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当前共找到 41393 篇文献，本页显示第 1181 - 1200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-06-26 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies Macrophage Heterogeneity and Mitophagy-Related Biomarkers in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104201
PMID:42196184
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序，识别特发性肺纤维化中巨噬细胞异质性和线粒体自噬相关生物标志物 | 首次整合单细胞与批量RNA测序分析，揭示巨噬细胞-线粒体自噬轴在特发性肺纤维化发病机制中的新框架 | 基于公共数据库和计算分析，缺乏独立外部验证队列 | 阐明特发性肺纤维化中巨噬细胞与线粒体自噬之间的关联，并筛选潜在生物标志物用于早期诊断和临床管理 | 巨噬细胞亚群（M2型巨噬细胞）和特发性肺纤维化患者样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1182 | 2026-06-26 |
Regenerative potential of Schneiderian membrane-derived mesenchymal stem cells in sinus floor elevation model and calvarial defect model
2026-May-08, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400611
PMID:42343636
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研究论文 | 本研究评估了上颌窦黏膜间充质干细胞在窦底提升和颅骨缺损模型中的骨再生潜力 | 首次在体内验证了SMMSCs的成骨能力，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子特征 | 未在文中明确提及 | 评估施耐德膜对窦底提升的贡献并验证SMMSCs在颅骨缺损中的功能 | 上颌窦黏膜间充质干细胞（SMMSCs）和骨髓间充质干细胞（BMSCs） | 数字病理学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 兔子（双侧窦底提升）和人类施耐德膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 1183 | 2026-06-26 |
Multi-omics reveals CXCR4 drives immune escape in colorectal cancer via metabolic reprogramming and immune microenvironment remodeling
2026-May-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08795-x
PMID:42082463
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research paper | 采用整合单细胞转录组学和代谢组学分析，揭示CXCR4通过代谢重编程和免疫微环境重塑驱动结直肠癌免疫逃逸的机制 | 发现CXCR4通过调节PI3K-Akt-SMAD4通路介导代谢重编程，并通过谷氨酰胺代谢-免疫微环境双轴调控促进免疫逃逸，靶向CXCR4可增强PD-1抑制剂疗效 | NA | 揭示CXCR4在结直肠癌免疫抑制微环境和谷氨酰胺代谢重编程中的关键作用 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8 T细胞 | machine learning | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、代谢组学、基因敲除、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1184 | 2026-06-26 |
Identifying batch-integrated domains from spatial transcriptomics via graph autoencoder with contrastive learning based on cross-modality and data augmentation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag248
PMID:42184117
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research paper | 提出GCAST框架，一种基于图对比自编码器的空间转录组学方法，通过跨模态对比学习和数据增强识别批次整合的组织域 | 首次将跨模态对比学习与图自编码器结合，利用组织学和基因权重特征增强生物学可解释性，并自动对齐多数据集实现批次效应校正 | NA | 开发一种统一的、生物学信息引导的框架，以整合多模态空间转录组数据，识别组织域并实现批次效应校正 | 空间转录组学数据及其对应的组织学图像 | computer vision, machine learning | NA | 空间转录组学 | 图对比自编码器 | 基因表达数据, 组织学图像 | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1185 | 2026-06-26 |
AnnQ: reference-based quantification of cellular abnormality at single-cell resolution
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag278
PMID:42218718
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研究论文 | AnnQ是一种基于参考的量化方法，能够在单细胞分辨率下评估细胞异常性 | 将细胞注释中的不确定性转化为量化指标，用于检测异常细胞状态，这是传统聚类和差异丰度分析无法实现的 | 未提及 | 提出一种利用参考数据集量化单细胞RNA测序中细胞异常性的方法 | 遗传扰动和耐药性数据集中的单细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1186 | 2026-06-26 |
scTumorDrug: predicting cell-type-specific drug responses for heterogeneous tumors
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag337
