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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-06-07 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞驱动淋巴结节转移性肢端黑色素瘤的肿瘤微环境相互作用 | 首次识别出SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并发现S100A8细胞在转移性肿瘤中为优势恶性亚群,以及抗SPP1疗法在体内可诱导巨噬细胞表型转换并减少肿瘤负荷 | 未明确说明研究局限性 | 研究肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移进展中的作用 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配的相邻正常样本,分为淋巴结转移阳性与阴性组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 治疗初治的肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1182 | 2026-06-07 |
SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data
2026-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04069-z
PMID:42015285
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研究论文 | 提出SpaNiche空间生态位分析框架,用于探索空间转录组数据中的共定位模式和细胞间相互作用 | 利用图正则化联合非负矩阵分解整合细胞丰度和配体-受体表达信息,并通过共识聚类定义“生态型”,增强多样本空间转录组数据分析的实用性 | 未明确说明 | 开发计算框架以揭示空间转录组中的细胞共定位模式和推断潜在配体-受体相互作用 | 结直肠癌、前列腺癌和早期阿尔茨海默病的脑皮层组织 | 数字病理学 | 结直肠癌, 前列腺癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1183 | 2026-06-07 |
Deciphering the role of circulating inflammatory proteins in myocarditis: Novel strategies for targeted therapy
2026-Apr-15, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2026.134198
PMID:41605333
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research paper | 使用孟德尔随机化和单细胞RNA测序解析循环炎症蛋白在心肌炎中的作用,为靶向治疗提供新策略 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞转录组分析,鉴定了LIF作为心肌炎的因果性炎症蛋白和潜在治疗靶点 | 研究依赖公开数据集,可能受样本异质性和统计效力限制;LIF在心肌炎中的具体机制仍需实验验证 | 探究循环炎症蛋白与心肌炎的因果关系,并评估其作为治疗靶点的转化潜力 | 91种循环炎症蛋白与心肌炎之间的因果关系 | machine learning | cardiovascular disease | GWAS, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA(基于公开GWAS汇总统计数据和GEO数据集,具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1184 | 2026-06-07 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了DAPK2通过磷酸化PKM2的Thr45位点调控扰动流诱导的动脉粥样硬化 | 首次发现DAPK2直接磷酸化PKM2的Thr45位点,促进其二聚化和核转位,从而激活内皮炎症反应,为动脉粥样硬化提供新的治疗靶点 | 未在人类动脉粥样硬化样本中验证DAPK2-PKM2轴的临床相关性,且可能涉及其他未识别的下游效应因子 | 阐明DAPK2在振荡剪切应力诱导的内皮细胞活化和动脉粥样硬化中的作用机制 | 人脐静脉内皮细胞、小鼠动脉组织、EC特异性Dapk2敲除小鼠、EC特异性Pkm2突变体小鼠 | NA | 动脉粥样硬化 | 全基因组微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序、质谱分析、免疫沉淀、邻近连接实验 | NA | 测序数据、质谱数据 | 人类动脉组织样本和小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 1185 | 2026-06-07 |
Macrophage membrane-biomimetic DNA nanocages deliver taurine to reprogram trained immunity for periodontitis therapy
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114664
PMID:41605382
|
研究论文 | 本研究开发了一种巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼递送牛磺酸的方法,通过重编程训练免疫来治疗牙周炎 | 首次利用巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼精准靶向单核细胞,通过递送牛磺酸纠正牙周炎中失调的训练免疫状态,同时恢复牙周膜细胞的成骨分化和线粒体功能 | 未提及具体限制,但可能包括纳米笼的体内稳定性、长期安全性及临床转化挑战 | 开发一种基于DNA纳米笼的靶向递送系统,用于重编程训练免疫以治疗慢性牙周炎 | 牙周炎患者的外周血单核细胞、M2极化和训练免疫抑制巨噬细胞、牙周膜细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1186 | 2026-06-07 |
Strategies for resolving cellular phylogenies from sequential lineage tracing data
2026-Apr, Theoretical population biology
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.tpb.2026.01.001
PMID:41554460
|
研究论文 | 本文通过模拟和分析顺序编辑的谱系示踪数据,研究在高概率下实现精确系统发育重建的条件 | 首次建模顺序编辑记录系统,并利用模拟和理论分析明确简化距离重建方法可准确解析细胞系统发育的参数范围 | 研究基于模拟和理论,实际实验条件可能与模型假设存在偏差 | 理解顺序编辑记录系统的信息内容并指导实验设计 | 顺序编辑记录系统及细胞系统发育重建方法 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 谱系示踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1187 | 2026-06-07 |
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503337
PMID:41611449
|
研究论文 | 探讨反复失血诱导的造血干细胞和祖细胞增殖对年龄相关DNA损伤积累的影响 | 发现反复失血诱导的增殖事件能够激活体内DNA损伤反应并减少双链断裂,而不影响HSPC功能 | 可能未完全模拟自然衰老过程中HSPC增殖的复杂效应,研究主要基于小鼠模型 | 研究造血干细胞和祖细胞增殖率增加对造血系统衰老的影响 | 小鼠造血干细胞和祖细胞及人类scRNA-Seq数据 | 机器学习 | 老年病 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 小鼠样本及人类scRNA-Seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1188 | 2026-06-07 |
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Mar-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218252
PMID:41565051
|
研究论文 | 利用化疗前后的胰腺癌类器官揭示化疗耐药性机制,并发现AG化疗可激活KRAS/MAPK信号通路,为后续靶向治疗提供依据 | 首次建立配对的患者来源胰腺癌类器官模型(化疗前后),揭示AG化疗诱导的KRAS/MAPK信号激活可作为治疗新靶点 | NA | 探究胰腺导管腺癌化疗耐药性的机制及潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者的类器官及其异种移植模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、类器官表型数据 | AG治疗患者30例,未治疗患者60例;验证队列29例类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1189 | 2026-06-07 |
Ferroptosis in heart failure: from molecular insights to therapeutic implications
2026-Mar-26, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag019
PMID:41616804
|
综述 | 本文综述了铁死亡在心力衰竭中的作用机制及其潜在治疗意义 | 提出了‘铁死亡连接’这一新的概念性机制框架,整合了铁动员、抗氧化崩溃、脂质启动和线粒体/钙放大器形成自我强化循环导致泵衰竭的观点 | 铁死亡与心力衰竭之间的明确因果关系尚未确立,且从基础研究向临床转化仍面临障碍 | 分析现有文献,讨论转化障碍,并提出新的机制框架以促进铁死亡调控在精确心脏保护中的应用 | 心力衰竭动物模型(慢性缺血、压力超负荷、糖尿病、脓毒症、肥胖相关和阿霉素诱导的心肌病模型)及人类心肌和心外膜脂肪组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1190 | 2026-06-07 |
A protective role of ECSIT in chemotherapy-induced intestinal mucositis by maintaining Lgr5+ intestinal stem cells and gut homeostasis
2026-Mar-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124236
PMID:41611204
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研究论文 | 探讨ECSIT在化疗诱导的肠道黏膜炎中通过维持Lgr5+肠道干细胞和肠道稳态的保护作用 | 首次揭示ECSIT通过稳定β-catenin复合物调控Wnt信号通路,在化疗诱导的肠道黏膜炎中维持Lgr5+干细胞平衡和黏膜修复的双重作用 | 未提及研究局限性,可能包括样本量有限、主要在动物模型中验证、临床转化还需进一步研究 | 阐明ECSIT在化疗诱导的肠道黏膜炎中对肠道干细胞平衡和黏膜修复的作用机制,特别是通过Wnt/β-catenin通路 | ECSIT基因、肠道干细胞、化疗诱导的肠道黏膜炎模型小鼠、肠道上皮细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 肠道黏膜炎 | 多组学分析, 单细胞RNA测序, 基因编辑 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 临床样本(正常、炎症、腺癌组织)、肠道特异性敲除小鼠、Lgr5特异性诱导敲除小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1191 | 2026-06-07 |
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101137
PMID:41592568
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研究论文 | Hist2Cell是一个视觉图变换器框架,能从组织学图像直接精确解析细粒度细胞类型 | 首次实现从组织学图像直接预测细粒度转录细胞类型,无需重新训练即可泛化至TCGA大型队列 | 未提及具体局限性 | 开发一种成本效益高的方法,从组织学图像预测空间转录组学的细胞表型 | 人类肺癌和乳腺癌数据集 | 计算机视觉 | 肺癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 视觉图变换器 | 图像 | 人类肺癌和乳腺癌数据集,以及TCGA大型队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1192 | 2026-06-07 |
IL-33 promotes rheumatoid arthritis progression by enhancing pro-inflammatory macrophage development in the synovial microenvironment
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20258645
PMID:41615676
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研究论文 | 本研究探讨IL-33在类风湿关节炎滑膜微环境中促进促炎性巨噬细胞发育的作用机制 | 首次揭示IL-33通过MAPK/NF-κB通路促进单核细胞分化为促炎性巨噬细胞,形成IL-33和TNF分泌的恶性循环,为RA滑膜炎症持续提供新机制 | 未提及具体局限性 | 探索IL-33在类风湿关节炎滑膜微环境中的作用,特别是其促进促炎性巨噬细胞分化的关键功能,为治疗耐药患者提供新靶点 | 类风湿关节炎患者的血清、滑液及滑膜组织 | 医学影像 | 类风湿关节炎 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、KEGG富集分析、细胞实验 | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 匹配类风湿关节炎患者样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1193 | 2026-06-07 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Mar-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
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研究论文 | 识别RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于评估育龄男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因的早发改变 | 首次发现RPS14在年轻精子发生功能障碍患者睾丸中显著上调,并证明其作为衰老相关生物标志物在预测精子获取手术成功率和与睾丸免疫微环境(特别是肥大细胞)关联中的潜在价值 | 研究样本量有限,且机制分析主要依赖生物信息学推断,缺乏直接的实验验证 | 探索睾丸衰老相关基因在年轻男性精子发生功能障碍中的早发表型标志物及其功能 | 老年小鼠、老年男性、育龄期正常精子生成患者及精子发生功能障碍患者的睾丸组织 | 机器学习 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集及多组睾丸组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1194 | 2026-06-07 |
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153347
PMID:41610714
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综述 | 文章综述了利用单细胞测序技术发现的克罗恩病相关的新型免疫细胞亚群及其在疾病发生发展中的作用 | 系统总结了克罗恩病中多种罕见免疫细胞亚群(如INFLARE细胞、LND细胞、Tc1/17细胞等)的特征及其潜在治疗靶点价值 | 未提供具体的实验数据或验证结果,主要依赖于已发表文献的总结 | 探讨克罗恩病中免疫细胞亚群的多样性及其在发病机制中的作用,为未来治疗干预提供潜在靶点 | 克罗恩病相关的免疫细胞亚群 | 自然语言处理 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1195 | 2026-06-07 |
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Mar-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.11.018
PMID:41619726
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研究论文 | Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组,影响阿片类药物镇痛效果和戒断反应,并在人类和小鼠中验证 | 首次发现Runx1在小胶质细胞中调节阿片类药物反应,并通过单细胞RNA测序和ChIP-seq揭示其作用机制,结合人类遗传关联分析证实临床相关性 | 未明确Runx1在其他细胞类型或人类脑区的具体作用,且临床样本量有限,机制验证主要依赖小鼠模型 | 探究Runx1转录因子在阿片类药物镇痛和戒断反应中的调控作用及其个体差异的遗传基础 | 小鼠小胶质细胞(Runx1敲除模型)及人类外周血样本(与阿片类药物反应相关的遗传变异) | 机器学习和数字病理学 | 阿片类药物耐受和戒断综合征 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、遗传关联分析 | NA | 基因表达数据、染色质结合位点数据、遗传变异数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)及人类队列(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 1196 | 2026-06-07 |
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117634
PMID:41391693
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研究论文 | 研究KCMF1在卵巢癌中通过调控HRI泛素化抑制整合应激反应的作用机制 | 首次揭示KCMF1通过调控HRI泛素化抑制卵巢癌中整合应激反应,并鉴定植物苷D为新型KCMF1抑制剂 | NA | 探究钾离子通道调节因子1在卵巢癌中的生物学功能和机制 | 卵巢癌上皮细胞、细胞系和异种移植小鼠模型 | 分子生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、定量实时反转录聚合酶链反应、免疫组化、蛋白质印迹分析、Ni-NTA pull-down实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 卵巢癌组织样本、细胞系样本及小鼠模型样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1197 | 2026-06-07 |
Remodeling of non-coding RNA regulatory networks: Decoding the pathological mechanisms and new therapeutic paradigms of cardiovascular diseases
2026-03, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2025.12.007
PMID:41447890
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综述 | 系统总结非编码RNA在心血管疾病中的表达谱、多层次调控机制及诊疗应用,并提出跨尺度分析框架 | 提出跨尺度分析框架整合网络拓扑、时空梯度和能量约束等原理,并强调单细胞多组学、空间转录组学等技术在ncRNA靶向治疗中的创新应用 | ncRNA疗法实际应用受限于递送效率低、功能冗余及微环境依赖性等挑战 | 解析非编码RNA在心血管疾病中的病理机制并探索新的治疗范式 | 微RNA、长链非编码RNA、环状RNA、小核仁RNA等非编码RNA在多种心血管疾病中的表达和功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1198 | 2026-06-07 |
Evaluating the toxicological effects of PET-MPs exposure on atherosclerosis through integrated network toxicology analysis and experimental validation
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04963-6
PMID:41540215
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研究论文 | 通过整合网络毒理学分析与实验验证,评估聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料暴露对动脉粥样硬化的毒性效应 | 首次结合网络毒理学、单细胞RNA测序数据分析和分子对接技术,系统揭示PET-MPs诱导动脉粥样硬化的潜在毒理机制,并通过细胞实验验证炎症反应的关键作用 | 未提及 | 阐明聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料暴露导致动脉粥样硬化的毒理机制 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料与动脉粥样硬化相关靶点及信号通路 | 生物信息学 | 动脉粥样硬化 | 网络毒理学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序、分子对接、细胞实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质结构数据 | 41个潜在靶点,4个核心靶点(CCL5、CTSB、PPARG、TNF) | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1199 | 2026-06-07 |
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512597
PMID:41580978
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研究论文 | 整合全外显子组测序、成像质谱流式与空间转录组学,揭示了有无致癌物暴露的两种小鼠肺腺癌前病变模型中分子与免疫演化的空间特征 | 首次在空间单细胞水平系统比较遗传工程模型与致癌物诱导模型的肺腺癌演化差异,揭示突变负荷、免疫浸润及细胞状态的空间动态变化 | 未提及 | 研究肺腺癌前病变向侵袭性肿瘤演化过程中的空间分子特征与免疫响应变化 | 两种小鼠肺腺癌模型(基因工程模型129S4 K和致癌物诱导模型129S4 U)的癌前病变及肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 全外显子组测序、成像质谱流式、空间转录组学 | NA | 基因序列、图像、空间转录组数据 | 141只小鼠,共284个成像质谱流式感兴趣区域(超过140万个空间单细胞)及156个病变区域的51531个空间转录组斑点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1200 | 2026-06-07 |
Phf6 truncating mutation drives leukemogenesis via disrupted epigenetic regulation in mice
2026-Mar, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02828-8
PMID:41588055
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研究论文 | 通过构建敲入截短Phf6突变的小鼠模型,揭示了Phf6截短突变通过破坏表观遗传调控驱动白血病发生的机制 | 首次证明Phf6截短突变具有功能获得效应,而非传统认为的功能缺失突变,并发现KAT6B乙酰转移酶是其关键下游靶点 | 未明确说明局限性 | 阐明Phf6截短突变在白血病发生中的具体作用机制 | 表达患者来源截短Phf6突变的转基因小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | CNN | 图像 | 转基因小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |