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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-14 |
Targeting bone marrow adipocyte-driven fatty acid metabolism to overcome drug resistance in lung cancer bone metastasis
2025-Nov-10, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03792-2
PMID:41214690
|
研究论文 | 本研究探讨骨髓脂肪细胞通过调节脂肪酸代谢促进肺癌骨转移耐药性的机制,并开发了靶向纳米颗粒治疗策略 | 首次揭示骨髓脂肪细胞驱动脂肪酸代谢重编程在肺癌骨转移耐药中的作用,并开发了具有骨靶向功能的酸性微环境响应型纳米颗粒递送系统 | 研究主要基于体外共培养模型和单细胞测序,缺乏大规模临床验证 | 克服肺癌骨转移中的药物耐药性问题 | 肺癌骨转移微环境中的骨髓脂肪细胞和转移性肺癌细胞 | 肿瘤代谢 | 肺癌 | 单细胞测序, 体外共培养, 纳米颗粒递送系统 | NA | 单细胞测序数据, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-11-14 |
Analysis of the associations between DNA methylation and clinical features reveals the potential oncogenic effect of CFAP52 in esophageal squamous cell cancer
2025-Nov-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03934-4
PMID:41214700
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研究论文 | 本研究通过分析DNA甲基化与临床特征的关联,揭示了CFAP52在食管鳞癌中的潜在致癌作用 | 首次系统揭示DNA甲基化与食管鳞癌性别差异和饮酒习惯的关联,并发现CFAP52作为新的癌基因通过影响花生四烯酸代谢促进肿瘤进展 | 研究主要基于TCGA数据库分析,实验验证主要在细胞水平进行,缺乏体内动物模型验证 | 探索DNA甲基化在食管鳞癌发展中的潜在作用机制 | 食管鳞癌患者组织样本、细胞系和公共数据库数据 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | DNA甲基化分析,RNA-seq,单细胞RNA-seq,Western blot,UPLC-MS/MS,免疫组化 | Cox回归分析,共识聚类,CIBERSORTx免疫细胞分析 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据,代谢组数据 | TCGA ESCA队列数据,多个GEO数据集(GSE53624,GSE160269,GSE203115) | Illumina | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | Seurat软件包用于单细胞RNA-seq数据分析 |
| 103 | 2025-11-14 |
Characterizing Stroke-related Cellular Changes in the Surviving Neurons of Mouse Ischemic Stroke
2025-Nov-10, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106086
PMID:41223896
|
研究论文 | 本研究通过单核和单细胞RNA测序技术,表征了小鼠缺血性中风后存活神经元的细胞和分子变化 | 首次结合snRNA-seq和scRNA-seq技术系统分析中风急性和亚急性期的细胞状态变化,揭示了SynGAP1-PSD-95解离在缺血损伤中的新机制 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,样本量有限,且未在人类样本中验证 | 阐明缺血性中风引起的分子改变机制,寻找潜在治疗靶点 | C57BL/6小鼠的脑组织细胞 | 单细胞组学 | 缺血性中风 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组织化学, 基因本体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | C57BL/6小鼠分为对照组、假手术组、dMCAO 3天组和dMCAO 14天组 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-11-14 |
Perfluorooctanoic Acid Disrupts Splenic Immunity and Antiviral Responses in the LCMV Model: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-10, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127367
PMID:41224070
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示全氟辛酸在小鼠LCMV模型中破坏脾脏免疫和抗病毒反应的细胞特异性机制 | 首次在病毒感染模型中结合单细胞RNA测序揭示PFOA对免疫系统的细胞特异性影响机制 | 研究仅使用雌性C57BL/6J小鼠,样本量相对有限 | 探究全氟辛酸对免疫系统功能的影响及其在病毒感染中的机制 | 雌性C57BL/6J小鼠的脾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | LCMV Clone 13病毒感染模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 对照组5522个细胞 vs 高剂量组4741个细胞(13个注释细胞簇) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-11-14 |
Caveolin-1 drives vasculogenic mimicry in lung adenocarcinoma through autophagy-mediated glycolytic reprogramming
2025-Nov-10, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112198
PMID:41224162
|
研究论文 | 本研究揭示了Caveolin-1通过自噬介导的糖酵解重编程驱动肺腺癌血管生成拟态的新机制 | 首次发现Caveolin-1-自噬-糖酵解-血管生成拟态轴在肺腺癌进展中的关键作用,并提出联合靶向治疗策略 | NA | 探究Caveolin-1在肺腺癌血管生成拟态形成中的分子机制 | 肺腺癌细胞及肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptome profiling of post-treatment and treatment-naïve colorectal cancer: Insights into putative mechanisms of chemoresistance
2025-Nov-09, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218127
PMID:41218746
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌化疗耐药机制 | 首次在单细胞水平系统比较初治与化疗后结直肠癌的肿瘤微环境特征,发现与化疗耐药相关的特异性细胞亚群和生物标志物 | 样本量相对有限(50例),且为观察性研究无法确定因果关系 | 探究结直肠癌化疗耐药的潜在机制 | 50例结直肠癌患者(30例初治,20例化疗后) | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 50例结直肠癌样本(30初治,20化疗后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-11-14 |
Identification and validation of stemness-related gene signatures to predict prognosis and immune infiltration in osteosarcoma reveals a critical role for S100A13
2025-Nov-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14939-7
PMID:41206435
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别骨肉瘤中具有高干性特征的肿瘤细胞,建立预后模型并鉴定S100A13为关键基因 | 首次在骨肉瘤中通过单细胞RNA测序识别高干性肿瘤细胞群,并建立基于干性特征的预后模型,发现S100A13在骨肉瘤恶性进展和干性调控中的关键作用 | 研究样本量有限,功能验证仅在MG-63和HOS两种骨肉瘤细胞系中进行 | 探索骨肉瘤细胞干性特征与预后及免疫浸润的关系 | 骨肉瘤患者样本和骨肉瘤细胞系(MG-63和HOS) | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,功能验证实验(集落形成、肿瘤球形成、伤口愈合、Transwell迁移和侵袭实验) | 预后风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-11-14 |
Spatial transcriptomics reveals unique inflammatory signatures across all anatomic locations in postoperative Crohn's disease
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf180
PMID:41092315
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了克罗恩病术后患者不同解剖位置共有的炎症特征 | 首次在克罗恩病术后患者的结肠、新末端回肠和吻合口三个解剖位置同时发现共同的炎症转录特征 | 样本来源仅限于PREDICT-OR研究队列,需要更大样本验证 | 探究克罗恩病术后患者胃肠道炎症的分子基础 | 克罗恩病术后患者的结肠、新末端回肠和吻合口活检样本 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | PREDICT-OR研究中的患者活检样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium CytAssist system V2.0 |
| 109 | 2025-11-14 |
Radiation-induced glioblastoma stem cell-mediated T cell exhaustion via EGR1-Gal3-LAG3 axis in glioblastoma
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218125
PMID:41213464
|
研究论文 | 本研究揭示了放疗通过EGR1-Gal3-LAG3轴诱导胶质母细胞瘤干细胞介导T细胞耗竭的新机制 | 首次发现放疗通过EGR1转录上调Gal3表达,进而通过LAG3介导T细胞耗竭的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证 | 探究胶质母细胞瘤放疗后肿瘤干细胞与T细胞相互作用的演变机制 | 胶质母细胞瘤干细胞、肿瘤浸润T细胞、原位移植瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发和新诊断胶质母细胞瘤患者的T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-11-14 |
Genetic and Cellular Architecture of Breast Cancer Risk in Multi-Ancestry Studies of 159,297 Cases and 212,102 Controls
2025-Nov-07, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.20.25334075
PMID:40909829
|
研究论文 | 通过多祖先群体的全基因组关联研究分析乳腺癌的遗传结构 | 迄今为止最大的多祖先乳腺癌研究,整合了非洲、东亚、欧洲和西班牙/拉丁裔样本的GWAS汇总统计数据 | 不同祖先群体间遗传力估计和易感标记数量差异无统计学显著性 | 探索乳腺癌在多祖先群体中的遗传结构和细胞类型关联 | 159,297例乳腺癌患者和212,102例对照样本 | 基因组学 | 乳腺癌 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序 | 稀疏正态混合效应模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 159,297病例和212,102对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens scRNA-seq图谱 |
| 111 | 2025-11-14 |
Unveiling tissue heterogeneity through genomic interaction-encoded image representation of RNA-sequencing data
2025-Nov-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.08.021
PMID:40967222
|
研究论文 | 提出一种基于基因组交互编码图像表示的RNA测序数据分析框架,用于改进组织异质性分析 | 利用基因组交互编码的图像表示方法,结合样本特异性基因表达变异性,通过卷积变分自编码器和高斯混合模型推导特征模式 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病中的适用性限制 | 开发改进的细胞组分分析方法,用于组织异质性研究和下游生物医学应用 | RNA测序数据,包括单细胞和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 卷积变分自编码器,高斯混合模型 | 基因表达数据,图像表示数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-11-14 |
Multi-omics Mendelian randomization and single-cell analysis identify novel therapeutic targets for osteosarcopenia
2025-Nov-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf228
PMID:41071635
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化和单细胞分析识别骨肌减少症的新型治疗靶点 | 整合多组学孟德尔随机化与单细胞RNA测序技术,首次系统识别骨肌减少症的因果分子靶点 | 需要进一步在特定组织和细胞环境中验证这些靶点的功能 | 识别骨肌减少症的潜在治疗靶点 | 骨肌减少症相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 老年疾病 | 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组,转录组,蛋白质组数据 | 基于eQTLgen、deCODE和Fenland三大数据集的大规模GWAS数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 113 | 2025-11-14 |
A novel information-theoretic approach reveals loss of effective biomolecular communication in aging muscle cells
2025-Nov-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf195
PMID:40920357
|
研究论文 | 本研究通过信息论方法分析骨骼肌单细胞RNA-seq数据,揭示了衰老过程中肌肉细胞生物分子通讯效率的下降 | 首次将信息论应用于单细胞RNA-seq数据,量化转录因子与靶基因之间的通讯效率随年龄的变化 | 研究仅限于骨骼肌细胞,未涉及其他组织类型 | 探究衰老过程中生物分子通讯效率的变化及其机制 | 年轻、中年和老年动物的骨骼肌细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq | 信息论模型 | 单细胞RNA测序数据 | 年轻、中年和老年三个年龄组的动物骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-11-14 |
Distinct Tumor-Associated Macrophage Signatures Shape the Immune Microenvironment and Patient Prognosis in Renal Cell Carcinoma
2025-Nov-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211740
PMID:41227385
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发了肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞特征,并建立了预后风险模型 | 首次在肾细胞癌中系统鉴定8种不同的肿瘤相关巨噬细胞特征,并构建27基因风险模型用于患者预后分层 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞特征对肾细胞癌免疫微环境和患者预后的影响 | 肾细胞癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,LASSO Cox回归分析 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床生存数据 | 多个独立肾细胞癌队列数据集,包括TCGA数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-11-14 |
Spatial Multiomics Defines a Shared Tumor Infiltrative Signature at the Resection Margin in High-Grade Gliomas
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4708
PMID:40759029
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析定义了高级别胶质瘤切除边缘的共享肿瘤浸润特征 | 首次结合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学数据,系统分析高级别胶质瘤核心区与边缘区的分子差异 | 样本量较小(4例单核测序+2例空间转录组学),需要更大规模验证 | 揭示高级别胶质瘤切除边缘的残余病变生物学特征 | 高级别胶质瘤患者肿瘤组织的核心区和边缘区样本 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9基因编辑, 染色质免疫沉淀测序 | 功能富集分析, 差异分析, RNA速度分析, 伪时间分析 | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 4例高级别胶质瘤(36,811个单核RNA测序核, 30,705个单核ATAC测序核)+ 2例额外空间转录组样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2025-11-14 |
Integrated Multi-Omics Analysis Uncovers Immune-Metabolic Interplay in Hepatocellular Carcinoma Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213565
PMID:41228357
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中免疫与代谢的相互作用 | 首次通过整合基因组学、表观基因组学和单细胞转录组学数据,发现了免疫代谢基因通过启动子低甲基化调控的机制及其与肿瘤微环境特征和患者预后的关联 | 样本量相对有限(60例患者),需要在更大队列中验证发现 | 解析肝细胞癌肿瘤微环境中免疫与代谢特征的相互作用机制 | 60例肝细胞癌患者的肿瘤样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、单细胞转录组数据 | 60例肝细胞癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | NA |
| 117 | 2025-11-14 |
Single-cell RNA sequencing revealed the role of the Th17 pathway in the development of anti- human leukocyte antigen antibodies in a highly sensitized mouse model
2025-Nov, Kidney research and clinical practice
IF:2.9Q1
DOI:10.23876/j.krcp.23.317
PMID:38934039
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Th17通路在高度致敏小鼠模型中抗人类白细胞抗原抗体形成中的作用 | 首次在HLA致敏模型中结合单细胞RNA测序技术系统分析Th17细胞分化通路的作用机制 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 探究人类白细胞抗原致敏过程中的特异性信号通路 | HLA.A2转基因小鼠的脾细胞 | 单细胞组学 | 免疫排斥反应 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | ALLO组9,190个细胞,SYN组8,890个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2025-11-14 |
Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the roles of neutrophils in pediatric Crohn's disease
2025-Nov, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-03961-x
PMID:40121337
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序揭示了中性粒细胞在儿童克罗恩病中的关键作用 | 首次在儿童克罗恩病中系统揭示中性粒细胞比例增加、功能状态改变及其在细胞间通讯中的主导作用 | 研究样本来源仅限于回肠和结肠活检样本,未涉及其他肠道部位 | 探索儿童克罗恩病的分子机制、识别诊断生物标志物和治疗靶点 | 儿童克罗恩病患者的回肠和结肠活检样本 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-11-14 |
Mechanical confinement governs phenotypic plasticity in melanoma
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09445-6
PMID:40866703
|
研究论文 | 本研究揭示了机械限制通过染色质重塑介导黑色素瘤表型可塑性转换的机制 | 首次证明机械限制通过HMGB2蛋白调控染色质构象,驱动黑色素瘤细胞在增殖与侵袭状态间的表型转换 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证相对有限 | 探究机械微环境对黑色素瘤表型可塑性的调控机制 | 黑色素瘤细胞(斑马鱼模型和人类样本) | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学,单细胞转录组学,定量建模 | 斑马鱼模型 | 转录组数据,形态学数据 | 斑马鱼黑色素瘤模型和人类肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-11-14 |
S100A12 correlates with inflammatory and pain symptoms in patients with chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome
2025-Nov, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2025.105536
PMID:40914239
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研究论文 | 本研究探讨了警报素S100A12作为慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征炎症与神经性疼痛关联的潜在生物标志物 | 首次在CP/CPPS患者中发现S100A12水平显著升高,并证实其与炎症标志物和疼痛评分的相关性,揭示了S100A12在白细胞-神经相互作用中的新机制 | 回顾性病例对照研究设计,样本量相对有限(90例患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 评估S100A12作为CP/CPPS诊断生物标志物的潜力,并探索其在疼痛机制中的作用 | 90名慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征患者和90名年龄匹配的健康对照 | 生物医学研究 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序,生物标志物分析,统计学分析 | 病例对照研究 | 生物样本数据(精浆、血清、尿液),临床评分数据 | 180名参与者(90名患者和90名对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |