单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39535 篇文献，本页显示第 1181 - 1200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-05-06 |
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-10-16, Aesthetic surgery journal
IF:3.0Q1
DOI:10.1093/asj/sjaf132
PMID:40601619
|
研究论文 | 建立非人灵长类动物模型，评估超选择性眼动脉介入溶栓治疗透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞的疗效 | 首次在非人灵长类动物模型中模拟临床眼动脉缺血再灌注，并验证超选择性眼动脉介入溶栓治疗在一定时间窗内能有效改善视觉功能 | 模型中仍观察到部分视觉功能损伤，且单细胞测序显示栓塞时间长会导致视紫红质细胞因子表达下降 | 证明超选择性眼动脉介入溶栓治疗在特定时间窗内能有效改善透明质酸栓塞导致的视觉功能损伤，并提出一个临床相关的视网膜缺血再灌注模型 | 猕猴（恒河猴） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 介入溶栓，单细胞RNA测序，数字减影血管造影，眼底荧光血管造影，视网膜电图，苏木精-伊红染色，透射电子显微镜 | NA | 图像，文本，基因表达数据 | 猕猴样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于检测视网膜细胞变化 |
| 1182 | 2026-05-06 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7766748/v1
PMID:41282081
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素介导的转录重编程驱动骨髓偏斜造血的内在机制 | 首次阐明I型干扰素信号异常激活是镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系分化的关键驱动因素，并发现SCA祖细胞通过上调CSF3R对G-CSF产生意外反应，导致单核细胞系偏向性造血 | NA | 探索镰状细胞贫血中粒细胞和单核细胞持续升高的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞（HSPCs） | 自然语言处理 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1183 | 2026-05-06 |
Decoding the association between mucosal-associated invariant T cells and prostate cancer via multi-omics analysis
2025-Oct-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044781
PMID:41054053
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示黏膜相关恒定T细胞与前列腺癌的关联 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，首次揭示MAIT细胞在前列腺癌中的潜在因果作用并发现关键调控基因ZFP36L2 | NA | 探究MAIT细胞与前列腺癌易感性的关联并识别潜在调控基因 | 前列腺癌样本和癌旁正常样本 | NA | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | 4个前列腺癌样本和4个癌旁正常样本，共计13139个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 1184 | 2026-05-06 |
TMEM258 modulates immune infiltration networks underlying co-susceptibility to Crohn disease and acute pancreatitis
2025-Oct-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044807
PMID:41054129
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析，发现TMEM258是克罗恩病和急性胰腺炎的共同易感基因，并调节免疫浸润网络 | 首次利用孟德尔随机化结合多组学数据（eQTL、bulk和单细胞RNA测序）揭示TMEM258作为CD和AP共病的共享遗传因子，并阐明其通过调控T细胞浸润影响疾病风险的机制 | 样本量较小（23例共病患者），且基于小鼠模型验证，需进一步在更大队列和功能实验中验证 | 探究克罗恩病与急性胰腺炎共病的遗传机制和免疫调节网络 | 克罗恩病和急性胰腺炎患者，以及DSS诱导的急性结肠炎小鼠模型 | machine learning | 克罗恩病, 急性胰腺炎 | 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-PCR | NA | 基因表达数据, 临床数据, 免疫细胞数据 | 23名CD患者，31864名个体的血液样本（来自37个队列的5421个顺式eQTL基因） | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1185 | 2026-05-06 |
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505656122
PMID:40966282
|
研究论文 | 本研究揭示了Duchenne肌营养不良动物模型中淋巴功能障碍与疾病发病机制的相关性 | 首次在DMD动物模型中证明淋巴系统功能失调与疾病进展相关，并发现抗肌萎缩蛋白在淋巴肌细胞中表达，且微抗肌萎缩蛋白基因治疗可改善炎症性淋巴管新生 | 未提及具体局限性 | 探究DMD动物骨骼肌中淋巴系统是否失调及其在疾病中的作用 | Duchenne肌营养不良小鼠模型、金毛犬模型以及小鼠和大鼠淋巴肌细胞（LMCs） | 数字病理学 | 肌营养不良症 | 单细胞RNA测序、微量淋巴造影术、磁共振淋巴管成像、基因表达谱分析、免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 小鼠模型（D2.mdx）、金毛犬模型（GRMD）及体外细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序用于控制组LMCs的scRNA-seq |
| 1186 | 2026-05-06 |
From preneoplastic lesion to heterogenous tumor: recent insights into hepatoblastoma biology and therapeutic opportunities
2025-Jul-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02405-8
PMID:40684183
|
综述 | 综述了肝母细胞瘤从癌前病变到异质性肿瘤的最新生物学见解和治疗机会 | 通过单细胞RNA测序、多组学、空间转录组学和功能基因组学筛选，揭示了肝母细胞瘤的复杂异质性，包括不同细胞亚群、WNT信号传导、发育通路以及肿瘤与免疫微环境的相互作用 | 未明确提及局限性 | 总结肝母细胞瘤的生物学新发现，推动治疗进展 | 肝母细胞瘤肿瘤细胞、肿瘤相关细胞类型及遗传依赖性 | 数字病理学 | 儿科肝癌 | 单细胞RNA-seq, 多组学, 空间转录组学, 功能基因组学筛选 | NA | 转录组数据, 空间数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1187 | 2026-05-06 |
Hair Bundle Degeneration is a Key Contributor to Age-Related Vestibular Dysfunction
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.02.636113
PMID:39975332
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究衰老小鼠前庭毛细胞，揭示纤毛束退化和机械传导障碍是年龄相关性前庭功能障碍的关键因素 | 首次通过单细胞转录组分析揭示前庭毛细胞在衰老过程中的细胞类型特异性变化，特别是纤毛束退化和机械传导障碍先于毛细胞丢失，并比较了前庭与耳蜗毛细胞衰老特征的差异 | 仅基于小鼠模型，人类前庭衰老机制有待验证；未深入探讨导致纤毛束退化的上游分子调控网络 | 阐明年龄相关性前庭功能障碍的分子机制，特别是毛细胞退化的关键驱动因素 | 年轻和衰老小鼠的前庭毛细胞 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序，电生理记录，成像 | NA | 基因表达数据，图像，电生理数据 | 年轻和老年小鼠的前庭毛细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1188 | 2026-05-06 |
The foraging gene coordinates brain and heart networks to modulate socially cued interval timing in Drosophila
2025-Jul, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011752
PMID:40627675
|
研究论文 | 本文探讨了 foraging 基因 (for) 如何通过协调大脑和心脏网络来调节果蝇的社会性间隔定时行为 | 首次揭示 foraging 基因通过神经和非神经机制（心脏肽能信号和钙动力学）整合社会线索调节间隔定时行为，并发现 forR 和 forS 两种等位变体的复杂相互作用 | 未提供 | 探究 foraging 基因在果蝇间隔定时行为，特别是交配持续时间中的调控作用及其神经和非神经机制 | 果蝇 (Drosophila melanogaster) 的两种等位变体（forR 和 forS）及其转杂合子 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 敲低实验, CaLexA信号成像 | NA | 基因表达数据, 行为数据, 钙成像数据 | 未详细说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置 |
| 1189 | 2026-05-06 |
Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182790
PMID:40067358
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B细胞耗竭治疗多发性硬化症后中枢和外周免疫细胞的变化 | 首次使用单细胞RNA-Seq全面描绘B细胞耗竭治疗对多发性硬化症患者免疫景观的影响，发现细胞类型特异性的转录组变化 | 未提及 | 探索B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观 | 多发性硬化症患者的脑脊液巨噬细胞和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1190 | 2026-05-06 |
Selective GSK3α Inhibition Promotes Self-Renewal Across Different Stem Cell States
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.653860
PMID:40463072
|
研究论文 | 选择性抑制GSK3α可促进不同干细胞状态的自我更新，并建立一种基于BRD0705/IWR1的通用培养系统 | 发现选择性抑制GSK3α（而非泛抑制GSK3α/β）能独立于β-catenin信号促进多种干细胞（ESC、EpiSC、NSC）的长期自我更新；联合IWR1构建的BRD0705/IWR1培养体系可维持多种多能干细胞状态并支持共培养 | 未提及具体限制 | 研究选择性GSK3α抑制对干细胞自我更新的调控作用，并开发一种能维持不同干细胞状态的培养系统 | 小鼠胚胎干细胞（ESC）、上胚层干细胞（EpiSC）、神经干细胞（NSC）及形成性多能干细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序、表观基因组分析、功能分析 | NA | 转录组数据、表观基因组数据 | 多种小鼠干细胞系（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1191 | 2026-05-06 |
High-dimensional profiling of immune responses to kidney transplant reveals heterogeneous T helper 1 and B cell effectors associated with rejection
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.10.009
PMID:39419342
|
研究论文 | 通过对肾移植后免疫应答进行高维分析，揭示了与排斥反应相关的异质性T辅助1细胞和B细胞效应器 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了肾移植排斥反应中不同内型涉及的免疫亚群多样性，并整合了表型、转录和克隆状态分析 | 信息未提供 | 探究肾移植后免疫排斥反应的机制，区分不同排斥反应内型中的免疫亚群特征 | 76名肾移植患者的血液CD4 T细胞和B细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，T/B细胞受体测序，血浆细胞因子谱分析，批量RNA测序 | NA | 测序数据，细胞因子表达数据 | 76名肾移植受者 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1192 | 2026-05-06 |
Graft-derived extracellular vesicles transport miRNAs to modulate macrophage polarization after heart transplantation
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.11.021
PMID:39586401
|
研究论文 | 本研究利用小鼠心脏移植模型和单细胞RNA测序，揭示移植物来源的细胞外囊泡通过携带miRNA调节巨噬细胞极化，影响心脏移植后免疫排斥反应 | 首次发现移植物CD63阳性巨噬细胞来源的细胞外囊泡携带microRNA-363和microRNA-709，通过Fcho2/Notch1信号通路诱导受体脾脏M1型巨噬细胞极化，揭示了器官间免疫通讯的新机制 | 基于小鼠模型，结论在人体的适用性需进一步验证；未详细说明EV分离和表征的具体方法；未探讨其他可能参与的免疫细胞类型 | 探究心脏移植后移植物与受体脾脏之间免疫细胞相互作用的动态机制 | 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞，包括移植心脏和脾脏中的单核细胞/巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 非监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 小鼠异位移植模型，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1193 | 2026-05-06 |
Eosinophilic esophagitis drives tissue fibroblast regenerative programs toward pathologic dysfunction
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.028
PMID:39617290
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序等技术，揭示嗜酸性食管炎如何驱动组织成纤维细胞从再生程序转变为病理功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序结合功能实验，发现EoE成纤维细胞保留软骨细胞等硬细胞再生程序但失去脂肪细胞等软细胞分化能力，并揭示CD73和ATP代谢异常在致病机制中的关键作用 | 文中未明确提及局限性 | 探究慢性嗜酸性食管炎炎症诱导病理性成纤维细胞及其功能障碍的分子机制 | 嗜酸性食管炎患者和健康对照的食管成纤维细胞 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、成纤维细胞分化与迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据、免疫染色图像、流式细胞数据 | EoE患者与健康对照的活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1194 | 2026-05-06 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1070
PMID:39724973
|
研究论文 | 本研究利用条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠模型，探讨上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 首次证明食管上皮Ikkβ缺失会促进实验性过敏小鼠模型中嗜酸性食管炎的发展，并建立了更接近人类EoE的小鼠模型 | 未提及具体局限性 | 阐明上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠（IkkβEEC-KO小鼠） | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1195 | 2026-05-06 |
Thymic and T-cell intrinsic critical roles associated with severe combined immunodeficiency and Omenn syndrome due to a heterozygous variant (G201R) in PSMB10
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1082
PMID:39734035
|
研究论文 | 该论文报告了一例由PSMB10基因杂合变异（G201R）导致的严重联合免疫缺陷和Omenn综合征，并揭示了该变异在胸腺和T细胞内在中的关键作用 | 首次阐明PSMB10 G201R杂合变异通过显性负效应降低免疫蛋白酶体表达，影响CD8 T细胞阳性选择、T细胞受体库多样性和自身反应性T细胞的阴性选择，并证明胸腺植入可能带来治疗益处 | 仅基于单个患者及其家族研究，样本量有限；未进行更广泛的队列验证或动物模型实验来进一步证实机制 | 对携带PSMB10杂合变异的婴儿进行免疫学和分子特征描述，以理解该变异导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征的机制 | 一名携带PSMB10 p.G201R杂合变异的婴儿及其父母 | 机器学习 | 免疫缺陷病 | 流式细胞术、免疫印迹、人工胸腺类器官T细胞发育、单细胞RNA测序 | NA | 生物数据 | 1名患者及其父母的外周血单核细胞、EB病毒转化B细胞、成纤维细胞和CD34+细胞；人类胸腺组织用于单细胞测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台用于人类胸腺单细胞RNA测序 |
| 1196 | 2026-05-06 |
Endothelial FOSL1 drives angiotensin II-induced myocardial injury via AT1R-upregulated MYH9
2025-Apr, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01410-9
PMID:39592734
|
研究论文 | 本研究揭示了FOSL1通过上调MYH9促进血管紧张素II诱导的心肌损伤的分子机制 | 首次发现FOSL1直接结合MYH9启动子并激活其转录，以及FOSL1/MYH9轴在Ang II诱导的血管重塑中的关键作用 | 未说明样本大小和人类验证实验 | 探究血管紧张素II诱导心肌损伤后血管重塑的分子机制 | 小鼠心脏内皮细胞和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 双荧光素酶报告基因, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠和细胞样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1197 | 2026-05-06 |
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-01-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01432-w
PMID:39825401
|
研究论文 | 通过对小鼠和人类前列腺单细胞转录组进行荟萃分析，揭示组织退化、再生和癌症中广泛的上皮可塑性 | 利用随机矩阵理论去噪并建立参考细胞类型分类，通过最优传输比较跨物种上皮细胞群体的转录组相似性，以及结合拷贝数变异分析揭示前列腺癌进展中的转录程序 | 未提及具体限制 | 研究前列腺上皮细胞在组织稳态、退化、再生及癌症中的动态变化和可塑性 | 小鼠和人类前列腺组织中的上皮细胞群体 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机矩阵理论, 最优传输 | 单细胞转录组数据 | 新生成和已发表的多个小鼠和人类前列腺单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1198 | 2026-05-06 |
SenPred: a single-cell RNA sequencing-based machine learning pipeline to classify deeply senescent dermal fibroblast cells for the detection of an in vivo senescent cell burden
2025-01-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01418-0
PMID:39810225
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序的机器学习管道SenPred，用于分类深层衰老的真皮成纤维细胞，以检测体内衰老细胞负荷 | 首次利用2D和3D培养的深层衰老成纤维细胞的单细胞转录组数据，构建机器学习模型预测衰老；发现3D模型比2D更准确检测体内衰老细胞 | 目前仅为概念验证，仅针对特定细胞类型（真皮成纤维细胞）和衰老触发条件，无法推广到其他组织（如肺成纤维细胞） | 开发一个基于单细胞RNA测序的机器学习管道，以精准检测体内衰老成纤维细胞，助力衰老相关疾病研究 | 人类真皮成纤维细胞（2D和3D培养的深层衰老细胞，以及体内皮肤组织） | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习管道（未指定具体模型类型，如CNN等，故输出NA） | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1199 | 2026-05-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evolutionary Reconfiguration of Embryonic Cell Fate Specification in the Sea Urchin Heliocidaris erythrogramma
2025-01-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae258
PMID:39587400
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示了海胆物种Heliocidaris erythrogramma胚胎细胞命运决定的进化重构 | 首次通过跨物种单细胞转录组时间序列分析，识别出海洋无脊椎动物发育调控网络的进化变化，发现主要生命史转变中细胞命运决定的时空分离 | 主要基于表达相关性推断调控相互作用，缺乏直接的实验验证，且仅比较了两个物种的祖先和衍生状态 | 研究胚胎发育中细胞命运决定的进化变化及其与表型多样性的关联 | 两种海胆：Heliocidaris erythrogramma（衍生状态）和Lytechinus variegatus（祖先状态）的胚胎细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 两种海胆物种的多个发育时间点单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 1200 | 2026-05-06 |
Spatial transcriptome profiling identifies DTX3L and BST2 as key biomarkers in esophageal squamous cell carcinoma tumorigenesis
2024-12-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01422-4
PMID:39696540
|
研究论文 | 通过空间转录组分析鉴定DTX3L和BST2为食管鳞癌肿瘤发生的关键生物标志物 | 首次利用数字空间分析和单细胞空间转录组技术（CosMx SMI）系统描绘了食管鳞癌从正常组织到癌变的分子和免疫变化全景，并发现DTX3L和BST2作为潜在生物标志物 | 样本量较小（11例DSP患者和4例SMI患者），且局限于早期食管鳞癌（pT1期），可能无法完全代表所有阶段的肿瘤异质性 | 揭示食管鳞癌恶性转化过程中的转录和免疫变化，并鉴定具有临床意义的生物标志物 | 早期食管鳞癌（pT1）患者的组织样本，包括正常组织、低度和高度不典型增生及癌组织 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 数字空间分析（DSP）、单细胞空间转录组学（CosMx SMI）、免疫组化（IHC）、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像（IHC） | 11例pT1 ESCC患者用于DSP，4例用于SMI，20例用于IHC | NanoString, 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | CosMx Spatial Molecular Imaging (SMI)系统, 10x Chromium | CosMx SMI用于单细胞空间转录组分析，10x Chromium用于单细胞RNA测序 |