单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40677 篇文献,本页显示第 1181 - 1200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1181 2026-06-09
Gene-Modulated Network Diffusion for Improved Modeling of Amyloid- β Spread in Alzheimer's Disease
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
学术论文 通过基因调控的网络扩散模型改善阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β扩散的建模 将空间转录组学数据(来自Allen人脑图谱)整合到扩展的网络扩散模型中,以调节蛋白质合成项的速率参数,从而反映区域遗传易感性对淀粉样蛋白-β扩散的影响 基线网络扩散模型在机制可解释性方面存在不足 改进阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β病理扩散的建模与预测 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部验证队列中的受试者 机器学习 阿尔茨海默病 NA 网络扩散模型、扩展网络扩散模型 影像数据、基因表达数据 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部队列 NA 空间转录组学 Allen人脑图谱 来自艾伦人脑图谱的空间转录组学数据用于调节区域脆弱性
1182 2026-06-09
Tumor glycosylation engages CD301b-mediated myeloid regulation in breast cancer
2026-May-05, Research square
研究论文 本研究揭示了肿瘤糖基化通过CD301b介导的髓系调控影响乳腺癌进展的机制 首次鉴定了C型凝集素受体CD301b及其人类同源物CLEC10A在乳腺癌微环境中作为免疫调控因子的作用,并建立了跨物种的髓系调控程序连接 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需扩大;具体髓系-肿瘤相互作用的分子机制仍需进一步阐明 探究异常肿瘤糖基化通过凝集素-糖相互作用对乳腺癌免疫微环境的影响及调控机制 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌组织中的髓系免疫细胞 机器学习和转录组学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠模型和人类乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1183 2026-06-09
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1
research paper 使用空间转录组学探索子宫颈腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌的转化 首次通过数字空间分析技术揭示了腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌转化过程中过渡性巢的分子特征,证实了疾病谱系的存在 样本量有限(仅20例,其中4例用于数字空间分析),仍需更大规模研究指导临床决策 阐明腺样基底细胞癌与鳞状细胞癌之间的组织形态学和分子生物学关系,以指导治疗策略 20例腺样基底细胞癌病例,多数伴有鳞状细胞癌、过渡性巢或高级别鳞状上皮内病变亚型 digital pathology 子宫颈癌 DSP, H&E, IHC NA image 20例(其中4例用于数字空间分析) NA spatial transcriptomics NA 数字空间分析(Digital Spatial Profiling)
1184 2026-06-09
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 针对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌,开发出一种基于双特异性T细胞衔接器(CD3×EGFR)的三联疗法,通过激活CD40/CD40L轴逆转免疫抑制 首次提出BC3448、西达本胺和WBP3425三联疗法,通过激活CD40/CD40L轴重塑肿瘤微环境,克服双特异性T细胞衔接器在免疫抑制性肿瘤中的局限性 未提供明确的局限性信息 研究第三代EGFR-TKI耐药非小细胞肺癌的免疫抑制性肿瘤微环境,并开发新型三联疗法恢复T细胞抗肿瘤活性 对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 机器学习 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序、多色荧光染色、多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、空间表达数据 非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
1185 2026-06-09
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-May, Gene therapy IF:4.6Q2
研究论文 结合空间转录组学和单核RNA测序,揭示rAAV2和rAAV9载体在小鼠肝脏中的转导特征及性别差异 首次利用空间转录组学结合单核RNA测序,在空间层面系统描绘了rAAV2和rAAV9载体在雄性和雌性小鼠肝脏中的分布、转导及转录组变化,揭示了性别特异性的脂代谢、昼夜节律和免疫应激反应失调 作为概念验证研究,仅使用CMV-EGFP转基因载体,结果可能受限于单一报告基因和特定血清型,且未涉及不同启动子或治疗性转基因的影响 探究rAAV血清型、性别和肝脏分区对转导效率和转录组变化的影响 rAAV2和rAAV9载体处理的雄性和雌性小鼠肝脏 空间转录组学 基因治疗相关肝脏疾病 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 两种性别(雄性和雌性)、两种血清型(rAAV2和rAAV9)的小鼠肝脏样本 10x Genomics 空间转录组学, 单核RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium空间转录组学平台用于组织切片分析,10x Chromium单核RNA测序平台用于单核转录组分析
1186 2026-06-09
Tumor Matrix Proteoglycan Accumulation and Processing Alter T-cell Effector Function and the Response to Immunotherapy in Patients with Oligometastatic Colorectal Cancer
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
research paper 研究肿瘤基质蛋白聚糖Versican(VCAN)在寡转移结直肠癌患者中如何影响T细胞效应功能及免疫治疗反应 首次在临床试验中评估VCAN蛋白聚糖及其裂解产物versikine对免疫监视和免疫治疗反应的影响,发现VCAN积累与蛋白水解表型(VPP)与循环CD8+ T细胞效应功能和临床结局改善相关 样本量较小(15名患者)的I期临床试验,且未详述机制验证步骤 评估VCAN对结直肠癌免疫监视和免疫治疗反应的影响 寡转移结直肠癌患者的T细胞功能和临床结局 机器学习 结直肠癌 RNA-seq NA 测序数据 243名结直肠癌患者(组织样本)及15名寡转移结直肠癌患者(临床试验) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序用于分析循环免疫表型
1187 2026-06-09
Comprehensive guide for optimizing octopus immune cell preparation to enhance single cell RNA sequencing success
2026-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出一种优化章鱼免疫细胞制备方案以增强单细胞RNA测序成功率的综合指南 首次建立适用于章鱼免疫细胞的单细胞RNA测序方法学框架,解决了血细胞聚集和高盐度化学限制的难题 未提供关于测序深度和细胞类型确认的详细信息 优化章鱼免疫细胞分离方案,实现单细胞RNA测序在非模型海洋物种中的应用 普通章鱼(Octopus vulgaris)的循环血细胞和白体驻留血细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未指定具体数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用低EDTA的MAS培养基兼容10x Genomics化学试剂进行GEM生成、逆转录和cDNA文库构建
1188 2026-06-09
Identification of stem cell marker-positive subpopulations in the vocal fold of the larynx through transcriptomic analyses
2026-Apr-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过转录组分析鉴定喉部声带中干细胞标志物阳性亚群 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术鉴定小鼠声带中的SOX9阳性基底细胞亚群和Lgr5阳性细胞亚群,并成功生成了喉部上皮类器官作为体外模型 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证人类喉部中的相应细胞亚群 探索喉部组织稳态维持机制,鉴定喉部组织干细胞 小鼠喉部黏膜 机器学习 其他疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 类器官培养 NA 基因表达数据 小鼠喉部黏膜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间转录组学通过光隔离化学
1189 2026-06-09
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过多组学分析揭示苯并[a]芘毒性网络在头颈鳞癌中的作用,并确定SERPINE1和STK3为预后生物标志物和治疗靶点 系统整合苯并[a]芘毒性靶点与细胞程序性死亡机制,利用空间转录组学和单细胞测序解析细胞特异性表达模式,并通过分子对接和动力学模拟验证毒物-蛋白相互作用 未提及 阐明苯并[a]芘诱导头颈鳞癌毒性的分子网络,并鉴定预后生物标志物和治疗靶点 苯并[a]芘毒性网络、头颈鳞癌中的细胞程序性死亡机制 机器学习 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 随机森林、支持向量机 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
1190 2026-06-09
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该论文通过整合单细胞RNA测序、TCGA WGCNA和空间转录组学,发现HSPB1是调控结直肠癌中Treg/CD8+ T细胞比例的关键分子,靶向HSPB1可抑制肿瘤生长并解除Treg介导的免疫抑制 首次揭示HSPB1作为结直肠癌内Treg/CD8+ T细胞比例的决定因子,并阐明其通过CCL20-CCR6轴招募Treg的机制,提出靶向HSPB1的双重抗肿瘤作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在临床样本中验证HSPB1抑制剂的疗效和安全性 探索结直肠癌中免疫检查点阻断疗法效果不佳的分子机制,寻找调控肿瘤免疫抑制平衡的关键靶点 结直肠癌肿瘤微环境中的Treg和CD8+ T细胞,以及HSPB1基因 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,流式细胞术,CRISPR-Cas9,RNA-seq NA 基因表达数据,图像 MC38和SW480细胞系,以及皮下肿瘤模型的小鼠样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA-seq,空间转录组学平台用于组织原位分析
1191 2026-06-09
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了成纤维细胞激活蛋白通过非酶促机制与PLAUR/ITGB1相互作用,促进促炎性巨噬细胞极化,从而推动胸主动脉夹层的发展 首次发现FAP通过非酶促位点与巨噬细胞PLAUR直接结合,激活ITGB1/FAK信号通路,介导成纤维细胞-巨噬细胞互作促进TAD进展,为TAD治疗提供新靶点 未明确说明研究的局限性 探究成纤维细胞激活蛋白在胸主动脉夹层发病机制中的作用及其分子机制 人类TAD标本、β-氨基丙腈诱导的TAD小鼠模型、成纤维细胞特异性Fap敲除小鼠 机器学习 心血管疾病 RNA测序 NA 基因表达数据 人类TAD标本和小鼠模型样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1192 2026-06-09
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-04, Trends in immunology IF:13.1Q1
评论 本文讨论了关于长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的重要性,基于遗传命运图谱和单细胞测序的最新发现 揭示了两类细胞群(长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞)共同维持IgE水平,为过敏持久性提供新机制见解 由于是评论文章,未提供实验验证数据,且未讨论不同过敏模型的差异 探讨长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的细胞来源和维持机制 IgE浆细胞和记忆B细胞两类细胞群 机器学习 过敏性疾病 遗传命运图谱、单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1193 2026-06-09
Linking Targeted Pancreatic Cancer Genes With Metabolic Disorders: A Cross-Species Translational Pathway
2026-Apr, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 通过跨物种分析,探究胰腺导管腺癌相关基因与代谢紊乱分子间的相互作用 首次系统整合人类与小鼠脂肪组织及胰腺癌单细胞数据,揭示PDAC复发相关基因与肥胖、糖尿病等代谢通路共享的免疫代谢调控轴 样本量有限且仅采用公开数据集,功能验证仅通过qPCR而未进行基因敲除或动物模型验证 阐明胰腺癌相关基因与代谢紊乱(肥胖、糖尿病、炎症)之间的分子联系通路 胰腺导管腺癌相关基因(ITGAM、PECAM1、CCL5、STAT1、STAT2、CD44)及代谢紊乱通路 生物信息学 胰腺癌,代谢性疾病 RNA-seq NA RNA测序数据 公开数据集(人类及小鼠脂肪组织bulk RNA-Seq、晚期PDAC单细胞RNA-Seq)和人类脂肪组织qPCR样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1194 2026-06-09
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
综述 本文探讨了microRNA在脑组织空间中的调控作用,特别是从3'UTR的视角,总结了当前空间定量miRNA和3'UTR的实验与计算方法 首次从3'UTR视角系统探讨miRNA在脑组织空间中的调控,并指出当前没有方法能同时空间定量miRNA及其靶标3'UTR 目前尚无方法可同时空间定量miRNA和3'UTR,且3'UTR亚型在空间中的变化尚未被充分探索 讨论miRNA在脑组织空间中的调控机制,重点关注神经发育和神经元功能 脑组织中的miRNA和3'UTR 数字病理学 神经系统疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1195 2026-06-09
Downregulated lysyl oxidase in plasma extracellular vesicles: a biomarker linked to brain metastasis risk in lung adenocarcinoma
2026-Mar-12, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 通过多组学分析发现肺腺癌脑转移患者血浆细胞外囊泡中赖氨酰氧化酶(LOX)下调,可作为非侵入性生物标志物 首次系统证明血浆细胞外囊泡来源的LOX蛋白可作为肺腺癌脑转移的非侵入性生物标志物,并提出PI3K/AKT-LOX-细胞外基质调控轴假说 提出了一种基于多组学验证策略的标志物发现框架,但LOX下调机制及临床转化价值仍需进一步验证 鉴定与肺腺癌脑转移相关的血浆细胞外囊泡蛋白标志物 59例IV期肺腺癌患者(30例脑转移 vs 29例非脑转移)的血浆细胞外囊泡 机器学习 肺癌 蛋白质组学,单细胞转录组学,酶联免疫吸附测定 LASSO/RF/SVM 蛋白质组学数据,单细胞转录组数据 发现队列59例,独立验证队列158例 NA NA NA NA
1196 2026-06-09
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
研究论文 FGFR4与HER2共表达与HR+乳腺癌中促炎肿瘤微环境相关 首次在HR+乳腺癌中揭示FGFR4和HER2共表达与促炎肿瘤微环境的关联,提出免疫治疗潜力 样本量较小(94例),且未进一步探索重塑肿瘤免疫微环境的治疗策略 研究FGFR4在不同乳腺癌亚型中的分子特征,为潜在治疗策略提供依据 激素受体阳性(HR+)和阴性(HR-)乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 靶向基因表达谱分析(AmoyDx Master Panel),单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 94例乳腺癌患者(53例HR+,41例HR-) AmoyDx 靶向基因表达谱分析,单细胞RNA测序 AmoyDx Master Panel NA
1197 2026-06-09
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析Col4a5 G5X Alport小鼠模型,发现早期Tnfsf15上调在限制肾小球损伤和蛋白尿中的保护作用 首次在Alport综合征早期阶段通过单细胞测序发现Tnfsf15的保护性上调,并利用基因敲除小鼠模型验证其限制蛋白尿和肾小球损伤的功能 未具体说明研究局限性,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异、早期时间点选择的局限性等 探究Alport综合征早期分子变化及其在疾病发生中的作用,特别是Tnfsf15的功能 Col4a5 G5X Alport小鼠模型(5周和8周龄)的肾小球细胞 数字病理学 Alport综合征 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 Col4a5 G5X Alport小鼠,涉及Tnfsf15基因敲除后比较分析,具体数量未说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1198 2026-06-09
Unveiling hidden variables in stressed bacteria
2026-Feb-24, Cell reports IF:7.5Q1
评论 综述了细菌应激反应中表型异质性背后的隐藏变量,提出看似随机的现象实际由可测定的确定性因素驱动 将细菌应激反应中的表型变异从随机噪声重新定义为可预测的隐藏变量,整合了确定性因素和前沿技术视角 主要基于已有案例和观点论述,缺乏原创实验数据验证 揭示细菌应激反应中表型异质性的隐藏变量,推动预测微生物学发展 细菌细胞及其应激反应行为 机器学习 NA 单细胞RNA测序,微流控 机器学习 图像,文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'基因表达分析系统
1199 2026-06-09
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 提出Gloss预测建模框架,系统关联基因与通路活性至直接细胞间相互作用强度 首次将组套索回归应用于单细胞RNA测序数据,实现可解释的细胞间相互作用强度预测 未明确说明,但基于方法学论文特点,可能存在对复杂相互作用网络的简化假设 开发能系统性关联分子活性与物理细胞间相互作用的计算框架 小鼠肿瘤中髓系-T细胞相互作用及病毒感染中T细胞亚群间相互作用 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 组套索回归 基因表达数据 多项数据集,包括抗Ctla4免疫治疗小鼠肿瘤样本及病毒感染样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1200 2026-06-09
Microbiota-host interaction in colorectal cancer: emerging computational technology, multi-omics integration, and mechanisms
2026-Feb-23, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
综述 本文综述了结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制,包括基因组不稳定性、转录和表观遗传重塑以及代谢重编程,并探讨了新兴计算技术、多组学整合和精准微生物组医学的应用 系统整合了多组学策略和计算工具在解析微生物群-宿主相互作用中的最新进展,并展望了人工智能驱动计算整合和精准微生物组医学在结直肠癌预防、诊断和治疗中的转化潜力 数据组成性、稀疏性和高维度等分析挑战仍阻碍有意义的结果解读 总结结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制,并评估新兴计算技术和多组学整合方法在相关研究中的作用 结直肠癌相关的微生物群与宿主相互作用 machine learning 结直肠癌 高通量测序, 长读长测序, 细菌单细胞空间转录组学 NA 多组学数据(基因组、转录组、表观基因组、代谢组) NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 细菌单细胞空间转录组学(具体平台未明确提及)
回到顶部