单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 11981 - 12000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11981 | 2024-08-04 |
Single-cell approaches define two groups of mammalian oligodendrocyte precursor cells and their evolution over developmental time
2024-May-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.03.002
PMID:38579710
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序等技术，对小鼠皮层的前髓鞘细胞进行特征描绘 | 识别和描述了两组局部差异化且具有转录和表观遗传学特征的前髓鞘细胞 | 缺乏对成年前髓鞘细胞在不同环境中行为的深入研究 | 探索前髓鞘细胞在后出生生活中的发育和演变 | 小鼠皮层中的前髓鞘细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，单细胞空间转录组学 | NA | RNA，表观遗传数据 | NA |
| 11982 | 2024-08-05 |
[Dental pulp stem cells in tooth regeneration: advancement and emerging directions]
2024-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文回顾了牙髓干细胞和人类脱落乳牙干细胞在牙齿再生中的应用。 | 提出了单细胞RNA测序和器官样培养系统在精准和可控再生中的应用潜力。 | 再生效率不稳定，仍需进一步研究。 | 探讨牙齿再生领域的最新进展和临床转化应用。 | 牙髓干细胞(DPSC)和人类脱落乳牙干细胞(SHED)。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11983 | 2024-08-05 |
Blimp-1 and c-Maf regulate immune gene networks to protect against distinct pathways of pathobiont-induced colitis
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01814-z
PMID:38609547
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子Blimp-1和c-Maf如何共同调控IL-10来保护免疫网络，防止由病原体引起的结肠炎。 | 揭示了Blimp-1和c-Maf在调控IL-10以及抑制促炎细胞因子中的共同作用，提供了新的见解 | 研究未深入探讨其他转录因子的影响和机制 | 研究Blimp-1和c-Maf在肠道免疫反应中的作用 | 小鼠模型，特别是双缺失Prdm1MafCd4小鼠与感染的反应 | 数字病理学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，RNA测序，ATAC测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠样本涉及不同基因缺失类型 |
| 11984 | 2024-08-05 |
Thioredoxin is a metabolic rheostat controlling regulatory B cells
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01798-w
PMID:38553615
|
研究论文 | 本研究揭示了硫氧还蛋白在调节性B细胞分化和功能中的角色 | 首次揭示了硫氧还蛋白通过调节线粒体电子运输和活性氧水平影响调节性B细胞的分化与功能 | 研究主要集中于系统性红斑狼疮患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索调节性B细胞分化和功能的代谢需求 | 研究调节性B细胞的代谢过程及其在系统性红斑狼疮中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11985 | 2024-08-04 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和空间转录组学，识别慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的配体-受体相互作用 | 创建了一个整合分析框架，以更全面地分析在慢性肾病和MASH中的细胞特异性配体-受体相互作用 | 研究主要基于两个人体群体的数据，可能存在样本偏倚 | 探索慢性肾病和MASH中细胞特异性配体-受体相互作用的分子机制 | 主要研究细胞之间的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 两个可用的人体队列 |
| 11986 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome revealed dysregulated RNA-binding protein expression patterns and functions in human ankylosing spondylitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1369341
PMID:38770048
|
研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎（AS）不同免疫细胞类型中 RNA 结合蛋白（RBP）的表达特征和调控模式。 | 揭示了 AS 患者不同免疫细胞中 RBP 的特定表达特点及其在病理过程中的关键作用。 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 研究 RBPs 在强直性脊柱炎发生和发展中的潜在关键作用。 | 研究对象为健康对照组（HC）和强直性脊柱炎（AS）患者的外周血单核细胞（PBMC）样本。 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | scRNA-seq 和大规模 RNA-seq | NA | RNA 数据 | HC 29 例，AS 10 例，此外还有 NC 3 例，AS 5 例 |
| 11987 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing to Identify an Immunogenic Cell Death-Related 5-Gene Prognostic Signature in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S449419
PMID:38770169
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，识别出与免疫原性细胞死亡相关的5基因预后标志在肝细胞癌中的应用 | 提出了一种新的预后模型，基于免疫原性细胞死亡相关基因的表达来评估HCC患者对免疫治疗的敏感性 | 研究可能受到样本数量和来源的限制，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨免疫原性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用及其与预后的关系 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境中的细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了肝细胞癌样本及细胞系进行验证 |
| 11988 | 2024-08-04 |
Lung tumor-infiltrating Treg have divergent transcriptional profiles and function linked to checkpoint blockade response
2023-09-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg1487
PMID:37713507
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润性调节性T细胞的转录组特征及其在免疫检查点阻断反应中的作用 | 发现了十种人类肿瘤浸润性调节性T细胞的亚群，并揭示了一种特定亚群在抑制PD-1阻断反应中的关键作用 | 研究主要集中在非小细胞肺癌，可能不适用于其他癌症类型 | 旨在理解调节性T细胞在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 主要研究对免疫检查点阻断治疗反应的非小细胞肺癌患者中的调节性T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序/ T细胞受体测序 | NA | NA | 超过73,000个肿瘤浸润性T细胞 |
| 11989 | 2024-08-04 |
Generative modeling of single-cell gene expression for dose-dependent chemical perturbations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100817
PMID:37602218
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的模型scVIDR，用于预测细胞对化学干扰的单剂量和多剂量反应 | 提出了一种基于变分自编码器的新模型，能够更好地预测剂量依赖性的基因表达变化 | 未提及具体样本的限制或本研究的潜在局限性 | 旨在改进对单细胞基因表达在化学干扰下的预测 | 研究小鼠肝细胞、人类血细胞和癌细胞系的细胞反应 | 数字病理学 | 癌症 | 变分自编码器 | VAE | 基因表达数据 | 包括小鼠肝细胞、人类血细胞和癌细胞系的样本 |
| 11990 | 2024-08-04 |
Nextflow Pipeline for Visium and H&E Data from Patient-Derived Xenograft Samples
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550727
PMID:37546876
|
研究论文 | 我们开发了一个自动化数据处理流程，以量化来自患者衍生异种移植样本的鼠和人数据 | 该文章的创新点在于设计了一个基于Nextflow DSL2的流程，首次组合了空间转录组学数据和对应的H&E染色全序列图像的数据处理 | 文章未提及具体的局限性 | 本研究旨在优化对患者衍生异种移植癌症标本的空间转录组学数据和H&E图像的同时处理 | 研究对象为来自四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本的数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学和H&E染色成像 | NA | 图像和基因表达数据 | 四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本 |
| 11991 | 2024-08-05 |
Probe-based bacterial single-cell RNA sequencing predicts toxin regulation
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01348-4
PMID:37012420
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于探针的细菌单细胞RNA测序方法，以研究细菌的转录变异性 | 创新点在于开发了ProBac-seq方法，利用DNA探针库和现有的商业微流体平台进行细菌单细胞RNA测序 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细菌在单细胞水平的转录变异性和相关性 | 研究对象包括拟杆菌和大肠杆菌，以及在病原过程中应用于梭状芽孢杆菌 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次实验测序数千个个体细菌细胞 |
| 11992 | 2024-08-05 |
Preparation of Drosophila Ovarioles for Single-Cell RNA Sequencing
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2970-3_17
PMID:36715913
|
研究论文 | 本文描述了为单细胞RNA测序准备果蝇卵巢的过程 | 提出了一种新的孤立和准备果蝇卵巢以进行单细胞RNA测序的协议 | 研究主要集中在建立方法上，未涉及具体的生物学发现 | 旨在提高果蝇卵巢单细胞RNA测序的准备效率 | 果蝇卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11993 | 2024-08-05 |
Zebrafish neuromesodermal progenitors undergo a critical state transition in vivo
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105216
PMID:36274939
|
研究论文 | 本文评估了斑马鱼神经中胚层祖细胞在脊肠和旁轴中胚层分化前的转变状态模型 | 本研究通过构建复合基因表达图谱，展示了细胞群体异质性在关键时间点的变化，为转变状态模型提供了支持 | 研究仅集中于斑马鱼，可能无法直接推广到其他物种 | 探讨神经中胚层祖细胞的基因表达变化与分化之间的关系 | 斑马鱼神经中胚层祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了一个18ss的单细胞RNA测序数据集 |
| 11994 | 2024-08-05 |
Differential dynamics of peripheral immune responses to acute SARS-CoV-2 infection in older adults
2021-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00127-2
PMID:37118336
|
研究论文 | 本研究考察了COVID-19患者外周血单核细胞的表型、转录组和功能特征，以揭示年龄、时间和疾病严重程度的特定适应性 | 提出了年龄对COVID-19免疫反应影响的新见解，特别是在老年患者中观察到的B细胞和T细胞反应的特征 | 研究未提及样本的地理和种族多样性以及潜在变量的控制 | 研究老年人群体在急性SARS-CoV-2感染中外周免疫反应的动态变化 | 年轻和老年的COVID-19患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞类型相关数据 | 年轻和老年COVID-19患者的外周血样本 |
| 11995 | 2024-08-05 |
Single-cell gene profiling and lineage tracing analyses revealed novel mechanisms of endothelial repair by progenitors
2020-Dec, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03480-4
PMID:32166394
|
研究论文 | 本研究揭示了干/祖细胞在大血管内皮修复中的新机制 | 展示了c-Kit谱系细胞在主动脉内皮更新和替代中的关键作用 | 未详细探讨细胞内在机制和其他类型祖细胞的潜在功能 | 阐明内源性血管干/祖细胞在大血管内皮修复中的角色 | 内源性c-Kit细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验和细胞样本分析 |
| 11996 | 2024-08-05 |
Helicobacter pylori infection and gastric cancer biology: tempering a double-edged sword
2019-Jul, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-019-03044-1
PMID:30783683
|
研究论文 | 本研究探讨了幽门螺杆菌感染与胃癌生物学之间的关系 | 提出幽门螺杆菌研究可作为微生物相关致癌模型的范例，并探讨其在胃癌中的复杂性 | 尚未完全阐明幽门螺杆菌感染对胃癌的机制及难以运用于更难处理的器官 | 研究幽门螺杆菌在胃癌发病机制中的作用 | 幽门螺杆菌对胃及其他器官的致癌影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | 三维类器官模型 | 分子生物学数据 | NA |
| 11997 | 2024-08-04 |
NTCdb: Single-cell transcriptome database of human inflammatory-associated diseases
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.057
PMID:38765608
|
研究论文 | 提出了一个人类炎症相关疾病的单细胞转录组数据库NTCdb | 集成了来自17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞的开放数据，填补了关于免疫细胞数据的空白 | 目前数据库可能仍缺乏广泛的临床样本或特定疾病的细胞数据 | 建立一个关于炎症相关疾病的单细胞转录组数据库，以支持疾病机制的研究 | 单细胞转录组数据，特别是来自炎症相关疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 来源于17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞 |
| 11998 | 2024-08-05 |
Integration of multiomics analyses reveals unique insights into CD24-mediated immunosuppressive tumor microenvironment of breast cancer
2024-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01882-9
PMID:38622285
|
研究论文 | 本研究揭示了CD24介导的乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的独特见解 | 使用多组学分析方法深入探索了CD24与免疫细胞的相互作用及其对预后模型的影响 | 未探讨所有可能的免疫标志物，可能限制了研究的全面性 | 探讨CD24在乳腺癌中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | CD24相关基因及其与免疫细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq和MQIF | 机器学习预后模型 | 基因表达数据 | 基于 bulk RNA-seq 数据构建的风险模型包含1488个差异基因 |
| 11999 | 2024-08-04 |
IGF2BP3 promotes glutamine metabolism of endometriosis by interacting with UCA1 to enhances the mRNA stability of GLS1
2024-May-17, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00834-7
PMID:38760723
|
研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP3在内膜异位症中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了IGF2BP3与UCA1相互作用并增强GLS1 mRNA稳定性对谷氨酰胺代谢的影响。 | 该研究主要在体外和小动物模型中进行，可能无法完全反映人类病理特征。 | 研究IGF2BP3对内膜异位症发生和发展的影响及其分子机制。 | 内异症相关的间质细胞及其谷氨酰胺代谢的相关过程。 | 数字病理学 | 内膜异位症 | RNA免疫沉淀、RNA拉下实验、荧光原位杂交、单细胞空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 异位内膜病变与正常内膜组织的比较分析 |
| 12000 | 2024-08-04 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-May-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
|
研究论文 | 本研究旨在识别与脓毒症相关的线粒体基因并进行分析 | 首次发现四个与脓毒症生存负相关的线粒体基因，提供了脓毒症免疫机制的新见解 | 样本量较小，仅涉及20例脓毒症和12例系统性炎症反应综合征 | 阐明脓毒症患者的线粒体基因机制并为临床治疗提供新思路 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合征患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 32个患者（20例脓毒症，12例SIRS） |