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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12101 | 2025-10-07 |
Interstitial macrophage phenotypes in Schistosoma-induced pulmonary hypertension
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372957
PMID:38779688
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了血吸虫诱导肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的表型特征和相互作用机制 | 首次在血吸虫诱导的肺动脉高压模型中鉴定出三个不同的间质巨噬细胞亚群,并阐明它们通过CCL2-CCR2轴和TSP-1/TGF-β通路的相互作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;观察时间点有限(仅第1、3、7天) | 探究血吸虫诱导肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的表型特征和功能作用 | 小鼠肺部间质巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 野生型和报告基因小鼠,在未暴露及血吸虫暴露后第1、3、7天的时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12102 | 2025-10-07 |
The role of SASP in ischemic stroke: a deep dive into cellular mechanisms
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1513357
PMID:39931101
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组分析,探究衰老相关分泌表型在缺血性脑卒中中的作用机制 | 首次结合bulk芯片和单细胞测序数据系统分析SASP在缺血性脑卒中中的作用,发现嗜碱性粒细胞中Ccl3和Lcp1基因的关键调控作用 | 研究样本量有限,主要基于动物模型数据,人类临床验证不足 | 解析SASP在缺血性脑卒中发病机制中的细胞分子作用 | 人类外周血bulk芯片数据、MCAO小鼠单细胞测序数据、MCAO和假手术大鼠血清样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, bulk转录组分析, RT-qPCR, 蛋白互作网络分析, 富集分析 | MCAO动物模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量,包含人类外周血芯片数据、小鼠单细胞数据和大鼠血清样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12103 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究PPARG在促进骨肉瘤进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平识别出C2MKI67+破骨细胞亚群,并发现PPARG转录因子在破骨细胞增殖分化中的关键作用 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证PPARG作为治疗靶点的临床可行性 | 探索骨肉瘤中破骨细胞的作用机制并寻找新的治疗靶点 | 骨肉瘤患者和破骨细胞 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, CCK-8检测, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Monocle2, Cytotrace, Slingshot, CellChat, PySCENIC | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12104 | 2025-10-07 |
Distinct mechanisms for sebaceous gland self-renewal and regeneration provide durability in response to injury
2023-09-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113121
PMID:37715952
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在稳态下通过专用干细胞池自我更新,在损伤后通过毛囊来源的替代干细胞再生的双重机制 | 首次发现皮脂腺损伤后可通过毛囊 bulge 区的替代干细胞实现再生,且该过程依赖 FGFR2 信号通路并可被毛发生长加速 | 研究主要集中于小鼠背部皮肤模型,尚未验证其他部位或其他物种的适用性 | 探究皮脂腺在稳态维持和损伤应答中的细胞机制 | 小鼠皮脂腺及其干细胞 | 细胞生物学 | 皮肤损伤 | 靶向单细胞 RNA 测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA |
| 12105 | 2025-10-07 |
Screening cell-cell communication in spatial transcriptomics via collective optimal transport
2023-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01728-4
PMID:36690742
|
研究论文 | 开发了一种名为COMMOT的计算方法,通过集体最优传输技术分析空间转录组数据中的细胞间通讯 | 提出了考虑不同配体-受体物种竞争和细胞间空间距离的集体最优传输方法,能够处理复杂分子相互作用和空间约束 | NA | 推断空间转录组中的细胞间通讯 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术,单细胞RNA测序 | 最优传输模型,机器学习模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和8个空间数据集,涉及5种不同技术 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12106 | 2024-08-07 |
Correcting the Mean-Variance Dependency for Differential Variability Testing Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2019-Oct-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.08.003
PMID:31647917
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12107 | 2025-10-07 |
Targeting enteric glial CRF-R1/Cx43 attenuates stress-induced accelerated colonic motility
2025-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2025.01.009
PMID:39929591
|
研究论文 | 本研究揭示了肠胶质细胞中CRF-R1/Cx43信号通路在应激诱导的结肠运动加速中的作用机制 | 首次发现肠胶质细胞表达CRF-R1,并阐明其通过Cx43介导应激诱导的结肠运动反应 | 研究仅使用雄性C57BL/6小鼠,未涉及雌性动物或其他品系 | 探究肠胶质细胞CRF-R1/Cx43信号在应激诱导结肠运动加速中的作用 | 雄性C57BL/6小鼠的肠胶质细胞和结肠组织 | 神经胃肠病学 | 胃肠功能紊乱 | 免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | C57BL/6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12108 | 2025-10-07 |
Exploring the therapeutic efficacy difference in claudin18.2-targeted cell therapy revealed by single-cell sequencing
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111768
PMID:39925434
|
研究论文 | 通过单细胞测序探索CLDN18.2靶向细胞疗法的疗效差异机制 | 首次在CLDN18.2阳性胃癌患者中通过单细胞测序分析CT041 CAR-T治疗的细胞特征与疗效关联 | 样本量较小(仅5名患者),需更大规模研究验证 | 探索CAR-T细胞疗法在实体瘤中的疗效差异机制 | 晚期CLDN18.2阳性胃癌患者 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5名患者的外周血和腹水样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12109 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal pre-metastatic subsets and therapeutic targets in penile carcinoma
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111765
PMID:39925432
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术识别阴茎癌中的前转移亚群并确定治疗靶点 | 首次在阴茎癌中发现MMP3+SPP1+前转移亚群和CK2α过表达,并验证Silmitasertib的抗肿瘤效果 | 样本量有限(6例原发癌、6例转移淋巴结、4例晚期癌的单细胞数据) | 解析肿瘤异质性并识别前转移亚群及治疗靶点 | 阴茎癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 细胞实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 6例原发阴茎癌、6例转移淋巴结、4例晚期阴茎癌(单细胞数据),另含98个单细胞数据集和6个空间数据集验证 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 12110 | 2025-10-07 |
m6A related metabolic genes in breast cancer and their relationship with prognosis
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114121
PMID:39889412
|
研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌中m6A相关代谢基因,构建预后风险模型并验证关键基因 | 首次整合单细胞转录组和bulk RNA-seq数据系统分析m6A相关代谢基因在乳腺癌中的作用,并构建预后风险模型 | 研究样本来源有限,主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证 | 探索m6A相关代谢基因在乳腺癌预后评估和治疗靶点开发中的价值 | 乳腺癌患者外周血单细胞数据和TCGA乳腺癌转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, Western blot | Lasso-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据 | TCGA乳腺癌数据集和患者外周血scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12111 | 2025-10-07 |
Dapagliflozin alleviated seizures and cognition impairment in pilocarpine induced status epilepticus via suppressing microglia-mediated neuroinflammation and oxidative stress
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114117
PMID:39889414
|
研究论文 | 本研究探讨达格列净通过抑制小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激减轻癫痫持续状态小鼠的癫痫发作和认知障碍 | 首次发现达格列净通过调节小胶质细胞表型转化和抑制SLC5A2表达发挥抗癫痫和神经保护作用 | 研究仅使用雄性小鼠和体外细胞模型,缺乏临床验证和性别差异分析 | 研究达格列净对癫痫持续状态引起的癫痫发作和认知障碍的治疗作用及机制 | 雄性C57BL/6小鼠、BV2小胶质细胞系、癫痫患者样本 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞转录组分析、免疫荧光染色、免疫组化、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、ELISA | 毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态小鼠模型、LPS诱导的神经炎症细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、行为学数据 | 动物模型和细胞实验,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12112 | 2025-10-07 |
Exploring the dynamic responses of group 3 innate lymphoid cells at different times in response to LPS challenge
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114162
PMID:39889415
|
研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,探索了第3组先天淋巴细胞在LPS攻击后不同时间点的动态响应 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据揭示肠道ILC3可能迁移至肺部的机制,并系统分析LPS攻击后不同时间点ILC3的动态变化 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证ILC3迁移机制 | 阐明ILC3在LPS诱导的急性肺部炎症中的动态响应机制 | 第3组先天淋巴细胞(ILC3s) | 免疫学 | 肺部炎症 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12113 | 2025-10-07 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2025-Feb-10, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
|
综述 | 回顾基因组学和生物信息学在帕金森病研究中的应用进展 | 系统总结了单细胞转录组学技术揭示帕金森病中细胞类型特异性失调的新发现 | NA | 解析帕金森病的复杂性质并识别新的治疗靶点 | 人类群体和模式生物 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因分型, 基因组测序, 转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 大规模人类群体队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12114 | 2025-10-07 |
Single-cell characterization of the immune heterogeneity of pulmonary hypertension identifies novel targets for immunotherapy
2025-Feb-10, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00684-w
PMID:39930365
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺动脉高压患者的肺组织样本,揭示免疫异质性并识别免疫治疗新靶点 | 首次在单细胞分辨率构建肺动脉高压细胞通讯全景图,发现多个未报道的细胞亚群及其调控互作 | 基于公共数据库的回顾性分析,样本来源存在异质性 | 系统探索肺动脉高压的免疫异质性并识别潜在治疗靶点 | 肺动脉高压患者和健康对照者的肺组织样本 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | CellChat, NicheNet | 单细胞转录组数据 | 约124,561个细胞,34个细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12115 | 2025-10-07 |
NEAT1-mediated regulation of proteostasis and mRNA localization impacts autophagy dysregulation in Rett syndrome
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf074
PMID:39921568
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA NEAT1在MECP2基因缺陷导致的Rett综合征中对蛋白质稳态和自噬调控的作用机制 | 首次揭示NEAT1通过RNA-RNA相互作用调控自噬基因的亚细胞定位和自噬复合体生物发生,阐明了lncRNA在Rett综合征中的新调控机制 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步在动物模型中验证;样本量相对有限 | 阐明NEAT1在MECP2缺陷导致的Rett综合征发病机制中的作用 | 人类神经细胞、Rett综合征患者样本、MECP2敲除细胞 | 神经发育疾病研究 | Rett综合征 | 单细胞RNA测序、分子分析 | NA | RNA测序数据、分子相互作用数据 | 人类神经细胞和RTT患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12116 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals that AK5 inhibits apoptosis in AD oligodendrocytes by regulating the AMPK signaling pathway
2025-Feb-08, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10311-x
PMID:39921763
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现AK5通过调控AMPK信号通路抑制阿尔茨海默病少突胶质细胞凋亡 | 首次揭示AK5在AD少突胶质细胞能量代谢和神经炎症中的调控作用及其通过AMPK信号通路抑制凋亡的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞实验,缺乏动物模型验证 | 探究AK5在阿尔茨海默病能量代谢和神经炎症中的作用机制 | 阿尔茨海默病患者样本和少突胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 生物信息学分析, 细胞实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 来自GEO公共数据库的AD和正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12117 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptome profiling reveals pathogenesis of bullous pemphigoid
2025-Feb-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07629-4
PMID:39922909
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示大疱性类天疱疮的发病机制 | 首次在BP患者中对皮损和非皮损皮肤及血液样本进行单细胞转录组分析,揭示了免疫和非免疫细胞的功能转变 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 阐明大疱性类天疱疮的发病机制 | 大疱性类天疱疮患者的皮损和非皮损皮肤组织及血液样本 | 单细胞组学 | 大疱性类天疱疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | BP患者的皮损、非皮损皮肤和血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12118 | 2025-10-07 |
ANO7 expression in the prostate modulates mitochondrial function and lipid metabolism
2025-Feb-08, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02081-7
PMID:39923095
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研究论文 | 本研究探讨了ANO7基因在前列腺中的功能,发现其通过调节线粒体功能和脂质代谢影响前列腺癌的进展 | 首次揭示了ANO7在前列腺细胞中调节代谢途径的功能,特别是对氧化磷酸化和脂质代谢的调控作用 | ANO7在前列腺中的具体作用机制仍需进一步研究 | 探究ANO7基因在前列腺细胞中的功能及其与前列腺癌的关系 | RWPE1细胞、前列腺组织单细胞RNA测序数据集、前列腺组织RNA测序数据 | 生物医学研究 | 前列腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 氧化磷酸化测定, 糖酵解测定, 靶向代谢组学, 线粒体形态图像分析, 脂质组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组学数据, 图像数据 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 12119 | 2025-10-07 |
Neonatal sevoflurane exposures inhibits DHHC5-mediated palmitoylation of TfR1 in oligodendrocytes, leading to hypomyelination and neurological impairments
2025-Feb-08, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.009
PMID:39929269
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿七氟醚暴露通过抑制少突胶质细胞中DHHC5介导的TfR1棕榈酰化,导致铁积累、铁死亡和髓鞘形成不良的机制 | 首次发现DHHC5介导的TfR1棕榈酰化在新生儿麻醉神经毒性中的关键作用,揭示了少突胶质细胞-神经元相互作用的铁死亡机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 阐明铁稳态特别是转铁蛋白受体1在新生儿麻醉易感性中的作用机制 | 野生型和Pdgfrα-CreERT转基因小鼠的少突胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统发育障碍 | 单细胞RNA测序, 共免疫沉淀, 酰基树脂辅助捕获测定, 行为测试 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 行为数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12120 | 2025-10-07 |
uN2CpolyG-mediated p65 nuclear sequestration suppresses the NF-κB-NLRP3 pathway in neuronal intranuclear inclusion disease
2025-Feb-07, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02079-1
PMID:39920690
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研究论文 | 本研究揭示了神经元核内包涵体病中uN2CpolyG蛋白通过隔离p65抑制NF-κB-NLRP3通路和自噬的分子机制 | 首次发现uN2CpolyG直接与p65相互作用并将其隔离在核内包涵体中,从而抑制NF-κB-NLRP3通路 | 研究主要基于细胞模型和果蝇模型,尚未在哺乳动物体内模型中完全验证 | 阐明uN2CpolyG与NF-κB-NLRP3通路之间的分子相互作用机制 | NIID患者皮肤组织、HEK-293T和U87-MG细胞系、CGG扩展敲入果蝇模型 | 神经退行性疾病研究 | 神经元核内包涵体病 | 单细胞RNA测序, 细胞转染, 果蝇模型 | 细胞模型, 果蝇模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NIID患者皮肤组织, 两种细胞系, 果蝇模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |