单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
12001 2024-08-05
SCUBE2 mediates bone metastasis of luminal breast cancer by modulating immune-suppressive osteoblastic niches
2023-06, Cell research IF:28.1Q1
研究论文 本文展示了ER调控的分泌蛋白SCUBE2如何促进乳腺癌的骨转移。 揭示了SCUBE2通过调节免疫抑制性成骨细胞微环境,促进乳腺癌骨转移的机制。 该研究可能未能涵盖所有乳腺癌亚型的骨转移机制。 探讨ER阳性乳腺癌骨转移的特异机制及其潜在的治疗方法。 聚焦于ER阳性乳腺癌及其在骨转移中的行为。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 肿瘤细胞数据 多个转移模型
12002 2024-08-05
Involucrin Modulates Vitamin D Receptor Activity in the Epidermis
2023-06, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 这篇文章研究了角质形成细胞中的involucrin如何调节维生素D受体的活性 研究揭示了involucrin在皮肤中对维生素D受体活性产生积极影响的功能角色 研究的功能意义尚不清楚 探讨involucrin如何在表皮中调节维生素D受体的功能 使用Ivl小鼠和野生型小鼠研究维生素D受体活性 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,16S细菌分型 NA 基因组数据 使用Ivl和野生型小鼠进行的研究
12003 2024-08-05
Systematic dissection of coordinated stromal remodeling identifies Sox10+ glial cells as a therapeutic target in myelofibrosis
2023-06-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 该文章系统性地分析了骨髓微环境的重塑,识别出Sox10+神经胶质细胞作为骨髓纤维化的治疗靶点 研究首次确定骨髓内Sox10+神经胶质细胞在骨髓纤维化中的重要作用,并提出它们作为潜在的治疗靶点 研究未能深入探讨小胶质细胞在纤维化过程中具体的分子机制 探索骨髓微环境重塑在纤维化病理中的作用 以小鼠模型为研究对象,分析其骶髓细胞的来源和功能 数字病理学 骨髓纤维化 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 细胞 多个小鼠模型的多样本
12004 2024-08-05
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究描述了在新月体肾小管炎中细胞毒性T细胞的转录和克隆特征。 本文首次揭示了新月体肾小管炎中克隆扩展的细胞毒性T细胞的致病功能,确定了GzmB作为潜在的治疗靶点。 该研究主要集中于T细胞的功能特征,可能未全面了解其他免疫细胞在新月体肾小管炎中的作用。 阐明新月体肾小管炎中T细胞的浸润及其对肾损伤的影响。 研究对象包括ANCA相关新月体肾小管炎患者及实验性新月体肾小管炎小鼠模型中的T细胞。 数字病理学 免疫介导的肾病 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 NA 组织样本 来自ANCA相关新月体肾小管炎患者的肾活检和血液样本,以及实验性小鼠的样本
12005 2024-08-04
Epigenetic landscape reveals MECOM as an endothelial lineage regulator
2023-04-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 这篇文章系统地研究了内皮细胞谱系的表观遗传图谱,并确定MECOM作为内皮细胞谱系调节因子 文章创新性地识别了MECOM作为内皮细胞谱系的主要调节因子,并揭示了其在细胞身份基因调控中的作用 文章未提及具体的限制因素 研究内皮细胞谱系特化的表观遗传机制以促进心血管再生医学的进展 研究对象为来源于诱导多能干细胞的内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 (Single-cell RNA-Seq), Hi-C, DNase-Seq, ChIP-Seq, RNA-Seq NA 基因组数据 使用了来自诱导多能干细胞的内皮细胞群体
12006 2024-08-05
Nociceptor neurons affect cancer immunosurveillance
2022-Nov, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究探讨了疼痛感知神经元对癌症免疫监视的影响 首次揭示了黑色素瘤细胞与痛觉神经元之间的相互作用及其对细胞免疫反应的影响 未能全面探索不同类型肿瘤对疼痛神经元的影响 研究痛觉神经元在肿瘤免疫监视中的作用 主要研究黑色素瘤细胞和肿瘤浸润的细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 小鼠模型 生物样本 研究中使用了多种小鼠和黑色素瘤患者的活检样本
12007 2024-08-05
Fibroblast Heterogeneity in Healthy and Wounded Skin
2022-Jun-06, Cold Spring Harbor perspectives in biology IF:6.9Q1
研究论文 本文讨论了健康和受伤皮肤中的成纤维细胞异质性。 利用单细胞测序技术,揭示了小鼠和人类皮肤中成纤维细胞的不同亚群体,并比较了其转录组特征。 未提及具体的局限性 研究成纤维细胞异质性对生理愈合及其在病理状态下的影响。 小鼠和人类的成纤维细胞。 数字病理 NA 单细胞测序 NA 细胞 使用了多种细胞群体,具体样本数量未提及
12008 2024-08-05
Systematic single-cell analysis provides new insights into heterogeneity and plasticity of the pancreas
2017-09, Molecular metabolism IF:7.0Q1
综述 该综述探讨了单细胞分析在胰腺细胞类型背景下的内源性β细胞再生机制的最新文献 介绍了单细胞技术如何提供胰腺内部细胞异质性的高分子分辨率 相关信息未指明具体的研究限制 旨在系统地表征和解开所有胰腺细胞类型的转录程序 关注胰腺中不同细胞类型的再生潜力 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序, 单细胞质谱细胞分析, 流式细胞术 NA NA NA
12009 2024-08-07
Alveolar macrophage-CD8 T cell interactions after acute lung allograft dysfunction: Insights from single-cell RNA sequencing
2024-Jul, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12010 2024-08-04
Dynamic Single-Cell RNA-Seq reveals mechanism of Selinexor-Resistance in Chronic myeloid leukemia
2024-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了慢性髓性白血病中Selinexor耐药的机制 首次通过动态单细胞RNA测序分析慢性髓性白血病中selinexor耐药相关的基因表达变化 本研究仅限于K562细胞系,可能无法完全代表所有CML中的耐药性 探讨慢性髓性白血病中selinexor的耐药机制 建立了对selinexor耐药的K562细胞系 数字病理学 慢性髓性白血病 动态单细胞RNA测序 NA RNA 对亲本和耐药细胞群体进行了多样性分析
12011 2024-08-05
Heterogeneity of myeloid cells in common cancers: Single cell insights and targeting strategies
2024-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
综述 本文全面概述了高发癌症中髓系细胞的异质性及其靶向策略 通过单细胞RNA测序技术,建立了新亚群体和靶点,提供了对髓系细胞异质性的深入理解 研究主要基于文献综述,缺乏实证研究数据支撑 理解髓系细胞在肿瘤微环境中的异质性及其潜在的靶向治疗策略 高发癌症中的髓系细胞亚群体及其功能 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA NA NA
12012 2024-08-05
TM-Score predicts immunotherapy efficacy and improves the performance of the machine learning prognostic model in gastric cancer
2024-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究提出了一种新颖的TM-Score评分,以预测胃癌患者的免疫治疗效果并提高机器学习预后模型的性能 研究结合肿瘤突变负担和主要组织相容性复合体相关中心基因建立了TM-Score,显示出优于传统预测指标的性能 研究的限制未在摘要中详细描述 优化与胃癌免疫治疗相关的患者筛选 胃癌患者 数字病理学 胃癌 RNA-seq和scRNA-seq 机器学习模型 基因表达数据 NA
12013 2024-08-05
Syngeneic murine models with distinct immune microenvironments represent subsets of human intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Jun, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究开发并表征了具有不同遗传驱动的免疫能力强的CCA小鼠模型,以探讨肿瘤基因组学、免疫生物学与治疗反应间的关联 建立了一种遗传小鼠模型以模拟人类肝内胆管癌,并展示了肿瘤基因型与免疫微环境表型之间的关联 研究没有详细说明样本的具体数量和来源 理解肿瘤基因型与肿瘤免疫微环境特征之间的关系 肝内胆管癌的免疫能力强的小鼠模型 数字病理学 NA scRNA-seq,CITE-seq,整体外显子和大量RNA测序 小鼠模型 基因组数据,转录组数据 NA
12014 2024-08-05
Single-cell transcriptome atlas reveals somatic cell embryogenic differentiation features during regeneration
2024-May-31, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 该文章研究了在植物再生过程中,体细胞胚胎发生中的细胞分化特征。 研究揭示了棉花体细胞胚胎发生中的标记基因调控模式,并识别出特定的细胞群体和新型基因。 研究主要集中在棉花样本上,可能不适用于其他植物类型的细胞分化研究。 探索植物再生过程中的体细胞全能性及其分化特征。 研究体细胞胚胎发生过程中的不同细胞群体和基因表达。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 样本包括了非胚胎性愈伤组织和初级胚胎性愈伤组织的异质细胞
12015 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing reveals the expansion of circulating tissue-homing B cell subsets in secondary acute dengue viral infection
2024-May-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究分析了登革病毒感染患者外周血中B细胞亚群的变化 首次揭示了二次登革病毒感染中循环组织归巢B细胞亚群的扩增 仅分析了来自登革病毒感染患者的外周血样本,不包括其他部位的B细胞 探讨组织归巢B细胞在登革病毒感染中的抗病毒免疫作用 登革病毒感染患者的B细胞亚群 数字病理学 登革热 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 文本 从登革病毒感染患者中获取的外周血样本
12016 2024-08-05
Advancing skeletal health and disease research with single-cell RNA sequencing
2024-May-30, Military Medical Research IF:16.7Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序在骨骼健康和疾病研究中的应用。 提供了一种获得高质量骨骼组织单细胞的简化方法,揭示了关节疾病的新见解。 在高度矿化的骨骼组织中,单细胞级别机制的研究面临技术挑战。 研究骨骼健康和疾病的细胞和分子层面的机制。 主要研究脊椎、关节、骨骼、肌肉和腱相关的疾病。 数字病理学 关节疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞数据 NA
12017 2024-08-05
An amphioxus neurula stage cell atlas supports a complex scenario for the emergence of vertebrate head mesoderm
2024-May-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究构建了头索动物神经胚阶段的细胞图谱,以支持脊椎动物头部中胚层出现的复杂情境 通过使用scRNA-seq构建细胞图谱,验证了头索动物中存在的前脊板样区域,并支持了特定细胞群体的同源性 未明确说明研究的局限性 探讨脊椎动物形态创新的出现与新胚胎细胞种群的关系 头索动物的胚胎细胞群体 数字病理学 NA scRNA-seq NA 转录组数据 NA
12018 2024-08-04
Next-Generation Sequencing-Based Spatial Transcriptomics: A Perspective from Barcoding Chemistry
2024-May-27, JACS Au IF:8.5Q1
评论 这篇文章探讨了基于下一代测序的空间转录组学方法及其条形码化学的进展 强调了空间条形码化学在空间转录组学中的重要性和创新应用 该文章未深入探讨特定实验结果或案例 旨在揭示细胞类型、位置及其相互作用相关的基因表达特征 关注空间转录组技术及其应用于生物学和医学研究 数字病理学 肿瘤 下一代测序 NA 转录组数据 NA
12019 2024-08-04
Single-cell sequencing technology in diabetic wound healing: New insights into the progenitors-based repair strategies
2024-May-26, World journal of stem cells IF:3.6Q3
研究论文 本文章集中于单细胞RNA测序技术在糖尿病伤口愈合中的应用,探讨基于祖细胞的修复策略 揭示了基于祖细胞的修复策略并强调了不同愈合相关细胞的生物行为和信号通路的变化 未提及具体的实验数据或样本分析 揭示糖尿病伤口愈合的复杂生物学并为干预提供新的目标 糖尿病伤口中的祖细胞及其在愈合过程中的角色 数字病理学 糖尿病相关疾病 单细胞RNA测序 NA 细胞和分子层面的数据 NA
12020 2024-08-04
SpaNCMG: improving spatial domains identification of spatial transcriptomics using neighborhood-complementary mixed-view graph convolutional network
2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种SpaNCMG算法,以提高空间转录组学中的空间域识别准确性 提出基于邻域互补混合视图图卷积网络的算法,有效整合KNN的局部信息与r半径的全局结构 处理高维数据时可能存在计算复杂度和噪声影响的挑战 旨在实现空间域的精确描述和定位 通过五个数据集与四个测序平台的应用测试算法性能 数字病理学 NA KPCA 图卷积网络 转录组数据 五个数据集
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