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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-11 |
Mitochondrial and Ribosomal Stress Underlying Pronuclear Envelope Breakdown Failure: Insights From Single-Cell Transcriptomics in Human Zygotes
2026-Mar, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.70096
PMID:41787695
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人类受精卵中前核膜破裂失败的分子机制,重点关注线粒体和核糖体应激 | 首次发现MT-ND1-RPL10A/RPL38轴作为评估ICSI胚胎质量的新型分子标志物,并揭示线粒体代谢功能障碍和核糖体组装异常共同导致前核膜破裂失败 | 未提及具体局限性 | 阐明前核膜破裂失败的核心调控网络及其对胚胎发育的影响 | 人类受精卵(PNEB型2PN受精卵和3PN对照受精卵) | 机器学习和数字病理学 | 不孕不育及胚胎发育异常 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析和LASSO回归 | 单细胞转录组数据、荧光染色数据 | PNEB型2PN受精卵和3PN对照受精卵(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-06-11 |
Assessment of dispersion metrics for estimating single-cell transcriptional variability
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014030
PMID:41770747
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研究论文 | 系统性比较统计指标在估计单细胞转录变异中的效果,并应用方差均值比(Fano因子)测量单细胞数据集中的转录变异性 | 通过模拟单细胞数据系统比较多种常用统计指标对噪声的响应性,并发现Fano因子是测量转录变异性的合适指标,能揭示平均表达以外的生物学信息 | 研究主要基于模拟数据和特定平台的数据集,结论的普适性有待进一步验证 | 评估不同统计指标在估计单细胞转录变异性中的有效性,并应用最合适的指标分析生物学相关信息 | 单细胞RNA测序数据中的转录变异性 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用多个单细胞数据集,代表不同复杂系统和跨平台测量,具体样本数未明确 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 使用10x Chromium进行单细胞捕获,Illumina NovaSeq进行测序,具体细节未提供 |
| 103 | 2026-06-11 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,开发了正弦细胞特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次从单细胞层面识别肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的细胞类型特异性特征,并将其整合为三个正弦评分(内皮、间充质和巨噬细胞),用于慢性肝病进展和逆转的生物学通路监测 | 回顾性研究设计,需进行前瞻性验证后才能推广至临床试验实施 | 开发正弦细胞特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 慢性肝病患者 | machine learning | chronic liver disease | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达定量分析 | 逻辑回归(AUROC评分) | 基因表达数据(来自肝活检样本) | 内部队列108例,验证队列1008例(含两年随访数据) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-06-11 |
GeneExt: a gene model extension tool for enhanced single-cell RNA-seq analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag094
PMID:41769841
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研究论文 | GeneExt是一款利用单细胞RNA测序数据完善基因注释的工具,能够提升非模式物种基因表达量化准确性 | 首次专门针对非模式物种设计,通过扩展和均一化基因注释来解决因基因模型不完整导致的表达量化问题 | 未提及具体限制,但推测可能依赖高质量scRNA-seq数据,且在不同物种间的适用性可能需要进一步验证 | 提升单细胞RNA测序数据中基因表达量化的准确性,改善非模式物种的生物注释和跨物种比较 | 八个非模式生物的单细胞图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 八个非模式生物的单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-06-11 |
scDock: streamlining drug discovery targeting cell-cell communication via scRNA-seq analysis and molecular docking
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag103
PMID:41769845
|
研究论文 | 提出scDock管线,整合单细胞RNA测序分析与分子对接,实现靶向细胞间通讯的药物发现 | 首次将单细胞RNA测序数据处理、细胞间通讯推断和基于分子对接的药物发现整合为无需编程技能的一站式管线 | NA | 开发一个用户友好的端到端管线,用于从单细胞数据中发现靶向细胞间通讯的治疗化合物 | 疾病相关的配体-受体相互作用及潜在治疗化合物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(RNA-seq)、分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-06-11 |
The dorsal root ganglion T-junction: a critical node in somatosensory processing and pain pathogenesis
2026-Feb-25, Sheng li xue bao : [Acta physiologica Sinica]
PMID:41777127
|
综述 | 综述背根神经节T形连接在躯体感觉处理和疼痛发病机制中的关键作用 | 首次系统总结空间转录组学、单细胞测序、超分辨率显微镜、类器官模型等新技术对T形连接分子组成、离子通道分布和电生理特性的解析 | T形连接体内动态调控机制尚不完全清楚,精准靶向治疗临床转化仍有挑战 | 阐明背根神经节T形连接在感觉信号处理和疼痛病理中的功能机制 | 背根神经节中的假单极神经元及其T形连接 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学、单细胞测序、超分辨率显微镜、电生理记录 | NA | 空间转录组数据、单细胞测序数据、图像数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | NA |
| 107 | 2026-06-11 |
Canonical human blood dendritic cells are distinguished by robust E-selectin binding
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf307
PMID:41764722
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研究论文 | 该研究表明,所有人血液树突状细胞亚群均能通过表达E-选择素配体实现与内皮细胞的粘附,从而在血流与组织间迁移中发挥作用 | 首次揭示人血液树突状细胞及其前体细胞普遍具备稳健的E-选择素结合能力,重新定义了这类连接先天性和适应性免疫系统的免疫细胞的分子迁移机制 | 单细胞RNA测序无法提供树突状细胞表达sLeX的关键化学酶效应物的见解,仅依靠RNA测序方法具有局限性 | 探究人血液树突状细胞与E-选择素结合的能力及其在免疫细胞组织募集中的作用 | 人血液树突状细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 流式细胞术、生化分析、转录本测序、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 文本、测序数据 | 人血液样本,具体数量未提及 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-11 |
A comprehensive single-cell analysis reveals the impact of laser interstitial thermal therapy on the tumor microenvironment in glioblastoma
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf327
PMID:41764740
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和免疫荧光技术,研究激光间质热疗对胶质母细胞瘤肿瘤微环境的影响 | 首次通过单细胞RNA测序全面揭示激光间质热疗诱导的亚致死高温对胶质母细胞瘤肿瘤微环境的多重复杂影响,包括促进细胞毒性T细胞浸润、驱动树突状细胞成熟、增强生发中心B细胞募集、减少M2型巨噬细胞浸润,并发现其通过减弱胶原相关基因与Cd44的相互作用抑制肿瘤,同时通过增强Ptn与Ncl的相互作用促进肿瘤血管生成和增殖的双重效应 | 研究基于大鼠颅内胶质母细胞瘤模型,结论可能需要进一步在人类患者中验证 | 研究激光间质热疗诱导的亚致死高温对胶质母细胞瘤肿瘤细胞及其微环境的影响 | 胶质母细胞瘤(GBM)大鼠颅内模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 大鼠颅内胶质母细胞瘤模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学 |
| 109 | 2026-06-11 |
T cells co-expressing high levels of CD29 and CD99 show increased cytotoxic potential and are upregulated in Sjögren's disease
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf370
PMID:41764742
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研究论文 | 本研究旨在探讨CD29和CD99在人类T淋巴细胞中的作用及其在干燥综合征中的意义 | 首次发现CD29和CD99在T细胞中高度共表达,并鉴定出CD29hiCD99hi T细胞亚群具有增强的细胞毒性潜能和活化表型,且在干燥综合征患者中上调 | 仅分析了外周血中的T细胞,缺乏对组织浸润T细胞的直接验证,且ROC分析显示仅CD29hiCD99hi CD4+ T细胞中的TIGIT表达达到高AUC值,临床价值有限 | 探索CD29和CD99在人类T细胞中的协同作用及其在干燥综合征发病机制中的意义 | 人类T淋巴细胞,特别是外周血单个核细胞中的CD4+和CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 干燥综合征患者和健康对照者的外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 110 | 2026-06-11 |
IFNγ/JAK/STAT1/CD38 pathway in SH2D1Bhigh NK cells: Implications for inflammation in type 1 diabetes
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf347
PMID:41764744
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研究论文 | 本研究探讨了SH2D1B高表达的自然杀伤细胞中IFNγ/JAK/STAT1/CD38通路在1型糖尿病炎症中的作用 | 首次揭示SH2D1B高表达的NK细胞通过IFNγ/JAK1/STAT/CD38通路产生腺苷,可能限制1型糖尿病的自身免疫和疾病发展 | NA | 探究1型糖尿病中SH2D1B高表达NK细胞的分子机制及其对炎症的影响 | 1型糖尿病患者外周血中的NK细胞 | 机器学习 | 1型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, Western blotting | LASSO | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-06-11 |
TWEAK is increased in ulcerative colitis and contributes to fibroblast-mediated monocyte activation via heterologous non-canonical NF-kB/STAT3 signaling
2026-Feb-05, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjag012
PMID:41765035
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研究论文 | 揭示TWEAK在溃疡性结肠炎中上调并通过异源非经典NF-kB/STAT3信号促进成纤维细胞介导的单核细胞活化 | 首次阐明TWEAK处理后的炎症成纤维细胞通过非经典NF-kB/STAT3信号通路诱导单核细胞STAT3磷酸化,并发现该轴与抗TNF治疗耐药和IBD易感性基因相关 | 未明确说明,但从摘要中推断机制研究主要在体外和公共数据中,体内验证有限 | 阐明成纤维细胞与单核细胞间通讯在溃疡性结肠炎中的失调机制,特别是TWEAK/NF-κB/STAT3轴的作用 | 溃疡性结肠炎患者及健康供体的结肠活检组织,以及共培养模型中的成纤维细胞和单核细胞 | machine learning | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学, 共培养模型, 免疫组化, 磷酸化分析 | NA | 转录组数据, 组织图像 | 溃疡性结肠炎患者及健康供体结肠活检(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞转录组数据(具体配置未明确) |
| 112 | 2026-06-11 |
Stereo-cell deciphers the spatial and functional heterogeneity of polyploid hepatocytes
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag023
PMID:41770024
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research paper | 使用Stereo-cell技术解析多倍体肝细胞的空间和功能异质性 | 开发了基于成像的倍性识别技术SCIPI,结合明场细胞轮廓识别、DAPI核面积和数量量化以及UMI条形码单细胞转录组学,实现了对6种核心肝细胞亚型的精准鉴定 | 未提及明显局限性 | 解析二倍体、四倍体和八倍体肝细胞之间的转录组和功能差异 | 多倍体肝细胞及其亚型(单核二倍体、单核四倍体、双核四倍体、单核八倍体、双核八倍体和双核十六倍体) | 单细胞转录组学 | NA | Stereo-cell空间分辨单细胞测序技术、SCIPI技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | Stereo-cell | 基于成像的倍性识别(SCIPI)技术,整合明场细胞轮廓识别、DAPI核染色和UMI条形码单细胞转录组学 |
| 113 | 2026-06-11 |
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743187
PMID:41766855
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 | 首次结合高通量转录组测序和单细胞转录组分析,系统探讨乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用,并建立基于机器学习的预后模型,识别出溶菌酶和聚合免疫球蛋白受体作为潜在临床生物标志物 | 样本量相对较小(8个PDAC样本,50795个细胞),且主要依赖公开数据集,缺乏独立外部验证队列 | 阐明乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用机制,并建立基于乳酸代谢基因的预后模型以指导早期诊断和个性化治疗 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,高通量转录组测序 | 机器学习(StepCox + Enet,α=0.5) | 基因表达数据 | 8个PDAC样本中的50795个细胞,以及多个队列共345个患者(ICGC:92;GSE28735:45;GSE62452:69;GSE183795:139) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-06-11 |
Identification and validation of prognostic genes related to glycolysis and M2 macrophage in hepatocellular carcinoma: an integrated analysis of bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1710411
PMID:41766871
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研究论文 | 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,鉴定与肝细胞癌中糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因 | 首次通过整合糖酵解相关基因、M2巨噬细胞相关基因和差异表达基因,系统筛选出8个与两者交叉相关的预后基因,并构建风险模型 | 研究基于公共数据库数据,缺乏多中心外部验证队列,且RT-qPCR验证样本量有限 | 鉴定肝细胞癌中同时与糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因并阐明其机制 | 肝细胞癌肿瘤组织和细胞样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | 回归分析风险模型 | 转录组数据, 单细胞表达数据 | 公共数据库数据(TCGA-LIHC等)+ RT-qPCR验证样本(具体数量未说明) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-06-11 |
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1760782
PMID:41766877
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综述 | 这篇综述整合了关于乳腺癌肿瘤免疫微环境在细胞、分子和代谢层面复杂性的最新进展,并强调了阻碍持久治疗效果的免疫抑制机制 | 提出了将免疫“冷”肿瘤转化为免疫“热”肿瘤的新策略,包括代谢调节、基质重编程和精准联合疗法,并整合了空间转录组学和液体活检等新型生物标志物策略 | 未明确提及具体局限性 | 总结乳腺癌肿瘤免疫微环境的最新研究进展,并探讨克服免疫抑制的合理免疫治疗策略 | 乳腺癌肿瘤免疫微环境 | machine learning | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-06-11 |
7-Ketocholesterol promotes T cell migration through Ca2+-NFATc1 pathway-mediated F-actin polymerization and proinflammatory cytokine production in oral lichen planus
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1682589
PMID:41766904
|
研究论文 | 该研究探讨了7-酮胆固醇通过Ca2+-NFATc1通路促进口腔扁平苔藓中T细胞迁移的机制 | 首次揭示7-酮胆固醇在口腔扁平苔藓中通过Ca2+-NFATc1通路调节F-肌动蛋白聚合和促炎细胞因子产生,从而促进T细胞迁移 | 未说明具体局限性 | 阐明氧化固醇是否参与口腔扁平苔藓的发病机制 | 口腔扁平苔藓患者的血浆和组织驻留T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 代谢组学、单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、qRT-PCR | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 口腔扁平苔藓患者的血浆样本和组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-06-11 |
Decoding the role of RPL38 in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1778481
PMID:41766901
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研究论文 | 采用多组学方法解析RPL38在肺腺癌中的作用 | 首次综合运用机器学习、泛癌队列分析、空间转录组学及体内外实验系统阐明RPL38在肺腺癌中的促癌作用及其与免疫抑制微环境的关联 | 本研究未明确RPL38的上游调控机制及其作为治疗靶点的临床转化可行性 | 探究RPL38在肺腺癌中的表达、预后价值及功能机制 | 肺腺癌(LUAD) | 机器学习 | 肺腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据 | TCGA-LUAD队列(具体样本量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-06-11 |
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1724740
PMID:41766913
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research paper | 通过整合分析转录组、单细胞测序和实验验证,发现METTL17和SLC27A1是慢性肾病中连接线粒体功能障碍和巨噬细胞极化的关键基因,可作为生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次整合多组学数据与实验验证,揭示METTL17和SLC27A1在慢性肾病中调节线粒体功能和免疫失衡的双重作用,并明确其细胞来源为近端肾小管细胞和平滑肌细胞 | 研究仅在体外和动物模型中进行验证,缺乏大规模临床队列验证,且样本量有限 | 鉴定慢性肾病中连接线粒体调节与巨噬细胞极化的关键基因及潜在治疗靶点 | 慢性肾病患者外周血样本和单侧输尿管梗阻小鼠模型 | machine learning | chronic kidney disease | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, qPCR, immunohistochemistry, Western blotting, machine learning | machine learning models (unspecified specific type) | gene expression data (RNA-seq), single-cell transcriptomic data, clinical data | CKD患者外周血样本(具体数量未提及)和UUO小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-06-11 |
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343734
PMID:41774717
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示秀丽隐杆线虫Q神经母细胞在迁移和分化过程中的分子机制 | 首次构建了Q神经母细胞谱系的高分辨率转录组分化图谱,发现亲代Q细胞初始具有上皮样特性并经历上皮-间充质转化,以及Wnt相关基因的左右不对称表达 | 未在摘要中明确说明局限性 | 研究Q神经母细胞迁移和分化的分子机制 | 秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞分选 | NA | 转录组数据 | Q谱系细胞在不同发育阶段分离 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 通过FACS分离Q谱系细胞进行单细胞RNA测序 |
| 120 | 2026-06-11 |
Increased secreted PLA2 in epithelial cells promotes the progression of chronic non-atrophic gastritis to chronic atrophic gastritis through the TGF-β signaling
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343531
PMID:41779702
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研究论文 | 本研究探讨了上皮细胞中分泌型磷脂酶A2(PLA2G10)通过TGF-β信号通路促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎进展的机制 | 首次发现PLA2G10在慢性胃炎进展中的关键作用,并通过体内外实验验证其通过TGF-β信号通路调控炎症反应和胶原沉积 | 未明确说明研究的局限性 | 研究上皮细胞中PLA2G10是否通过TGF-β信号通路促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎的进展 | SD大鼠慢性非萎缩性胃炎模型和人胃黏膜上皮细胞(GES-1) | 机器学习 | 慢性胃炎 | RNA微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SD大鼠和GES-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |