单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12141 - 12160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12141 | 2024-08-05 |
The landscape of human tissue and cell type specific expression and co-regulation of senescence genes
2022-01-09, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00507-7
PMID:35000600
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研究论文 | 这项研究揭示了人类组织和细胞类型特异的衰老基因的共调控特征 | 系统地分析了健康人类组织中衰老基因的表达模式及其细胞类型特异性 | 对健康人类组织中的衰老细胞的普遍性理解仍然有限 | 研究衰老基因在不同类细胞中的共表达特征及其特异性 | 非疾病人类组织中的衰老基因及其相关网络 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 网络分析 | 转录组数据 | 50种人类组织 |
| 12142 | 2024-08-05 |
The immune landscape of common CNS malignancies: implications for immunotherapy
2021-11, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00518-9
PMID:34117475
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评论 | 本文回顾了中央神经系统恶性肿瘤的免疫景观及其对免疫治疗的影响 | 本文揭示了免疫组成和免疫生物学的基本差异，为胶质瘤的免疫治疗策略奠定基础 | 关于脑瘤对免疫检查点抑制剂反应的患者子集的研究限制了总体结果的推广 | 探讨中央神经系统恶性肿瘤中的免疫细胞组成和功能差异以及这些差异对免疫疗法的影响 | 对患有中央神经系统恶性肿瘤的患者样本进行免疫分析 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 质谱细胞术和单细胞测序 | 基因工程小鼠模型 | 样本 | NA |
| 12143 | 2024-08-05 |
SCINA: A Semi-Supervised Subtyping Algorithm of Single Cells and Bulk Samples
2019-07-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes10070531
PMID:31336988
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研究论文 | 本研究开发了SCINA，一个半监督模型，用于单细胞和大样本的分类。 | SCINA利用期望最大化算法，结合已有的基因特征进行分析，提供了不同于传统方法的新方法论和生物学见解。 | 本研究在于模型的应用依赖于事先建立的基因特征，可能限制其在某些数据集上的通用性。 | 解决单细胞RNA测序数据分析中的主观性和准确性问题。 | 包括小鼠大脑的单细胞RNA测序数据和基因工程小鼠模型中的细胞群体变化。 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-Seq，流式细胞术/CyTOF数据 | 半监督模型 | 基因表达数据 | 应用于多种数据集，具体样本数量未提及 |
| 12144 | 2024-08-04 |
Loss of PBX1 function in Leydig cells causes testicular dysgenesis and male sterility
2024-May-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05249-5
PMID:38724675
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研究论文 | 本文研究了PBX1在莱迪格细胞分化和睾酮产生中的作用 | 发现PBX1是小鼠莱迪格细胞分化和睾酮产生的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨PBX1在莱迪格细胞功能和生育中的作用 | 小鼠的莱迪格细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠 |
| 12145 | 2024-08-05 |
Identification of Novel Regulators of Leaf Senescence Using a Deep Learning Model
2024-May-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13091276
PMID:38732491
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研究论文 | 本文开发了DEGRN深度学习模型，以识别叶片衰老的调节因子 | 提出了一种创新的深度学习模型DEGRN，能够通过整合丰富的表达数据解析基因相互作用 | 对基因调控的研究仍专注于有限的实例，许多相互作用尚未全面探索 | 研究基因调控网络，特别是叶片衰老过程中的调节因子 | 621个转录因子和13739个非转录因子基因的交互作用 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | 深度学习模型 | 表达数据 | 大量数据，包括bulk RNA-Seq和scRNA-Seq数据 |
| 12146 | 2024-08-04 |
Time-course RNAseq data of murine AB1 mesothelioma and Renca renal cancer following immune checkpoint therapy
2024-May-03, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03294-0
PMID:38702329
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研究论文 | 本研究提供了小鼠AB1间皮瘤和Renca肾癌在免疫检查点治疗下的RNA测序数据 | 本研究通过时间序列RNA测序和单细胞测序技术，首次全面表征了免疫微环境中转录事件及其对ICB响应的重要性 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类肿瘤的复杂性 | 本研究旨在通过RNA测序数据，揭示免疫检查点治疗对肿瘤微环境转录特征的影响 | 研究对象包括小鼠模型的AB1间皮瘤和Renca肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNAseq数据 | 144个肿瘤样本和12个单细胞样本 |
| 12147 | 2024-08-04 |
New genetic insights into immunotherapy outcomes in gastric cancer via single-cell RNA sequencing and random forest model
2024-May-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03684-8
PMID:38693422
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序及随机森林模型，探索胃癌免疫治疗结果的新遗传学见解 | 使用单细胞测序识别基因并开发随机森林模型来预测胃癌患者的免疫治疗敏感性 | 该研究的具体样本数量及相应的临床数据未详细说明 | 旨在识别胃癌患者对免疫治疗的敏感性新生物标志物 | 胃癌患者的基因表达及其与免疫治疗敏感性的相关性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林模型 | 基因表达数据 | NA |
| 12148 | 2024-08-04 |
Neuroinflammation generated by HIV-infected microglia promotes dysfunction and death of neurons in human brain organoids
2024-May, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae179
PMID:38737767
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研究论文 | 本文研究了HIV感染的微胶质细胞如何促进神经元功能障碍和死亡的机制 | 提出HIV感染导致微胶质细胞产生的炎症反应可扩展到多个未感染的旁观者细胞，最终影响神经元功能 | 本研究主要依赖于体外模型，尚需在更复杂的生物系统中验证结果 | 探讨HIV感染微胶质细胞后，神经炎症与神经元功能障碍之间的关联 | 使用人类诱导多能干细胞来源的脑类器官模型进行研究 | 数字病理学 | HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 使用了两种不同的脑类器官模型（大脑和脉络丛类器官） |
| 12149 | 2024-08-05 |
Characterization of Th17 tissue-resident memory cells in non-inflamed intestinal tissue of Crohn's disease patients
2024-May, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103206
PMID:38554656
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研究论文 | 本文研究了克罗恩病患者小肠中Th17组织驻留记忆细胞的特征及其与免疫细胞的相互作用 | 首次详细描述了克罗恩病小肠中Th17 Trm细胞的转录组特征及其功能特性 | 样本量相对较小，仅包括七名克罗恩病患者和四名对照患者 | 探索克罗恩病患者的小肠中Th17 Trm细胞的特征及其在疾病中的作用 | 七名克罗恩病患者及四名溃疡性结肠炎患者作为对照 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 七名克罗恩病患者和四名溃疡性结肠炎患者的组织样本 |
| 12150 | 2024-08-04 |
Identification of key molecules in the formation of portal vein tumor thrombus in hepatocellular carcinoma based on single cell transcriptomics and in vitro experiments
2024-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1589
PMID:38737676
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的关键分子 | 通过单细胞转录组学技术和体外实验，识别了与肝细胞癌PVTT形成相关的关键基因和调控网络 | 研究可能存在样本量小或只依赖于生物信息学分析的局限性 | 探究肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的分子机制及其与免疫浸润的关联 | 识别与PVTT发展相关的基因及其调控miRNA和lncRNA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，hdWGCNA，高维基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12151 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals Molecular Expression Differences and Marker Genes in Testes during the Sexual Maturation of Mongolian Horses
2024-Apr-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14091258
PMID:38731262
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研究论文 | 本研究旨在调查蒙古马性成熟过程中睾丸组织形态、基因表达及标记基因的差异 | 通过单细胞转录组测序技术揭示了不同年龄组之间睾丸细胞的显著差异和潜在的性成熟标记基因 | NA | 探索蒙古马的生殖生理及识别性成熟潜在标记 | 对1岁（性未熟）和10岁（性成熟）蒙古马的睾丸组织进行了比较研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 2个年龄组的睾丸组织样本，分别为1岁和10岁 |
| 12152 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics in MI identify Slc25a4 as a new modulator of mitochondrial malfunction and apoptosis-associated cardiomyocyte subcluster
2024-04-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59975-8
PMID:38654053
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析确定了Slc25a4作为心肌梗死相关线粒体功能障碍和细胞凋亡的调节因子 | 创新性地识别了与心肌梗死后心室重塑密切相关的心肌细胞新亚群C5，以及新标志基因Slc25a4 | 研究限制在于仅使用了GEO数据库中的单细胞数据，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究的目的是确定心肌细胞的转录谱及其在缺氧条件下的异质性 | 研究对象为心肌梗死和假手术组的小鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 12153 | 2024-08-05 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究探讨了施旺细胞源性多效素如何刺激成纤维细胞增殖和胶原沉积。 | 提出了PTN/NCL/PRAS40轴在施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间相互作用的重要性，提供了新的分子机制见解。 | 本研究的样本基于人类pNF，可能限制了在其他类型神经肿瘤中的适用性。 | 研究施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间的相互作用，及其对pNF发展的影响。 | 主要研究对象为来自pNF样本的人类施旺细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序、功能性实验（如CCK8、EdU等） | NA | 转录组数据、细胞培养实验数据 | NA |
| 12154 | 2024-08-05 |
Single cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells
2024-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.19.576293
PMID:38293140
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研究论文 | 本研究揭示了Zika病毒在人体树突细胞中的抗病毒网络 | 提出了一种新范式，通过单细胞基因表达与实验性蛋白相互作用数据相结合，评估特定病毒的抗病毒反应 | 未提及相关的限制 | 深入理解宿主对Zika病毒感染的反应 | 感染了Zika病毒的人类单核细胞来源的树突细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12155 | 2024-08-04 |
Screening and validation of atherosclerosis PAN-apoptotic immune-related genes based on single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1297298
PMID:38736872
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研究论文 | 本文筛选并验证了与颈动脉粥样硬化相关的PAN-凋亡免疫相关基因 | 首次探索了与颈动脉粥样硬化有关的PAN-光体相关基因，并通过机器学习识别出四个诊断基因 | 研究的样本量和类型未详细提及 | 旨在筛选与颈动脉粥样硬化有关的PAN-光体相关诊断基因 | 主要研究对象是颈动脉粥样硬化相关的不同ially expressed genes | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 12156 | 2024-08-04 |
Exploring the Relevance of Disulfidptosis to the Pathophysiology of Ulcerative Colitis by Bioinformatics Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S454668
PMID:38737111
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研究论文 | 本研究探讨了二硫键死亡与溃疡性结肠炎的相关性 | 首次识别了与二硫键死亡相关的溃疡性结肠炎亚型，并建立了高准确度的预测模型 | 样本来源于公共数据库，可能存在选择偏倚 | 探究二硫键死亡在溃疡性结肠炎中的相关性 | 溃疡性结肠炎患者的样本与二硫键死亡相关基因 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序分析，qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 180个溃疡性结肠炎样本 |
| 12157 | 2024-08-04 |
A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain
2023-Oct, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02170-1
PMID:37710042
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研究论文 | 这篇文章建立了盲鳗整个大脑的细胞类型图谱，探讨了脊椎动物大脑的起源 | 通过单细胞RNA-seq和在位测序数据，首次系统描绘了盲鳗大脑的细胞和分子起源 | 研究发现了在进化过程中出现的关键组织和细胞类型，可能限制了对所有脊椎动物特征的认识 | 追踪脊椎动物大脑的细胞和分子起源 | 盲鳗这一无颚类物种的整个大脑 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和在位测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 12158 | 2024-08-04 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
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研究论文 | 本文提出了一种对小鼠肺部的单细胞RNA测序数据进行深入评估的协议 | 创新之处在于提供了一种综合分析健康与结核分枝杆菌感染小鼠肺淋巴细胞群体的详细步骤 | 未提及具体的局限性 | 研究目的在于分析不同条件下的小鼠肺淋巴细胞群体 | 研究对象为健康及结核分枝杆菌感染的小鼠肺淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 12159 | 2024-08-05 |
MetaTiME integrates single-cell gene expression to characterize the meta-components of the tumor immune microenvironment
2023-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38333-8
PMID:37149682
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研究论文 | MetaTiME整合单细胞基因表达以表征肿瘤免疫微环境的元组成部分 | 本研究开发了一个数据驱动框架MetaTiME，以克服手动标注已知基因标记所导致的分辨率和一致性局限性 | NA | 旨在通过集成多个scRNA-seq数据集来表征肿瘤微环境中的细胞类型和状态 | 使用数百万TME单细胞数据学习与癌症类型相关的独立基因表达组分 | 数字病理学 | 癌症免疫疗法 | 单细胞RNA测序 | 数据驱动模型 | 基因表达数据 | 数百万TME单细胞 |
| 12160 | 2024-08-05 |
Interspecies Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals the Novel Trajectory of Osteoclast Differentiation and Therapeutic Targets
2022-Jul, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10631
PMID:35866155
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了破骨细胞分化的新轨迹及治疗靶点 | 首次建立了人类和小鼠破骨细胞发生的综合命运图谱，并识别了RAB38作为关键分子 | 样本数量和数据范围的限制可能影响结果的普遍适用性 | 探索破骨细胞分化的机制并识别骨疾病的治疗靶点 | 人类和小鼠的破骨细胞谱系细胞 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的破骨细胞样本，具体数量未知 |