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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12021 | 2025-10-07 |
Carboxylesterase 1-mediated endocannabinoid metabolism in skin: role in melanoma progression in BRafV600E/Pten-/- mice
2025-Feb-11, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-025-00378-2
PMID:39934865
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研究论文 | 本研究首次揭示了皮肤中羧酸酯酶1介导的内源性大麻素代谢在黑色素瘤进展中的作用 | 首次证明CES1在皮肤中的表达及其通过降解2-AG促进黑色素瘤进展的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究内源性大麻素代谢在黑色素瘤进展中的分子机制 | BRafV600E/Pten-/-基因工程小鼠黑色素瘤模型 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 靶向代谢组学、化学蛋白质组学、活性蛋白质谱分析、靶向脂质组学、放射性示踪检测、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 基因工程小鼠黑色素瘤组织与正常皮肤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12022 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial-resolved profiling reveals cancer-associated fibroblast heterogeneity in colorectal cancer metabolic subtypes
2025-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06103-3
PMID:39934919
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示结直肠癌代谢亚型中癌症相关成纤维细胞的异质性 | 首次系统鉴定SFRP2+CAF亚群在结直肠癌代谢亚型中的分布特征及其促癌机制 | 样本量有限,需要更大队列验证研究结果 | 探索结直肠癌代谢亚型中癌症相关成纤维细胞的异质性及其功能 | 结直肠癌患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,体内实验 | 层次聚类分析 | 基因表达数据,空间定位数据,图像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 12023 | 2025-10-07 |
Induction of the p21/CDK6 pathway and alteration of the immune microenvironment by the stem cell marker CBX3 in melanoma
2025-Feb-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04179-8
PMID:39934923
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研究论文 | 本研究探讨干细胞标志物CBX3通过激活p21/CDK6通路和改变免疫微环境促进黑色素瘤进展的机制 | 首次揭示CBX3在黑色素瘤中通过调控p21/CDK6通路影响细胞周期并改变肿瘤免疫微环境 | 机制研究仍需深入,临床转化价值有待验证 | 阐明CBX3在黑色素瘤发生发展中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 黑色素瘤细胞系、动物模型和公共数据库数据 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,qPCR,Western blotting,CCK8,克隆形成,伤口愈合,Transwell | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | 公共数据库和实验样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12024 | 2025-10-07 |
Immune profiling of the macroenvironment in colorectal cancer unveils systemic dysfunction and plasticity of immune cells
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70175
PMID:39934971
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研究论文 | 通过多组学技术系统分析结直肠癌免疫宏观环境中免疫细胞的异质性和功能状态 | 首次全面描绘结直肠癌免疫宏观环境特征,发现三级淋巴结构对免疫治疗的预测价值及血液中PD-1/CD69表达作为生物标志物的潜力 | 需要更大样本验证生物标志物的临床适用性 | 解析结直肠癌免疫宏观环境的组成特征及其与免疫治疗反应的关系 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、血液及不同肠道结构(上皮、固有层、粘膜下层、肌层) | 数字病理 | 结直肠癌 | 飞行时间质谱流式细胞术,RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据 | 发现队列和验证队列的结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 12025 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals cell heterogeneity and aberrantly activated pathways associated with microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1449624
PMID:39944086
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌微血管侵犯相关的细胞异质性和异常激活通路 | 首次在单细胞水平识别MVI阳性恶性细胞亚型,发现MARCKSL1基因通过PTN信号网络促进MVI进展 | 样本量较小(仅5例患者),需要进一步实验验证MARCKSL1的功能 | 探索肝细胞癌微血管侵犯的细胞异质性、生物标志物和细胞间信号相互作用 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据 | 5例肝细胞癌患者(其中3例显示微血管侵犯) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12026 | 2025-10-07 |
Revealing the molecular links between coronary heart disease and cognitive impairment: the role of aging-related genes and therapeutic potential of stellate ganglion block
2024-Nov-28, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-024-10159-x
PMID:39609308
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研究论文 | 本研究揭示了衰老相关基因FKBP5和DDIT3在冠心病与认知障碍共病机制中的关键作用,并评估了星状神经节阻滞的治疗潜力 | 首次通过单细胞和bulk RNA测序技术系统阐明FKBP5和DDIT3在冠心病与认知障碍共病机制中的核心作用,并发现星状神经节阻滞通过调节自主神经可同时改善心脏功能和认知能力 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类临床试验中得到验证 | 阐明冠心病与认知障碍共病的分子机制,探索星状神经节阻滞的治疗效果 | 冠心病和认知障碍的分子机制及治疗干预 | 生物医学研究 | 冠心病, 认知障碍 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 激光多普勒血流仪, 脑电图, 行为学测试 | 动物模型 | 基因表达数据, 行为学数据, 生理信号数据 | 大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 12027 | 2025-10-07 |
Association between premature vascular smooth muscle cells senescence and vascular inflammation in Takayasu's arteritis
2024-Oct-21, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225630
PMID:38816066
|
研究论文 | 本研究探讨高安氏动脉炎中血管平滑肌细胞早衰与血管炎症之间的关联 | 首次揭示IL-6-线粒体STAT3-MFN2信号通路驱动血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 样本来源于手术患者,可能存在选择偏倚;体外实验结果需在更大样本中验证 | 探究高安氏动脉炎中血管平滑肌细胞衰老是否参与血管炎症过程 | 高安氏动脉炎患者的血管手术样本和原代血管平滑肌细胞 | 分子病理学 | 高安氏动脉炎 | 组织学检测、bulk RNA-Seq、单细胞RNA-seq、体外实验、离体实验 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 高安氏动脉炎患者血管手术样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12028 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal potent extrafollicular B cell response linked with granzyme K+ CD8 T cell activation in lupus kidney
2024-Oct-17, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225876
PMID:39419536
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了狼疮性肾炎肾脏中滤泡外B细胞反应与GZMK+ CD8 T细胞活化的关联机制 | 首次在单细胞水平系统描绘狼疮性肾炎肾脏适应性免疫景观,发现肾脏特异性IGHG4-59克隆扩增和GZMK+ CD8 T细胞与ABCs通过II型干扰素通路的相互作用 | 样本量有限,主要基于相关性分析,功能验证需要进一步深入 | 探索活动性狼疮性肾炎患者肾脏特异性适应性免疫景观 | 狼疮性肾炎患者的肾脏和配对外周血B、T细胞,以及匹配对照的外周血细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA/BCR/TCR测序,流式细胞术,ATAC-seq,多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,BCR/TCR序列数据,表观遗传数据,蛋白质表达数据 | 活动性狼疮性肾炎患者肾脏和外周血样本,匹配对照外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞BCR/TCR测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 12029 | 2025-10-07 |
CD8+ tissue-resident memory T cells are expanded in primary Sjögren's disease and can be therapeutically targeted by CD103 blockade
2024-Sep-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225069
PMID:38777379
|
研究论文 | 本研究探讨了组织驻留记忆T细胞在原发性干燥综合征中的作用及CD103阻断的治疗潜力 | 首次系统表征pSS中CD8+组织驻留记忆T细胞的表型功能,并证明CD103阻断可改善疾病症状 | 动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证 | 研究组织驻留记忆T细胞在原发性干燥综合征发病机制中的作用及治疗靶点 | 原发性干燥综合征患者、非特异性干燥综合征患者、实验性干燥综合征小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 临床指标 | 人类唾液腺组织和外周血样本, 实验性干燥综合征小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 12030 | 2025-10-07 |
A spatiotemporally resolved atlas of mRNA decay in the C. elegans embryo reveals differential regulation of mRNA stability across stages and cell types
2024-Sep-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278980.124
PMID:39142810
|
研究论文 | 通过转录抑制结合RNA测序技术,构建了线虫胚胎发育过程中mRNA衰减速率的时空图谱 | 首次在全转录组范围内直接测量胚胎发育过程中具有时空分辨率的mRNA衰变速率,揭示了不同发育阶段和细胞类型中mRNA稳定性的差异调控 | 研究仅限于线虫胚胎发育过程,未涉及其他生物或发育阶段 | 探究胚胎发育过程中mRNA衰变速率的时空动态变化及其对基因表达的调控作用 | 秀丽隐杆线虫(C. elegans)胚胎 | 转录组学 | NA | 转录抑制,bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 线虫胚胎发育全过程样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12031 | 2025-10-07 |
Characterization and bioinformatic filtering of ambient gRNAs in single-cell CRISPR screens using CLEANSER
2024-Sep-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.04.611293
PMID:39282389
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研究论文 | 开发了一种名为CLEANSER的混合模型,用于识别和过滤单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA噪声 | 利用CRISPR混合实验表征环境gRNA噪声,开发了包含gRNA和细胞特异性归一化参数的混合模型 | NA | 提高单细胞CRISPR筛选实验中gRNA-细胞分配准确性 | 单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA噪声 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序CRISPR筛选 | 混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12032 | 2025-10-07 |
New dimension in viral hepatitis research
2024-Sep, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2024-100136
PMID:39944365
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研究论文 | 使用GeoMx数字空间分析技术研究乙型肝炎患者肝组织中基因表达的空间分布特征 | 首次应用GeoMx DSP技术对HBV感染肝组织进行空间转录组分析,能够靶向选择特定组织区域进行精确基因表达定位 | 样本量较小(仅3例患者),目前仍处于概念验证阶段 | 通过空间转录组学技术深入了解肝脏免疫反应和HBV感染细胞分布,最终实现HBV功能性治愈 | 三名患者的肝组织(一名HBV单感染、一名HBV/HDV共感染、一名HBV/HIV共感染) | 空间转录组学 | 病毒性肝炎 | 数字空间分析,空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 3例患者肝组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析技术,支持靶向选择特定组织区域(感兴趣区域)进行分析 |
| 12033 | 2025-10-07 |
Characterisation of choroid plexus-infiltrating T cells reveals novel therapeutic targets in murine neuropsychiatric lupus
2024-Jul-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224689
PMID:38531610
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了神经精神性狼疮小鼠模型中脉络丛浸润T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | 首次在神经精神性狼疮小鼠模型中系统表征脉络丛浸润T细胞,发现特异性T细胞克隆并验证VCAM/VLA-4信号通路作为潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究神经精神性狼疮疾病进展中脉络丛浸润免疫细胞的作用机制 | MRL/lpr小鼠(神经精神性狼疮模型)的脉络丛组织 | 单细胞组学 | 神经精神性狼疮 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | MRL/lpr小鼠在疾病早期和晚期的脉络丛组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞转录组分析平台 |
| 12034 | 2025-10-07 |
Defining the Regulatory Logic of Breast Cancer Using Single-Cell Epigenetic and Transcriptome Profiling
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598858
PMID:38948758
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研究论文 | 通过单细胞表观遗传和转录组分析揭示乳腺癌的调控逻辑 | 开发了使用线性混合效应模型系统量化染色质可及性区域与基因表达关联的新方法,并发现正常细胞中基因表达沉默子转变为癌细胞中增强子的调控元件 | 研究样本仅限于手术切除后立即处理的人类乳腺肿瘤和健康乳腺组织 | 解析乳腺癌细胞的转录失调调控机制 | 人类乳腺肿瘤、健康乳腺组织和乳腺癌细胞系 | 单细胞多组学 | 乳腺癌 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 线性混合效应模型 | 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 12035 | 2025-10-07 |
Unveiling inflammatory and prehypertrophic cell populations as key contributors to knee cartilage degeneration in osteoarthritis using multi-omics data integration
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224420
PMID:38325908
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学整合分析揭示膝关节骨关节炎中炎症和前肥大细胞群对软骨退变的关键作用 | 发现两个新的软骨细胞群体(preInfC和InfC),揭示MIF-CD74信号通路激活,并确定preHTC和HTC为OA关键细胞群 | 样本量相对有限(8例OA供体和3例非OA对照),需要更大规模研究验证 | 解析人类膝关节软骨细胞异质性并识别骨关节炎关键细胞群体 | 人类膝关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 全基因组关联研究数据 | 11名供体(8例OA,3例对照)共19个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 12036 | 2025-10-07 |
