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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-20 |
Molecular characterization of benign intracranial glioependymal and arachnoid cysts suggest heterogeneous mechanisms of action
2025-Jul-01, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf029
PMID:40197611
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研究论文 | 该研究对良性颅内胶质室管膜囊肿和蛛网膜囊肿进行分子表征,提出异质性作用机制 | 首次通过单细胞测序和RNA表达分析揭示两种囊肿的细胞组成差异,发现胶质室管膜囊肿中钠转运蛋白和水通道蛋白表达上调,提示主动液体分泌机制 | 样本量较小(仅16例患者),且未进一步验证囊肿形成的分子机制 | 阐明良性颅内囊肿形成和生长的异质性机制 | 16例接受手术治疗的良性颅内囊肿患者的囊壁病理样本(8例)和囊液(4例) | 数字病理学 | 颅内囊肿 | H&E染色、免疫荧光染色、单细胞测序、RNA表达谱分析 | NA | 图像、文本 | 16例患者,其中8例囊壁样本,4例囊液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-05-20 |
High-throughput differentiation of human blood vessel organoids reveals overlapping and distinct functions of the cerebral cavernous malformation proteins
2025-06-06, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09985-5
PMID:40478324
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研究论文 | 通过高通量分化人血管类器官,揭示了脑海绵状畸形蛋白CCM1、CCM2和CCM3在功能上的重叠与差异 | 结合高通量血管类器官分化、CRISPR敲除、单细胞RNA测序和高内涵成像,系统比较了三种CCM基因敲除在细胞类型特异性表达模式和增殖行为上的差异 | NA | 阐明CCM1、CCM2和CCM3突变导致不同临床表型(尤其是CCM3更严重)的分子和细胞机制 | 人诱导多能干细胞分化而来的血管类器官及其中的成纤维细胞、神经细胞、间充质细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 脑海绵状畸形 | 单细胞RNA测序、高内涵成像、CRISPR基因敲除 | NA | 图像、基因表达数据 | 96孔板格式中多次分化的血管类器官;涉及CCM1、CCM2和CCM3敲除及野生型对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-05-20 |
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537364
PMID:37131803
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研究论文 | 介绍D-SPIN计算框架,从多重单细胞RNA测序数据构建基因调控网络模型,揭示细胞对扰动响应的组织原则 | D-SPIN能够从数千种不同扰动条件下的单细胞mRNA-seq数据生成定量基因调控网络模型,解析基因敲除扰动下的细胞命运决定关键调控因子和远程通路协调机制 | NA | 开发可解释的基因调控网络模型构建框架,揭示细胞信息处理和生理调控原则 | 基因调控网络模型及其在细胞扰动响应中的作用机制 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-05-20 |
Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure
2025-May-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095
PMID:40315846
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,解析儿童高级别胶质瘤的免疫景观,揭示治疗压力下细胞状态的变化 | 首次全面分析儿童高级别胶质瘤的免疫微环境,比较成人与儿童之间的差异,并探索化疗/放疗和免疫检查点抑制治疗后的免疫微环境变化 | 未提供具体局限性信息 | 分析儿童高级别胶质瘤的免疫景观,探究治疗压力下免疫细胞状态变化 | 儿童弥漫性高级别胶质瘤或高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞 | 数字病理学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自儿童弥漫性高级别胶质瘤或高级别室管膜瘤患者的配对样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 空间转录组学分析 |
| 105 | 2026-05-20 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-Cell Treatment Efficacy
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653878
PMID:40463198
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示I型干扰素信号强度对CAR T细胞治疗效果的影响,并提出低强度IFN-I信号增强治疗的新策略 | 首次发现低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞细胞毒性和体内疗效,且与共刺激域类型无关,具有临床转化可行性 | 研究样本量较小(8例患者),且未在其他淋巴瘤亚型或实体瘤中进行验证 | 探索影响CAR T细胞治疗弥漫大B细胞淋巴瘤疗效的分子决定因素,并开发增强策略 | 8例复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的CAR T细胞输注产品 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例患者的输注产品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 106 | 2026-05-20 |
Loss of Kmt2c / d promotes gastric cancer initiation and confers vulnerability to mTORC1 inhibition and anti-PD1 immunotherapy
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645747
PMID:40236091
|
research paper | 基于Kmt2c/d缺失促进胃癌起始并增强对mTORC1抑制和抗PD1免疫治疗敏感性的研究 | 首次揭示Kmt2c/d缺失在胃癌起始中的功能,发现其丧失会增强对mTORC1抑制剂的敏感性并提高MHC-I分子表达及抗原呈递,为Kmt2c/d缺陷型胃癌提供潜在的治疗策略 | NA | 探索Kmt2c/d缺失在胃癌起始中的作用及其对治疗策略的潜在影响 | 胃上皮细胞中的Kmt2c和Kmt2d基因 | machine learning | gastric cancer | 单细胞RNA测序、组织学染色、Cre介导的基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学图像 | 使用基因工程小鼠模型,包含多个时间点和处理组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 107 | 2024-11-07 |
Metabolic reprogramming landscape of pan-cancer by single-cell transcriptome data integration
2025-03-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.10.026
PMID:39500689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2026-05-20 |
A tissue-scale strategy for sensing threats in barrier organs
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644134
PMID:40166266
|
研究论文 | 通过分析肺部流感感染,发现屏障器官采用一种组织尺度的分层威胁感知策略 | 首次揭示屏障器官采用组织尺度分层威胁感知策略,即从最外层上皮到内层基质,检测和响应感染的概率逐渐升高 | 未阐明该策略在其他屏障器官(如肠道、皮肤)中的具体实现机制 | 探究屏障器官如何感知威胁并调整免疫反应以平衡宿主保护与组织损伤 | 小鼠肺部组织 | 数字病理学 | 流感感染 | 单分子成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-20 |
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.70060
PMID:40110679
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研究论文 | 通过小鼠和人类脑部空间转录组学及单细胞RNA测序,揭示代谢应激和年龄如何驱动炎症及认知衰退 | 首次整合小鼠高脂饮食模型与人脑组织空间转录组及单细胞测序,发现代谢应激诱导的认知损伤与微胶质细胞SPP1促炎机制相关,并验证跨物种一致性 | 未明确SPP1在认知障碍中的具体信号通路,且小鼠模型可能无法完全模拟人类长期代谢应激的复杂性 | 探究代谢应激(如肥胖、糖尿病)通过炎症机制导致认知障碍的分子机制,尤其关注微胶质细胞作用 | 高脂饮食小鼠及阿尔茨海默病(AD)合并2型糖尿病(T2D)患者死后脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病,2型糖尿病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,图像 | 小鼠模型及AD/T2D患者死后脑组织(具体数量未提供) | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组分析,10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 110 | 2026-05-20 |
Cxcl9 modulates aging associated microvascular metabolic and angiogenic dysfunctions in subcutaneous adipose tissue
2025-02-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09970-y
PMID:39934436
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研究论文 | 本研究揭示了Cxcl9在皮下脂肪组织微血管衰老中调节代谢和血管生成功能的作用 | 首次发现Cxcl9与衰老内皮细胞氧化磷酸化损伤密切相关,并识别出Aplnr信号通路受抑制是导致能量代谢和血管生成障碍的关键机制,提出Cxcl9作为微血管衰老的生物标志物 | 具体机制需进一步验证,动物模型向人类转化的可靠性待评估 | 探究衰老对微血管网络各段内皮细胞的影响及其分子机制 | 老龄小鼠皮下脂肪组织中的微血管内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 老龄小鼠皮下脂肪组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 111 | 2026-05-20 |
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-02, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14476
PMID:39737748
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research paper | 通过大规模单细胞转录组学揭示阿尔茨海默病的性别依赖性分子特征 | 首次利用大规模单细胞转录组图谱系统揭示阿尔茨海默病中性别特异性基因表达模式、通路改变及细胞间通讯变化,并识别出男性星形胶质细胞中RPTOR关键调控因子及女性中Wnt信号与细胞周期调节差异 | 研究仅关注前额叶皮层区域,未覆盖其他脑区;基于转录组层面的分析可能未完全反映蛋白质功能或表观遗传修饰的影响 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制,为性别特异性治疗策略提供依据 | 人类前额叶皮层单细胞转录组图谱中的细胞类型(包括星形胶质细胞、兴奋性神经元等) | machine learning | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大规模人类前额叶皮层组织样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-05-20 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析了33例神经胶质瘤的免疫细胞和肿瘤细胞,在IDH野生型胶质母细胞瘤中鉴定出两种不同的髓系来源抑制细胞群体 | 首次在人类胶质母细胞瘤中鉴定出早期祖细胞髓系来源抑制细胞和单核细胞髓系来源抑制细胞两个亚群,并揭示了它们与代谢干细胞样肿瘤细胞在假栅栏区的空间共定位及配体-受体互作机制 | 该研究主要基于转录组分析,缺乏功能验证实验和体内模型数据支持 | 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤生长和免疫逃逸中的作用机制 | 33例胶质瘤患者的免疫细胞和肿瘤细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 33例胶质瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Visium 空间转录组平台 |
| 113 | 2026-05-20 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
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研究论文 | 本研究开发了用于单细胞核RNA-seq数据等位基因失衡分析的实验和计算方法 | 首次证明单细胞核RNA-seq比单细胞RNA-seq更适合等位基因特异性表达分析,并开发了一套完整的计算工具 | 未提及具体局限性 | 优化等位基因失衡分析的实验和计算选择,提升分析效能 | 人脑组织样本(帕金森病队列) | 机器学习 | 帕金森病 | snRNA-seq, scRNA-seq, 等位基因特异性表达分析, eQTL分析 | NA | 基因表达数据 | 94例帕金森病患者样本 | NA | 单细胞核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-05-20 |
Specifically blocking αvβ8-mediated TGF-β signaling to reverse immunosuppression by modulating macrophage polarization
2025-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03250-1
PMID:39743547
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研究论文 | 本研究通过开发特异性阻断αvβ8介导的TGF-β信号传导的抗体,揭示了其通过调节巨噬细胞极化逆转免疫抑制的抗肿瘤机制 | 首次阐明抗αvβ8抗体通过直接调控巨噬细胞极化而非仅依赖T细胞来发挥抗肿瘤作用,并发现与PD-1抗体联用可显著增强免疫排斥型肿瘤的敏感性 | αvβ8在不同肿瘤中的表达谱仍存在争议,且抗αvβ8抗体的抗肿瘤机制尚未完全阐明 | 探究特异性阻断αvβ8介导的TGF-β信号对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 多种人类肿瘤样本、同源小鼠模型、人外周血单核细胞、巨噬细胞及食蟹猴 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 肿瘤疾病(肺癌、前列腺癌等) | 单细胞RNA测序、冷冻电镜单颗粒分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据、冷冻电镜结构数据 | 多种人类肿瘤样本及同源小鼠模型(未明确具体数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 115 | 2026-05-20 |
LRRC45 accelerates bladder cancer development and ferroptosis inhibition via stabilizing NRF2 by competitively KEAP1 interaction
2025-01, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了LRRC45通过竞争性结合KEAP1稳定NRF2,加速膀胱癌发展并抑制铁死亡 | 首次发现中心体连接蛋白LRRC45在膀胱癌中通过竞争性结合KEAP1抑制NRF2降解,从而促进肿瘤发生并抑制铁死亡,为膀胱癌治疗提供了新靶点 | NA | 探索LRRC45在膀胱癌发展中的作用及其分子机制 | 膀胱癌细胞及临床样本 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 116 | 2026-05-20 |
Characterization of MAIT cells in glioblastoma reveals a potential immunosuppressive role through a MAIT-neutrophil axis
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf173
PMID:41030524
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的免疫抑制作用,并发现MAIT-中性粒细胞轴可能成为新的治疗靶点 | 首次系统表征MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的免疫抑制功能,发现MAIT17亚型与肿瘤相关中性粒细胞相互作用形成免疫抑制轴 | MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的具体分子机制尚未完全阐明,且研究样本量有限 | 探究MAIT细胞在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | 胶质母细胞瘤患者外周血和肿瘤组织样本中的MAIT细胞及肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重组织成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 20例胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-05-20 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 通过单细胞核RNA测序和空间转录组学揭示IL-1β驱动致心律失常性心肌病疾病进展的机制 | 首次在致心律失常性心肌病中识别出以纤维化-炎症生态位为特征的空间微环境,并证实IL-1β中和抗体可改善疾病表型 | 未详细说明人类样本量及动物模型与人类的跨物种差异 | 探究IL-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的作用及治疗潜力 | 致心律失常性心肌病患者心肌组织及Dsg2突变小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞核RNA测序(snRNAseq)、空间转录组学、IL-1β中和抗体治疗 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 人类ACM患者与对照供体心肌样本(具体数量未说明)及Dsg2突变小鼠模型 | NA | 单细胞核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-05-20 |
Integration of single-nucleus and exosome RNA sequencing dissected inter-cellular communication and biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.021
PMID:38689717
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研究论文 | 通过整合单细胞核与外泌体RNA测序,解析了胰腺导管腺癌中细胞间通讯与生物标志物 | 提出了一种结合snRNA-seq和外泌体小RNA测序构建细胞间通讯网络的新方法,并整合miRNA追踪与配体-受体分析 | 未提及具体局限性 | 探究胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的细胞间通讯机制,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | snRNA-seq, 小RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞核RNA测序, 外泌体小RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-05-20 |
Spatial Transcriptomics Reveals the Temporal Architecture of the Seminiferous Epithelial Cycle and Precise Sertoli-Germ Synchronization
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620681
PMID:39554074
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示小鼠睾丸生精上皮周期的时间架构及支持细胞与生精细胞的精确同步 | 首次通过RNA SeqFISH+空间转录组学技术,在单细胞水平绘制了生精上皮周期的转录动态图谱,并发现支持细胞独立维持周期性转录,提出内源性维甲酸周期及转录因子网络调控机制 | 主要基于小鼠模型,结果是否能推广到其他物种(如人类)需进一步验证 | 阐明生精上皮周期的转录动态及支持细胞与生精细胞的时间同步机制 | 小鼠睾丸组织 | 数字病理学 | 生殖疾病 | RNA SeqFISH+ | NA | 转录组数据 | 216,090个细胞 | NA | 空间转录组学 | RNA SeqFISH+ | RNA SeqFISH+技术用于空间基因表达谱分析 |
| 120 | 2026-05-20 |
Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester - An analysis by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100919
PMID:38941941
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类妊娠早期胎盘绒毛周细胞的基因表达谱 | 首次鉴定出REN和AREG阳性成纤维细胞特异性表达经典周细胞标志物,并发现AREG在早期胎盘绒毛周细胞中特异性转录但蛋白定位于合体滋养层 | 未明确说明具体局限性 | 探究胎盘绒毛周细胞作为胎盘绒毛间充质细胞亚群的标志物和功能 | 人类妊娠早期胎盘绒毛组织中的周细胞 | 数字病理学 | 胎盘相关妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |