单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-08-06	Enhancing Sirt1-mediated deacetylation of p62 with a self-assembling nanopeptide and resveratrol hydrogel to mitigate sepsis-induced inflammation 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157047 PMID:40627928	研究论文	本研究探讨了Sirtuin 1 (Sirt1)在调节巨噬细胞线粒体自噬和免疫代谢重塑中的作用，以减轻脓毒症休克相关的炎症	开发了一种自组装纳米肽和resveratrol (Res)复合水凝胶，通过增强Sirt1介导的p62去乙酰化，促进线粒体自噬和免疫代谢重塑，从而减轻脓毒症诱导的炎症	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究Sirt1在脓毒症炎症中的作用机制，并开发新的治疗策略	小鼠脓毒症模型和腹腔巨噬细胞(PMs)	免疫代谢	脓毒症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、透射电子显微镜(TEM)、代谢组学	NA	基因表达数据、代谢组学数据、显微镜图像	小鼠脓毒症模型和腹腔巨噬细胞样本
102	2025-08-06	The role and mechanisms of macrophages in chronic pain: A peripheral-to-central perspective 2025-Sep, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111470 PMID:40683471	review	本文综述了巨噬细胞在慢性疼痛中的作用机制，从外周至中枢的视角	系统分析了巨噬细胞在外周伤害感受器、背根神经节及中枢神经系统中的不同功能，并提出了未来研究方向	巨噬细胞在许多解剖位置中的具体功能角色尚未充分研究且缺乏系统比较	探讨巨噬细胞在慢性疼痛发生和维持中的作用机制	巨噬细胞在外周伤害感受器、背根神经节(DRG)及中枢神经系统(CNS)中的功能	神经免疫学	慢性疼痛	单细胞转录组学	NA	NA	NA
103	2025-08-06	Selective PPARγ modulator alpinetin restores insulin sensitivity and protects from bone loss in type 2 diabetes 2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.157003 PMID:40570558	研究论文	本研究探讨了天然黄酮类化合物alpinetin作为选择性PPARγ调节剂，在恢复胰岛素敏感性和防止2型糖尿病相关骨丢失方面的作用	首次发现alpinetin可作为选择性PPARγ激动剂，既能改善胰岛素敏感性又能防止骨丢失，相比传统PPARγ激动剂具有更好的安全性	研究主要基于STZ诱导的糖尿病小鼠模型，在人类患者中的效果仍需进一步验证	开发治疗2型糖尿病的新型选择性PPARγ调节剂，同时解决胰岛素抵抗和骨丢失问题	2型糖尿病相关的胰岛素抵抗和骨代谢异常	糖尿病研究	2型糖尿病	分子对接、分子动力学模拟、CETSA、双荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA测序、网络药理学	STZ诱导的2型糖尿病小鼠模型	分子相互作用数据、细胞实验数据、动物实验数据、测序数据	体外细胞实验和STZ诱导的T2DM小鼠模型
104	2025-08-06	BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation 2025-Aug-12, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916 PMID:40435510	研究论文	本研究揭示了BCLAF1在造血干细胞（HSCs）应激反应中的调控作用，支持其在胎儿发育和干细胞移植后的扩增与再殖能力	首次发现BCLAF1通过限制HSCs的应激反应来维持其发育和再殖功能	研究主要基于小鼠模型，人类HSCs中的具体机制尚需进一步验证	探究BCLAF1在HSCs发育和应激反应中的功能	胎儿和成年小鼠的造血干细胞	造血干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	小鼠基因敲除模型	基因表达数据	NA
105	2025-08-06	Immune-responsive gene 1: The mitochondrial key to Th17 cell pathogenicity in CNS autoimmunity 2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2427052122 PMID:40758870	研究论文	该研究通过RNA-seq分析发现免疫应答基因1（IRG1）在中枢神经系统自身免疫性疾病如多发性硬化症（MS）中起关键作用，并探讨其在致病性Th17细胞调控中的机制	首次揭示了IRG1在调控致病性Th17细胞中的关键作用及其通过NLRP3/IL-1β轴影响巨噬细胞和CD4+ T细胞的机制	研究主要基于动物模型（EAE），尚未在人类MS患者中验证IRG1的功能	探究IRG1在中枢神经系统自身免疫性疾病中的作用机制	致病性Th17细胞、巨噬细胞、CD4+ T细胞	免疫学	多发性硬化症	RNA-seq、单细胞RNA测序、骨髓嵌合体实验	EAE动物模型	基因表达数据	实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）动物模型及基因敲除小鼠
106	2025-08-06	A recurrent de novo damaging variant in EMP2 causes progressive symmetric erythrokeratoderma 2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2509896122 PMID:40758889	研究论文	该研究揭示了EMP2基因中的一个反复出现的从头错义变异与进行性对称性红斑角化病谱系中的孟德尔皮肤病相关	首次发现EMP2基因的特定变异与进行性对称性红斑角化病相关，并通过单细胞空间转录组学揭示了EGFR信号通路的异常激活	研究样本可能有限，且需要进一步验证EMP2变异在其他人群中的普遍性	探究导致进行性对称性红斑角化病的遗传机制	进行性对称性红斑角化病患者及其EMP2基因变异	遗传学	皮肤病	单细胞空间转录组学、Western blotting	NA	基因序列数据、蛋白质表达数据	未明确提及具体样本数量
107	2025-08-06	The Key to Spinal Cord Recovery: Harnessing p21 Inhibition to Boost Neural Stem/Progenitor Cell Proliferation 2025-Aug-05, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.5c05512 PMID:40712080	research paper	该研究开发了一种基于阳离子脂质体的递送系统，通过抑制p21基因来增强脊髓损伤后神经干/祖细胞的增殖能力	首次利用阳离子脂质体递送p21 siRNA来增强神经干/祖细胞增殖，并证实其能促进脊髓损伤后的功能恢复	研究仅在T9脊髓损伤大鼠模型中进行，尚未进行临床前或临床试验	探索通过调控细胞周期来促进脊髓损伤后神经再生的新方法	神经干/祖细胞(NSPCs)和脊髓损伤大鼠模型	神经再生医学	脊髓损伤	单细胞测序、阳离子脂质体递送系统	动物模型(T9脊髓损伤大鼠)	基因表达数据、功能恢复数据	未明确说明实验动物数量
108	2025-08-06	Prg4+ fibroadipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair 2025-Aug-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2417806122 PMID:40729389	研究论文	本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪生成祖细胞（FAPs）在骨折修复中的关键作用	首次发现并证实了肌肉中的Prg4+ FAPs能够迁移至骨折部位并分化为软骨细胞、成骨细胞和骨细胞，为骨折修复提供新的细胞来源	研究主要基于小鼠模型，在人体中的适用性尚需验证；钻孔骨损伤模型中FAPs的贡献显著低于骨折模型	探究肌肉细胞在骨损伤修复中的作用机制	小鼠肌肉中的Prg4+纤维脂肪生成祖细胞（FAPs）	骨生物学	骨折	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠骨折模型和钻孔骨损伤模型	基因表达数据	NA
109	2025-08-06	Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations 2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02360-2 PMID:40759634	综述	本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略	总结了单细胞测序、空间转录组学和多组学整合等最新技术在CSC研究中的应用，并探讨了双代谢抑制、合成生物学干预和免疫疗法等新兴治疗策略	缺乏普遍可靠的CSC生物标志物，难以在不影响正常干细胞的情况下靶向CSC	探讨CSC的生物学特性及其在肿瘤治疗中的挑战和前景	癌症干细胞（CSCs）及其与肿瘤微环境的相互作用	肿瘤生物学	癌症	单细胞测序、空间转录组学、多组学整合、CRISPR、AI驱动的多组学分析	3D类器官模型	NA	NA
110	2025-08-06	Single-Cell Multi-Omics Identifies Specialized Cytotoxic and Migratory CD8+ Effector T Cells in Acute Myocarditis 2025-Aug-05, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.125.073836 PMID:40762079	研究论文	本研究通过单细胞多组学技术，识别了急性心肌炎中具有高细胞毒性和迁移潜能的CD57+CD8+效应T细胞，并揭示了其在上游炎症信号中的作用	首次在急性心肌炎中鉴定出具有高细胞毒性和迁移潜能的CD57+CD8+效应T细胞，并揭示了IL-18信号通路在其功能分化中的关键作用	样本量相对较小（40例患者），且主要基于观察性研究，需要进一步验证	探究急性心肌炎（特别是暴发性心肌炎）的免疫发病机制，寻找新的治疗靶点	急性心肌炎患者（40例，其中24例轻度，16例暴发性）和柯萨奇病毒B3诱导的暴发性心肌炎小鼠模型	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、飞行时间质谱流式细胞术、Olink蛋白质组学	NA	单细胞多组学数据	40例患者（24例轻度，16例暴发性）和柯萨奇病毒B3诱导的小鼠模型
111	2025-08-06	β-Sitosterol improves murine ulcerative colitis by inhibiting the expression of ribosomal proteins and the attempted polarization of type 1 macrophages 2025-Aug-05, International journal of colorectal disease IF:2.5Q1 DOI:10.1007/s00384-025-04974-y PMID:40762728	研究论文	本研究探讨了β-谷甾醇通过抑制核糖体蛋白表达和1型巨噬细胞极化来改善小鼠溃疡性结肠炎的作用机制	首次揭示了β-谷甾醇通过调控核糖体信号通路抑制MΦ1巨噬细胞极化的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	探究β-谷甾醇对溃疡性结肠炎的治疗作用及其分子机制	溃疡性结肠炎小鼠模型和RAW264.7来源的巨噬细胞	分子免疫学	溃疡性结肠炎	scRNA-seq, KEGG分析, FCM, ELISA, Western blotting, qRT-PCR	小鼠溃疡性结肠炎模型	基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据	未明确说明小鼠数量，使用RAW264.7细胞系
112	2025-08-06	KAFSTExp: Kernel Adaptive Filtering with Nystrom Approximation for Predicting Spatial Gene Expression from Histology Image 2025-Aug-04, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3595101 PMID:40758493	研究论文	提出了一种名为KAFSTExp的框架，利用核自适应滤波和Nystrom近似从组织学图像预测空间基因表达	结合病理基础模型UNI和核最小均方算法，显著提高了预测准确性并降低了计算成本	在有限的ST数据集上可能面临泛化能力不足的问题	预测组织学图像对应的基因表达，以替代昂贵的空间转录组学检测	空间转录组学数据和病理图像	数字病理	肿瘤	核自适应滤波，Nystrom近似	UNI, 核最小均方算法	图像, 基因表达数据	多个ST数据集
113	2025-08-06	A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia 2025-Aug-04, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1 DOI:10.1164/rccm.202501-0217OC PMID:40758632	research paper	该研究通过大规模单细胞转录组图谱揭示了细菌性肺炎外周免疫的全景，并分析了不同疾病严重程度下的免疫重塑	首次构建了细菌性肺炎外周血免疫细胞的大规模单细胞转录组图谱，揭示了严重和轻度肺炎的免疫特征差异	样本量相对有限（100人），且仅关注外周血免疫细胞，未涉及肺部局部免疫反应	阐明细菌性肺炎的免疫发病机制和疾病严重程度的驱动因素	39名严重细菌性肺炎患者、31名轻度患者和30名健康对照者的外周血免疫细胞	免疫学	细菌性肺炎	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	100人（39名重症、31名轻症、30名健康对照）
114	2025-08-06	Deciphering neutrophil dynamics in the focal lesion tumor microenvironment to overcome immunosuppression in multiple myeloma 2025-Aug-04, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2025028963 PMID:40758944	研究论文	本研究通过分析多发性骨髓瘤（MM）病灶和骨髓中的髓系细胞，揭示了中性粒细胞在肿瘤微环境中的免疫抑制作用及其临床意义	首次描述了三种不同的CXCR2+成熟中性粒细胞亚群，并发现TREM1+CD10+亚群在病灶中高度富集且具有强效免疫抑制功能	研究主要基于临床前模型，需要进一步临床试验验证CXCR2阻断策略的疗效	阐明中性粒细胞在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的功能机制并探索新的治疗靶点	多发性骨髓瘤患者的病灶组织和骨髓样本	肿瘤免疫学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光成像、功能实验	NA	基因表达数据、影像数据	配对的病灶和骨髓样本（具体数量未明确说明）
115	2025-08-06	Spatial Multi-omics Defines a Shared Tumor Infiltrative Signature at the Resection Margin in High-Grade Gliomas 2025-Aug-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4708 PMID:40759029	研究论文	本研究通过空间多组学技术定义了高级别胶质瘤切除边缘共有的肿瘤浸润特征	首次结合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学数据，系统分析了高级别胶质瘤核心区与边缘区的差异，并鉴定出共有的浸润特征	样本量相对有限（4种亚型共36,811个snRNA-seq和30,705个snATAC-seq核），且仅针对特定分子亚型的高级胶质瘤	揭示高级别胶质瘤在切除边缘的残留病变生物学特征	高级别胶质瘤（HGG）的核心区和边缘区组织	数字病理学	胶质瘤	snRNA-seq, snATAC-seq, 空间转录组学, CRISPR/Cas9, ChIP-seq	NA	单细胞多组学数据、空间转录组数据	4种分子亚型HGG（共36,811个snRNA-seq核和30,705个snATAC-seq核）及2例附加HGG的空间转录组数据
116	2025-08-06	Short-chain fatty acids regulate T cell heterogeneity to alleviate recurrent spontaneous abortion 2025-Aug-04, British journal of pharmacology IF:6.8Q1 DOI:10.1111/bph.70155 PMID:40759431	研究论文	研究肠道微生物衍生的短链脂肪酸（SCFAs）在复发性自然流产（RSA）免疫耐受中的作用	发现SCFAs通过调节CD4+ T细胞分化来缓解RSA，并设计了结肠靶向SCFA递送纳米颗粒系统以优化治疗效果	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证可能有限	探索肠道微生物及其代谢物在RSA免疫调节中的作用	复发性自然流产（RSA）患者和小鼠模型	免疫学	复发性自然流产	单细胞测序、16S rDNA测序、粪便微生物移植（FMT）	小鼠模型	基因组数据、微生物组数据	RSA患者和小鼠模型
117	2025-08-06	The spatial landscape of glial pathology and T cell response in Parkinson's disease substantia nigra 2025-Aug-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-62478-3 PMID:40759663	研究论文	本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和T细胞受体测序技术，分析了帕金森病患者脑组织中T细胞和胶质细胞的状态	揭示了帕金森病黑质中T细胞的克隆扩增及其与CD44+星形胶质细胞的空间相关性，提出了CD44作为潜在治疗靶点	研究基于死后脑组织，可能无法完全反映活体状态下的病理过程	探究帕金森病中适应性免疫反应的特性及其在神经退行性变中的作用	帕金森病患者死后脑组织中的T细胞和胶质细胞	神经科学	帕金森病	单核RNA测序、空间转录组学、T细胞受体测序	NA	RNA测序数据、空间转录组数据	NA
118	2025-08-06	Comprehensive analysis of the PLXNA3 gene on prognosis and immune characteristics in breast cancer 2025-Aug-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-13843-1 PMID:40760011	研究论文	本文通过RNA测序和生存分析，探讨了PLXNA3基因在乳腺癌预后和免疫特征中的作用	首次揭示了PLXNA3在乳腺癌中的高表达与不良预后及免疫抑制状态的关联，并验证了其作为抗PD1免疫治疗反应不良的预测标志物的潜力	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证	探究PLXNA3基因在乳腺癌中的生物学意义及其与免疫特征的关系	乳腺癌组织和细胞	癌症研究	乳腺癌	bulk RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
119	2025-08-06	A programmed decline in ribosome levels governs human early neurodevelopment 2025-Aug-04, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-025-01708-8 PMID:40760247	研究论文	该研究揭示了核糖体水平在人类早期神经发育中的程序性下降及其对神经发育障碍的影响	首次发现核糖体生物合成因子AIRIM/C1orf109变异与神经发育障碍相关，并揭示了早期大脑发育中蛋白质生产的下降现象	研究主要基于人类大脑类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境	探究核糖体生物合成减少如何导致组织和发育特异性缺陷	人类大脑类器官和神经上皮细胞	神经发育生物学	神经发育障碍	蛋白质组学、单细胞RNA测序、单类器官翻译分析	人类大脑类器官模型	蛋白质组数据、RNA测序数据	未明确说明具体样本数量，使用人类大脑类器官进行研究
120	2025-08-06	Blocking CXCR4+ CD4+ T cells reprograms Treg-mediated immunosuppression via modulating the Rho-GTPase/NF-κB signaling axis 2025-Aug-04, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01515-8 PMID:40760450	研究论文	本研究探讨了CXCR4在调节性T细胞（Treg）介导的免疫抑制中的作用及其分子机制	揭示了CXCR4通过调控Rho-GTPase/NF-κB信号轴在Treg介导的免疫抑制中的关键作用，并验证了CXCR4阻断剂在增强抗肿瘤免疫治疗中的潜力	研究主要基于小鼠模型和临床前数据，需要在更多临床样本中进一步验证	探究CXCR4在肿瘤微环境中调节Treg细胞介导的免疫抑制的分子机制	CXCR4+ CD4+ T细胞和Treg细胞	肿瘤免疫学	宫颈癌和乳腺癌	单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、磷酸化蛋白质组学、ChIP测序	条件性敲除小鼠模型（Cxcr4flox/flox, LckCre）和人宫颈癌类器官模型	单细胞转录组数据、多组学数据、临床试验数据	多个癌症的单细胞转录组数据集、小鼠模型和人类类器官模型