Disease activity drives divergent epigenetic and transcriptomic reprogramming of monocyte subpopulations in systemic lupus erythematosus
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225433
PMID:38413168
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研究论文 | 本研究探讨系统性红斑狼疮中疾病活动度对单核细胞亚群表观遗传和转录组重编程的影响 | 首次整合DNA甲基化组、转录组和单细胞转录组学数据,揭示SLE疾病活动度驱动单核细胞亚群特异性表观遗传和转录组重编程 | 样本量相对有限,仅包含SLE患者和健康供体的单核细胞分析 | 研究系统性红斑狼疮中单核细胞亚群的表观遗传和转录组特征与疾病活动度和进展的关系 | 系统性红斑狼疮患者和健康供体的经典、中间和非经典单核细胞亚群 | 表观遗传学 | 系统性红斑狼疮 | DNA甲基化组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据,单细胞转录组数据 | SLE患者(首次和随访访视)和健康供体的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 12037 | 2025-10-07 |
Proinflammatory phenotype of B10 and B10pro cells elicited by TNF-α in rheumatoid arthritis
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224878
PMID:38302261
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研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过干扰SHIP-1诱发B10和B10pro细胞促炎表型在类风湿关节炎中的机制 | 首次发现TNF-α能够改变B10和B10pro细胞的免疫表型,使其从抑炎转为促炎,并阐明了SHIP-1在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究TNF-α对B10和B10pro细胞表型和功能的调控机制及其在类风湿关节炎发病中的作用 | B10和B10pro细胞、类风湿关节炎患者、健康个体、基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、转录组测序、基因敲除模型 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞频率数据 | 健康个体和RA患者的外周血样本、TNF-α-/-和SHIP-1-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12038 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal disturbed decidual homoeostasis in obstetric antiphospholipid syndrome
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224930
PMID:38331588
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示产科抗磷脂综合征中蜕膜稳态失衡的细胞组成和分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘OAPS患者蜕膜细胞的异常微环境,发现巨噬细胞/dNK细胞比例失衡、血管内皮细胞收缩及代谢通路改变等新特征 | 样本量有限(5例患者+5例对照),需更大队列验证;主要聚焦早孕期蜕膜组织 | 揭示产科抗磷脂综合征的发病机制 | 早孕期蜕膜组织细胞 | 单细胞组学 | 产科抗磷脂综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,免疫荧光,ELISA | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 5例OAPS患者和5例健康对照的蜕膜组织(初验证扩大队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12039 | 2025-10-07 |
p53 accelerates endothelial cell senescence in diabetic retinopathy by enhancing FoxO3a ubiquitylation and degradation via UBE2L6
2024-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2024.112391
PMID:38437929
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研究论文 | 本研究揭示了p53通过增强UBE2L6介导的FoxO3a泛素化降解加速糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的机制 | 首次发现p53通过上调UBE2L6表达促进FoxO3a泛素化降解,从而加速内皮细胞衰老的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在人体临床试验中验证 | 阐明糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的具体分子机制 | db/db糖尿病小鼠视网膜组织和人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs) | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 12040 | 2025-10-07 |
[Analysis of the types and functions of CD34+ cells in full-thickness skin defect wounds of normal mice and diabetic mice by single-cell RNA sequencing]
2024-Mar-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面中CD34+细胞的类型和功能 | 首次使用CD34细胞谱系示踪小鼠结合单细胞RNA测序技术,系统比较了正常和糖尿病小鼠创面愈合过程中CD34+细胞的异质性和功能差异 | 样本量较小(对照组3只,糖尿病组2只),仅观察了伤后第4天的时间点 | 探究CD34+细胞在正常和糖尿病小鼠皮肤创面愈合过程中的细胞类型和功能差异 | CD34细胞谱系示踪小鼠(正常组和糖尿病模型组) | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | Seurat 4.0.2 | 单细胞RNA测序数据 | 6只CD34细胞谱系示踪小鼠(3只对照组,2只糖尿病组用于单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |