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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-06-29 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals clonal smooth muscle cell heterogeneity and programs associated with atherosclerotic plaque calcification
2026-Mar-14, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02090-x
PMID:41832370
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序、线粒体突变谱系追踪和高分辨率空间转录组学,构建人类颈动脉粥样硬化斑块的空间解析转录组图谱,揭示克隆平滑肌细胞异质性与斑块钙化相关程序 | 首次结合线粒体突变谱系追踪与空间转录组学,在单细胞水平揭示平滑肌细胞克隆扩增与骨生成分化的空间异质性,并阐明SPP1/FN1-CD44/整合素轴在钙化微环境中介导的泡沫巨噬细胞与骨生成样平滑肌细胞互作机制 | 未提及 | 探究克隆相关的平滑肌细胞如何与空间定义的微环境相互作用驱动动脉粥样硬化钙化 | 人类颈动脉粥样硬化斑块(AHA III-V期)中的平滑肌细胞及其亚型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 线粒体突变谱系追踪, 高分辨率空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 细胞谱系数据 | 人类颈动脉粥样硬化斑块(AHA III-V期,具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序, 10x Visium 用于空间转录组学 |
| 1182 | 2026-06-29 |
Fibroblast-associated CTHRC1 as a key indicator of recurrence risk in prostate cancer
2026-Mar-14, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-026-04293-8
PMID:41832493
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研究论文 | 整合临床、基因组和转录组数据,识别与前列腺癌复发相关的基因,并构建预后模型,发现成纤维细胞相关的CTHRC1高表达是复发风险的关键指标 | 首次通过单细胞RNA测序定位CTHRC1主要在成纤维细胞亚群中表达,并发现其与MDK信号通路上调及广泛的细胞间通讯相关 | 未提及明确的局限性 | 识别前列腺癌复发相关基因并开发预后模型,探索其肿瘤微环境背景 | 前列腺腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | LASSO Cox模型 | 表达数据 | 训练集145例,验证集106例 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1183 | 2026-06-29 |
M2-like GAMs secreting CSTA drive glioblastoma progression via the ITGB4-TGFB1 feedback axis
2026-Mar-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08009-0
PMID:41832564
|
研究论文 | 本研究揭示了分泌CSTA的M2型胶质瘤相关巨噬细胞/小胶质细胞通过ITGB4-TGFB1反馈轴驱动胶质母细胞瘤进展的机制 | 首次鉴定出CSTA阳性的M2型GAM亚群,并阐明其通过CSTA-ITGB4结合激活下游NF-κB和MAPK信号通路,形成TGFB1介导的正反馈环路来促进GBM进展 | 具体机制仍需进一步验证,临床相关性分析样本量有限 | 探究胶质瘤与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用,鉴定调控胶质母细胞瘤进展的巨噬细胞亚群,阐明CSTA的作用及机制 | CSTA阳性的M2型胶质瘤相关巨噬细胞/小胶质细胞和胶质母细胞瘤细胞 | 机器学习 | 肺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 测序数据 | NA | Illumina, BGI | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | bulk RNA-seq和scRNA-seq数据集 |
| 1184 | 2026-06-29 |
RNA biomarkers in spinal muscular atrophy: enhancing pathogenesis understanding and guiding precision medicine
2026-Mar-12, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06164-7
PMID:41817636
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综述 | 本文探讨了脊髓性肌萎缩症中RNA生物标志物在揭示病理机制和指导精准医疗中的作用 | 提出将全局microRNA谱分析与临床参数整合,形成高预测价值的SMA评分体系 | RNA生物标志物实施需解决标准化、多中心验证和纵向评估等挑战 | 阐明RNA生物标志物在SMA精准医疗中的价值 | SMA患者的RNA生物标志物,包括SMN转录本和特定microRNA | 自然语言处理 | 脊髓性肌萎缩症 | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1185 | 2026-06-29 |
Unraveling new characteristics of γδ T cells using scRNA-seq in TCR KO chicken
2026-Mar-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12741-8
PMID:41807936
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研究论文 | 利用scRNA-seq在TCR KO鸡中揭示γδ T细胞的新特征 | 首次通过单细胞转录组分析在TCR Cβ和Cγ基因敲除鸡中系统研究了αβ和γδ T细胞亚群的功能和特征,发现了与干扰素通路相关的独特γδ T细胞簇,并鉴定出精确区分αβ和γδ T细胞亚群的新基因标记 | 未明确指出,可能包括研究仅针对鸡模型,且未涉及功能验证实验 | 深入探究鸡中αβ和γδ T细胞亚群的功能和特征,特别是γδ T细胞的细胞溶解活性及其与严重表型的关系 | 野生型、TCR Cβ敲除和TCR Cγ敲除鸡的CD3+单细胞 | 数字病理学 | 未明确 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自胚胎期18天、孵化后3天和14天的野生型、TCR Cβ敲除和TCR Cγ敲除鸡的CD3+细胞 | 未明确 | 单细胞RNA测序 | 未明确 | 未明确 |
| 1186 | 2026-06-29 |
MYC promotes the progression of prostate cancer by regulating CD47 to induce an immunosuppressive microenvironment
2026-Mar-11, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06109-0
PMID:41813864
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种实验方法,发现MYC通过调控CD47诱导免疫抑制微环境,促进前列腺癌进展 | 首次揭示MYC通过CD47-SIRPα相互作用诱导M2巨噬细胞极化和减少CD8+ T细胞比例,解析了前列腺癌免疫逃逸的新机制 | 未明确说明研究局限性 | 探究MYC在前列腺癌肿瘤免疫微环境中的功能与调控机制 | 前列腺癌细胞、CD8+ T细胞、M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、Transwell、集落形成、EdU、染色质免疫沉淀、免疫共沉淀、流式细胞术、多重免疫荧光 | NA | 测序数据、图像数据 | 涉及前列腺癌及癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1187 | 2026-06-29 |
Integrative bioinformatics reveals complement dysregulation: critical insights into C1q, C1r, and C1s in aortic dissection pathogenesis
2026-Mar-10, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-026-02364-9
PMID:41806029
|
研究论文 | 通过整合生物信息学揭示补体失调在主动脉夹层发病机制中的作用,重点关注C1q、C1r和C1s | 首次联合差异表达分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序系统阐明C1r作为主动脉夹层的诊断和机制标志物,并区分C1q的非因果性临床价值 | NA | 阐明补体失调对主动脉夹层的贡献并识别具有诊断和机制相关性的补体相关生物标志物 | 主动脉夹层患者样本及公开数据集GSE153434 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 血清蛋白数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1188 | 2026-06-29 |
AI-powered radiogenomics: imaging-driven diagnosis and discovery of cancer's molecular and cellular landscape
2026-Mar-10, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-026-02389-0
PMID:41806059
|
综述 | 综述AI驱动的放射基因组学在癌症分子与细胞景观无创诊断和发现中的进展 | 整合人工智能(包括CNN、GAN、Transformer等)与多组学数据,推动放射基因组学从传统成像向定量特征自动化提取和稳健相关分析的转变 | 数据协调、标准化、伦理考量及跨人群验证等挑战仍需解决 | 总结AI驱动的放射基因组学在临床相关性和实验室诊断中的应用,强调其精准肿瘤学潜力 | 主要癌症类型(乳腺癌、肺癌、脑癌、前列腺癌)的成像表型与多组学数据 | 计算机视觉 | 乳腺癌、肺癌、脑癌、前列腺癌 | 放射基因组学 | CNN、GAN、Transformer | 影像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1189 | 2026-06-29 |
Smarce1-dependent modulation of Stat3 signaling governs cardiomyocyte proliferation
2026-Mar-10, Biological research
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40659-026-00681-2
PMID:41808150
|
研究论文 | 本研究鉴定Smarce1作为斑马鱼心肌细胞增殖的关键调控因子,揭示了它通过调节Stat3信号传导来影响心脏生长的表观遗传机制 | 首次发现SWI/SNF染色质重塑复合体核心亚基Smarce1在心肌细胞增殖中的关键作用,并建立了一个保守的Smarce1-Stat3轴,连接了染色质重塑与增殖信号传导 | 未明确说明局限性 | 揭示调控心脏发育和再生过程中心肌细胞增殖的分子机制 | 斑马鱼心肌细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1190 | 2026-06-29 |
Single-cell RNA-seq and in vitro study reveal Fusobacterium nucleatum impairs β-cell identity in type 2 diabetes via the NF-κB-CDKN1C axis
2026-Mar-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07981-x
PMID:41803883
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和体外实验揭示具核梭杆菌通过NF-κB-CDKN1C轴损害2型糖尿病中β细胞身份 | 首次揭示牙周病原体具核梭杆菌通过NF-κB信号通路下调CDKN1C表达,促进β细胞身份丧失并转分化为α细胞,为牙周炎与糖尿病关联提供新机制 | 未在体内模型验证该机制,且样本量有限,可能影响结论的普适性 | 探究牙周病原体具核梭杆菌对β细胞身份维持的影响及其分子机制 | 人类胰岛的单细胞RNA测序数据以及MIN6细胞与具核梭杆菌的共培养模型 | 自然语言处理 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、体外共培养 | NA | 基因表达数据 | 非糖尿病、前糖尿病和2型糖尿病供体的人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1191 | 2026-06-29 |
Comprehensive analysis of the potential role of Ferroptosis-related genes in glioblastoma multiforme
2026-Mar-09, Neurological sciences : official journal of the Italian Neurological Society and of the Italian Society of Clinical Neurophysiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s10072-026-08938-0
PMID:41796391
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研究论文 | 通过多组学方法分析铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的潜在作用,并构建预后风险模型 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的细胞类型特异性分布和空间定位 | 研究基于公共数据库TCGA-GBM数据,样本量有限,且风险模型的预后性能AUC值中等,有待外部验证 | 探索铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的作用及其预后评估潜力 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 基因集变异分析 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1192 | 2026-06-29 |
The complement system contributes to the immunosuppressive microenvironment of uveal melanoma
2026-Mar-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07910-y
PMID:41803879
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研究论文 | 本研究首次综合分析了补体系统在原发性葡萄膜黑色素瘤和转移性葡萄膜黑色素瘤中的作用,揭示了其促进免疫抑制微环境的机制 | 首次系统探究补体系统在葡萄膜黑色素瘤免疫抑制微环境中的作用,整合了公共组学数据和实验验证,并发现C1S和C3作为潜在治疗靶点 | 研究主要依赖公共数据库和有限样本,缺乏大规模前瞻性临床验证 | 阐明补体系统对葡萄膜黑色素瘤免疫抑制微环境和进展的影响 | 葡萄膜黑色素瘤中的补体系统 | 机器学习和数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,蛋白质组学,免疫组化 | NA | 测序数据,蛋白质组数据,图像 | 公共数据集及人类样本(未提供具体数量) | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 1193 | 2026-06-29 |
ACSL4 mediates ferroptosis to promote immunoglobulin A nephropathy progression: scRNA-seq analysis
2026-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43023-8
PMID:41794881
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示ACSL4介导的铁死亡在免疫球蛋白A肾病进展中的作用 | 首次通过scRNA-seq鉴定出IgAN中ACSL4+的髓袢细胞亚群,并揭示其通过铁死亡途径促进疾病进展的新机制 | 研究未在体内模型中验证ACSL4+ LOHs的致病功能,且样本量可能有限 | 探究ACSL4介导的铁死亡在免疫球蛋白A肾病进展中的机制 | 免疫球蛋白A肾病患者的肾组织样本 | 数字病理学 | 肾疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | IgAN组和对照组的肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1194 | 2026-06-29 |
Intraovarian injection of autologous platelet-rich plasma combined with peripheral blood mononuclear cells improves ovarian function in advanced-age women with diminished ovarian reserve: a clinical retrospective cohort and single-cell transcriptomic analysis
2026-Mar-07, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-026-02006-z
PMID:41794754
|
研究论文 | 对高龄卵巢储备功能减退患者进行卵巢内注射自体富血小板血浆与外周血单个核细胞联合治疗,评估其对卵巢功能的改善作用,并结合单细胞转录组分析探索潜在机制 | 首次在临床上评估PRP与外周血单个核细胞联合卵巢内注射对高龄DOR患者的疗效,并通过动物模型单细胞转录组分析揭示潜在机制,涉及颗粒细胞间通讯改变和蛋白质合成与能量代谢通路的激活 | 非随机对照研究,样本量有限,未评估妊娠或活产结局,结果需前瞻性随机对照试验验证 | 初步评估卵巢内注射PRP联合外周血单个核细胞对高龄卵巢储备功能减退患者卵巢功能的改善效果和潜在机制 | 122例高龄卵巢储备功能减退患者(进行IVF-ET)和13月龄DOR大鼠模型 | 机器学习的其他应用 | 卵巢储备功能减退(DOR) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 122例患者(回顾性队列,含空白对照45例、PRP组47例、PRP+PBMCs组30例);动物实验每组5只大鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1195 | 2026-06-29 |
Unique phenotypic and T cell receptor characteristics of CD8+ T cells accumulated in the brains of Alzheimer's disease mice
2026-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38351-8
PMID:41794902
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研究论文 | 重新分析阿尔茨海默病小鼠大脑中CD8+ T细胞的单细胞RNA测序数据,揭示了两种表型和克隆型截然不同的组织驻留记忆T细胞群 | 发现阿尔茨海默病相关CD8+ T细胞具有干细胞样特征并可特异性结合β-淀粉样蛋白42肽 | 仅基于已发表的公共数据集进行重分析,缺乏功能验证实验 | 探究阿尔茨海默病中CD8+组织驻留记忆T细胞的表型与功能差异 | 正常衰老、野生型AD和Cxcr6缺陷AD小鼠大脑中的CD8+ T细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3种小鼠模型(正常衰老、野生型AD、Cxcr6缺陷AD)的脑源性CD8+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1196 | 2026-06-29 |
Amino acid metabolism-related genes signature correlates with immune infiltration and predicts clinic prognosis in osteosarcoma
2026-Mar-07, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15746-4
PMID:41803737
|
研究论文 | 本研究基于氨基酸代谢相关基因构建预后模型,揭示其在骨肉瘤免疫浸润中的作用 | 首次构建基于五个氨基酸代谢相关基因的预后风险模型,并验证其与传统临床因素相比的优越预后预测能力 | 未提及具体局限性 | 探究氨基酸代谢相关风险特征在骨肉瘤预后评估和免疫细胞浸润中的作用 | 骨肉瘤患者的临床和转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq | Cox回归模型, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TARGET和GEO数据库的骨肉瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1197 | 2026-06-29 |
Functional genomics integration of glycolysis-related gene networks reveals prognostic biomarkers and immune microenvironment regulation in breast cancer
2026-Mar-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29391-7
PMID:41792142
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研究论文 | 通过整合糖酵解相关基因网络的多组学分析,构建乳腺癌预后生物标志物,并揭示其对免疫微环境的调控机制 | 首次结合糖酵解相关基因的预后模型与单细胞测序、孟德尔随机化及分子对接技术,全面解析糖酵解重编程在乳腺癌免疫微环境中的作用及因果关系 | 未提及具体的局限性,但可能包括数据来源的异质性、样本量有限或模型验证范围不足 | 探究糖酵解相关基因在乳腺癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 乳腺癌患者的多组学数据(TCGA、METABRIC、GEO单细胞RNA-seq数据)及糖酵解相关基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, PCR | Cox回归, LASSO回归, 一致性聚类 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, eQTL数据 | TCGA和METABRIC数据库中的乳腺癌样本(具体数量未提供)及GEO单细胞数据 | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | NA |
| 1198 | 2026-06-29 |
Clusterin elaborated by renal tubular epithelial cells under high oxalate stress serves as a matrix protein to facilitate kidney stone formation
2026-Mar-06, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06105-4
PMID:41792547
|
研究论文 | 通过多组学方法鉴定肾小管上皮细胞分泌的簇蛋白作为基质蛋白促进草酸钙肾结石形成 | 首次揭示TWIST1-CLU调控轴在肾草酸钙结石形成中的关键作用,并发现CLU可作为潜在治疗靶点 | 尚未明确CLU在结石形成中的其他潜在机制及体内长期影响 | 阐明肾小管上皮细胞来源的簇蛋白在草酸钙肾结石形成中的作用及分子机制 | 肾小管上皮细胞、草酸钙肾结石患者肾组织标本、小鼠模型 | 机器学习 | 肾结石 | 蛋白质组学、转录组学、单细胞转录组测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 人肾标本(结石患者与对照)、小鼠模型 | NA | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1199 | 2026-06-29 |
High-fat diet leads to male reproductive dysfunction by disrupting lipid-droplet-mediated organelle crosstalk
2026-Mar-06, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-00891-2
PMID:41792600
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研究论文 | 高脂饮食通过破坏脂滴介导的线粒体-内质网接触导致男性生殖功能障碍 | 首次揭示脂滴在调控线粒体-内质网接触中的关键作用,为高脂饮食引起的男性生殖功能障碍提供新机制 | 未明确提及,需进一步研究脂滴介导的细胞器互作在人类中的适用性 | 探究高脂饮食导致男性生殖功能障碍的分子机制 | 高脂饮食小鼠的睾丸间质细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学、流式细胞术、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、图像数据 | 高脂饮食小鼠(未提供具体数量) | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 已发表的单细胞RNA测序数据(平台细节未明确说明) |
| 1200 | 2026-06-29 |
Decoding the ubiquitination-immunity axis in idiopathic pulmonary fibrosis: diagnostic insights and therapeutic implications
2026-Mar-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03612-7
PMID:41792712
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研究论文 | 本研究通过分析泛素化相关基因在特发性肺纤维化中的诊断和免疫意义,构建了诊断模型并揭示了UBD在疾病发展中的关键作用 | 首次将泛素化相关基因与特发性肺纤维化的免疫浸润特征系统关联,并发现UBD作为新的促纤维化因子和中性粒细胞浸润调节因子 | 研究基于公开数据集和动物模型,且缺乏临床队列验证;具体分子机制尚未完全阐明 | 探究泛素化相关基因在特发性肺纤维化中的诊断价值和免疫调控功能 | 特发性肺纤维化患者肺组织样本、小鼠原代肺成纤维细胞 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA测序、单细胞RNA测序、CIBERSORT算法 | LASSO回归 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 3个批量RNA测序数据集(GSE110147、GSE53845、GSE32537)和1个单细胞RNA测序数据集(GSE122960) | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 从Gene Expression Omnibus数据库获取的数据集 |