单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 12081 - 12100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12081 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1701
PMID:38778448
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和空间转录组数据，以系统性描述粘液性结直肠腺癌的肿瘤微环境 | 研究揭示了MUC1介导的细胞间相互作用，为粘液性结直肠腺癌的治疗提供了新的机制信息 | 研究的病理特征模糊，治疗方法仍然面临挑战 | 深入理解粘液性结直肠腺癌的细胞水平转录动态，以开发专门的治疗策略 | 研究对象包括粘液性结直肠腺癌的肿瘤细胞、间质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 三维生物打印技术 | RNA数据 | 涉及的样本数量和类型未明确指出 |
| 12082 | 2024-08-05 |
Bioengineered Hydrogels Recapitulate Fibroblast Heterogeneity in Cancer
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307129
PMID:38493497
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研究论文 | 该研究利用生物工程水凝胶重现肿瘤微环境中癌相关成纤维细胞的异质性 | 创新性地应用可调节的透明质酸水凝胶系统来培养患者来源的成纤维细胞，并揭示了它们的异质性特征 | 缺乏全面的临床验证，且水凝胶系统可能无法完全模拟体内环境的复杂性 | 开发反映癌相关成纤维细胞异质性的体外模型以促进治疗策略的开发 | 人头颈鳞状细胞癌组织中提取的不同成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 水凝胶培养模型 | 转录组数据 | 来源于患者的头颈鳞状细胞癌组织样本 |
| 12083 | 2024-08-04 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Apr-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03734-z
PMID:38679747
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研究论文 | 该研究探讨了TPOm如何刺激骨髓血管和基质微环境，以减轻急性辐射综合症。 | 该研究首次阐明了TPOm在调节骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生方面的作用。 | 该研究仅在小鼠模型中进行，存在转化为人类的局限性。 | 研究TPOm在急性辐射综合症缓解中的作用及其机制。 | C57BL/6J小鼠，研究急性辐射综合症与TPOm的关系。 | 数字病理学 | 急性辐射综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | C57BL/6J小鼠（9-14周龄），接受亚致死或致死全身照射 |
| 12084 | 2024-08-05 |
[Jisuikang formula promotes spinal cord injury repair in rats by activating the YAP/PKM2 signaling axis in astrocytes]
2024-Apr-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 该文章研究了Jisuikang方剂对大鼠脊髓损伤修复的促进作用及其可能机制 | 该研究首次揭示了Jisuikang通过激活PKM2/YAP信号通路促进星形胶质细胞有氧糖酵解，从而加速脊髓损伤修复的作用 | 该研究主要在动物模型中进行，临床应用效果尚需进一步验证 | 探讨Jisuikang方剂在促进脊髓损伤修复中的作用及其机制 | 研究对象为成年SD大鼠，观察其脊髓损伤后的修复情况 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 (细胞、组织) | 30只成年SD大鼠 |
| 12085 | 2024-08-05 |
Investigation of cellular communication and signaling pathways in tumor microenvironment for high TP53-expressing osteosarcoma cells through single-cell RNA sequencing
2024-Mar-25, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02318-4
PMID:38526643
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨高TP53表达骨肉瘤细胞在肿瘤微环境中的细胞间通信和信号通路 | 探究了高TP53表达骨肉瘤细胞与肿瘤微环境内相邻细胞类型之间的细胞间动态，识别了重要的信号通路 | 对细胞间通信网络的理解仍需更深入的研究 | 阐明骨肉瘤TME内细胞间通信网络的复杂性 | 高TP53表达骨肉瘤细胞及其周围的巨噬细胞、单核细胞、内皮细胞和PVLs | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 12086 | 2024-08-04 |
Resolving cellular dynamics using single-cell temporal transcriptomics
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103060
PMID:38194753
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综述 | 本文讨论了通过单细胞时间转录组学解决细胞动态的方法 | 介绍了非破坏性活细胞转录组学方法，并探讨了其与计算模型的互补性质 | 未具体提及研究的限制 | 加深对细胞动态及其在发育过程和疾病进展中作用的理解 | 单细胞转录组学及其在细胞状态动态重建中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 转录组数据 | NA |
| 12087 | 2024-08-05 |
Computing Minimal Boolean Models of Gene Regulatory Networks
2024-02, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0122
PMID:37889991
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研究论文 | 文章提出了一种算法，用于优化基因调控网络的数据拟合和噪声消除。 | 提出了一种新的方法，将实验数据整合并通过优化线性目标函数在约束下寻找最佳一致结构。 | 对于基因调控的复杂性和实验技术的局限性，所需的逻辑规则未经预先确认。 | 开发一种算法，以最佳方式找到适合数据的基因调控网络。 | 对基因调控网络模型的构建与优化进行研究。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | 布尔网络 | 模拟数据和公开的scRNA-Seq数据集 | NA |
| 12088 | 2024-08-05 |
Development and verification of a manganese metabolism- and immune-related genes signature for prediction of prognosis and immune landscape in gastric cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1377472
PMID:38807601
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种与锰代谢和免疫相关的基因标志，以预测胃癌的预后和免疫环境 | 首次利用锰代谢和免疫相关基因来识别胃癌的预后相关基因 | 未提及此研究的具体局限性 | 研究旨在预测胃癌患者的临床结果并指导未来的免疫治疗干预 | 胃癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，基因表达组数据库分析 | 未提供 | 转录组信息，临床数据 | 未提供具体样本数量 |
| 12089 | 2024-08-05 |
Quantitative Modeling of Stemness in Single-Cell RNA Sequencing Data: A Nonlinear One-Class Support Vector Machine Method
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0484
PMID:38010500
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的干性量化模型。 | 创新性地使用一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM)来定义和量化细胞的干性。 | NA | 研究单细胞的干性量化，以评估自我更新和分化的潜力。 | 主要研究对象包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 一类Hadamard核支持向量机(OCHSVM) | 数据集，包括细胞转录组数据 | 涉及多个数据集，包括预植入胚胎细胞、诱导多能干细胞和肿瘤细胞 |
| 12090 | 2024-08-05 |
Evaluation of Therapeutic Mechanism of Hedyotis Diffusa Willd (HDW)‒ Scutellaria Barbata (SB) in Clear Cell Renal Cell Carcinoma via Singlecell RNA Sequencing and Network Pharmacology
2024, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究旨在探讨Hedyotis diffusa Willd (HDW)和Scutellaria barbata (SB)在透明细胞肾癌(ccRCC)中的治疗机制 | 通过单细胞RNA测序和网络药理学识别了29个针对ccRCC的关键基因，揭示了其在诊断和预后中的良好表现 | 未提及具体的临床实验数据来进一步验证发现 | 研究HDW-SB在ccRCC中的治疗机制 | Hedyotis diffusa Willd和Scutellaria barbata的活性成分及其在ccRCC中的靶点基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用两个不同的数据集进行分析，其中GSE53757和GSE121638 |
| 12091 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-Dec-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
|
研究论文 | 本文探讨了新生小鼠子宫上皮的单细胞转录组分析 | 揭示了子宫上皮成熟、谱系分叉和分化的轨迹分析，并识别了新的腺体上皮表达基因 | 所研究的模型仅限于新生小鼠，可能无法完全代表其他生物或成年状态 | 阐明子宫上皮发育过程中的细胞和分子机制 | 新生小鼠的子宫上皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组学 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 子宫上皮细胞样本 |
| 12092 | 2024-08-04 |
Re-convolving the compositional landscape of primary and recurrent glioblastoma reveals prognostic and targetable tissue states
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38186-1
PMID:37142563
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研究论文 | 本文研究了原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞组成和转录状态 | 通过研究特定亚群体之间的共居模式识别了三种组成性组织状态，并提出了针对GBM微环境相互依赖性的治疗方案 | 未说明样本数量和研究范围的具体限制 | 本研究旨在确定原发性和复发性胶质母细胞瘤的细胞组成及其转录状态 | 研究对象为原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞类型及其相互关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 12093 | 2024-08-05 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2023-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.01.530562
PMID:36993439
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研究论文 | 本研究探讨了Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化机制 | 揭示了Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用及其在肾脏内皮细胞中的表达模式 | 未详细研究Esm-1在所有成熟组织中的表达及其潜在的生物学效应 | 研究Esm-1在糖尿病肾病中的表达和功能 | 研究对象包括成年人和小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞，及20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 |
| 12094 | 2024-08-04 |
Buyang Huanwu decoction promotes angiogenesis after cerebral ischemia through modulating caveolin-1-mediated exosome MALAT1/YAP1/HIF-1α axis
2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155609
PMID:38677273
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研究论文 | 本文探讨了补阳还五汤通过调节腔蛋白1介导的外泌体MALAT1/YAP1/HIF-1α通路来促进脑缺血后的血管生成 | 研究首次通过单细胞测序及基因敲除小鼠系统性验证BHD在脑缺血治疗中的作用机制 | 尚未充分探索BHD在临床应用中的长期效果 | 研究补阳还五汤促进脑缺血后血管生成的机制 | 使用中膜动脉阻塞模型的小鼠对BHD的作用进行评估 | 数字病理学 | 脑缺血 | 单细胞测序 | 基因敲除小鼠 | 生物样本数据 | 多个剂量的BHD处理的小鼠组 |
| 12095 | 2024-08-05 |
Macrophage-Derived GSDMD Plays an Essential Role in Atherosclerosis and Cross Talk Between Macrophages via the Mitochondria-STING-IRF3/NF-κB Axis
2024-Jun, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320612
PMID:38695170
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞衍生的GSDMD在动脉粥样硬化及巨噬细胞之间的相互作用中的关键作用 | 揭示了GSDMD在动脉粥样硬化进程中的新机制，并提出GSDMD作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 本研究主要使用小鼠模型，尚需在人类样本中验证其发现 | 研究巨噬细胞衍生的GSDMD如何影响动脉粥样硬化及其机制 | 使用ApoE-/-和Gsdmd-/- ApoE-/-小鼠及其骨髓移植模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 使用了ApoE-/-和Gsdmd-/- ApoE-/-小鼠的样本 |
| 12096 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the contribution of laminin γ2 -CD44 to the immune resistance in lymphocyte-infiltrated squamous lung cancer subtype
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31299
PMID:38803944
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研究论文 | 本文分析了LUSC中间质微环境的异质性及其导致免疫耐受的分子机制 | 识别了LUSC中一种淋巴细胞浸润亚型CS3，以及LAMC2和CD44的共同高表达与免疫耐受的关系 | 本研究为回顾性分析，可能受到样本选择偏差的影响 | 旨在探讨导致LUSC患者免疫耐受的特征和分子机制，以改善免疫疗法的效果 | 包含513个LUSC样本的RNA测序数据及其单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 513个LUSC样本 |
| 12097 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomic brain imaging reveals the effects of immunomodulation therapy on specific regional brain cells in a mouse dementia model
2024-May-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10434-8
PMID:38796425
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析了免疫调节治疗对小鼠痴呆模型中大脑特定区域细胞的影响 | 开发了一个适用于条形码空间转录组学的分析工作流，并提供了名为STquantool的定制分析管道 | 未提及具体的样本大小和实验限制 | 研究免疫调节治疗在阿尔茨海默病中的有效性及其对大脑细胞的影响 | 小鼠阿尔茨海默病模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 10x Genomics Visium | NA | 转录组数据 | NA |
| 12098 | 2024-08-05 |
irGSEA: the integration of single-cell rank-based gene set enrichment analysis
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae243
PMID:38801700
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研究论文 | irGSEA是一个R包，用于评估不同基因集评分方法在单细胞RNA测序数据中的结果。 | 该包整合了六种基于基因表达排名的评分方法，并使用稳健的排名聚合算法汇总结果。 | 未提及具体的限制 | 评估多种基因集评分方法在单细胞RNA测序数据的表现。 | 单细胞RNA测序数据中的基因集评分方法。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 表达矩阵 | NA |
| 12099 | 2024-08-04 |
Bi-allelic variants in chromatoid body protein TDRD6 cause spermiogenesis defects and severe oligoasthenoteratozoospermia in humans
2024-May-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109766
PMID:38341271
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研究论文 | 本研究探讨了TDRD6变异与人类不孕症之间的关联。 | 首次识别出五名中国不育男性中的双等位TDRD6变异，并揭示其在精子发生中的关键角色。 | 仅涉及五名患者，样本量较小，结果可能无法普遍适用。 | 研究TDRD6变异与人类精子发生缺陷之间的关系。 | 不孕男性及其变异的TDRD6基因。 | 数字病理学 | 生育障碍 | 全外显子测序，单细胞RNA测序，定量RT-PCR | CRISPR-Cas9系统的小鼠模型 | 基因组数据，RNA数据 | 5名不育男性 |
| 12100 | 2024-08-05 |
Malignant transformation of white sponge nevus: a case report of a novel keratin 4 mutation
2024-May-21, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-024-04300-y
PMID:38773401
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病例报告 | 本文报告了一例白色海绵痣的恶性转化，并识别出KRT4基因的独特突变 | 识别出一种新的KRT4基因插入突变，并提出其可能与白色海绵痣的恶性转化相关 | 仅基于单例病例的观察，缺乏更大样本的验证研究 | 探讨白色海绵痣的恶性转化及其潜在的遗传因素 | 一例70岁男性患者的白色海绵痣病例 | NA | 口腔疾病 | 外显子测序以及单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1例 |