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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-04 |
Depletion of Sorcs3 Activates Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells by Modulating Key Signaling Pathways
2025-Nov-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509151
PMID:41178446
|
研究论文 | 通过敲除Sorcs3基因激活小鼠胚胎干细胞全能性并揭示相关信号通路机制 | 首次发现Sorcs3缺失可诱导胚胎干细胞获得全能性状态,并阐明Tfap2c基因和特定信号通路在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 建立可持续的全能性干细胞并研究其调控机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 基因敲除、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-11-04 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经生成的时间顺序 | 首次在单细胞水平证明牙髓干细胞在体内分化时血管生成先于神经生成的时间顺序 | 研究样本量有限,且仅在免疫缺陷小鼠模型中进行验证 | 探究人牙髓干细胞的分化机制和时序 | 人牙髓干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 动物移植模型 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-11-04 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
|
研究论文 | 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡通过释放细胞外囊泡和脂肪酸诱导S100A8+巨噬细胞在肝脏积累,并通过CCN3-CD36通路促进肝细胞脂质储存 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床样本中验证 | 探究脂肪细胞死亡后促进肝细胞脂肪积累和MASLD进展的分子机制 | 基因修饰小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-11-04 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2025-Nov-03, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
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研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架识别原发性震颤的高置信度候选基因,并评估计算预测与实验验证之间的差异 | 开发了整合多组学数据的计算框架,提出了原发性震颤的皮质假说,揭示了计算预测与实验验证之间的关键差距 | 在死后小脑组织中未发现显著差异表达,计算预测与实验验证存在不一致 | 识别原发性震颤的效应基因以阐明疾病机制并开发靶向治疗 | 原发性震颤患者和对照组的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 孟德尔随机化, 共表达网络分析, 空间转录组学 | 多阶段计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-11-04 |
New advances on the interaction between internal and external factors in the tumor microenvironment of solid tumors
2025-Nov-02, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2585349
PMID:41177968
|
综述 | 本文综述了实体瘤微环境中内外因素相互作用的最新研究进展,重点关注肿瘤免疫逃逸、代谢重编程和神经免疫等领域 | 整合单细胞测序和空间肿瘤学技术揭示肿瘤微环境中细胞间相互作用的复杂细节,为联合免疫治疗提供新思路 | NA | 寻求突破实体瘤免疫治疗瓶颈的联合治疗方案设计 | 实体瘤肿瘤微环境 | 空间肿瘤学 | 实体瘤 | 单细胞测序, 空间肿瘤学技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-11-04 |
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Nov, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.025
PMID:39842636
|
研究论文 | 通过空间转录组学和多色免疫组化等技术研究胎盘分子和细胞形态,揭示生殖免疫新机制 | 发现胚胎滋养细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白,揭示母胎界面存在免疫排斥与抑制的平衡机制 | NA | 研究人类生殖过程中胎盘细胞和分子特征的免疫调控机制 | 正常和异位妊娠胎盘组织及动物模型 | 生殖免疫学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学,多重免疫组织化学,免疫组化-荧光原位杂交双标记 | NA | 空间转录组数据,组织图像,蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2025-11-04 |
Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing
2025-Nov-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.287586
PMID:40438979
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序开发多发性骨髓瘤血浆细胞特征谱,建立集成风险分层模型以提高预后预测准确性 | 首次在单细胞分辨率识别出具有染色体不稳定、高耐药性和高危基因特征的侵袭性骨髓瘤细胞亚群,并基于此开发七基因特征评分 | 样本量较小(12例新诊断患者),需要在更大队列中进一步验证 | 改善多发性骨髓瘤的风险分层和预后预测 | 多发性骨髓瘤患者及其肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,数字PCR | Cox比例风险模型,集成风险分层模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 12例新诊断多发性骨髓瘤患者,并在5个独立数据集中验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-11-04 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
|
综述 | 系统概述单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 整合单细胞与空间转录组技术,结合人工智能和机器学习算法分析大数据 | 存在技术挑战和数据分析障碍 | 探讨单细胞RNA测序在疾病研究和精准医疗中的应用 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 自然语言处理 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 109 | 2025-11-02 |
Parental Specific Expression by scRNA-Seq Reveals HaWRKY40 Contributing to Heterosis of Sunflower
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70266
PMID:41170640
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2025-11-04 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
|
研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达谱,发现其在癌相关成纤维细胞中高表达,并揭示其通过调节CXCL2调控中性粒细胞浸润的新机制 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要更多临床验证 | 探究免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤患者组织和细胞,小鼠模型 | 生物信息学,肿瘤免疫学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学,去卷积分析,相关性分析 | 逻辑回归模型,风险评分模型,列线图 | RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据,图像数据 | 肝母细胞瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-11-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a metastasis-associated PCSK1+ neuroendocrine subpopulation in pancreatic neuroendocrine tumors
2025-Nov, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70084
PMID:40817830
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现胰腺神经内分泌肿瘤中与转移相关的PCSK1+神经内分泌亚群 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤中鉴定出富含于肝转移灶的PCSK1+神经内分泌亚群,并揭示其高拷贝数变异负荷、低分化潜能和独特的转录调控特征 | 基于公开数据库的回顾性分析,样本量有限(27个样本),需要后续实验验证机制 | 探索胰腺神经内分泌肿瘤中神经内分泌细胞的异质性及其与转移的关系 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者组织样本(包括癌旁正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | 单细胞组学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 伪时间轨迹分析, 转录调控网络分析, 细胞间通讯分析 | CytoTRACE2, Monocle3, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 27个样本(包括正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-11-04 |
Neoadjuvant chemotherapy modulates mast cell phenotypes and immune infiltration in high-grade serous carcinoma
2025-Nov-01, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.10.014
PMID:41176887
|
研究论文 | 本研究探讨新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫浸润模式的影响,特别关注肥大细胞表型变化 | 首次揭示NACT诱导肥大细胞从CD52+KIT+表型向JUN+/TNFRSF12A+亚群转变的动态过程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫景观的影响及其临床意义 | 高级别浆液性癌患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序,免疫组织化学,单细胞RNA测序 | Scissor分析,伪时间分析 | RNA测序数据,免疫组织化学图像,单细胞RNA测序数据 | 81对NACT前后样本(8+7内部RNA-seq,73对IHC),三个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2025-11-04 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
|
研究论文 | 通过回顾性转录组分析研究体积性肌肉损失损伤后线粒体基因和代谢途径的时间性失调 | 首次利用现有RNA-seq数据集综合分析VML损伤后线粒体相关基因和代谢途径的时序变化 | 回顾性研究,数据来源于公开数据库,样本数量有限 | 研究体积性肌肉损失损伤后线粒体和代谢转录组的变化 | 大鼠和小鼠的肌肉组织 | 转录组学 | 肌肉损伤疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含bulk RNA-seq数据集(大鼠)和单细胞RNA-seq数据集(小鼠) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-11-04 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间代谢组学技术,揭示了人参属植物根尖细胞分化及人参皂苷生物合成的细胞特异性 | 首次在人参属植物中构建单细胞转录图谱,发现新型转录因子调控内皮层木栓化和人参皂苷生物合成,揭示跨物种保守及分化的配体-受体互作模式 | 研究仅针对三种人参属植物,样本代表性有限;空间代谢组学分辨率有待进一步提高 | 探究人参属植物根尖早期发育过程中细胞分化命运及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 三种人参属植物(Panax ginseng, Panax quinquefolius, Panax notoginseng)的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 双荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率变动分析, RNA原位杂交, 质谱成像, LC-MS/MS | NA | 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 质谱数据 | 三种人参属植物的根尖样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 115 | 2025-11-04 |
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01881-y
PMID:41171372
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定C1QA作为早期肺腺癌预后标志物和免疫抑制中性粒细胞调节因子 | 首次发现C1QA是调控早期肺腺癌免疫抑制中性粒细胞的关键基因,并揭示其通过补体受体与中性粒细胞相互作用机制 | 研究主要基于公共数据库分析,需要进一步实验验证C1QA功能机制 | 探索早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制 | 早期肺腺癌患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 基因表达分析,单细胞RNA测序,免疫荧光染色,RT-qPCR | CIBERSORTx,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 公共数据集GSE31210及独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals bidirectional development of infantile hemangioma
2025-Oct-31, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次在人类婴儿血管瘤中构建单细胞图谱,发现血管瘤壁细胞通过释放VEGFA和PGF配体促进内皮细胞增殖和血管生成的新机制 | 样本量较小(仅3名婴儿),缺乏功能验证实验 | 探究婴儿血管瘤的发病机制和细胞组成 | 婴儿血管瘤组织样本 | 单细胞组学 | 血管瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名婴儿的血管瘤样本,共36,237个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-11-04 |
Single-cell sequencing analysis reveals CHURC1 as a non-canonical oncoprotein governing goblet cell-driven colorectal tumorigenesis
2025-Oct-31, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112197
PMID:41177418
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析发现杯状细胞是结直肠癌的潜在细胞起源,并鉴定CHURC1作为新型致癌基因 | 首次发现杯状细胞作为结直肠癌的细胞起源,并揭示CHURC1作为非经典致癌蛋白的功能机制 | 样本量较小(4名患者),需要更大规模研究验证 | 探索结直肠癌的细胞起源和致癌机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织、肠息肉和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者的14个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-11-04 |
CXCR6 sustains TRM-driven psoriasis relapse by CXCL16 chemotaxis and curcumol targeting
2025-Oct-31, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.066
PMID:41177431
|
研究论文 | 本研究揭示CXCR6/CXCL16轴通过调控组织驻留记忆T细胞(TRM)驱动银屑病复发,并证实姜黄醇可通过靶向该轴抑制疾病复发 | 首次系统阐明CXCR6/CXCL16轴在TRM介导的银屑病复发中的关键作用,并发现姜黄醇作为潜在治疗药物的新机制 | 动物模型与人类疾病存在差异,临床转化需进一步验证 | 阐明CXCR6/CXCL16轴调控TRM细胞导致银屑病复发的机制,探索姜黄醇的治疗潜力 | 银屑病患者临床样本、咪喹莫特诱导的小鼠银屑病模型、TRM细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,流式细胞术,免疫荧光,体外细胞实验 | CXCR6基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | 未明确样本数量,包含临床样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2025-11-04 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理学的空间框架,用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理学整合,在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因风险模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究,样本量较小(5个膀胱肿瘤标本),需要更大规模研究验证 | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱肿瘤组织标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全切片图像, 基因表达数据 | 5个膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2025-11-04 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
|
研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学,揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次整合GWAS、单细胞和空间转录组学数据,发现STK24作为新的凋亡相关基因在LUAD中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多中心样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |