单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27508 篇文献，本页显示第 12121 - 12140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12121 | 2024-08-04 |
Error modelled gene expression analysis (EMOGEA) provides a superior overview of time course RNA-seq measurements and low count gene expression
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae233
PMID:38770716
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EMOGEA的RNA-seq数据分析框架，能够处理时间序列测量的基因表达数据 | 该框架综合考虑了测量不确定性，适用于低计数转录本的数据分析，有助于提取基因表达的动态特征 | 本文未提到具体的局限性 | 改善对动态现象中基因调控的理解，尤其是在肿瘤进展和药物反应过程中 | 主要涉及RNA-seq数据，特别是低计数转录本 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 时间序列数据 | 使用了斑马鱼胚胎和小鼠早期植入的实验数据进行验证 |
| 12122 | 2024-08-05 |
Analyzing Immune Cell Infiltration and Copper Metabolism in Diabetic Foot Ulcers
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S452609
PMID:38774446
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研究论文 | 本研究分析了糖尿病足溃疡中免疫细胞渗透和铜代谢的关系 | 首次探讨了铜代谢在糖尿病足溃疡发展中的作用及其与免疫细胞渗透的联系 | 未提供对其他类型伤口或非糖尿病患者的比较数据 | 研究糖尿病足溃疡中与铜代谢相关的基因，以发现潜在的治疗靶点 | 分析糖尿病伤口中免疫细胞的失调及与铜代谢相关的基因 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | qRT-PCR和单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 两个糖尿病伤口GEO数据集 |
| 12123 | 2024-08-05 |
Mendelian Randomization and Transcriptomic Analysis Reveal the Protective Role of NKT Cells in Sepsis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S459706
PMID:38774448
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研究论文 | 本研究揭示了NKT细胞在脓毒症中的保护作用及其与28天死亡率的关系 | 首次通过孟德尔随机化分析揭示NKT细胞在脓毒症中的保护作用，并发现了独特的FOS+NKT亚型 | 未能探索NKT细胞在脓毒症中的具体机制 | 研究NKT细胞在脓毒症中的角色及其对28天死亡率的影响 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化分析 | 基因组数据 | 115名脓毒症患者 |
| 12124 | 2024-08-05 |
Exploring dendritic cell subtypes in cancer immunotherapy: unraveling the role of mature regulatory dendritic cells
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10627
PMID:38716077
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综述 | 本文探讨了树突细胞在癌症免疫治疗中的亚型及成熟调节树突细胞的作用 | 文章通过单细胞RNA测序分析揭示了树突细胞的表型获取、转录状态和功能程序的最新研究成果 | 文章未提及具体的实验研究和数据支持 | 研究树突细胞在肿瘤免疫微环境中的功能和激活 | 重点研究树突细胞亚型及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12125 | 2024-08-04 |
The Functional Roles of MDSCs in Severe COVID-19 Pathogenesis
2023-12-23, Viruses
DOI:10.3390/v16010027
PMID:38257728
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评论 | 本文总结了骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在严重COVID-19发病机制中的功能角色 | 文章提出MDSCs的早期扩展可能是严重COVID-19进展的关键特征，并探讨其作为潜在预后生物标志物的作用 | 缺乏对严重COVID-19进展的全面分子决定因素的阐明 | 探讨骨髓来源抑制细胞在严重COVID-19发病机制中的作用 | 严重COVID-19患者的MDSCs及其功能 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 通过转录组RNA-seq和单细胞测序数据的荟萃分析得出的数据 |
| 12126 | 2024-08-05 |
Anatomical Diversity of the Adult Corticospinal Tract Revealed by Single-Cell Transcriptional Profiling
2023-11-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0811-22.2023
PMID:37748862
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研究论文 | 文章通过单细胞转录组分析揭示了成人皮质脊髓束的解剖多样性 | 首次通过结合脊髓逆行追踪与单细胞RNA测序的方式，详细索引了不同类型的皮质脊髓神经元 | 当前对皮质脊髓束的修复策略仍不理想，部分原因是对分子异质性了解不够全面 | 研究皮质脊髓神经元的亚型及其在运动皮层中的分布模式 | 成年小鼠的皮质脊髓神经元亚型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 成年小鼠（男女各一） |
| 12127 | 2024-08-05 |
IL-1β inhibition partially negates the beneficial effects of diet-induced lipid lowering
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562255
PMID:37873280
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的脂质降低效果的部分抵消作用 | 研究揭示了IL-1β在饮食诱导的斑块负担减少和斑块稳定性提高中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全适用于人类 | 探讨饮食改变对动脉粥样硬化病变的影响及其机制 | 采用Apoe-/-小鼠作为研究对象，以分析饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, CyTOF, 免疫染色, 高分辨率共聚焦显微镜z堆叠分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠，18周喂养西方饮食后切换到低脂饮食 |
| 12128 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9984
PMID:37418531
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研究论文 | 该文章研究了与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 通过单细胞转录组分析，揭示了骨骼肌巨噬细胞的新型转录程序和其在肌肉病中的作用 | 未详细讨论巨噬细胞在不同类型肌病中的具体功能 | 探讨巨噬细胞在肌肉疾病发展中作用机制 | 骨骼肌中的健康和病变的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 发现六个巨噬细胞群体，涉及不同的肌肉病变样本 |
| 12129 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analyses show that long non-coding RNAs are conspicuously expressed in Schistosoma mansoni gamete and tegument progenitor cell populations
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.924877
PMID:36204320
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研究论文 | 该研究分析了Schistosoma mansoni的单细胞RNA测序数据，发现长非编码RNA在生殖细胞和外表细胞群体中显著表达 | 首次揭示了Schistosoma mansoni中长非编码RNA的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要依赖公开的数据，可能存在数据质量和完整性的问题 | 探索Schistosoma mansoni中长非编码RNA的表达模式及其潜在的治疗靶点 | Schistosoma mansoni的成人细胞类型及其长非编码RNA表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 8023个长非编码RNA |
| 12130 | 2024-08-05 |
Next-generation molecular diagnosis: single-cell sequencing from bench to bedside
2017-03, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-016-2368-x
PMID:27738745
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综述 | 本综述提供了单细胞测序在基因组医学中诊断应用的现状和前景概述 | 该文章强调了单细胞测序在新生物标志物识别和靶向治疗中的潜力，促进了基因组医学的下一步发展 | NA | 简要说明单细胞测序在早期疾病检测和诊断中的应用 | 单细胞测序在胚前基因诊断、非侵入性产前诊断和循环肿瘤细胞分析中的使用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12131 | 2024-08-05 |
NK Cell-Monocyte Cross-talk Underlies NK Cell Activation in Severe COVID-19
2024-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300731
PMID:38578283
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研究论文 | 这篇文章探讨了重症COVID-19患者外周血中的NK细胞与单核细胞之间的相互作用及其对NK细胞激活和功能障碍的影响 | 首次结合了细胞间通讯分析与体外原代细胞共培养实验，以揭示COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 仅在体外模型中进行验证，尚未在活体系统中进行全面观察 | 了解重症COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 重症COVID-19患者的NK细胞和单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 细胞数据 | 健康供体的NK细胞与来自重症COVID-19患者或健康供体的单核细胞共培养 |
| 12132 | 2024-08-04 |
Transcriptomic profiling and regulatory pathways of cardiac resident macrophages in aging
2024-May-20, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05235-x
PMID:38763956
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研究论文 | 本研究探讨了衰老对心脏常驻巨噬细胞的转录组特征及其调控通路 | 揭示了衰老过程中心脏常驻巨噬细胞亚群的功能差异，特别是 CCR2 巨噬细胞在炎症反应中的作用 | 仅使用了老鼠模型，结果可能不适用于人类 | 探究衰老对心脏常驻巨噬细胞的影响及其与心血管疾病的关系 | 老龄小鼠的心脏常驻巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | Smart-Seq | NA | 基因表达数据 | 20 个月大的老鼠 |
| 12133 | 2024-08-05 |
Decoding the complexity of delayed wound healing following Enterococcus faecalis infection
2024-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95113
PMID:38767331
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研究论文 | 本文研究了肠球菌感染后延迟伤口愈合的复杂性 | 通过单细胞RNA测序创建了感染伤口的综合单细胞图谱，揭示了感染时细胞和转录组的独特变化 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能限制了对人类伤口愈合的直接适用性 | 探讨肠球菌感染对伤口愈合过程的影响和分子机制 | 对比感染与未感染的伤口，分析超过23000个细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 超过23000个细胞 |
| 12134 | 2024-08-07 |
Correction: ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2024-May-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00517-3
PMID:38769580
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12135 | 2024-08-04 |
Single-cell approaches define two groups of mammalian oligodendrocyte precursor cells and their evolution over developmental time
2024-May-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.03.002
PMID:38579710
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序等技术，对小鼠皮层的前髓鞘细胞进行特征描绘 | 识别和描述了两组局部差异化且具有转录和表观遗传学特征的前髓鞘细胞 | 缺乏对成年前髓鞘细胞在不同环境中行为的深入研究 | 探索前髓鞘细胞在后出生生活中的发育和演变 | 小鼠皮层中的前髓鞘细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，单细胞空间转录组学 | NA | RNA，表观遗传数据 | NA |
| 12136 | 2024-08-05 |
[Dental pulp stem cells in tooth regeneration: advancement and emerging directions]
2024-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文回顾了牙髓干细胞和人类脱落乳牙干细胞在牙齿再生中的应用。 | 提出了单细胞RNA测序和器官样培养系统在精准和可控再生中的应用潜力。 | 再生效率不稳定，仍需进一步研究。 | 探讨牙齿再生领域的最新进展和临床转化应用。 | 牙髓干细胞(DPSC)和人类脱落乳牙干细胞(SHED)。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12137 | 2024-08-05 |
Blimp-1 and c-Maf regulate immune gene networks to protect against distinct pathways of pathobiont-induced colitis
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01814-z
PMID:38609547
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Blimp-1和c-Maf如何共同调控IL-10来保护免疫网络，防止由病原体引起的结肠炎。 | 揭示了Blimp-1和c-Maf在调控IL-10以及抑制促炎细胞因子中的共同作用，提供了新的见解 | 研究未深入探讨其他转录因子的影响和机制 | 研究Blimp-1和c-Maf在肠道免疫反应中的作用 | 小鼠模型，特别是双缺失Prdm1MafCd4小鼠与感染的反应 | 数字病理学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，RNA测序，ATAC测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠样本涉及不同基因缺失类型 |
| 12138 | 2024-08-05 |
Thioredoxin is a metabolic rheostat controlling regulatory B cells
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01798-w
PMID:38553615
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研究论文 | 本研究揭示了硫氧还蛋白在调节性B细胞分化和功能中的角色 | 首次揭示了硫氧还蛋白通过调节线粒体电子运输和活性氧水平影响调节性B细胞的分化与功能 | 研究主要集中于系统性红斑狼疮患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索调节性B细胞分化和功能的代谢需求 | 研究调节性B细胞的代谢过程及其在系统性红斑狼疮中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12139 | 2024-08-04 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和空间转录组学，识别慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的配体-受体相互作用 | 创建了一个整合分析框架，以更全面地分析在慢性肾病和MASH中的细胞特异性配体-受体相互作用 | 研究主要基于两个人体群体的数据，可能存在样本偏倚 | 探索慢性肾病和MASH中细胞特异性配体-受体相互作用的分子机制 | 主要研究细胞之间的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 两个可用的人体队列 |
| 12140 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome revealed dysregulated RNA-binding protein expression patterns and functions in human ankylosing spondylitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1369341
PMID:38770048
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研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎（AS）不同免疫细胞类型中 RNA 结合蛋白（RBP）的表达特征和调控模式。 | 揭示了 AS 患者不同免疫细胞中 RBP 的特定表达特点及其在病理过程中的关键作用。 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 研究 RBPs 在强直性脊柱炎发生和发展中的潜在关键作用。 | 研究对象为健康对照组（HC）和强直性脊柱炎（AS）患者的外周血单核细胞（PBMC）样本。 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | scRNA-seq 和大规模 RNA-seq | NA | RNA 数据 | HC 29 例，AS 10 例，此外还有 NC 3 例，AS 5 例 |