单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 41090 篇文献，本页显示第 1181 - 1200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-06-18 |
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-01-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.009
PMID:38096816
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研究论文 | 通过MADM-CloneSeq技术分析小鼠上丘的发育谱系，揭示径向胶质前体细胞的多能性及PTEN依赖的细胞类型比例调控机制 | 首次在单细胞水平建立哺乳动物上丘发育的谱系框架，发现单个径向胶质前体细胞可产生所有兴奋性和抑制性神经元类型，并揭示PTEN信号调控不同神经元类型的适当比例 | 未明确说明实验样本量大小及是否涵盖所有上丘区域或发育阶段 | 阐明哺乳动物上丘细胞类型多样性的发育原理 | 小鼠上丘的径向胶质前体细胞及其产生的兴奋性和抑制性神经元与胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 遗传镶嵌分析, MADM-CloneSeq | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | MADM-CloneSeq（基于遗传镶嵌分析与双标记的单细胞克隆分析） |
| 1182 | 2026-06-18 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
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研究论文 | 介绍STOmicsDB，一个综合性的空间转录组学数据库，用于数据共享、分析和可视化 | 整合218个手工整理的数据集，涵盖17个物种，并支持用户自定义子数据库和快速可视化百万细胞 | 未明确说明局限性，但可能依赖手动整理数据集的完整性和覆盖范围 | 为空间转录组学数据提供一站式共享、分析和可视化平台 | 空间转录组学数据集（218个数据集，涵盖17个物种） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 218个数据集，涵盖17个物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1183 | 2026-06-18 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
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研究论文 | StemDriver是一个综合性知识库，致力于功能注释参与造血干细胞命运决定的基因 | 利用单细胞RNA测序数据构建了完整的造血谱系图谱，并提供了标准化的数据分析流程 | 当前版本仅整合了42项研究数据，覆盖14种组织类型，可能未涵盖所有相关数据 | 为参与造血干细胞命运决定的基因提供功能注释和参考数据集 | 造血干细胞和成熟细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类样本23,839个基因，小鼠样本29,533个基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1184 | 2026-06-18 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma
2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.03.573968
PMID:38260522
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研究论文 | 通过瘤内注射TLR9激动剂CpG增强自发性肉瘤小鼠模型对放疗的应答 | 首次在自发性肉瘤模型中验证CpG联合放疗对CD8 T细胞的依赖性机制，并结合CRISPR/Cas9和化学致癌物MCA构建高肿瘤突变负担模型 | 未在人体临床试验中验证，且机制研究主要基于小鼠模型 | 探究TLR9激动剂CpG增强放疗对软组织肉瘤的免疫应答机制 | 自发性软组织肉瘤小鼠模型 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | CRISPR/Cas9, 化学诱导, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | 自发性肉瘤小鼠模型，具体数量未在摘要中给出 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1185 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460442
PMID:39835127
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序，揭示了加强免疫策略下Omicron突破感染的外周免疫特征 | 首次在单细胞水平系统解析Omicron突破感染后的免疫特征，发现加强疫苗诱导的积极抗病毒潜力以及第四剂吸入式Ad5-nCoV可能引发的“训练免疫”现象 | NA | 研究加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的外周免疫特征 | 15例外周血单核细胞（PBMC）样本，包括Omicron感染者和未感染但加强免疫的对照 | 单细胞转录组学 | Omicron突破感染 | 单细胞RNA测序，T细胞/B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，TCR/BCR测序数据 | 15例外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞TCR/BCR测序 | NA | NA |
| 1186 | 2026-06-18 |
Coordinated immune dysregulation in Juvenile Dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.07.566033
PMID:37986917
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研究论文 | 利用单细胞基因组学揭示青少年皮肌炎中协调的免疫失调 | 首次通过单细胞转录组学与表面蛋白表达结合的方法，系统分析了JDM患者不同疾病活动阶段的血液免疫细胞状态，发现B细胞向未成熟幼稚状态的偏移是JDM的标志，并揭示I型干扰素反应在免疫群体中的过度激活与蛋白质加工和细胞死亡调控的功能障碍相协调 | 未提及明显的局限性，但可能受限于样本量或仅基于血液样本的分析，未涉及组织层面 | 阐明青少年皮肌炎（JDM）从免疫系统失调中出现的机制，以提供恢复免疫平衡的策略 | 青少年皮肌炎（JDM）患者的外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞基因组学 | 青少年皮肌炎 | 单细胞转录组学、表面蛋白表达分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、表面蛋白表达数据 | JDM患者处于不同疾病活动阶段的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞转录组学与表面蛋白表达（CITE-seq） |
| 1187 | 2026-06-18 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
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研究论文 | 通过CRISPR-人类类器官-单细胞RNA测序系统筛选36个高风险的孤独症谱系障碍相关基因，揭示了它们对脑细胞命运决定的调控作用 | 开发了CHOOSE系统，结合CRISPR-Cas9基因编辑、人类大脑类器官模型和单细胞转录组学，实现了在嵌合类器官中进行高通量功能缺失筛选 | NA | 研究孤独症谱系障碍高风险基因在人类脑发育过程中的细胞类型特异性功能 | 孤独症谱系障碍相关的36个转录调控基因 | 机器学 | 孤独症谱系障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 诱导多能干细胞 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质模态数据 | 36个高风险基因扰动实验, 患者特异性诱导多能干细胞来源的类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1188 | 2026-06-18 |
Intra-heterogeneity in transcription and chemoresistant property of leukemia-initiating cells in murine Setd2-/- acute myeloid leukemia
2021-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12189
PMID:34196511
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研究论文 | 该研究在Setd2基因敲除的小鼠急性髓系白血病模型中鉴定出两种具有不同转录组和耐药特性的白血病起始细胞亚群 | 首次在Setd2敲除AML模型中揭示了共存白血病起始细胞在转录组和化疗响应方面的异质性，并发现RAS通路激活与阿霉素耐药性相关 | 研究仅基于单一小鼠模型（Setd2-/-），未在人类AML样本中验证，且未深入探讨两种LIC亚群之间的相互作用机制 | 阐明白血病起始细胞在同一个体中的功能异质性，特别是药物响应的差异 | Setd2基因敲除小鼠急性髓系白血病模型中的白血病起始细胞（LICs） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA-seq,全基因组测序,流式细胞术 | NA | 转录组数据（bulk和单细胞）,基因组数据（全基因组测序） | 原代Setd2-/- AML小鼠脾细胞移植到C57BL/6受体小鼠，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1189 | 2026-06-17 |
Reprogramming macrophages to treat liver diseases
2026-Jul-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001160
PMID:39716928
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综述 | 综述了利用重新编程巨噬细胞治疗肝脏疾病的最新研究进展 | 结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了肝脏巨噬细胞的异质性和多功能角色，并提出了基于纳米技术的巨噬细胞靶向治疗策略 | 巨噬细胞来源的循环可溶性标志物仅部分反映肝脏巨噬细胞亚群的复杂性，且涉及的多重调控机制和多样群体仍需进一步研究 | 综述调节肝脏疾病中巨噬细胞行为的潜在靶点，并探讨巨噬细胞靶向治疗以恢复肝脏稳态的治疗方法 | 肝脏巨噬细胞（包括常驻组织Kupffer细胞和单核细胞来源的巨噬细胞） | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 1190 | 2026-06-17 |
Alterations in NK cell subsets and the regulatory role of JAB1 in nasopharyngeal carcinoma with implications for tumor immunity and biomarker development
2026-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03397-y
PMID:41992060
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研究论文 | 本文研究了鼻咽癌患者血液中NK细胞亚群的变化，并探讨了JAB1在塑造肿瘤免疫环境中的作用 | 首次揭示JAB1在NK细胞中增强细胞毒性作用，并发现CD16+CD57+NK细胞与良好预后相关，而CD16- NK细胞预示较差预后，同时JAB1和CD107a的组合在诊断和预后方面优于传统肿瘤标志物 | NA | 研究鼻咽癌中NK细胞亚群的变化及JAB1在肿瘤免疫中的调节作用，为生物标志物和免疫治疗靶点开发提供依据 | 鼻咽癌患者的NK细胞亚群及JAB1基因 | 机器学习 | 鼻咽癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 鼻咽癌患者血液和外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1191 | 2026-06-17 |
Single-cell landscape of goose thymus uncovers developmental and regulatory dynamics of T cell differentiation
2026-Jul, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106951
PMID:42061246
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研究论文 | 通过对浙东白鹅胸腺进行单细胞转录组分析，揭示了从胚胎到成年各阶段T细胞分化的发育和调控动态 | 首次构建了家禽胸腺发育的单细胞转录组图谱，发现了禽类特有的γδT细胞富集和T细胞分化路径的物种特异性差异 | 研究主要基于浙东白鹅，可能无法完全代表其他禽类或品种；未深入验证调控机制的功能 | 揭示禽类胸腺中T细胞分化的发育动态和调控机制 | 浙东白鹅胸腺细胞（涵盖胚胎、雏鹅、幼鹅和成年四个阶段） | 机器学习和单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 多个胸腺样本（涵盖胚胎、雏鹅、幼鹅和成年阶段） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1192 | 2026-06-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks
2026-Jul, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107004
PMID:42061263
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制鸭脂肪祖细胞的图谱，揭示不同脂肪沉积部位的分子异质性和调控机制 | 首次在鸭胸肌、皮下和内脏脂肪组织中构建了脂肪祖细胞的单细胞图谱，揭示了不同脂肪沉积部位的细胞异质性、谱系动力学和微环境特异性调控 | 未提及具体限制 | 探究鸭不同脂肪沉积部位（胸肌、皮下和内脏脂肪）中脂肪祖细胞的调控机制 | 鸭的脂肪祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自胸肌、皮下脂肪和内脏脂肪组织的鸭脂肪祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1193 | 2026-06-17 |
NAT10-dependent ac4C mRNA modification programs fibroblast pathogenicity in systemic sclerosis
2026-07, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108247
PMID:42140328
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研究论文 | 研究揭示NAT10依赖性ac4C mRNA修饰在系统性硬化症中调控成纤维细胞致病性的机制 | 首次发现NAT10介导的ac4C RNA修饰在系统性硬化症成纤维细胞激活和纤维化重塑中的致病作用，并鉴定COL11A1和ZNF621为下游靶点 | 未完全阐明NAT10在纤维化疾病中的具体调控网络，且药物抑制的长期效应和安全性尚需进一步验证 | 探讨NAT10介导的ac4C RNA修饰在成纤维细胞激活和纤维化重塑中的作用，为纤维化疾病提供潜在治疗策略 | 系统性硬化症患者的皮肤样本和成纤维细胞，以及小鼠模型 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组测序、多组学分析 | NA | 转录组数据、体外实验数据、体内模型数据 | 涉及人类系统性硬化症皮肤样本、体外细胞实验、体内小鼠模型及成纤维细胞特异性基因敲除小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1194 | 2026-06-17 |
Kupffer cell plasticity regulates hepatic immunity in mycobacterial infection
2026-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.02.024
PMID:41791462
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研究论文 | 探讨库普弗细胞在分枝杆菌感染中的可塑性及其对肝脏免疫的调控作用 | 发现胚胎起源的库普弗细胞在慢性分枝杆菌感染中展现出高度可塑性，可转化为具有抗分枝杆菌功能的独特亚群（KClow），挑战了传统认为它们是终末分化细胞的观点 | 未提及 | 研究库普弗细胞在持续性分枝杆菌感染中的可塑性及其起源对功能的影响 | 库普弗细胞及单核细胞来源的巨噬细胞在小鼠分枝杆菌感染模型中的角色 | 数字病理学 | 分枝杆菌感染 | ATAC测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、高分辨率成像、免疫表型分析 | NA | 测序数据、图像数据 | 小鼠模型，包括Ccr2-/-和Irf8-/-基因敲除小鼠及骨髓移植小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、ATAC测序 | NA | NA |
| 1195 | 2026-06-17 |
Blockage of cuproplasia inhibits pancreatic tumour-associated neutrophils infiltration through TRAF6/STAT3/CCL2 pathway
2026-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03371-8
PMID:41981139
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研究论文 | 研究发现铜转运蛋白CTR1过表达通过TRAF6/STAT3/CCL2通路促进胰腺导管腺癌中肿瘤相关中性粒细胞浸润，靶向铜代谢可重塑肿瘤微环境并增强化疗效果 | 首次揭示细胞内铜代谢调节分子CTR1通过TRAF6/JAK/STAT3信号轴转录激活CCL2趋化因子，进而调控肿瘤相关中性粒细胞（TANs）浸润的分子机制，并证明靶向铜稳态可协同吉西他滨克服耐药性 | 未在临床样本中验证铜靶向干预的治疗效果，且缺乏对铜代谢异常与其他免疫细胞亚群互作的系统性分析 | 阐明胰腺导管腺癌中铜代谢异常对肿瘤免疫微环境的影响及其分子机制 | 胰腺导管腺癌组织样本、细胞系、原位肿瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、趋化因子阵列、分子生物学检测 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 胰腺导管腺癌组织样本（未明确数量）、细胞系、原位肿瘤小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 1196 | 2026-06-17 |
Regulatory logic underlying neural crest contributions to the head versus the heart
2026-Jun-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512031123
PMID:42296344
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研究论文 | 探究转录因子差异使用如何调控心脏神经嵴细胞身份，揭示神经嵴发育中的区域特异性调控机制 | 首次发现并鉴定两个相邻增强子：一个心脏神经嵴特异性增强子含TGIF结合位点，另一个颅面和心脏神经嵴共有增强子含TFAP2B结合位点，并证明TFAP2B位点突变特异性消除颅面神经嵴表达 | 未明确说明具体局限性 | 阐明神经嵴细胞轴向水平特异性转录程序背后的调控机制，特别是心脏神经嵴细胞命运决定的调控逻辑 | 鸡胚胎和斑马鱼胚胎中的颅面神经嵴细胞与心脏神经嵴细胞 | 机器学习 | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1197 | 2026-06-17 |
[Impact of bone metastasis on the prognosis of lung adenocarcinoma patients treated with third-generation EGFR-TKI and the underlying mechanisms]
2026-Jun-16, Zhonghua yi xue za zhi
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研究论文 | 评估骨转移对接受第三代EGFR-TKI一线治疗的肺腺癌患者预后的影响，并探索其潜在机制 | 通过单细胞RNA测序揭示骨转移灶中肿瘤细胞免疫调节基因上调及免疫细胞功能失调，构建免疫调节评分以预测预后 | 回顾性研究设计，单中心数据，样本量有限，需进一步验证 | 分析骨转移对肺腺癌患者接受第三代EGFR-TKI治疗效果的影响及耐药机制 | 370例EGFR突变晚期肺腺癌患者，含骨转移组161例、无骨转移组209例 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归 | LASSO-Cox回归模型 | 临床数据, 单细胞转录组数据 | 370例患者（其中2例原发肺肿瘤和2例骨转移灶用于scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1198 | 2026-06-17 |
Well-ST-seq: Cost-Effective and Near-Cellular Spatial Transcriptomics Using Deterministic Barcoded Bead Arrays
2026-Jun-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.6c01070
PMID:42246548
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研究论文 | 提出Well-ST-seq平台，通过确定性条形码微珠阵列实现接近单细胞分辨率的空间转录组学，兼具低成本和高效率 | 利用微孔组装水凝胶微珠载体与组合微流控索引生成预定义空间条形码阵列，简化工作流程并大幅降低试剂成本（每平方毫米0.05-0.54美元），实现30-10微米点间距的快速制备 | 可能受限于微珠阵列的尺寸一致性和空间分辨率进一步优化，以及在大规模组织样本中的验证需求 | 开发经济高效、接近单细胞分辨率的空间转录组学方法，提升基础研究和临床应用中组织解剖图谱的精细度 | 小鼠海马体和发育中的小鼠胚胎脑连续切片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠海马体组织样本和多个发育中小鼠胚胎脑连续切片 | NA | 空间转录组学 | Well-ST-seq平台 | 微孔组装水凝胶微珠载体与组合微流控索引系统 |
| 1199 | 2026-06-17 |
The Association Between Alzheimer's Disease-Related Biomarkers And Parkinson's Disease Based On Single-Cell Sequencing Analysis Combined With Mendelian Randomization
2026-Jun-16, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02558-1
PMID:42298115
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研究论文 | 基于单细胞测序分析和孟德尔随机化研究探讨阿尔茨海默病相关生物标志物与帕金森病的关联 | 结合双向孟德尔随机化与单细胞核RNA测序，从遗传和细胞层面初步探索阿尔茨海默病相关生物标志物（如tau、Aβ42）与帕金森病及其进展的因果关系 | 多重暴露的工具变量数量有限，单细胞核RNA测序队列样本量小，且缺乏蛋白水平验证 | 探索阿尔茨海默病相关生物标志物与帕金森病之间的因果关系 | 帕金森病患者和阿尔茨海默病患者的脑脊液生物标志物（p-tau、总tau、Aβ42）以及死后中脑组织的单细胞核RNA测序数据 | 机器学习 | 帕金森病, 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序, GWAS | NA | 基因表达数据, 遗传汇总统计 | 双向孟德尔随机化基于GWAS汇总统计，样本量未明确；单细胞核RNA测序队列样本较小，数量未说明 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 死后中脑组织的单细胞核RNA测序分析 |
| 1200 | 2026-06-17 |
Ovarian localization drives IL-7R-dependent CD8 coreceptor expression in peripheral double-negative T cells
2026-Jun-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06295-x
PMID:42298246
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研究论文 | 研究发现卵巢微环境可诱导外周双阴性T细胞获得CD8共受体表达，且此过程依赖于IL-7R信号通路 | 首次直接证明卵巢组织能主动改变浸润淋巴细胞的表型，揭示IL-7R信号是卵巢局部诱导CD8共受体的必要条件 | 未明确卵巢内具体细胞亚群如何通过IL-7信号调控CD8表达，且仅在小鼠模型中验证 | 探究卵巢组织是否主动指导浸润淋巴细胞表型改变 | 小鼠外周双阴性T细胞（DNTs）及卵巢组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体样本量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 卵巢组织单细胞RNA-seq |