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当前共找到 33948 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-03 |
Next-generation method for preparing plant cells for single-cell RNA sequencing
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02940-8
PMID:41326821
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2025-12-12 |
Chronic viral infections impaired the growth process of splenic B cells by upregulating Bbc3 and Atf3 in LCMV-CL13 infected mouse model
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2598932
PMID:41329555
|
研究论文 | 本研究利用LCMV慢性感染模型，揭示了慢性病毒感染通过上调Bbc3和Atf3基因表达，破坏脾脏B细胞发育并削弱体液免疫应答的机制 | 首次在LCMV-CL13慢性感染模型中，结合单细胞RNA测序和免疫组库分析，系统阐明了Bbc3和Atf3基因上调导致脾脏B细胞发育受阻的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，其在人体中的适用性仍需进一步验证；且未深入探讨其他潜在调控基因或信号通路的影响 | 探究慢性病毒感染导致脾脏损伤及体液免疫应答减弱的分子机制 | 感染LCMV-CL13病毒的小鼠模型及其脾脏B细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 免疫组库分析 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-12-12 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2025-Dec-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
|
研究论文 | 本研究开发了两种基于机器学习的框架，用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计 | 开发了首个整合第一性原理模拟与卷积神经网络的数字孪生框架，以及首个结合单细胞RNA测序与C同位素示踪的单细胞代谢通量分析框架，实现了从临床前模型到人类患者的体内代谢通量估计突破 | 未明确说明模型在更大患者队列中的验证情况，也未提及对肿瘤微环境动态变化的长期追踪能力 | 克服组织采样困难、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战，实现人类患者体内代谢通量的精准估计 | 脑癌患者（神经胶质瘤）的肿瘤细胞与非恶性细胞，以及脑癌小鼠模型 | 机器学习 | 脑癌 | C同位素示踪，单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 单细胞RNA测序数据，同位素示踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-12-12 |
The recombinant zoster vaccine induces trained immunity in monocytes through persistent downregulation of TGFβ
2025-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013759
PMID:41348857
|
研究论文 | 本研究探讨了重组带状疱疹疫苗（RZV）通过下调TGFβ1在单核细胞中诱导训练免疫的机制 | 首次揭示RZV通过基因组水平抑制TGFβ1，在单核细胞中诱导同源和异源训练免疫的新机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证；样本时间点有限，长期效应需更多数据支持 | 探究RZV疫苗在老年人中高效诱导训练免疫的分子机制 | 老年人接种RZV后的单核细胞、NK细胞和DC细胞 | 免疫学 | 带状疱疹 | ATAC-seq, scRNA-seq, 免疫蛋白质组学 | NA | 基因组可及性数据、单细胞转录组数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量，但涉及疫苗接种后长达5年的追踪 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-12-12 |
TMEM106A as a Macrophage-Associated Biomarker of Prognosis in IDH-Wildtype Glioma: Integrative Multi-Omics and Spatial Analyses
2025-Dec, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71454
PMID:41354084
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和空间分析，探讨了TMEM106A作为IDH野生型胶质瘤中与巨噬细胞相关的预后生物标志物的作用 | 首次将TMEM106A与IDH野生型胶质瘤的预后及肿瘤微环境中的髓系细胞浸润联系起来，并利用单细胞和空间转录组学技术验证其表达模式 | 所有发现均为相关性研究，需要前瞻性研究来验证其临床适用性 | 探索TMEM106A在胶质瘤中的表达模式、预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | IDH野生型胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | limma, Kaplan-Meier, Cox模型, CIBERSORT, GSEA, pRRophetic | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | TCGA和CGGA数据库的批量RNA-seq数据、单细胞数据集（GSE131928, GSE89567）、空间数据集（Ivy Atlas, Visium）以及79例免疫组化样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 106 | 2025-12-12 |
A Macrophage-Derived 7-Gene Signature Predicts Prognosis and Therapeutic Response in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70079
PMID:41355397
|
研究论文 | 本研究基于EGFR-TKI耐药巨噬细胞亚群，鉴定了一个7基因预后特征，用于预测肝细胞癌患者的生存和治疗反应 | 首次从EGFR-TKI耐药巨噬细胞亚群中推导出7基因预后特征，并验证其在预测生存、免疫治疗反应和靶向药物敏感性方面的价值 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性临床研究进一步验证该特征的临床应用价值 | 识别肝细胞癌的新型预后生物标志物并评估其临床和治疗相关性 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析 | 预后风险模型，临床列线图 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | TCGA-LIHC队列和独立验证队列GSE76427 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-12-12 |
ER Stress Ire1-Xbp1s Pathway Maintains Youthful Epidermal Basal Layer Through the Regulation of Cell Proliferation
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70258
PMID:41077712
|
研究论文 | 本研究揭示了内质网应激反应通路Ire1-Xbp1s在维持年轻表皮基底细胞增殖及皮肤衰老过程中的新作用 | 首次在超短寿命脊椎动物Nothobranchius furzeri中引入Ire1-Xbp1s通路报告系统，结合光隔离化学空间转录组学技术，发现该通路通过激活细胞周期调控因子Vcp维持年轻表皮细胞增殖，并阐明葡萄糖代谢下降导致通路活性降低的衰老机制 | 研究主要基于N. furzeri模型，在哺乳动物中的保守性需要进一步验证；空间转录组学分析范围局限于表皮组织 | 探究内质网应激反应在衰老过程中的时空调控机制及其在组织稳态维持中的作用 | Nothobranchius furzeri（非洲鳉鱼）的表皮组织及内质网应激反应通路 | 空间转录组学 | 皮肤衰老 | 光隔离化学空间转录组学、功能验证实验 | NA | 空间转录组数据、细胞增殖数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2025-12-12 |
The BCG in situ study - novel techniques applied to a 100-year-old vaccine
2025-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2025.103712
PMID:41362666
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学和液体活检等先进技术，深入解析了皮内接种BCG疫苗后局部皮肤和全身免疫反应 | 首次将空间转录组学应用于BCG疫苗接种后的皮肤组织研究，结合液体活检技术全面表征局部和系统免疫反应 | 研究样本量有限，且主要关注短期反应，长期保护效果和成人肺结核预防仍需进一步验证 | 阐明BCG疫苗接种后局部皮肤和全身免疫反应的细胞与分子机制，以加速改进或新疫苗的开发 | BCG疫苗接种后的皮肤组织活检样本和血液样本 | 数字病理学 | 结核病 | 空间转录组学、细胞游离血浆转录组学、全血转录组学、表观遗传分析、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 组织图像、转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | 空间转录组学, 液体活检 | NA | NA |
| 109 | 2025-12-12 |
Decoding the Therapeutic Effects of Acupuncture in Hemorrhagic Stroke Using Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70689
PMID:41363028
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在小鼠出血性卒中模型中探索针灸治疗的细胞和分子机制 | 首次在单细胞水平揭示针灸通过调节胶质细胞基因表达及APOE-TREM2信号轴促进卒中恢复的分子机制 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类临床研究中进一步验证 | 阐明针灸治疗出血性卒中的细胞分子机制 | 出血性卒中模型小鼠的脑组织细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-12-12 |
Characterizing epithelial-mesenchymal transition-linked heterogeneity in breast cancer circulating tumor cells at a single-cell level
2025-Dec, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70132
PMID:41046340
|
研究论文 | 本研究在单细胞水平上表征了乳腺癌循环肿瘤细胞中与上皮-间质转化相关的异质性 | 首次在早期乳腺癌患者中，结合免疫磁珠去除、多标记免疫荧光和单细胞转录组学，系统检测并量化了不同EMT状态的循环肿瘤细胞及其异质性，并揭示了间质特征CTC中核糖体基因下调及mTORC1信号相关的翻译抑制 | 样本量相对有限（107例），且为观察性研究，需要进一步的功能实验验证发现的分子机制 | 检测并表征乳腺癌患者循环肿瘤细胞中与上皮-间质转化相关的异质性，以理解血行播散的机制 | 乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫磁珠去除，多标记免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 107例乳腺癌患者的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-12-12 |
The mouse neonatal small intestine is regionally specialized for protein absorption and transepithelial transport
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205127
PMID:41208810
|
研究论文 | 本研究揭示了新生小鼠小肠中空肠和回肠上皮细胞在蛋白质吸收和跨上皮运输方面的区域和功能特化 | 首次揭示了新生小鼠小肠中空肠和回肠上皮细胞在蛋白质吸收和运输方面的区域特化，并发现了Dab2在营养性蛋白质跨细胞运输中的特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类新生儿中的类似机制需要进一步验证 | 探究新生小鼠小肠不同区域在蛋白质吸收和运输中的功能特化及其分子机制 | 新生小鼠的小肠上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、遗传学方法、体内和体外货物运输实验 | NA | 转录组数据、遗传数据、功能实验数据 | 新生小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-12-12 |
Fibroblasts in the tumor microenvironment: heterogeneity and dynamic interactions in tumor progression revealed by spatial transcriptomics
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01108-y
PMID:41129052
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2025-12-12 |
Novae: a graph-based foundation model for spatial transcriptomics data
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02899-6
PMID:41372623
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Novae的基于图的基础模型，用于处理空间转录组学数据，以提取细胞在空间背景下的表征 | Novae是一种基于图的基础模型，能够在多个切片上执行零样本域推断，并原生校正批次效应，同时构建空间域的嵌套层次结构 | NA | 改进当前模型在多个切片上的局限性，以促进空间转录组学在生物医学研究中的应用 | 空间转录组学数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 基于图的模型 | 空间转录组学数据 | 近3000万个细胞，覆盖18种组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2025-12-12 |
Effect of acupuncture on brain microenvironment in rats with post-stroke limb spasticity based on single-cell transcriptome sequencing technology
2025-Dec, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术探讨了针灸对脑卒中后肢体痉挛大鼠脑微环境的影响及其可能机制 | 首次结合单细胞转录组测序技术分析针灸对脑卒中后肢体痉挛大鼠脑缺血半暗带细胞类型比例及基因表达的影响 | 研究仅基于大鼠模型，样本量较小（32只），且未涉及长期疗效评估 | 探究针灸改善脑卒中后肢体痉挛的可能机制 | 脑卒中后肢体痉挛大鼠模型 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组测序，Western blot，实时定量PCR，酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，基因表达数据 | 32只大鼠，分为对照组、假手术组、模型组和针灸组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-12-12 |
Multi-omics integration reveals hypoxia-driven mechanisms in vascular dementia: a machine learning and single-cell sequencing approach
2025-Dec, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004296
PMID:41377395
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别并分析了血管性痴呆中的关键缺氧相关基因，揭示了其在代谢、免疫和细胞分化中的作用 | 结合机器学习与单细胞测序技术，首次系统性地鉴定了DUSP1、MAFF和TGFBI作为血管性痴呆缺氧机制的核心基因，并关联了代谢通路与免疫微环境 | 研究主要基于公开数据集和动物模型，缺乏大规模临床样本验证，且机制探索仍处于初步阶段 | 识别血管性痴呆中的缺氧相关枢纽基因，探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 血管性痴呆相关的基因表达数据、慢性脑低灌注模型（2VO）动物组织 | 机器学习 | 血管性痴呆 | 单细胞测序，免疫组织化学，WGCNA，机器学习 | 机器学习模型（未指定具体类型） | 基因表达数据，单细胞测序数据，图像数据 | 基于公开数据集GSE122063和GSE282111，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，高通量测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-12-12 |
Detection of serotonin and serotonin related gene reveals unique roles in human intestinal epithelial development
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.27.690965
PMID:41377494
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和组织学验证，揭示了血清素及其相关基因在人类肠道发育中的时空表达图谱 | 首次生成了从妊娠早期到成年晚期的血清素及其相关基因在人类肠道中的时空表达图谱，揭示了其动态、细胞类型特异性的调控模式 | 研究主要基于转录组数据，缺乏功能实验验证血清素在肠道发育中的具体作用机制 | 探究血清素在人类早期肠道发育中的作用 | 人类肠道组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 从妊娠早期到成年晚期的多个时间点的人类肠道样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-12-12 |
Unveiling the dental cellular landscape: A comprehensive review of single-cell RNA sequencing in human dental tissues
2025-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2025.11.004
PMID:41377691
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示人类牙科组织细胞异质性和分子动态方面的应用 | 首次系统性地评估和比较了scRNA-seq在健康和疾病状态下人类牙科组织细胞组成研究中的应用，揭示了牙髓和牙周组织中独特的细胞亚群及其转录特征 | 纳入的研究数量有限（共15项），部分细胞亚群的命名和功能尚未完全统一，且主要基于体外培养环境的研究可能无法完全反映体内情况 | 评估scRNA-seq技术在人类牙科组织细胞图谱研究中的应用现状和生物学发现 | 人类牙科组织（包括牙髓、牙周组织等）在健康和疾病状态下的细胞 | 单细胞组学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 15项符合纳入标准的研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-12-12 |
Systematic analysis of the expression profiles and prognostic values of the FAM72 family in liver cancer
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102358
PMID:41378103
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，系统评估了FAM72家族成员在肝癌中的表达水平及其预后相关性 | 首次系统分析了FAM72A-D在肝癌中的表达谱和预后价值，并构建了基于FAM72的基因特征来预测肝癌患者预后 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证，且单细胞RNA测序结果仅提示FAM72A-D主要存在于增殖性T细胞中，具体机制未深入探讨 | 探究FAM72家族在肝癌中的表达模式、预后意义及其与肿瘤发生的关系 | 肝癌组织和正常组织中的FAM72A-D基因 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-12-12 |
Single-cell and spatial transcriptome landscapes reveal the spatial immune defense pattern shared by primary and brain metastatic lung adenocarcinoma
2025-Nov-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1224
PMID:41376899
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了原发性与脑转移性肺腺癌共享的空间免疫防御模式 | 首次通过单细胞和空间转录组学结合，识别了肿瘤细胞中的metaprogram MP1及其在肿瘤边界的空间富集，提出了共享的'肿瘤免疫防御模式'（TIDP）概念 | 研究主要基于转录组数据，未深入验证功能机制；样本可能有限，需要更大规模验证临床潜力 | 旨在阐明原发性与脑转移性肺腺癌共享的免疫防御机制，识别空间组织程序和分子相互作用，以解释免疫逃逸和治疗抵抗 | 原发性与脑转移性肺腺癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2025-12-12 |
Identification of the key gene for hepatocellular carcinoma based on bioinformatics and machine learning and experimental verification
2025-Nov-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1067
PMID:41378005
|
研究论文 | 本研究结合生物信息学和机器学习方法，筛选并验证了肝细胞癌中的关键基因FAM83D | 首次通过整合多个GEO数据集、机器学习算法（SVM-RFE和LASSO）以及单细胞和空间转录组学分析，系统性地识别并验证了FAM83D作为肝细胞癌的关键驱动基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证部分可能受样本量限制，且需要进一步的功能性实验验证FAM83D的具体作用机制 | 识别肝细胞癌的关键驱动基因，以促进早期诊断和预后评估 | 肝细胞癌患者与非肝细胞癌对照的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、机器学习、免疫组化、单细胞转录组学、空间转录组学 | SVM-RFE, LASSO | 基因表达数据 | 三个GEO数据集（GSE78737、GSE98383、GSE121248），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |