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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1181 | 2025-10-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-12-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
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研究论文 | 本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达导致骨折不愈合的分子机制 | 首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制,并证明表观遗传修饰的祖细胞治疗可恢复炎症条件下的骨再生能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和效果需要进一步验证 | 探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略 | 骨折愈合过程中的祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序,遗传动物模型,表观遗传调控 | 转基因小鼠模型(Ikk2ca,Dnmt3b功能缺失和转基因) | 单细胞转录组数据,遗传表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1182 | 2025-10-05 |
Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics
2023-11, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16900
PMID:37424435
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研究论文 | 本文提出了一个描述前列腺上皮动态的雄激素依赖性调控概念框架,并建立了相应的数学模型 | 区分了上皮和基质雄激素受体的不同功能,提出IGF1作为关键生长因子协调基质-上皮旁分泌通讯,并开发了能够定量拟合实验数据的数学模型 | 模型相对简单,可能需要更全面的建模来完全描述健康和患病前列腺的复杂性 | 阐明雄激素依赖性调控前列腺上皮动态的细胞和分子机制 | 前列腺上皮细胞和基质细胞 | 计算生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1183 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2023-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01455-9
PMID:37845544
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示小鼠前额叶皮层在慢性疼痛调控中的独特细胞类型和神经环路组织 | 首次利用空间分辨单细胞转录组分析揭示前额叶皮层细胞类型组成、基因表达模式和神经亚型投射的靶向特异性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 解析前额叶皮层调控多种功能(包括慢性疼痛)的细胞和环路组织机制 | 成年小鼠前额叶皮层 | 空间转录组学 | 慢性疼痛 | 空间分辨单细胞转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 成年小鼠前额叶皮层样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1184 | 2025-10-05 |
Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06120-6
PMID:37258678
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研究论文 | 本研究揭示了髓鞘功能障碍通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散斑块清除小胶质细胞来驱动阿尔茨海默病模型中β-淀粉样蛋白沉积的机制 | 首次发现髓鞘功能障碍是阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白沉积的上游风险因素,并揭示了其通过分散斑块清除小胶质细胞的新型机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究年龄相关髓鞘功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | 小鼠疾病模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1185 | 2025-10-05 |
Nonlesional lupus skin contributes to inflammatory education of myeloid cells and primes for cutaneous inflammation
2022-04-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abn2263
PMID:35476593
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示狼疮非皮损皮肤在炎症启动中的作用 | 首次全面表征狼疮皮损和非皮损皮肤的分子特征,发现非皮损皮肤是富含I型干扰素的预炎症环境 | 样本量有限,需要进一步功能验证 | 探究皮肤性红斑狼疮的免疫发病机制 | 狼疮患者的正常外观皮肤、皮损皮肤和循环免疫细胞 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 狼疮患者的皮肤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1186 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression
2021-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01338-7
PMID:34244611
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究AML起始细胞在疾病进展过程中的RNA克隆进化 | 首次在AML起始细胞中发现RNA克隆进化现象,而非传统的DNA突变进化 | 研究样本量有限,需要更大队列验证发现 | 探索AML疾病复发过程中白血病起始细胞的转录组变化机制 | 急性髓系白血病患者的匹配诊断和复发样本中的白血病起始细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 匹配的诊断和复发AML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1187 | 2025-10-05 |
Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses
2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw202
PMID:27153638
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA-seq数据分析的beta-Poisson混合模型,能够捕捉基因表达分布的双峰特征 | 开发了beta-Poisson混合模型来捕捉单细胞RNA-seq数据特有的双峰分布特征,并将其整合到广义线性模型框架中进行差异表达分析 | NA | 开发适用于单细胞RNA-seq数据分析的统计模型和方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | beta-Poisson混合模型, 广义线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1188 | 2025-10-05 |
Targeting CLK1/SRSF7 axis-dependent alternative splicing sensitizes pancreatic ductal adenocarcinoma to chemotherapy and immunotherapy
2025-Nov, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101292
PMID:40840404
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研究论文 | 本研究揭示了环状RNA cALG8通过调控选择性剪接促进胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫抑制的分子机制 | 首次发现cALG8作为蛋白支架促进CLK1磷酸化SRSF7,形成ATM203剪接变体,增强DNA损伤修复和免疫微环境重塑 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 阐明胰腺导管腺癌对吉西他滨耐药的分子机制并开发靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞、患者来源类器官、患者来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 环状RNA测序、液相色谱-质谱联用、单细胞测序、分子生物学技术 | NA | RNA测序数据、质谱数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1189 | 2025-10-05 |
Environmental nano-particulates induced pre-implantation embryonic toxicity in pluripotent stem cell-derived blastoids
2025-Oct-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.126809
PMID:40645264
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研究论文 | 本研究利用多能干细胞衍生的胚状体评估环境纳米颗粒污染物对胚胎发育的毒性作用 | 首次建立基于灵长类多能干细胞的胚状体平台用于环境暴露组研究,构建了多层级多维度的早期胚胎暴露组数据集 | 研究基于体外胚状体模型,与真实人类胚胎发育可能存在差异 | 评估环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性影响 | 灵长类多能干细胞衍生的胚状体 | 发育生物学 | 胚胎发育异常 | 单细胞RNA测序, 数据非依赖采集质谱 | 胚状体模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
1190 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics combined with spatial transcriptomics reveals a fibrotic microenvironment in hyperuricemic nephropathy
2025-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178062
PMID:40816527
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组和空间转录组技术揭示了高尿酸血症肾病纤维化微环境的关键细胞和分子机制 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组技术结合应用于高尿酸血症肾病研究,揭示了纤维化微环境中的关键细胞互作和分子通路 | 研究仅使用大鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 阐明高尿酸血症肾病纤维化微环境的细胞组成和分子机制 | 高尿酸血症肾病大鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 高尿酸血症肾病大鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
1191 | 2025-10-05 |
IGF2BP2 alleviates ulcerative colitis by inhibiting MEK1/2 and ERK1/2 signaling pathways in intestinal epithelial cells via m6A-dependent stabilization of LGI4 mRNA
2025-Oct-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115206
PMID:40663812
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研究论文 | 本研究揭示了m6A阅读蛋白IGF2BP2通过稳定LGI4 mRNA抑制MEK1/2-ERK1/2信号通路,从而缓解溃疡性结肠炎的分子机制 | 首次发现IGF2BP2通过m6A依赖性方式稳定LGI4 mRNA,并阐明其在溃疡性结肠炎中抑制MEK1/2-ERK1/2信号通路的新机制 | 研究主要聚焦于肠道上皮细胞,未全面评估其他细胞类型在溃疡性结肠炎中的作用 | 探究m6A阅读蛋白IGF2BP2在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及分子机制 | 人类组织样本、溃疡性结肠炎细胞模型、DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、IHC、Western blot、IF、RT-qPCR、meRIP-qPCR、RNA pulldown、RIP、mRNA稳定性检测 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据、蛋白质数据 | 人类UC患者组织样本、UC细胞模型、DSS诱导UC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1192 | 2025-10-05 |
Lonidamine alleviates inflammation and tissue remodeling in a mouse model of eosinophilic chronic sinusitis: A single-cell transcriptomics study
2025-Oct-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115258
PMID:40700828
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研究论文 | 通过单细胞转录组学研究揭示洛尼达明在嗜酸性慢性鼻窦炎小鼠模型中缓解炎症和组织重塑的作用机制 | 首次在ECRS模型中系统研究HK2的表达模式,并发现洛尼达明通过抑制Cxcl1-Cxcr2和Ptn-Ncl信号通路发挥抗炎和抗重塑作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究HK2抑制剂洛尼达明在嗜酸性慢性鼻窦炎中的治疗作用及机制 | ECRS小鼠模型和人类鼻上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 嗜酸性慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1193 | 2025-10-05 |
Immunoglobin attenuates fulminant myocarditis by inhibiting overactivated innate immune response
2025-Oct, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.17372
PMID:39442535
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研究论文 | 本研究探讨免疫球蛋白通过抑制过度激活的先天免疫反应来减轻暴发性心肌炎的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示免疫球蛋白通过调控Plac8+单核细胞和S100a8+中性粒细胞的促炎活性来改善暴发性心肌炎 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证 | 研究免疫调节药物对暴发性心肌炎的治疗效果及作用机制 | A/JGpt小鼠模型中的暴发性心肌炎 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠心脏CD45+细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1194 | 2025-10-05 |
Microglial Regulation of Neural Networks in Neuropsychiatric Disorders
2025-Oct, The Neuroscientist : a review journal bringing neurobiology, neurology and psychiatry
DOI:10.1177/10738584251316558
PMID:39932233
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综述 | 本文探讨小胶质细胞在神经精神疾病中对神经网络的调控作用 | 结合单细胞测序技术揭示小胶质细胞亚型多样性及其与神经网络的相互作用机制 | NA | 研究小胶质细胞在神经精神疾病发病机制中的作用及治疗策略开发 | 中枢神经系统中的小胶质细胞及其与神经网络的相互作用 | 神经科学 | 阿尔茨海默病、抑郁症、癫痫等神经精神疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1195 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal Tumor Cell Characteristics and Communication Features of Primary and Lymphatic Metastatic Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct, Head & neck
DOI:10.1002/hed.28195
PMID:40395022
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序揭示原发性及淋巴转移性下咽鳞状细胞癌的肿瘤细胞特征和通讯特征 | 首次结合单细胞和批量RNA测序分析HPSCC原发灶与转移灶恶性上皮细胞的差异,并构建基于配体-受体对的预后预测模型 | NA | 识别HPSCC淋巴转移的关键驱动因素和潜在治疗靶点 | 下咽鳞状细胞癌患者的原发肿瘤和淋巴转移灶组织 | 单细胞测序分析 | 下咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 配体-受体对风险模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1196 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals systemic and placental immune landscape in preeclampsia
2025-Oct, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.08.325
PMID:40803063
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示先兆子痫患者外周血和胎盘各区域的免疫细胞景观 | 首次在单细胞水平系统比较早发型和晚发型先兆子痫的免疫差异,发现EPE患者外周血中新型CD8+初始T细胞亚群和基底板dNK4细胞亚群 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明先兆子痫的免疫病理机制 | 先兆子痫患者和正常妊娠对照的外周血及胎盘组织 | 单细胞组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 早发型和晚发型先兆子痫患者及正常对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1197 | 2025-10-05 |
Differentially expressed fusogens specify myocyte states to drive myogenesis
2025-Sep-17, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204771
PMID:40959964
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现小鼠肌细胞中存在两种不同的肌细胞群体,分别表达不同的融合蛋白,挑战了脊椎动物肌肉前体细胞同质性的传统观点 | 首次识别出表达Myomaker和Myomixer的Mc1细胞群和仅表达Myomaker的Mc2细胞群,并揭示了它们之间的谱系关系和调控机制 | 研究仅限于小鼠胚胎发育的特定时期(E9.5-11.5),需要进一步验证在其他物种和发育阶段的普适性 | 探究肌细胞融合过程中肌细胞状态的异质性及其调控机制 | 小鼠胚胎体节中的肌细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,荧光原位杂交,谱系追踪,荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | E9.5-11.5小鼠胚胎体节 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1198 | 2025-10-05 |
Limited nasal interferon production contributes to delayed respiratory virus clearance and suboptimal vaccine responses
2025-Sep-16, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182836
PMID:40956633
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研究论文 | 本研究揭示鼻部干扰素产生受限导致呼吸道病毒清除延迟和疫苗反应不佳的机制 | 首次发现鼻部免疫环境处于静息状态,通过单细胞RNA测序证实上呼吸道干扰素刺激基因表达较低,并证明干扰素佐剂可改善黏膜疫苗反应 | 研究主要使用小鼠模型,人类数据仅限于COVID-19患者的验证 | 探究鼻部干扰素产生受限对呼吸道病毒清除和疫苗反应的影响机制 | 人类偏肺病毒(HMPV)感染的小鼠模型和COVID-19患者 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1199 | 2025-10-05 |
AutoGRN: An Automated Graph Neural Network Framework for Gene Regulatory Network Inference
2025-Sep-16, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3609408
PMID:40956752
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研究论文 | 提出了一个自动化图神经网络框架AutoGRN,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 通过遗传搜索算法和信息熵约束,自动适应不同数据集特征寻找最优GNN架构 | 未明确说明框架在极端稀疏数据集上的表现 | 开发自动化框架以改进基因调控网络推断的准确性和泛化能力 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) | 基因表达数据 | 多个公共数据集(未指定具体样本数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1200 | 2025-10-05 |
Pharmacovigilance-Based Identification and Mechanistic Exploration of Periodontitis-Related Drugs
2025-Sep-16, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70040
PMID:40957584
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研究论文 | 基于药物警戒数据识别与牙周炎相关的药物并探索其分子机制 | 首次整合FAERS药物警戒数据、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术系统探索药物与牙周炎的关联及潜在机制 | 需要进一步研究确认因果关系 | 识别与牙周炎相关的药物并探索其分子机制 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 逻辑回归, 信号检测算法 | 药物警戒报告, 基因组数据, 单细胞转录组数据 | FAERS数据库报告, UKB-PPP和deCODE队列, 牙周炎患者牙龈组织和外周血单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |