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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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12141 | 2024-08-04 |
Ehmt2 inactivation in pancreatic epithelial cells shapes the transcriptional landscape and inflammation response of the whole pancreas
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1412767
PMID:38948355
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研究论文 | 本研究探讨了Ehmt2在胰腺细胞中的失活如何影响整个胰腺的转录谱和炎症反应 | 揭示了Ehmt2在维护器官免受炎症影响中的重要作用,并展示了其对胰腺癌起始和炎症相关疾病的调控机制 | 未具体说明样本数量和特定实验条件的限制 | 研究Ehmt2在胰腺细胞中的作用及其对转录和炎症反应的影响 | 条件性缺失的胰腺外分泌上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 来自条件性缺失动物的正常和年轻成人胰腺组织的比较研究 |
12142 | 2024-08-05 |
Deciphering the Underlying Mechanisms of Sanleng-Ezhu for the Treatment of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Based on Network Pharmacology and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
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研究论文 | 本文揭示了三棱-莪术对特发性肺纤维化的治疗机制 | 首次利用网络药理学和单细胞RNA测序数据探索了三棱-莪术的作用机制,并确定了其影响的细胞类型和信号通路 | 未进行长期临床试验以验证三棱-莪术的疗效和安全性 | 探究三棱-莪术在特发性肺纤维化治疗中的潜在机制 | 特发性肺纤维化相关基因及生物活性成分 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | LC-MS/MS和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | GSE53845数据集中有1907个差异表达基因 |
12143 | 2024-08-04 |
Artificial intelligence-based pathology as a biomarker of sensitivity to atezolizumab-bevacizumab in patients with hepatocellular carcinoma: a multicentre retrospective study
2023-12, The Lancet. Oncology
DOI:10.1016/S1470-2045(23)00468-0
PMID:37951222
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研究论文 | 本研究开发了一种人工智能模型,以直接从组织切片中估计ABRS表达,并评估其与无进展生存期的相关性。 | 采用人工智能技术分析肝细胞癌数字切片作为无进展生存期的生物标志物,提供了新的治疗策略。 | 本研究为回顾性研究,可能会受到样本选择偏差的影响。 | 研究旨在开发一种人工智能模型来估计肝细胞癌患者对治疗的反应。 | 研究对象为接受了手术切除及活检的肝细胞癌患者。 | 数字病理学 | 肝癌 | 分子生物学分析,空间转录组学 | 聚类约束的注意力多实例学习模型(CLAM) | 组织切片图像 | 840名患者 |
12144 | 2024-08-05 |
Inflammatory Activity of Epithelial Stem Cell Variants from Cystic Fibrosis Lungs Is Not Resolved by CFTR Modulators
2023-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202305-0818OC
PMID:37695863
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研究论文 | 这篇文章探讨了囊性纤维化(CF)肺部上皮干细胞变体的炎症活性,并评估了CFTR调节剂的影响 | 首次识别了CF肺部的三种促炎干细胞变体,并证明CFTR调节剂未能抑制其促炎功能 | 研究仅限于终末期CF患者的样本,结果可能不适用于早期CF患者 | 确定CF肺部是否存在与正常肺干细胞不同的促病干细胞变体 | 研究CF患者的终末期肺部干细胞,重点关注促炎性变体 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序、RNA测序、异种移植 | NA | 组织样本 | 四名接受治疗的囊性纤维化患者 |
12145 | 2024-08-04 |
N4-acetylcytidine of Nop2 mRNA is required for the transition of morula-to-blastocyst
2023-Sep-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04955-w
PMID:37768430
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研究论文 | 本研究探讨了Nop2 mRNA的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的作用 | 首次揭示了NAT10介导的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠前植入期胚胎中对mRNA稳定性和翻译效率的重要性 | 研究主要集中在小鼠胚胎中,结果可能无法直接推广到其他哺乳动物 | 旨在了解N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的功能 | 小鼠早期胚胎,包括缺乏NAT10的小鼠胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, RNA-seq, 乙酰化RNA免疫沉淀结合PCR(acRIP-PCR) | NA | NA | NA |
12146 | 2024-08-05 |
Stem cell antigen-1+cell-derived fibroblasts are crucial for cardiac fibrosis during heart failure
2023-Sep-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04957-8
PMID:37740736
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研究论文 | 本研究探讨了干细胞抗原-1+细胞来源的成纤维细胞在心力衰竭中的关键作用 | 揭示了非骨髓来源的Sca1+细胞通过Wnt4-PDGFRα通路转化为成纤维细胞并促进心脏纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能在应用到人类时存在差异 | 探讨干细胞在心力衰竭中的作用及机制 | 小鼠和人类心脏中的干细胞抗原-1+细胞及其转化的成纤维细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠的非心肌细胞和人类心力衰竭患者的样本 |
12147 | 2024-08-05 |
CNS Repopulation by Hematopoietic-Derived Microglia-Like Cells Corrects Progranulin deficiency
2023-Sep-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3263412/v1
PMID:37790525
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研究论文 | 这篇文章探讨了通过造血干细胞移植来纠正Progranulin缺乏症的方法 | 提出了一种基于Busulfan和 PLX3397的高效条件处理方案,以增强微胶质细胞的再生 | 尚未提及该方法在临床应用中的具体限制 | 研究造血干细胞移植在CNS中替代微胶质细胞的能力 | 主要研究对象为骨髓来源的微胶质细胞及其在小鼠模型中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和高维CyTOF质谱细胞计数 | NA | 细胞 | 小鼠模型,具体样本大小未详细说明 |
12148 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-Jul-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.003
PMID:37257452
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研究论文 | 本文探讨了心脏骤停后患者的单细胞转录组特征及其与神经预后不良的联系 | 首次在单细胞水平上揭示心脏骤停后超急性细胞因子和免疫检查点轴 | 样本量可能有限,可能影响研究结果的广泛适用性 | 研究心脏骤停后系统性炎症反应与神经损伤之间的关系 | 心脏骤停患者的单细胞免疫网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 心脏骤停患者的外周血细胞 |
12149 | 2024-08-05 |
The meningeal transcriptional response to traumatic brain injury and aging
2023-01-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81154
PMID:36594818
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研究论文 | 本研究利用高通量RNA测序技术探讨了脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 | 该研究揭示了年轻和衰老小鼠在轻微脑损伤后的脑膜转录组动态变化 | 研究对脑膜生物学的基本认识仍然不足 | 探讨脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 | 研究对象为年轻和衰老小鼠的脑膜 | 数字病理学 | 神经疾病 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 年轻小鼠和衰老小鼠 |
12150 | 2024-08-05 |
TSEE: an elastic embedding method to visualize the dynamic gene expression patterns of time series single-cell RNA sequencing data
2019-Apr-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-019-5477-8
PMID:30967106
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研究论文 | 提出了一种利用弹性嵌入方法可视化时间序列单细胞RNA测序数据的算法 | 开发了时间序列弹性嵌入(TSEE)算法,通过整合实验时间信息来增强对时间序列scRNA-seq数据的可视化 | NA | 旨在开发一种算法以可视化时间序列单细胞RNA测序数据 | 时间序列单细胞RNA测序数据,主要用于人类和斑马鱼的发育过程 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 弹性嵌入(EE) | 时间序列数据 | NA |
12151 | 2024-08-05 |
Cerebral organoids at the air-liquid interface generate diverse nerve tracts with functional output
2019-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0350-2
PMID:30886407
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研究论文 | 本文探讨了大脑类器官在气液界面培养条件下的神经轨迹形成及其功能输出 | 通过气液界面培养,显著提高了神经元存活率和轴突生长,显示出不同的神经轨迹形态及功能 | 研究未提及样本数量的限制或长期功能观察 | 旨在改善对人脑发育和神经疾病的理解 | 研究对象为大脑类器官及其形成的神经网络 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
12152 | 2024-08-05 |
A diffusion-based microfluidic device for single-cell RNA-seq
2019-03-27, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c8lc00967h
PMID:30815639
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散的微流体设备,用于单细胞RNA测序 | 提出的MID-RNA-seq设备通过扩散试剂交换方案简化了单细胞RNA测序的执行 | NA | 开发一个低输入、高效率的单细胞RNA测序平台 | 单细胞样本的转录组研究 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |
12153 | 2024-08-05 |
Human beta cells generated from pluripotent stem cells or cellular reprogramming for curing diabetes
2019-Mar, Regenerative engineering and translational medicine
IF:2.2Q3
DOI:10.1007/s40883-018-0082-y
PMID:30984818
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评论 | 本文探讨了使用人类β细胞治疗和治愈糖尿病的方法 | 提出了通过人类多能干细胞定向分化和细胞重编程生成功能性β细胞的新方法 | 依赖于发现有效的转录因子组合,该过程可能存在挑战 | 研究糖尿病治疗中β细胞的生成 | 人类β细胞及其在糖尿病治疗中的应用 | 干细胞工程 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
12154 | 2024-08-05 |
scRNA-Seq reveals distinct stem cell populations that drive hair cell regeneration after loss of Fgf and Notch signaling
2019-01-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.44431
PMID:30681411
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研究论文 | 该文章通过scRNA-Seq研究支持细胞如何驱动毛细胞再生 | 揭示了五种不同的支持细胞类型及其在毛细胞分化中的基因调控网络 | 缺乏对哺乳动物毛细胞再生过程中的具体因素的详细探讨 | 研究支持细胞向毛细胞分化的机制 | 斑马鱼的毛细胞及其支持细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA |
12155 | 2024-08-05 |
The subiculum is a patchwork of discrete subregions
2018-10-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.37701
PMID:30375971
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠次皮质中锥体细胞的异质性及其组织原则 | 本研究发现次皮质的锥体细胞可以分解为八个独立的亚类,并呈现出复杂的层级和柱状组织 | 本文主要基于小鼠模型,结果可能不适用于其他物种或不同的生理条件 | 研究小鼠次皮质内锥体细胞的异质性及其组织结构 | 小鼠的次皮质锥体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
12156 | 2024-08-05 |
Evolution of multiple cell clones over a 29-year period of a CLL patient
2016-12-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms13765
PMID:27982015
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研究论文 | 本文研究了一名慢性淋巴细胞白血病患者29年的细胞克隆演化过程 | 首次通过单核苷酸多态性微阵列分析揭示了病程中细胞克隆的演变及其对治疗的反应 | 仅基于单个患者的数据,样本代表性有限 | 探讨慢性淋巴细胞白血病的细胞克隆演化及其在治疗中的变化 | 一名慢性淋巴细胞白血病患者及其细胞克隆的演化 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 1名患者的多次样本 |
12157 | 2024-08-05 |
Exploring the Pathogenesis of Autoimmune Liver Diseases from the Heterogeneity of Target Cells
2024-Jul-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00531
PMID:38993508
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review | 本综述探讨了靶细胞异质性对自身免疫性肝病病因学的影响 | 提出了靶细胞的异质性为自身免疫性肝病的病因学提供了新的见解 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果 | 研究自身免疫性肝病的病因机制及潜在治疗策略 | 主要关注肝细胞和胆管细胞的异质性 | 数字病理学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
12158 | 2024-08-05 |
Myeloid-T cell interplay and cell state transitions associated with checkpoint inhibitor response in melanoma
2024-Jul-12, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.03.015
PMID:38593812
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研究论文 | 该文章探讨了黑色素瘤中髓系细胞与T细胞之间的相互作用及其在检查点抑制剂反应中的细胞状态转变 | 揭示了检查点抑制剂反应前肿瘤免疫微环境的特征,提出通过调节髓系细胞和效应细胞的相互作用以改善免疫治疗反应的可能性 | 研究主要限于22名阶段III-IV转移性黑色素瘤患者,样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探讨免疫治疗前肿瘤微环境与黑色素瘤患者对检查点抑制剂反应之间的关系 | 22名检查点抑制剂初治的阶段III-IV转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22名患者的肿瘤免疫浸润细胞和外周血单核细胞 |
12159 | 2024-08-05 |
Targeting CSF1R in myeloid-derived suppressor cells: insights into its immunomodulatory functions in colorectal cancer and therapeutic implications
2024-Jul-11, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02584-4
PMID:38992688
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研究论文 | 本研究探讨了CSF1R在结直肠癌中的免疫调节功能及其对骨髓源抑制细胞的影响 | 探讨了CSF1R和JAK/STAT3信号轴在结直肠癌免疫抑制中的关键作用,并评估了LNCs@CSF1R siRNA与抗PD-1联合治疗的疗效 | 研究的样本仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类结直肠癌中的相应机制 | 研究骨髓源抑制细胞在结直肠癌中的免疫抑制作用 | 主要研究小鼠模型中的骨髓源抑制细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠结直肠癌模型 |
12160 | 2024-08-04 |
Deconwolf enables high-performance deconvolution of widefield fluorescence microscopy images
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02294-7
PMID:38844629
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研究论文 | 本研究开发了Deconwolf,一种用于高性能去卷积宽场荧光显微镜图像的开源软件 | Deconwolf能够在普通笔记本电脑上高效运行,并显著提高了在DNA和RNA原位杂交图像中分辨拥挤荧光点的准确性 | 此文未提及具体的局限性 | 旨在克服传统显微镜方法在拥挤分子靶标分辨率上的限制 | 研究针对DNA和RNA原位杂交图像的荧光点及细胞切片中的个体转录本 | 数字病理学 | NA | 荧光显微镜 | NA | 图像 | NA |