PMID:42341215
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研究论文 | 开发了scTumorDrug工具，整合单细胞RNA测序、批量RNA和药物响应数据，预测异质性肿瘤中细胞类型特异性药物反应 | 首次在来自小鼠模型和临床人类样本的真实肿瘤上直接验证细胞类型特异性药物反应预测，结合空间转录组学进行交叉验证 | 缺乏来自肿瘤亚群药物响应的直接实验验证，仅通过小鼠模型和空间转录组学间接验证 | 预测异质性肿瘤中细胞类型特异性药物反应，以实现精准医疗 | 细胞系、小鼠模型和临床人类样本中的肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物响应数据 | 公开数据集（细胞系、小鼠模型、临床人类样本）及小鼠膀胱肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1187 | 2026-06-26 |
scDeepAPA: a deep learning framework for single-cell alternative polyadenylation identification
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag339
PMID:42341216
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研究论文 | 提出了scDeepAPA，一个针对单细胞RNA测序数据优化的深度学习框架，用于准确识别多聚腺苷酸化位点、定量异构体并解析APA事件的功能影响 | 首次将Mamba状态空间模型与双向LSTM和卷积特征提取相结合，专门针对单细胞RNA测序数据设计，无需依赖基因注释即可实现高精度APA识别 | NA | 开发适用于单细胞转录组学的多聚腺苷酸化位点检测与功能解读计算方法 | 人类和小鼠单细胞RNA测序数据，阿尔茨海默病小鼠脑组织数据，KRAS突变小细胞肺癌数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络, 双向LSTM, Mamba状态空间模型 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1188 | 2026-06-26 |
Tumor Electric Field Therapy Inhibits Epithelial-Mesenchymal Transition, Invasion, and Migration of Glioblastoma by Targeting the c-FOS/CXCL14 Axis
2026-May, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70926
PMID:42153722
|
research paper | 本研究揭示了肿瘤电场疗法通过c-FOS/CXCL14轴抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化、侵袭和迁移的机制 | 首次阐明肿瘤电场疗法通过c-FOS/CXCL14轴抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化的新机制 | NA | 探究肿瘤电场疗法抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化、侵袭和迁移的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系（U87、U251、T98G）及原位裸鼠模型 | machine learning | lung cancer | RNA-seq, 单细胞测序, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 三个胶质母细胞瘤细胞系及原位裸鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1189 | 2026-06-26 |
Multi-Omics Analysis and Mechanistic Validation Reveal RPS8 as a Novel Prognostic Biomarker and Therapeutic Target for Hepatocellular Carcinoma
2026 May-Jun, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70116
PMID:42216580
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研究论文 | 通过多组学分析和机制验证，揭示RPS8作为肝细胞癌的新型预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统研究核糖体蛋白S8在肝细胞癌进展中的作用及其通过激活内质网应激通路的分子机制 | 尚需进一步验证RPS8在更大临床样本中的预后价值及其治疗靶点的可行性 | 阐明RPS8在肝细胞癌进展中的生物学功能、临床相关性及其调控机制 | 肝细胞癌中的RPS8基因 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全转录组测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 公开数据集TCGA和GEO中的肝细胞癌样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 1190 | 2026-06-26 |
Post-Stroke Depression Is Associated With Shared Neurodevelopmental Risk and Circuit Disruption
2026-May, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71502
PMID:42178876
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研究论文 | 该研究整合了跨疾病基因组学、发育性空间转录组学和因果神经影像学，揭示了卒中后抑郁（PSD）与共享的神经发育风险和回路破坏相关 | 首次将发育性遗传风险（E16.5小鼠胚胎脑）与卒中后抑郁的神经回路异常（DMN-SMN去耦联）直接关联，并识别HDAC9和PITX2为潜在通路靶点 | 样本量较小（16例PSD患者和14例对照），且依赖发育小鼠模型数据，未在人类发育组织中验证 | 阐明卒中后抑郁（PSD）的生物学基础，特别是遗传、发育和神经回路层面的机制 | 16例卒中后抑郁（PSD）患者和14例匹配对照 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 空间转录组学, fMRI | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 16例PSD患者和14例匹配对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 功能磁共振成像（fMRI） | NA | NA |
| 1191 | 2026-06-26 |
COX2+/PDGFRα+ fibroblasts selectively localize near bile ducts and interact with immune cells in early liver fibrosis in mice
2026-May, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70938
PMID:42178880
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠肝脏中PDGFRα阳性成纤维细胞的异质性，发现COX2+亚群在早期肝纤维化中优先定位于胆管周围并与免疫细胞相互作用 | 首次揭示COX2阳性PDGFRα阳性成纤维细胞亚群在早期肝纤维化中与免疫细胞的优先相互作用，并发现其定位于胆管周围的独特空间分布特征 | 仅基于小鼠模型研究，未在人类样本中验证；未深入探讨COX2阳性亚群在纤维化进展中的具体功能机制 | 阐明PDGFRα阳性成纤维细胞在早期肝纤维化中的细胞异质性及其与免疫细胞的相互作用机制 | 健康小鼠和胆管结扎诱导肝纤维化小鼠肝脏中的PDGFRα阳性成纤维细胞及免疫细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1192 | 2026-06-26 |
Somatic Mutation Trajectories Define Prognostically Distinct Subtypes and Shape the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2026-Apr-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050536
PMID:42194993
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研究论文 | 通过重构体细胞突变轨迹，定义胃癌中预后不同的亚型并揭示其肿瘤微环境特征 | 首次应用SuStaIn算法推断胃癌体细胞突变累积的时间顺序，识别出两种预后截然不同的进化轨迹（加速路径和渐进路径），并系统关联了转录组、肿瘤微环境和药物敏感性特征 | 计算药物敏感性预测及基因表达模式与临床结局之间的机制联系为假说生成性发现，需前瞻性和功能性验证 | 通过重构体细胞突变轨迹，识别胃癌中预后不同的亚型并研究其转录组与微环境特征 | 胃癌患者的体细胞突变、基因表达、肿瘤微环境特征及药物敏感性 | 机器学习 | 胃癌 | NGS | SuStaIn算法 | 基因突变数据、转录组数据 | TCGA-STAD队列及三个独立外部转录组队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1193 | 2026-06-26 |
Characterizing Infiltrating Macrophages in Intracranial Aneurysm with IA Animal Models and Spatial Transcriptomics
2026-Apr-29, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01437-6
PMID:42053685
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综述 | 总结颅内动脉瘤中浸润性巨噬细胞的研究现状，并介绍用于研究巨噬细胞浸润的动物模型和空间转录组学方法 | 结合空间转录组学和动物模型，系统性总结浸润性巨噬细胞在颅内动脉瘤中的特征，包括其发生起源、转录组谱及与其他细胞亚群的相互作用 | 空间转录组学受限于样本可用性，动物模型的应用需要谨慎以转化研究解决未满足的临床需求 | 理解颅内动脉瘤病理生理学，识别潜在治疗靶点 | 颅内动脉瘤中的浸润性巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1194 | 2026-06-26 |
Spatial profiling of chronic liver disease: a pilot spatial case series
2026-Apr-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49400-7
PMID:42010014
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研究论文 | 利用基于测序的空间转录组学对酒精性肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎患者的肝脏组织进行空间分析，揭示慢性肝病组织可能共享重复的假小叶功能结构 | 首次采用病毒感知工作流程的空间转录组学进行慢性肝病空间病例系列研究，实现丙肝病毒RNA原位检测、组织学指导的微环境注释及细胞间通讯分析，发现跨病因的共享假小叶功能架构 | 样本量小（仅4例通过质控），为初步试点研究；乙型肝炎样本未纳入核心分析，结论外推性受限 | 探究不同病因慢性肝病在保留组织学背景下的空间组织规律 | 酒精性肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎患者肝脏八份组织样本（其中四份通过质控） | 数字病理学 | 肝病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 四例通过质控的慢性肝病患者肝脏组织 | NA | 空间转录组学 | NA | 基于测序的空间转录组学，包含病毒感知工作流程（用于丙肝病毒RNA原位检测） |
| 1195 | 2026-06-26 |
Advances in the Genetics and Molecular Biology of Brain Arteriovenous Malformations
2026-Apr-18, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01436-7
PMID:41999461
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综述 | 本文综述了脑动静脉畸形在遗传学和分子生物学方面的最新进展，包括体细胞突变、转录组图谱和动物模型的研究 | 揭示了KRAS和BRAF体细胞突变在散发性bAVM内皮细胞中的关键作用，以及RAS/MAPK通路激活驱动异常血管生成的新机制 | 临床转化仍面临挑战，原因是变异等位基因频率低且组织获取受限 | 总结bAVM的遗传和分子机制进展，为靶向治疗提供基础 | 脑动静脉畸形的内皮细胞、体细胞突变和血管病变 | 分子生物学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、全转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1196 | 2026-06-26 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715992
PMID:41993471
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研究论文 | 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR扰动技术，揭示了衰老通过限制CXCL13+ T滤泡辅助细胞的成熟来削弱人类体液免疫的机制 | 首次发现人类特异性CXCL13+ Tfh细胞在衰老过程中成熟受阻，并确定BACH2和SOX4为年龄相关的分化转录调控因子 | 研究仅基于扁桃体类器官模型，可能无法完全反映体内复杂免疫微环境；样本量较小且未涉及其他淋巴组织 | 探究人类免疫衰老过程中抗体反应下降的B细胞和T细胞相对贡献，以及CXCL13 Tfh细胞的调控机制 | 人类扁桃体样本（来自年轻和老年供体） | 机器学习和数字病理学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序、CRISPR扰动、类器官培养 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 涉及年轻和老年供体的扁桃体类器官样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1197 | 2026-06-26 |
ISL1 Restricts Progenitor Programs and Promotes β-Cell Maturation, Revealing Sex Differences in Diabetes Progression
2026-04-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0673
PMID:41700921
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研究论文 | 通过条件性敲除Isl1结合单细胞测序和染色质分析，揭示ISL1在维持内分泌细胞身份和促进β细胞成熟中的关键作用，并发现性别差异影响糖尿病进展 | 首次阐明ISL1在抑制中间祖细胞程序、促进染色质重塑及β细胞终末分化中的新角色，并揭示性别特异性响应影响糖尿病进程 | 研究基于小鼠模型，人类胰岛中ISL1功能的直接验证尚需进一步研究；未深入探讨性别差异的分子机制 | 阐明ISL1在胰岛内分泌细胞分化和成熟中的分子功能及其与糖尿病进展的关联 | 小鼠胰岛细胞（特别是α细胞、β细胞、δ细胞和γ细胞） | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序（H3K27ac和H3K27me3） | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、染色质组蛋白修饰数据 | Isl1条件性敲除小鼠（Isl1CKO）及其对照胰岛样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 文库制备 |
| 1198 | 2026-06-26 |
Activation of the Pancreatic "Metabolic Synapse" Aggravates Type 2 Diabetes Mellitus by Inducing PANoptosis in β-Cells
2026-04-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0863
PMID:41701561
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研究论文 | 提出了“代谢突触”新概念，揭示胰腺成纤维细胞通过谷氨酸-NMDAR信号轴诱导β细胞PANoptosis，加剧2型糖尿病进展 | 首次提出“代谢突触”概念，发现成纤维细胞-β细胞新型通信途径，阐明谷氨酸-NMDAR轴在2型糖尿病发病机制中的作用 | 未提及具体局限性 | 探究胰腺成纤维细胞在β细胞功能障碍和2型糖尿病进展中的作用机制 | 胰腺成纤维细胞和β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞测序, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1199 | 2026-06-26 |
A Novel CRYBB2 Splicing Mutation Is Associated With Lens Extracellular Matrix Remodeling and Vascular Alterations in Congenital Cataract
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.36
PMID:41989229
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研究论文 | 在一个先天性白内障家系中发现新的CRYBB2剪接突变，并通过功能研究揭示其导致晶状体细胞外基质重塑和血管改变的机制 | 首次报道CRYBB2剪接位点突变导致晶状体细胞外基质重塑和玻璃体血管异常，且通过单细胞转录组学揭示晶状体与血管间的非细胞自主性相互作用 | 研究主要基于斑马鱼模型，人类晶状体组织的直接验证有限；突变对晶状体发育的长期影响未充分探讨 | 鉴定先天性白内障的遗传病因并解析CRYBB2剪接突变导致眼部表型的分子机制 | 一个常染色体显性遗传先天性白内障大家系及其成员 | 数字病理学 | 先天性白内障 | 全外显子测序, Sanger测序, RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫染色, 细胞黏附实验 | NA | 测序数据, 图像数据 | 一个大家系中的多名成员；斑马鱼模型（未明确具体数量） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 全外显子测序和单细胞RNA测序平台 |
| 1200 | 2026-06-26 |
[Comprehensive Analysis of Spatial and Temporal Tumor Heterogeneity of Immune Checkpoint Molecules in GastricCancer]
2026-Apr, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:42178627
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综述 | 综合分析了胃癌中免疫检查点分子的空间和时间肿瘤异质性 | 通过单细胞分析和空间转录组学的新进展，揭示了肿瘤免疫相互作用的复杂生物异质性，包括免疫抑制性肿瘤生态系统的空间定位和治疗干预对免疫检查点分子表达动态的影响 | 未提及具体限制，但作为综述可能受限于现有研究的范围和样本量 | 总结胃癌中免疫检查点分子的空间和时间异质性，并讨论其临床意义及生物标志物解读的考量 | 胃癌中的免疫检查点分子及肿瘤免疫相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |