单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 11981 - 12000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11981 | 2024-08-05 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Effects of Circadian Rhythm Disruption on the Metabolic Reprogramming of CD4+ T Cells in Alzheimer's Disease
2024-Aug, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03907-6
PMID:38265551
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研究论文 | 这项研究揭示了生物节律失调对阿尔茨海默病CD4+ T细胞代谢重编程的影响 | 提出了一种基于23个生物节律相关基因的CRDscore算法，用于有效分类阿尔茨海默病数据集中生物节律状态 | 缺乏对其他类型免疫细胞的深入研究 | 阐明生物节律相关基因对阿尔茨海默病T细胞免疫功能的影响机制 | 研究阿尔茨海默病中的CD4+ T细胞及其代谢 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, RF | 脑部样本 | 112个脑样本 |
| 11982 | 2024-08-05 |
Colorectal cancer-associated fibroblasts inhibit effector T cells via NECTIN2 signaling
2024-Jul-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216985
PMID:38821255
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研究论文 | 研究揭示了结直肠癌相关成纤维细胞通过NECTIN2信号抑制效应性T细胞的机制 | 首次识别出一种新的免疫抑制性 CAF 群体，并表明 NECTIN2 是T细胞抑制的关键驱动因子 | 尚缺乏对结直肠癌中 CAF 的全面特征描述 | 探究结直肠癌中成纤维细胞的异质性及其对效应性T细胞的影响 | 健康人类结肠和结直肠癌患者中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq 和空间蛋白组学 | NA | 细胞样本 | 近23,000个成纤维细胞 |
| 11983 | 2024-08-04 |
Benchmarking and integrating human B-cell receptor genomic and antibody proteomic profiling
2024-Jul-12, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00402-z
PMID:38997321
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研究论文 | 本文研究了人类B细胞受体和抗体的联合特征分析 | 创新点在于首次对bulkBCR-seq、scBCR-seq和Ab-seq三种技术生成的数据进行了综合分析 | 本研究仍需进一步验证多样本的普遍性 | 研究旨在评估B细胞受体和抗体组库的特征及其相关性 | 研究对象为健康人群的外周血B细胞和血清抗体 | 系统免疫学 | NA | bulkBCR-seq, scBCR-seq, Ab-seq | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 健康人捐赠者的外周血B细胞样本 |
| 11984 | 2024-08-04 |
Deubiquitylase ubiquitin-specific protease 7 plays a crucial role in the lineage differentiation of preimplantation blastocysts†
2024-Jul-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae034
PMID:38438135
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研究论文 | 该文章研究了去泛素化酶USP7在早期胚胎发育中的角色 | 首次揭示USP7在早期胚胎发育过程中通过调节谱系分化和关键表观遗传修饰的作用 | 研究主要集中在小鼠胚胎上，缺乏人类胚胎的相关数据 | 探讨USP7在早期胚胎发育中的功能和机制 | 小鼠胚胎的发育过程及相关基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA干扰, 小分子抑制剂, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎，样本量不明确 |
| 11985 | 2024-08-05 |
Analyzing the molecular mechanism of Scutellaria Radix in the treatment of sepsis using RNA sequencing
2024-Jul-12, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-024-09589-2
PMID:38997656
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研究论文 | 本文系统分析了黄芩根在脓毒症治疗中的分子机制 | 研究基于网络药理学、RNA测序和分子对接，揭示了黄芩根活性成分与靶点之间的关系 | 研究可能受样本量和个体差异的限制 | 探讨黄芩根对脓毒症的治疗作用及其分子机制 | 脓毒症患者与健康志愿者 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者和健康志愿者的样本 |
| 11986 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals plasmid constrains bacterial population heterogeneity and identifies a non-conjugating subpopulation
2024-Jul-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49793-x
PMID:38997267
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研究论文 | 该文章研究了质粒与细菌亚群形成的关系 | 本研究揭示了质粒如何限制细菌群体异质性并识别出不进行结合传递的细胞亚群 | 文章未提及实验的特定局限性 | 研究质粒与细菌亚群形成之间的相互关系 | 细菌亚群体和质粒载体 | 微生物学 | NA | 微生物分裂池连接转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11987 | 2024-08-04 |
[Isolation and characterization of normal mandibular periosteal stem cells from human and macaca mulatta and cross-species single-cell analysis]
2024-Jul-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本文研究了人类和猕猴下颌骨膜干细胞的分离和特征化。 | 首次稳定分离和鉴定正常下颌骨膜干细胞，提供了研究下颌骨膜内膜成骨机制的细胞基础。 | 研究未涉及更多动物模型和临床应用的长时间随访数据。 | 探讨人类和非人灵长类动物下颌骨膜中不同于间充质干细胞的干细胞群体的特性。 | 研究对象为人类和猕猴的下颌骨膜干细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 人类18-24岁患者的下颌膜和6岁猕猴的下颌膜 |
| 11988 | 2024-08-07 |
TMEM176B Promotes EMT via FGFR/JNK Signalling in Development and Tumourigenesis of Lung Adenocarcinoma
2024-Jul-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16132447
PMID:39001509
|
研究论文 | 本研究探讨了TMEM176B在肺腺癌发展中的作用及其通过FGFR/JNK信号通路促进EMT的机制 | 本研究首次揭示了TMEM176B在肺腺癌中的表达增强及其与较短总生存期的关联，并证明了TMEM176B通过FGFR1/JNK/Vimentin/Snail信号通路调控EMT | NA | 探索TMEM176B作为肺腺癌治疗潜在靶点的可能性 | TMEM176B在肺腺癌发展中的作用及其分子机制 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞测序, 蛋白质组学, Co-IP | NA | 组织 | 肺腺癌组织样本 |
| 11989 | 2024-08-05 |
PFHpA alters lipid metabolism and increases the risk of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease in youth-a translational research framework
2024-Jul-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.07.01.24309775
PMID:39006440
|
研究论文 | 本文研究了PFHpA对青少年代谢功能障碍相关脂肪肝病的风险影响 | 本研究首次探讨了PFHpA在青少年中与MASLD风险和进展之间的关系，提供了新策略来识别高风险个体 | 研究的局限性在于尚未全面人类研究PFAS对MASLD的影响 | 旨在识别和理解PFHpA如何影响MASLD的风险和进展 | 研究对象为肥胖青少年及其肝脏代谢 | 数字病理学 | 肝疾病 | 单细胞转录组学 | 3D人肝球体 | 多组学数据 | NA |
| 11990 | 2024-08-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病小鼠模型中的作用 | 发现了一种独特的杆状微胶质细胞亚群，它通过与神经元树突和兴奋性突触输入的相互作用来抑制运动皮层的过度兴奋性 | 本研究仅在小鼠模型中进行，尚需在人类疾病中验证 | 研究微胶质细胞在运动皮层电活动调控中的作用 | 使用TDP-43神经退行性疾病小鼠模型中的微胶质细胞 | 数字病理 | 肌萎缩侧索硬化症 | 多通道探针记录和纵向钙成像 | NA | 细胞RNA测序 | rNLS8小鼠模型中的实验样本 |
| 11991 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Spatial Heterogeneity and Functional Alteration of Endothelial Cells in Chronic Hepatitis B Infection
2024-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25137016
PMID:39000126
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞的空间异质性和功能改变。 | 揭示了内皮细胞的三种亚群体在慢性乙型肝炎感染中的功能变化及其与免疫细胞的相互作用，尤其是VISFATIN/Nampt信号通路的潜在作用。 | 研究中主要使用了小鼠模型，结果可否完全推广至人类尚需进一步验证。 | 研究慢性乙型肝炎感染中内皮细胞的异质性及其功能变化。 | 慢性乙型肝炎感染小鼠肝脏中的内皮细胞。 | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 在小鼠模型中分析了十种细胞类型的内皮细胞 |
| 11992 | 2024-08-05 |
Mapping the Development of Human Spermatogenesis Using Transcriptomics-Based Data: A Scoping Review
2024-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136925
PMID:39000031
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综述 | 本文回顾了人类精子发生的转录组数据和发育过程 | 提供了关于人类睾丸发育的转录特征的新见解，并提出了优化体外成熟的方法 | 对于体细胞谱系的数据有限，尤其是在Sertoli细胞方面存在技术问题 | 描述睾丸从胎儿期到成年期的发育过程，并寻找优化体外成熟的相关信息 | 与原生和体外培养的人类睾丸细胞及单细胞RNA测序相关的研究论文 | 数字病理学 | 无梗阻性无精症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 11993 | 2024-08-05 |
Tumor-associated characteristics and immune dysregulation in nasopharyngeal carcinoma under the regulation of m7G-related tumor microenvironment cells
2024-Jun-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-024-03441-2
PMID:38918785
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研究论文 | 本研究揭示了在m7G相关肿瘤微环境细胞调控下，鼻咽癌微环境中的肿瘤相关特征和免疫失调 | 揭示了m7G调控的肿瘤微环境细胞与鼻咽癌免疫分布及其生物学特征之间的关系 | 本研究未详细探讨m7G修饰的具体机制及其在治疗中的潜在应用 | 探索m7G修饰相关的肿瘤微环境细胞在鼻咽癌中的作用 | 分析来自11个鼻咽癌肿瘤样本和3个鼻咽淋巴增生样本的68,795个单细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞数据 | 68,795个单细胞，来自11个鼻咽癌样本和3个鼻咽淋巴增生样本 |
| 11994 | 2024-08-05 |
Identification of New Chemoresistance-Associated Genes in Triple-Negative Breast Cancer by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2024-Jun-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136853
PMID:38999963
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析识别了与三阴性乳腺癌化学耐药相关的新基因 | 首次揭示了三阴性乳腺癌细胞中转录异质性的显著性，并通过scRNA-seq识别了稀有的抗药性相关细胞亚群 | 未能明确所有机制，特别是在其他亚群中的耐药基因的作用 | 揭示三阴性乳腺癌中化疗耐药的转录特征 | 三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了多种三阴性乳腺癌细胞样本，具体样本数量未说明 |
| 11995 | 2024-08-05 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-Jun-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
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研究论文 | 本研究探讨了KRAS靶向疗法对肿瘤微环境的影响。 | 提出将SOS1和MEK抑制联合用于改善免疫疗法反应的新策略。 | 缺乏持久反应，且肿瘤微环境仍然高度免疫抑制。 | 研究KRAS抑制如何影响肿瘤微环境以增强抗肿瘤效果。 | 使用KrasG12D、p53突变的鼠源性胰腺导管腺癌细胞系进行研究。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 使用多种KPCY细胞系进行实验 |
| 11996 | 2024-08-05 |
Destabilization of mRNAs enhances competence to initiate meiosis in mouse spermatogenic cells
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.557439
PMID:37781613
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研究论文 | 这篇文章探讨了MEIOC如何在小鼠生殖细胞中分子地支持早期减数分裂。 | 该研究首次揭示了MEIOC在减数分裂启动前如何介导转录组变化，并早于之前的认识。 | 本研究主要集中在小鼠模型，结果的普遍适用性可能有限。 | 研究MEIOC如何影响小鼠生殖细胞中的减数分裂启动。 | 小鼠的生殖细胞，特别是有能力启动减数分裂的 spermatogenic cells。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 11997 | 2024-08-04 |
EHMT2 Inactivation in Pancreatic Epithelial Cells Shapes the Transcriptional Landscape and Inflammation Response of the Whole Pancreas
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.584700
PMID:38529489
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研究论文 | 本研究阐明了EHMT2在维持胰腺转录组和炎症反应中的关键作用 | 揭示了EHMT2失活如何重塑局部环境并影响胰腺的炎症反应 | 未提及具体样本数量和研究范围的局限性 | 探讨EHMT2在胰腺炎症中的功能影响 | 采用条件性敲除小鼠模型研究胰腺外分泌细胞中的EHMT2 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq、数字细胞学解卷积、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 条件性敲除动物的胰腺组织样本 |
| 11998 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals granzyme K-expressing cytotoxic Tfh cells in tertiary lymphoid structures in IgG4-RD
2024-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.019
PMID:37652139
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研究论文 | 本研究揭示了在IgG4相关疾病患者的三级淋巴结构中表达颗粒酶K的细胞毒性Tfh细胞。 | 发现了一种新的HLA+GZMK+细胞毒性Tfh细胞亚群，并提出浸润的Tfr细胞可能抑制这些细胞的功能。 | 研究主要集中在IgG4相关疾病患者的特定组织，可能限制了结果的广泛适用性。 | 通过单细胞转录组学识别IgG4-RD患者三级淋巴结构中的GC-Tfh细胞亚群。 | 来自IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞。 | 数字病理 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 已分析的样本来自IgG4相关疾病患者的受累病灶中的CD3+ T细胞 |
| 11999 | 2024-08-05 |
Genome-wide meta-analysis implicates variation affecting mast cell biology in urticaria
2024-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.033
PMID:37690594
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究确定了影响荨麻疹易感性的基因组位点 | 识别了6个基因组位点与荨麻疹相关的常见遗传变异，这些位点涉及肥大细胞生物学中的特定基因 | 缺乏对其他种族或地区的研究结果，这可能限制了结果的普遍性 | 旨在确定影响荨麻疹易感性的基因组位点 | 研究对象为来自三个欧洲队列的荨麻疹病例和对照组 | 数字病理学 | 荨麻疹 | 全基因组关联研究 | NA | 遗传数据 | 14,306个荨麻疹病例和650,664个对照 |
| 12000 | 2024-08-05 |
Unravelling the heterogeneity of oral squamous cell carcinoma by integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data
2024-02, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18108
PMID:38279519
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研究论文 | 本研究通过单细胞和整体转录组数据的综合分析揭示了口腔鳞状细胞癌的异质性 | 识别出四种主要的肿瘤细胞亚群及其独特的分子特征和功能特性，并探讨其与肿瘤微环境的相互作用 | 研究可能没有涵盖所有潜在的亚群和与其相关的临床特征 | 探讨口腔鳞状细胞癌组织中肿瘤细胞的异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 口腔鳞状细胞癌组织中的肿瘤细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |