单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37658 篇文献，本页显示第 12041 - 12060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12041 | 2025-10-06 |
Sex-specific neurotoxicity induced by long-term bisphenol A exposure: Single-cell sequencing reveals dual mechanisms involving hippocampal gliosis and neuronal apoptosis
2025-Aug-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.179810
PMID:40505511
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示长期双酚A暴露通过海马胶质增生和神经元凋亡双重机制诱导性别特异性神经毒性 | 首次结合行为学分析和单细胞测序技术系统阐明BPA性别特异性神经毒性的细胞分子机制 | 仅使用小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 探究长期BPA暴露对成年小鼠行为记忆和神经系统的性别特异性影响 | 成年小鼠（分雌雄性别） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、行为学数据、形态学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12042 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic atlas reveals the underlying mechanism of indole-3-acetic acid in protecting against acute cholestatic liver injury
2025-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156942
PMID:40513326
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了吲哚-3-乙酸在急性胆汁淤积性肝损伤中的保护机制 | 首次整合转录组学、代谢组学和单细胞RNA测序技术，系统阐明3-IAA通过调节免疫细胞亚群发挥肝保护作用的新机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证 | 探究吲哚-3-乙酸对急性胆汁淤积性肝损伤的治疗潜力及其作用机制 | 胆管结扎诱导的急性胆汁淤积性肝损伤大鼠模型 | 单细胞组学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12043 | 2025-10-06 |
Investigating the potential risk of cadmium exposure on Osteoporosis: An integrated multi-omics approach
2025-Aug, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118502
PMID:40517505
|
研究论文 | 通过多组学方法研究镉暴露对骨质疏松症的潜在风险 | 整合了流行病学数据、生物信息学、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接等多种方法，首次系统揭示镉暴露通过HMOX1基因影响骨质疏松的机制 | 研究主要基于横断面分析，无法确定因果关系；需要进一步实验验证 | 探索镉暴露在骨质疏松症发病机制中的作用 | 骨质疏松症患者及相关基因表达 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 多组学数据, 流行病学数据 | NHANES数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12044 | 2025-10-06 |
Mucosal Macrophages Govern Intestinal Regeneration in Response to Injury
2025-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.01.252
PMID:40086603
|
研究论文 | 本研究揭示了黏膜巨噬细胞在辐射损伤后通过分泌神经调节蛋白1和骨桥蛋白诱导肠道上皮细胞胎儿样重编程和增殖，从而驱动肠道再生的关键机制 | 首次发现巨噬细胞通过特定分泌因子直接调控肠道干细胞区室的再生程序，并证实该机制在人类细胞中具有保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；巨噬细胞亚型的具体功能分化需要进一步解析 | 探究辐射性肠炎中肠道再生程序的激活机制 | 小鼠模型和人类肠道类器官 | 细胞生物学 | 辐射性肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 细胞谱系追踪, 细胞轨迹分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠模型和人类肠道类器官共培养体系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 12045 | 2025-10-06 |
Targeting FGFR Attenuates Tumor Growth in an Anal Squamous Cell Carcinoma Patient Derived Xenograft Model
2025-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23919
PMID:40256931
|
研究论文 | 本研究通过建立肛门鳞状细胞癌患者来源异种移植模型，发现FGFR抑制剂可显著抑制肿瘤生长 | 首次在ASCC PDX模型中应用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性，并验证FGFR靶向治疗的疗效 | 研究仅基于单个患者样本，样本量有限 | 探索肛门鳞状细胞癌的有效治疗靶点 | 肛门鳞状细胞癌患者来源的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肛门鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 傅里叶变换红外光谱 | 患者来源异种移植模型 | 基因表达数据, 光谱数据, 图像数据 | 1例转移性ASCC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12046 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of proximal tubular cells with different DNA content reveals functional heterogeneity in the acute kidney injury to chronic kidney disease transition
2025-Jul, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.03.025
PMID:40268163
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的功能异质性 | 首次揭示不同DNA含量（特别是多倍体细胞）的近端肾小管上皮细胞在AKI向CKD转变中的功能异质性及其促纤维化作用机制 | 研究仅关注缺血再灌注损伤模型，未验证其他AKI模型中的普适性 | 探究不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的功能异质性 | 急性肾损伤后不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | AKI后第3天和第14天分离的近端肾小管上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12047 | 2025-10-06 |
A survey of the methodological process of modeling, inference, and evaluation of gene regulatory networks using scRNA-Seq data
2025-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105464
PMID:40409400
|
综述 | 本文系统探讨了使用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络的方法学流程，包括建模、推断和评估环节 | 全面梳理了scRNA-Seq技术在基因调控网络推断中面临的方法学挑战，并通过比较计算实验提出更稳健的方法学流程建议 | 作为综述性文章，未提出新的推断算法，主要聚焦于方法学问题的系统分析 | 分析单细胞RNA测序数据在基因调控网络推断中的方法学挑战并提出改进建议 | 基因调控网络的建模、推断和评估方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12048 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of progression gene signature and tumor microenvironment leading to progression in mycosis fungoides
2025-Jun-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014495
PMID:40163757
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析蕈样肉芽肿进展过程中的基因特征和肿瘤微环境变化 | 首次使用空间转录组学技术结合形态学标记分析MF进展过程中的转录组表达变化和肿瘤微环境动态 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 识别早期蕈样肉芽肿患者进展至晚期的生物标志物和机制 | 蕈样肉芽肿患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学染色 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | 使用CD3、CD4和CD30形态学标记进行空间分辨转录组分析 |
| 12049 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell chromatin and transcriptomic profiling of peripheral immune cells in nonsegmental vitiligo
2025-Jun-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf041
PMID:39888372
|
研究论文 | 通过单细胞多组学方法研究非节段型白癜风患者外周免疫细胞的转录组和染色质可及性特征 | 首个对非节段型白癜风患者外周血单核细胞进行的单细胞多组学研究，整合了转录组和染色质可及性数据 | 样本量相对有限（初始队列NSV患者11例，健康对照5例） | 探究非节段型白癜风的系统性免疫失调机制 | 非节段型白癜风患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 初始队列：NSV患者11例，健康对照5例；扩展队列：NSV患者16例，健康对照9例；共分析59,192个PBMCs | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 12050 | 2025-10-06 |
Colorectal cancer cell line-derived organoid model with stem cell properties captures the regrowing state of residual cancer cells after neoadjuvant chemotherapy
2025-Jun-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02567-w
PMID:40537472
|
研究论文 | 本研究建立了结直肠癌细胞系来源的类器官再生模型，用于研究新辅助化疗后残留癌细胞的再生状态 | 首次利用具有癌症干细胞特性的患者来源细胞系建立结直肠癌类器官再生模型，并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能显著抑制肿瘤生长 | 研究仅基于单一患者来源的细胞系，需要更多样本验证结果的普适性 | 研究结直肠癌新辅助化疗后残留癌细胞的再生机制并寻找治疗靶点 | 结直肠癌细胞系来源的类器官模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 单一患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12051 | 2025-10-06 |
Gap junction protein beta 5 interacts with Gαi3 to promote Akt activation and cervical cancer cell growth
2025-Jun-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07768-w
PMID:40537499
|
研究论文 | 本研究探讨了间隙连接蛋白β5在宫颈癌中的表达、功能及其通过Gαi3促进Akt信号通路激活的机制 | 首次发现GJB5与Gαi3相互作用并通过该机制激活Akt-mTOR信号通路促进宫颈癌进展 | NA | 探索GJB5在宫颈癌中的致癌作用及其分子机制 | 宫颈癌细胞系和异种移植模型 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | shRNA、CRISPR/Cas9基因敲除、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库宫颈癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12052 | 2025-10-06 |
scExtract: leveraging large language models for fully automated single-cell RNA-seq data annotation and prior-informed multi-dataset integration
2025-Jun-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03639-x
PMID:40537825
|
研究论文 | 开发了一个利用大语言模型自动化单细胞RNA测序数据分析的框架scExtract | 首次将大语言模型应用于单细胞RNA测序数据的全自动注释和先验信息引导的多数据集整合 | NA | 解决公共单细胞RNA测序数据集分析中的注释和整合挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本, 基因表达数据 | 44万个细胞，来自14个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12053 | 2025-10-06 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2025-Jun-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03648-w
PMID:40533768
|
研究论文 | 开发用于Visium空间转录组学的端到端自动化图像处理工具Vispro，提升成像分析质量 | 首个专门针对10x Visium数据优化的端到端图像处理工具，包含基准标记检测、图像恢复、组织区域检测和分离组织区域分割模块 | NA | 解决空间转录组学中组织学图像因基准标记和背景区域干扰而质量下降的问题 | Visium空间转录组学数据中的组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 12054 | 2025-10-06 |
Two types of regenerative cell populations appear in acute liver injury
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102503
PMID:40345206
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现急性肝损伤中同时出现两种不同的再生细胞群 | 首次揭示在相同再生过程中同时存在两种形态、分化、定位、增殖率和信号响应显著不同的再生细胞群，其中一种通过与坏死组织接触诱导产生 | 研究基于公开数据且仅使用对乙酰氨基酚处理的小鼠模型，可能无法完全代表所有类型的急性肝损伤 | 探究急性肝损伤中肝脏再生的细胞机制 | 对乙酰氨基酚诱导急性肝损伤的小鼠肝脏细胞 | 单细胞生物学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的对乙酰氨基酚处理小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12055 | 2025-10-06 |
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102532
PMID:40499510
|
综述 | 本文回顾了人类多能干细胞在基因表达异质性方面的研究，重点探讨其占据不同亚状态的能力及其对分化结果的影响 | 提出了一种建模荧光标记分布时间序列的新方法，表明亚状态间的转换可能受确定性混沌和基因表达随机波动的共同调控 | NA | 探索干细胞命运决定的动态机制和亚状态转换规律 | 人类多能干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、荧光标记动态分析 | NA | 基因表达数据、荧光标记分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12056 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Reveals Cancer and Stromal Cell Heterogeneity Between Center and Invasive Front of Pancreatic Cancer
2025-Jun, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100726
PMID:39889965
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示胰腺癌肿瘤中心与侵袭前沿的癌细胞和癌症相关成纤维细胞的转录异质性 | 首次在空间维度上系统比较胰腺癌肿瘤中心与侵袭前沿的癌细胞和CAFs转录组差异，发现侵袭前沿细胞具有更强的应激反应、增殖、糖酵解和上皮间质转化活性 | 仅分析了4例高分化胰腺癌样本，样本量较小；仅包含常规形态学病例 | 探究胰腺导管腺癌肿瘤内部空间异质性 | 人类胰腺导管腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 数字空间分析，全转录组测序，免疫组织化学验证 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 4例用于空间转录组分析的高分化PDAC，17例用于免疫组化验证的不同分化程度PDAC | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx系统 | GeoMx数字空间分析系统，全转录组检测 |
| 12057 | 2025-10-06 |
New Anti-Fibrotic Strategies for Keloids: Insights From Single-Cell Multi-Omics
2025-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13818
PMID:39902627
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术研究瘢痕疙瘩的细胞异质性和分子机制，识别关键成纤维细胞亚群及其在纤维化中的作用 | 首次在瘢痕疙瘩中识别POSTN阳性间充质成纤维细胞和IGFBP2阳性成纤维细胞两个关键亚群，揭示它们在纤维化中的相反作用 | 样本量较小（仅3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本），需要更大规模研究验证 | 探索瘢痕疙瘩的发病机制并开发新的抗纤维化治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3个瘢痕疙瘩组织, 3个正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12058 | 2025-10-06 |
GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data
2025-Jun, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110283
PMID:40311462
|
研究论文 | 本研究开发了一个结合自编码器和分类器的深度学习框架，通过血液单细胞RNA测序数据识别阿尔茨海默病的生物标志物 | 采用对抗自编码器框架整合差异表达基因和传统方法常忽略的细微遗传变异，首次在PBMC单细胞水平系统分析AD相关基因 | 单核细胞数据存在限制需依赖随机森林分类器处理，样本来源仅限于外周血单核细胞 | 识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器, 随机森林 | 基因表达数据 | AD患者和正常对照的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12059 | 2025-10-06 |
Targeting BATF2-RGS2 axis reduces T-cell exhaustion and restores anti-tumor immunity
2025-May-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02351-5
PMID:40442751
|
研究论文 | 本研究揭示BATF2-RGS2轴在调控T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 首次发现BATF2通过转录调控RGS2驱动T细胞耗竭，并证明靶向该轴可增强抗肿瘤免疫 | 样本量较小（6例患者），主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究RGS2在肺癌免疫调控中的作用及BATF2-RGS2轴的调控机制 | 肺癌患者样本、小鼠模型、CD8+ T细胞、3LL癌细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析、荧光素酶报告基因检测、体外共培养 | 基因敲除小鼠模型、肿瘤类器官模型 | 转录组数据、细胞实验数据 | 6例肺癌患者，多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12060 | 2025-10-06 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
|
研究论文 | 本研究首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴管，并揭示其在关节炎和疼痛中的作用机制 | 首次在颞下颌关节中鉴定出滑膜淋巴系统，并证明淋巴功能障碍会驱动关节炎和疼痛的发生 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究颞下颌关节滑膜淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 | 基因报告小鼠、人类组织样本 | 生物医学研究 | 颞下颌关节关节炎 | 基因报告技术、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |