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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12001 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合从胚胎期到老年期的单细胞RNA测序数据,系统描绘卵巢基质细胞的发育轨迹和细胞间通讯网络,并鉴定出CD24阳性间充质祖细胞作为基质细胞起源 | 研究主要基于小鼠模型,人类卵巢中的情况可能需要进一步验证 | 探索卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从胚胎11.5天到12月龄小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12002 | 2025-10-07 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了GPR35在MASLD中调控肝脏分区特异性脂质代谢的机制 | 首次结合空间转录组学、空间代谢组学和脂质代谢组学,在肝脏分区水平上系统解析GPR35调控MASLD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明GPR35在代谢功能障碍相关脂肪肝病中调控肝脏分区特异性基因表达和代谢物分布的机制 | 小鼠肝脏组织,重点关注GPR35缺陷模型在MASLD进展中的变化 | 空间多组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学,空间代谢组学,脂质代谢组学 | NA | 空间基因表达数据,空间代谢物分布数据 | GPR35缺陷小鼠模型 | NA | 空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 12003 | 2025-10-07 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
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研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组和染色质可及性分析揭示卵巢体细胞的进化特征 | 首次在人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子五个物种中整合分析单细胞转录组和染色质可及性数据,揭示卵巢细胞进化规律 | 研究仅针对成年卵巢,未涵盖发育过程;物种数量有限 | 探究不同物种间卵巢体细胞分子机制的保守性与差异性 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢体细胞 | 单细胞多组学 | 卵巢生理与疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 五个物种的卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 12004 | 2025-10-07 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
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研究论文 | 通过比较分析人类iPSC-NK细胞分化与NK细胞发育的转录景观,识别诱导分化过程中的关键缺失因子 | 首次对胎儿肝脏NK细胞和iPSC-NK细胞进行关键分化阶段的比较性单细胞转录组分析,并创建具有NK细胞和巨噬细胞双重特征的STAT5A-iPSC新细胞系 | 未明确说明样本数量和实验重复次数,STAT5A-iPSC新细胞系的功能验证需要进一步临床前研究 | 解析iPSC-NK细胞分化机制以改进治疗性iNK细胞的生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12005 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
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综述 | 总结单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新进展,及其在肿瘤研究中的整合应用 | 整合单细胞转录组和表观遗传测序数据的生物信息学策略,深化对肿瘤发生发展的理解 | 未提及具体实验样本量和数据验证结果 | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用与整合策略 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 12006 | 2025-10-07 |
Generation of renal tubular organoids from adult SOX9+ kidney progenitor cells
2023-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad047
PMID:39872058
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研究论文 | 本研究从成年SOX9+肾脏祖细胞成功生成了肾小管类器官 | 首次证明成年SOX9+肾脏祖细胞具有自主形成肾脏类器官的能力 | 无法分化为肾小球细胞 | 研究SOX9+肾脏祖细胞的分化潜能和类器官形成能力 | 小鼠和人类的SOX9+肾脏祖细胞 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12007 | 2025-10-07 |
Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids
2023-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac034
PMID:39872117
|
研究论文 | 本研究利用人类多能干细胞衍生的脑类器官构建胆固醇暴露模型,揭示母体高胆固醇暴露导致神经祖细胞增殖减少的机制 | 首次使用人类脑类器官建立母体胆固醇暴露模型,并通过单细胞测序发现与自闭症谱系障碍的高度相关性 | 研究基于体外类器官模型,可能与体内真实生理环境存在差异 | 探究母体高胆固醇暴露对后代大脑发育缺陷的影响及其机制 | 人类多能干细胞衍生的脑类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞测序,类器官培养 | 脑类器官模型 | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12008 | 2025-10-07 |
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad006
PMID:39872951
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研究论文 | 本研究利用人类孤雌生殖干细胞成功生成孤雌生殖囊胚结构 | 首次从人类孤雌生殖扩展多能干细胞生成孤雌生殖囊胚结构,为研究基因组印记提供新模型 | 存在发育缺陷和伦理限制,对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 | 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及亲本起源偏倚对人类发育的影响 | 人类孤雌生殖干细胞衍生的扩展多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12009 | 2025-10-07 |
Decoding liver fibrogenesis with single-cell technologies
2022-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac040
PMID:39872749
|
综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术如何改变对肝纤维化调控机制的理解 | 利用单细胞技术揭示肝纤维化过程中疾病相关细胞亚群、分子事件和细胞间相互作用的动态变化 | 尚未完全理解这些变化对肝纤维化的功能贡献,需要进一步研究将新知识转化为有效治疗方法 | 解析肝纤维化的细胞和分子机制 | 肝细胞、肝窦内皮细胞、肌成纤维细胞和巨噬细胞等肝脏细胞类型 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12010 | 2025-10-07 |
ARP2/3 complex affects myofibroblast differentiation and migration in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Mar-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35246
PMID:39472297
|
研究论文 | 本研究探讨ARP2/3复合物在胰腺导管腺癌中对癌症相关成纤维细胞迁移和分化的影响 | 首次揭示ARP2/3复合物在肌成纤维细胞样CAF分化中的关键作用,并发现其特异性影响TGFβ1介导的分化过程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明ARP2/3复合物在胰腺癌微环境中对CAF功能的调控机制 | 胰腺导管腺癌、癌症相关成纤维细胞、胰腺星状细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、微阵列分析、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | p48; LSL-Kras基因工程小鼠、人永生化胰腺星状细胞、原代PDAC来源CAFs | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12011 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations in prostate cancer: Implications for prognosis and immunotherapy
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102255
PMID:39721245
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示前列腺癌中癌症相关成纤维细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 首次系统识别前列腺癌中四个主要CAF亚群(C0 IER2+、C1 ABCA8+、C2 ABI3BP+、C3 MEOX2+),并发现C1 ABCA8+亚群通过NFAT5转录因子促进肿瘤增殖 | 研究样本量未明确说明,体外实验仅使用LNCaP FGC和22Rv1两种细胞系进行验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞在前列腺癌肿瘤微环境中的多重作用及其对预后和免疫治疗策略的影响 | 前列腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚群 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12012 | 2025-10-07 |
Cortisol regulates neonatal lung development via Smoothened
2025-Jan-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03104-0
PMID:39827090
|
研究论文 | 本研究揭示了皮质醇通过竞争性结合Smoothened蛋白的CRD结构域抑制SHH信号通路,从而调控新生儿肺发育的分子机制 | 首次发现皮质醇可直接与SMO蛋白结合并竞争性抑制胆固醇激活的SHH信号通路,阐明其在新生儿肺发育中的新调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究皮质醇在新生儿肺发育中的分子调控机制 | 小鼠肺组织、细胞系 | 发育生物学 | 新生儿呼吸窘迫综合征 | 分子对接模拟、CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、荧光原位杂交 | 基因编辑小鼠模型 | 基因序列数据、图像数据、单细胞转录组数据 | 基因编辑小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12013 | 2025-10-07 |
Elucidating cardiomyocyte heterogeneity and maturation dynamics through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111596
PMID:39811652
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学揭示心肌细胞的异质性和成熟动态 | 识别了过渡性心肌细胞亚群,揭示了连续而非离散的成熟轨迹,并阐明了心肌细胞发育的空间组织 | 仅使用新生小鼠心脏细胞,未涉及其他发育阶段或物种 | 解析心肌细胞异质性及其在心脏发育中的动态变化 | 新生小鼠心脏中的心肌细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 新生小鼠心脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12014 | 2024-11-30 |
Dissecting the effect of genetic variants on atherosclerosis: integrating bulk and single-cell transcriptomics
2025-Jan-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae489
PMID:39607792
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12015 | 2025-10-07 |
Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis
2025-Jan-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123315
PMID:39675550
|
研究论文 | 本研究通过平滑肌细胞特异性CD47基因敲除揭示了TSP1-CD47信号通路在调控血管平滑肌细胞表型和动脉粥样硬化发展中的关键作用 | 首次发现CD47在动脉粥样硬化动脉中表型调制的平滑肌细胞内表达上调,且平滑肌细胞特异性CD47缺失能抑制动脉粥样硬化 | 未观察到体重增加、肝脏和脂肪组织质量、血浆总胆固醇及空腹血糖的显著差异 | 探究平滑肌细胞CD47在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、小鼠模型、人类动脉粥样硬化血管组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、基因敲除、体外细胞实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织切片图像、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12016 | 2025-10-07 |
Elucidating stearoyl metabolism and NCOA4-mediated ferroptosis in gastric cancer liver metastasis through multi-omics single-cell integrative mendelian analysis: advancing personalized immunotherapy strategies
2025-Jan-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01769-z
PMID:39812999
|
研究论文 | 通过多组学单细胞整合孟德尔分析阐明硬脂酰代谢和NCOA4介导的铁死亡在胃癌肝转移中的作用 | 首次整合孟德尔随机化、批量转录组分析和单细胞多组学技术揭示硬脂酰代谢通过铁死亡途径促进胃癌肝转移的机制 | NA | 探究硬脂酰代谢在胃癌肝转移肿瘤微环境异质性中的作用机制 | 胃癌肝转移患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 批量转录组分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 12017 | 2025-10-07 |
BMP6, a potential biomarker of inflammatory fibrosis and promising protective factor for dilated cardiomyopathy
2025-Jan-15, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01062-9
PMID:39825396
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现BMP6是扩张型心肌病的潜在生物标志物和抗纤维化保护因子 | 首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析相结合的方法,鉴定出BMP6在DCM中的特异性表达及其保护作用机制 | NA | 鉴定扩张型心肌病心力衰竭的潜在特异性标志物和干预靶点 | 扩张型心肌病患者心脏组织、动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 孟德尔随机化分析, 动物模型构建, BMP6敲低 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12018 | 2025-10-07 |
A comprehensive analysis to reveal the underlying molecular mechanisms of natural killer cell in thyroid carcinoma based on single-cell RNA sequencing data
2025-Jan-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01779-x
PMID:39808350
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据揭示自然杀伤细胞在甲状腺癌中的分子机制 | 首次整合limma、WGCNA和singleR分析方法系统鉴定甲状腺癌中NK细胞相关枢纽基因,并构建mRNA-miRNA-lncRNA调控网络 | 仅从公共数据库获取数据,缺乏实验验证;KEGG富集分析仅获得两条信号通路 | 探索甲状腺癌中自然杀伤细胞的分子机制以改善疾病管理和治疗 | 甲状腺癌组织和癌旁组织中的自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | limma, WGCNA, singleR, Pearson相关分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12019 | 2025-10-07 |
Predictive value of dendritic cell-related genes for prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025-Jan-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03642-z
PMID:39810206
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研究论文 | 本研究通过筛选树突状细胞相关基因构建预后特征模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 创新性地建立了基于深度学习的预测模型DCRGS,结合单细胞RNA测序和机器学习算法筛选树突状细胞相关基因 | NA | 开发预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, 机器学习算法 | Coxboost, 随机生存森林, 深度学习 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 12020 | 2025-10-07 |
Differential impact of TIM-3 ligands on NK cell function
2025-Jan-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010618
PMID:39773563
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研究论文 | 本研究探讨了四种TIM-3配体对头颈鳞状细胞癌患者自然杀伤细胞功能的差异性影响 | 首次系统比较四种TIM-3配体对NK细胞功能的差异性调控,并确定半乳糖凝集素-9是最具免疫抑制作用的配体 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本来源局限于头颈鳞状细胞癌患者 | 评估TIM-3+ NK细胞在头颈鳞癌中的功能特性,确定不同TIM-3配体的免疫调节作用 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和血液样本中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外杀伤实验,细胞增殖检测,细胞因子分析,数字空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |