果基因,并通过体内外实验验证TRIM8的抑癌功能 泛素化相关基因的筛选局限于已有的基因集合,且主要依赖生物信息学分析,部分结果需要更大样本量的临床队列验证 识别前列腺癌中泛素化关键调控基因并验证其多层次的生物学作用 前列腺癌患者的组织样本和细胞系 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序、全基因组关联分析、孟德尔随机化、免疫组化、Western blot、qPCR、分子对接 NA 基因表达数据、GWAS数据 30例前列腺癌组织样本(按Gleason分级),细胞系包括22Rv1、LNCaP、PC-3和RWPE-1 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1203 2026-05-08
Fibroblast signaling influences macrophage-dependent, biomaterial-induced tissue remodeling
2026-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 揭示纳米纤维-水凝胶复合材料诱导软组织重塑的机制,证明该过程由成纤维细胞与巨噬细胞之间的信号交流驱动,且炎症信号持续升高 挑战了传统认为炎症抑制重塑的观点,发现促炎和抗炎信号在长期过程中均持续升高;通过单细胞RNA测序鉴定出重塑微环境中的独特 ⁺ 巨噬细胞和 ⁺ 成纤维细胞,并揭示成纤维细胞向巨噬细胞的信号传导模式 未明确提及局限性 探究生物材料诱导组织重塑的免疫机制,特别是成纤维细胞与巨噬细胞间的关键相互作用 小鼠模型(巨噬细胞耗竭实验)及纳米纤维-水凝胶复合材料 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠(具体样本量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1204 2026-05-08
A transcriptomic-driven segmentation and cell simulation framework for high-resolution spatial transcriptomics and cell-cell communication
2026-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种基于转录组驱动的细胞分割与模拟框架TENGU,用于高分辨率空间转录组学及细胞间通讯分析 采用转录信号优先的细胞分割方法,优先利用转录信号密度而非组织学图像定义细胞边界,并引入基于转录组的细胞模拟算法优化边界,有效减少空间扩散并保留分子特征 可能对低转录信号区域或极端组织类型(如完全矿化组织)的适用性需进一步验证,且计算资源需求较高 解决高细胞密度、炎症或矿化组织中传统图像依赖分割导致的转录信号渗漏和聚类不准确问题 小鼠大脑、小鼠骨髓炎模型以及人结直肠癌异种移植样本 计算生物学 肿瘤疾病、骨骼感染 空间转录组学 细胞模拟算法 空间基因表达数据 小鼠大脑、小鼠骨髓炎模型及人结直肠癌异种移植样本(具体数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD NA
1205 2026-05-08
Systems Biology Identifies TARS2 as a Cardiomyocyte Regulator of Mitochondrial Oxidative Stress in Dilated Cardiomyopathy
2026-Apr-27, JACC. Basic to translational science
研究论文 通过系统生物学方法整合转录组学和机器学习,发现TARS2是扩张型心肌病中心肌细胞线粒体氧化应激的关键调控因子 首次识别TARS2作为心肌细胞富集的线粒体氧化应激调控因子,并建立基于系统生物学的心血管疾病靶点发现框架 未提及具体局限性 阐明扩张型心肌病中线粒体氧化应激的分子驱动机制 扩张型心肌病患者心脏组织及心肌细胞 机器学习 心血管疾病 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 机器学习模型 转录组数据 人类扩张型心肌病心脏样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞基因表达分析, 10x Visium空间转录组学
1206 2026-05-08
Fusobacterium nucleatum-Derived Outer Membrane Vesicles Disrupt Epithelial Barrier in Oral Lichen Planus via JNK/c-JUN Mediated Claudin-4 Downregulation
2026-Apr-27, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 该研究揭示了具核梭杆菌外膜囊泡通过JNK/c-JUN介导的Claudin-4下调破坏口腔扁平苔藓上皮屏障的机制 首次发现具核梭杆菌外膜囊泡通过激活JNK/c-JUN信号通路下调Claudin-4表达,导致口腔扁平苔藓上皮屏障功能障碍,为微生物驱动口腔扁平苔藓发病机制提供新见解 尚未在其他细胞类型或体内模型中验证该机制,且FLN-OMVs的具体成分及作用方式需进一步探索 探究具核梭杆菌外膜囊泡在口腔扁平苔藓上皮屏障破坏中的作用及其分子机制 口腔扁平苔藓患者的病变组织及HaCaT角质形成细胞 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, qPCR, Western blotting, RNA测序 NA 基因表达数据, 图像数据 NA(未明确说明样本数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
1207 2026-05-08
CD47 Blockade Reprograms the Monocyte-Macrophage Axis to Promote Inflammation Resolution in Atherosclerosis
2026-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过CD47阻断重编程单核-巨噬细胞轴,促进动脉粥样硬化炎症消退 首次利用单细胞转录组学、单核细胞命运图谱和功能分析,在互补的动脉粥样硬化小鼠模型中揭示CD47阻断如何从根本上重塑已形成病变的髓系免疫景观,并鉴定出保守的TREM2+巨噬细胞亚群作为新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和回顾性人类数据分析,未在前瞻性临床试验中验证;样本量有限,需要更多人类样本验证跨物种保守性 阐明CD47阻断通过促进胞葬作用如何重塑动脉粥样硬化病变的免疫微环境 动脉粥样硬化小鼠模型中的单核细胞和巨噬细胞 自然语言处理 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 多个动脉粥样硬化小鼠模型样本及独立人类冠状动脉单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1208 2026-05-08
Identification of key genes and immune mechanisms in atrial fibrillation: An observational bioinformatics and single-cell transcriptome study
2026-Apr-24, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过生物信息学和单细胞转录组分析,鉴定心房颤动中关键基因及免疫机制 结合批量转录组与单细胞RNA测序数据,系统分析房颤免疫微环境及细胞间通讯,发现LBH等五个关键基因具有诊断潜力 基于公开数据集,缺乏实验验证;样本量有限且未考虑房颤亚型差异 探索房颤的免疫失调机制并识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点 房颤患者与健康对照的心房组织基因表达数据及单细胞转录组数据 生物信息学 心房颤动 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO回归 基因表达数据, 单细胞转录组数据 多个公开数据集,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1209 2026-05-08
PFDN5 synergizes with anti-PD1 therapy to promote triple-negative breast cancer cell death through JAK2/STAT3/c-Myc signaling axis
2026-Apr-24, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 研究PFDN5在三阴性乳腺癌中的抑癌作用及其与抗PD1治疗协同诱导肿瘤细胞死亡的分子机制 首次明确PFDN5通过JAK2/STAT3/c-Myc信号轴抑制三阴性乳腺癌进展并重塑免疫微环境,揭示其与抗PD1治疗的协同抗肿瘤效应 主要基于细胞系和小鼠模型,缺乏大规模临床样本验证;PFDN5的调控机制在人体中的复杂性尚未完全阐明 阐明PFDN5在三阴性乳腺癌进展中的功能作用及其对免疫微环境的影响 三阴性乳腺癌临床标本、细胞系以及小鼠异种移植瘤模型 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化、蛋白质芯片分析 NA 图像、文本 涉及临床标本和细胞系,具体样本量未明确,小鼠模型中使用了免疫缺陷和免疫健全小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学,结合多重免疫组化
1210 2026-05-08
The role and underlying mechanism of FABP4 dysregulation mediated by m6A modification in unexplained recurrent spontaneous abortion
2026-Apr-24, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 探讨m6A修饰介导的FABP4失调在不明原因复发性流产中的作用及其分子机制 首次揭示FABP4通过m6A表观遗传机制调控滋养细胞脂质代谢和线粒体功能,并鉴定FTO和IGF2BP3为关键调控因子,为URSA提供潜在治疗靶点 主要基于动物模型和体外细胞实验,缺乏大规模临床样本验证;具体临床转化价值需进一步研究 阐明FABP4在不明原因复发性流产发病机制中的作用及m6A修饰的调控机制 人类胎盘组织、Fabp4基因敲除小鼠模型、滋养细胞系 数字病理学 不明原因复发性流产 MeRIP-qPCR, Seahorse代谢分析, 拉曼光谱, 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型、细胞系 RNA测序数据、代谢数据 人类胎盘组织样本(URSA患者与对照组)、小鼠模型、滋养细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1211 2026-05-08
Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks
2026-Apr-23, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术绘制了鸭不同脂肪组织中脂肪祖细胞的分子图谱,揭示了不同脂肪库的特异性调控机制 首次在鸭中构建了跨脂肪库的脂肪祖细胞单细胞图谱,揭示了其分子异质性和谱系动态,并鉴定了库特异性调控因子 NA 探究鸭不同脂肪库中脂肪祖细胞的调控机制,以理解脂肪沉积差异并改善肉品质和生产效率 鸭的胸肌、皮下和内脏脂肪组织中的脂肪祖细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1212 2026-05-08
Resilience to Diabetic Retinopathy (RDR) Is Associated with a Pre-Retinopathy Transcriptional Program Induced by Diabetes
2026-Apr-21, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序研究糖尿病抵御能力获得与丧失过程中的视网膜细胞基因表达变化 首次揭示糖尿病持续时间短于引发视网膜病变时,视网膜细胞(特别是穆勒细胞)中已发生转录组重编程,且这种保护性基因表达变化与糖尿病抵御能力的获得和丧失在时间上高度一致 研究仅基于小鼠模型,且糖尿病持续时间较短(5天和15天),未涉及长期糖尿病或人类样本 定义糖尿病视网膜病变抵御能力获得与丧失过程中单个视网膜细胞的基因表达变化 雄性小鼠的视网膜细胞,包括穆勒细胞等 单细胞测序 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 糖尿病5天组、15天组及同龄非糖尿病对照组小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1213 2026-05-08
Neutrophil Heterogeneity: Molecules to Cellular Behavior
2026-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
综述 综述了中性粒细胞在分子和细胞行为层面的异质性,并探讨了单细胞RNA测序和活体成像等技术如何揭示其在健康和疾病中的功能多样性 首次系统整合单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示的中性粒细胞分子异质性,并提出活体成像技术作为连接静态分子图谱与动态细胞行为的桥梁 未提供具体实验数据支持,主要依赖现有文献综述,且对中性粒细胞异质性在不同疾病中的具体调控机制阐述有限 总结中性粒细胞异质性的分子基础及其在癌症、脓毒症和缺血性中风等疾病中的体内功能行为,并探讨活体成像技术的应用前景 中性粒细胞 自然语言处理 癌症, 脓毒症, 缺血性中风 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术, 活体成像 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1214 2026-05-08
The Hodgkin Lymphoma Microenvironment: Insights from Spatial Transcriptomics
2026-Apr-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 总结空间转录组学在经典霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境研究中的最新进展 首次系统综述空间转录组学技术在cHL微环境研究中的应用,揭示HRS细胞为中心的细胞生态位和免疫逃逸机制 未提及具体局限性,但作为综述可能依赖于现有研究数据,缺乏原始实验验证 探讨空间转录组学如何提升对cHL微环境中细胞间相互作用和空间组织的理解 经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤微环境 自然语言处理 淋巴癌 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1215 2026-05-08
Integrated Transcriptomic and Single-Cell Analyses Identify HILPDA as a Hypoxia-Mediated Regulator of Ferroptotic Signaling in Glioblastoma
2026-Apr-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组和单细胞分析,鉴定HILPDA为胶质母细胞瘤中缺氧介导的铁死亡信号调节因子 首次发现HILPDA作为缺氧与铁死亡信号之间的关键连接基因,并揭示其在胶质母细胞瘤免疫微环境中的潜在作用 主要基于转录组关联分析,缺乏功能验证实验来确认HILPDA在铁死亡调控中的直接作用 探究胶质母细胞瘤中缺氧信号与铁死亡相关基因表达谱的关系 胶质母细胞瘤肿瘤样本和单细胞数据 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA测序,单细胞RNA测序 结构方程模型 基因表达数据,单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,但使用了公开的转录组和单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
1216 2026-05-08
Prognostic Role of Uric Acid-Related Gene Signatures in Glioblastoma Multiforme: Insights from Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Apr-20, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 基于尿酸相关基因在多形性胶质母细胞瘤中构建预后风险模型,并利用批量RNA和单细胞RNA测序揭示其免疫微环境特征 首次从尿酸相关基因角度构建GBM预后模型,结合批量RNA和单细胞RNA测序揭示树突状细胞、巨噬细胞和T细胞等关键细胞亚群与尿酸基因表达的关联 未提及外部验证队列或实验验证,依赖公开数据库且样本量有限 阐明尿酸驱动机制在GBM风险分层和治疗脆弱性中的作用 TCGA和GEO数据库中的多形性胶质母细胞瘤转录组数据及单细胞数据集GSE162631 机器学习 多形性胶质母细胞瘤 RNA-seq LASSO回归 基因表达数据 TCGA和GEO数据库中的GBM样本(具体数量未提及)以及GSE162631单细胞数据集 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1217 2026-05-08
Multimodal Single-Cell Transcriptomic and Chromatin Accessibility Profiling Reveals Monocyte-Derived Macrophage Dynamics Following Ischemic Stroke
2026-Apr-20, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过单细胞转录组和染色质可及性分析揭示缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞的动态变化 鉴定出应激反应性单核细胞来源巨噬细胞(MDM)亚群,并揭示其向溶酶体富集MDM功能状态的转变轨迹 研究局限于小鼠模型和卒中后48小时时间点,人类卒中后期MDM动态变化尚未探索 解析缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞(MDM)的异质性和表型转变 小鼠大脑中的巨噬细胞谱系细胞 神经科学、单细胞组学 缺血性卒中 scRNA-seq、scATAC-seq NA 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 小鼠脑组织样本:卒中模型组和假手术对照组 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq,10x Chromium Single Cell ATAC用于scATAC-seq
1218 2026-05-08
An Integrative Network Analysis Framework for Identifying Altered Glycosylation Pathways Associated with Autism Spectrum Disorder
2026-Apr-19, Genes IF:2.8Q2
研究论文 开发整合转录组和网络分析框架研究自闭症谱系障碍中糖基化通路改变及其功能关联 首次系统性地利用转录组和网络分析框架,结合公开数据集的批量及单细胞RNA测序数据,研究自闭症中糖基化相关基因的表达变化及其与免疫和神经发育通路的互作 依赖公开数据集的可用性和质量,可能限制发现的特异性和可重复性 探究糖基化通路在自闭症谱系障碍病理生理学中的作用 自闭症谱系障碍患者脑和血液组织中的糖基化相关基因表达变化 机器学习 自闭症谱系障碍 RNA-seq NA 文本 NA NA NA NA NA
1219 2026-05-08
Spatial Dynamics Links PD-L1 and Tumor-Associated Macrophage-Enriched Niches to Immune and Mesenchymal States in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2026-Apr-18, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 探索微卫星稳定结直肠癌中PD-L1表达与肿瘤相关巨噬细胞富集微环境对免疫和间充质状态的影响 首次在微卫星稳定结直肠癌中通过空间转录组学揭示PD-L1表达与免疫激活状态及间充质主导状态之间的关联,并指出PD-L1阴性肿瘤中上皮-间充质转化相关程序在巨噬细胞富集的基质微环境中占主导地位 样本仅为254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例,属于探索性分析,且未涉及功能性验证实验 识别微卫星稳定结直肠癌中与预后相关的免疫细胞成分,并探究其与RNA表达谱及高分辨率空间转录组特征的差异 254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例的肿瘤组织 数字病理学 结直肠癌 空间转录组学, 批量RNA表达分析 NA 空间转录组数据, 批量RNA表达数据 254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于高分辨率空间基因表达分析
1220 2026-05-08
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Ectopic ACTH-Secreting Pheochromocytoma Reveals the Chromaffin Cell Origin of Ectopic Hormone Production
2026-Apr-18, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤中ACTH产生的嗜铬细胞起源 首次通过单细胞RNA测序揭示异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤中POMC阳性嗜铬细胞是ACTH的细胞来源,并发现代谢重编程和免疫调节机制 样本量较小(仅3例患者),缺乏功能验证实验,未探讨POMC表达调控机制 阐明异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤的细胞起源和分子特征 异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤患者的肿瘤组织和邻近肾上腺组织 数字病理学 内分泌肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例患者的肿瘤标本和邻近肾上腺组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
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