单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39758 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-05-29
Coronary artery disease risk gene PRDM16 regulates smooth muscle homeostasis
2026-Apr, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 研究发现冠心病风险基因PRDM16调控血管平滑肌细胞稳态,通过调节Tgfb2表达影响新生内膜形成。 首次发现转录因子PRDM16在血管平滑肌细胞中具有维持细胞稳态的功能,并揭示其作为冠心病风险基因的新机制 仅在小鼠模型中验证了Prdm16在平滑肌细胞中的功能,未在人体组织中进行直接的功能实验。 识别调控血管平滑肌细胞稳态的新型转录因子,探索其在冠心病发展中的作用 人类和小鼠的动脉组织、血管平滑肌细胞、PRDM16/Prdm16基因 基因组学、分子生物学 冠心病、血管再狭窄 ChIP-seq、RNA-seq、scRNA-seq、qRT-PCR、Western blotting NA 测序数据、基因表达数据 多个动脉组织样本、基因敲除小鼠(诱导型和组成型) NA NA NA NA
102 2026-05-29
Chemokine-defined macrophage niches establish spatial organization of tumor immunity
2026-Apr, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了肺癌中巨噬细胞谱系和空间组织对肿瘤免疫的调控机制 首次发现趋化因子定义的巨噬细胞亚群在肿瘤区域中划分不同的空间生态位,并揭示其对立功能:支气管血管区域的IM亚群促进抗肿瘤免疫,而肿瘤区域的IM亚群招募促肿瘤的recMacs 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;莫拉维罗治疗的效果可能需要更广泛的临床评估 阐明巨噬细胞谱系和空间组织如何塑造抗肿瘤免疫,并识别保护保护性IM功能同时破坏巨噬细胞驱动的免疫抑制的策略 肺癌中的组织驻留CD206+和CD206-间质巨噬细胞亚群以及Ly6c2+Fn1+Vcan+募集巨噬细胞 计算机视觉, 机器学习 肺癌 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 图像, 文本 小鼠模型中的肿瘤样本和引流淋巴结样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台
103 2026-05-29
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-04, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示肺部免疫反应的动态变化如何区分对结核病的保护性与易感性 首次通过单细胞RNA测序,在多时间点、多小鼠品系和多结核分枝杆菌菌株下,系统比较了初次感染与已受控感染小鼠的肺免疫反应动态差异,发现保护性免疫依赖于免疫激活的时序和协调,而非单一反应的强度 研究中主要使用小鼠模型,结果向人类和灵长类的推广仍需进一步验证;且未深入探讨相关信号通路的分子机制 阐明肺结核保护性免疫的免疫相关因素,特别是时间动态和细胞协调机制 小鼠(未感染和已受控结核分枝杆菌感染的品系)及非人灵长类(静脉注射BCG疫苗后的样本) 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序 NA 基因表达谱(单细胞转录组数据) 多个时间点、多个小鼠品系和多个结核分枝杆菌菌株的肺免疫细胞样本,以及非人灵长类样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 平台
104 2026-05-29
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-04, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 该研究利用小鼠巨细胞病毒呼吸道感染模型和过继性T细胞转移实验,结合单细胞RNA测序技术,揭示了早期生命中CD8 T细胞毒性功能缺陷导致对肺部MCMV感染保护不足的机制 首次发现新生期αβ T细胞普遍缺乏导致MCMV特异性CD8 T细胞富集延迟,并揭示关键细胞因子不足是造成CD8 T细胞启动缺陷的核心因素 仅在小鼠模型中验证,未在人类样本中确认;未深入探究除细胞因子外的其他微环境因素对T细胞启动的影响 阐明早期生命中对巨细胞病毒感染的抗病毒T细胞免疫应答机制 新生期和成年期小鼠的肺组织、MCMV特异性CD8 T细胞、αβ T细胞 数字病理学 巨细胞病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于分析效应T细胞分化
105 2026-05-29
Current understanding and future directions in severe asthma through artificial intelligence-integrated multi-omic approaches
2026-Apr, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society IF:9.0Q1
综述 本文探讨了通过人工智能整合多组学方法在重度哮喘研究中的应用,包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学,旨在识别关键生物标志物、细化疾病内型并实现个性化治疗策略 创新点在于利用人工智能模型分析大规模多组学数据集,以发现传统方法难以捕捉的模式,从而提高诊断精度、预测治疗反应并指导靶向疗法开发 综述中提及将多组学发现转化为临床实践仍面临挑战,但未具体说明详细局限性 探索人工智能整合多组学方法在重度哮喘研究中的当前理解与未来方向 重度哮喘患者 机器学习 哮喘 多组学(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)和单细胞RNA测序 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
106 2026-05-29
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2026-03-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究烟曲霉感染时肺成纤维细胞的激活及其通过免疫调节和组织重塑增强肺防御的机制 首次通过细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序揭示成纤维细胞在烟曲霉感染中的保护性免疫调节作用 未提及具体局限性 探究烟曲霉引起的肺损伤中成纤维细胞的功能反应及其在宿主防御中的作用 免疫正常和免疫抑制宿主中的肺成纤维细胞 机器学习 肺曲霉病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 免疫正常和免疫抑制小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
107 2026-05-29
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用机器学习和多组学分析解码VDAC2恶性亚型对肿瘤演化的影响 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次系统揭示了VDAC2在泛癌中的恶性功能及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 基于公开数据库的分析,缺乏大规模独立临床样本验证,且实验主要在体外细胞模型中进行 系统挖掘VDAC2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 VDAC2基因在泛癌中的表达、功能及免疫调控机制 机器学习 泛癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-PCR、细胞共培养、CCK-8实验、Transwell侵袭实验、ELISA NA RNA测序数据、空间转录组数据 泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
108 2026-05-29
Taming autoimmunity: Alpha-1 antitrypsin overexpressing mesenchymal stromal cells promote regulatory T cell crosstalk to reverse diabetes
2026-Mar-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序等技术,研究了过表达alpha-1抗胰蛋白酶的间充质基质细胞如何调节T细胞以逆转糖尿病 首次揭示AAT-MSCs通过增强调节性T细胞与其他细胞的通讯来逆转新发糖尿病,并阐明其在CD4和CD8 T细胞上的免疫调节机制 仅在雌性非肥胖糖尿病小鼠模型中进行研究,尚未在人类临床试验中验证其效果 探索AAT-MSCs如何通过调节T细胞免疫反应来逆转1型糖尿病 过表达alpha-1抗胰蛋白酶的人和小鼠间充质基质细胞,以及CD4和CD8 T细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据 50%以上的雌性非肥胖糖尿病小鼠(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
109 2026-05-29
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用高分辨率空间转录组技术解析猪雌性早期性腺发育过程中细胞类型及其空间动态 首次应用高分辨率空间转录组技术绘制猪早期性腺发育的时空图谱,阐明了支持细胞谱系中两波颗粒细胞的空间定位及其在生殖细胞发育中的调控作用,并发现BMP信号通路在原始生殖细胞向卵原细胞特化中的关键角色 空间转录组技术无法直接解析单细胞水平的基因表达,可能遗漏部分细胞类型的细微差异 揭示猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞特化和进入减数分裂的时空动态机制 猪(Sus scrofa)雌性早期性腺组织中的原始生殖细胞、体细胞及各种细胞类型 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 猪早期性腺样本(具体数量未在标题和摘要中明确) NA 空间转录组学 NA 高分辨率空间转录组技术(具体平台未在摘要中说明)
110 2026-05-29
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 提出IN-DEPTH工作流,实现同一玻片上的空间转录组和蛋白质组整合分析,结合SGCC框架揭示肿瘤微环境中的空间重排 开发了IN-DEPTH工作流,可在同一玻片上整合单细胞空间蛋白质组和转录组且无RNA信号丢失;提出SGCC框架用于跨模态整合,解析细胞间功能状态变化 新兴同玻片多组学方法在多重性、空间分辨率、信号保留和整合分析方面仍存在局限 实现空间多组学整合以揭示肿瘤微环境中的临床相关机制,并推动稳健的空间多模态AI模型发展 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织样本 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC NA 图像、空间转录组数据 EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
111 2026-05-29
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-03-17, Accounts of chemical research IF:16.4Q1
综述 本文综述了代谢RNA标记结合时间分辨单细胞RNA测序技术的最新进展,包括Well-TEMP-seq、scDUAL-seq、Dyna-vivo-seq等方法,并探讨了该技术在揭示细胞异质性和动态基因表达调控中的应用潜力 系统总结了基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序技术的创新,如双核苷酸标记的scDUAL-seq能同时监测RNA合成与降解,以及从体外细胞培养扩展到体内动物模型(Dyna-vivo-seq)的能力,并整合空间转录组学以解析时空动态 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中存在局限性,如核苷酸标记效率、成本、体内外应用差异,以及时空整合的复杂度 探讨代谢RNA标记增强时间分辨单细胞RNA测序技术,以理解异质性和动态基因表达调控 单细胞RNA代谢标记、时间分辨测序技术及其在生物过程(如胚胎发育、疾病进展)中的应用 机器学习 NA 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
112 2026-05-29
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 FineST通过对比学习整合组织学和空间转录组学数据,实现核分辨率下的配体-受体分析 利用组织学基础模型的深度对比学习,实现核精度的RNA表达插补和细胞间通信分析,在VisiumHD和Xenium数据集上显著优于现有方法 主要聚焦于Visium平台,可能在其他平台上的泛化能力有限;数据稀疏性和分辨率限制在复杂组织中仍存在挑战 开发高分辨率空间转录组学分析方法以揭示细胞间通信模式 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集,以及多种癌症类型的肿瘤-免疫相互作用 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 空间转录组学, 对比学习 对比学习模型 组织学图像, 空间转录组学数据 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x VisiumHD, 10x Xenium 10x Visium平台用于空间基因表达分析,VisiumHD用于高分辨率数据,Xenium用于乳腺癌原位验证
113 2026-05-29
The single cell transcriptomic landscape of recurrent giant cell tumor of bone following neoadjuvant denosumab therapy
2026-Mar-04, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 通过单细胞RNA测序分析新辅助地诺单抗治疗后复发骨巨细胞瘤的转录组特征 首次通过单细胞RNA测序揭示新辅助DMAb治疗后GCTB复发的潜在机制,包括肿瘤细胞转化及免疫抑制微环境形成 未提及 探索新辅助地诺单抗治疗增加骨巨细胞瘤局部复发风险的潜在机制 未经治疗的原发性GCTB、新辅助DMAb治疗的原发性GCTB以及刮除后停用DMAb的复发性GCTB 单细胞转录组学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 33,440个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
114 2026-05-29
BET inhibition blunts antibody production and macrophage-mediated fibrosis to restore lung function in murine cGVHD
2026-03-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 在慢性移植物抗宿主病模型中,BET抑制通过降低抗体产生和巨噬细胞介导的纤维化来恢复肺功能 首次揭示BET蛋白在慢性移植物抗宿主病肺部纤维化中调控抗体产生和巨噬细胞极化的新机制 主要基于小鼠模型,缺乏临床样本验证 研究BET抑制对慢性移植物抗宿主病相关闭塞性细支气管炎综合征的治疗效果和机制 慢性移植物抗宿主病小鼠模型中的免疫细胞(T细胞、B细胞、巨噬细胞)和肺组织 医学研究 移植物抗宿主病,闭塞性细支气管炎综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 慢性移植物抗宿主病小鼠与对照小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
115 2026-05-29
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 发现TRPV1疼痛感知伤害感受器与化学感应上皮簇细胞协同,驱动2型炎症和肠道免疫的神经-上皮回路 首次揭示TRPV1伤害感受器通过CGRP信号调控上皮簇细胞增殖分化,形成神经-上皮回路整合感觉输入驱动2型免疫 未明确其他感觉神经元类型在该回路中的作用,且机制验证主要在小鼠模型中完成 阐明神经、上皮和免疫细胞如何协调感知输入以启动2型炎症反应 小鼠肠道中的TRPV1伤害感受器、上皮簇细胞及CGRP神经纤维 机器学习 寄生虫感染相关2型免疫疾病 空间转录组学、单细胞RNA测序、化学遗传学沉默/激活 NA 基因表达数据 小鼠肠道组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间基因表达分析
116 2026-05-29
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-03, PLoS pathogens IF:5.5Q1
research paper 通过单细胞RNA测序揭示了HDAC抑制剂诱导的EBV溶解裂解异质性,定义了B淋巴母细胞中的流产和难治状态 首次在单细胞水平上解析HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性,发现NF-κB及CD137信号轴在阻止成功裂解再激活中的作用 研究仅限于四种EBV阳性细胞系,且裂解再激活仅在少数细胞中成功,可能未全面反映体内微环境的影响 探讨HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤的裂解再激活机制及宿主因素的作用 EBV阳性细胞系,包括P3HR1-ZHT Burkitt淋巴瘤、Jijoye Burkitt淋巴瘤、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 machine learning Burkitt淋巴瘤、Hodgkin淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 4种EBV阳性细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-05-29
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Feb-27, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示肿瘤浸润NK细胞中与免疫抑制相关的二分型群体 首次系统描绘肿瘤中NK细胞的二分型表型和功能景观,发现由IFNG和TGFB1对立信号驱动的内在调控轴,并揭示组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断疗效的关联 未提及具体局限性 探究肿瘤浸润NK细胞的异质性及其对免疫反应和临床结局的影响 多种实体瘤中的肿瘤浸润NK细胞 单细胞组学 实体瘤(如肺癌、前列腺癌等) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个肿瘤类型的样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒
118 2026-05-29
BARTsc identifies key transcriptional regulators from single-cell omics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
119 2026-05-29
A Pan-Cancer Single-Cell Atlas to Evaluate Tumor Identity, Cell Line Concordance, and Dependency Mapping
2026-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序构建泛癌图谱,评估肿瘤身份、细胞系一致性和依赖性图谱 开发了一种基于马氏距离的严格整合框架,优先考虑代表性恶性转录状态,构建高质量泛癌单细胞图谱,并利用该图谱推断肿瘤-细胞系一致性和癌症特异性基因依赖性 未在摘要中提及具体限制,如可变数据质量、注释不一致等问题仍可能存在 建立可扩展的泛癌单细胞图谱,用于肿瘤身份推断、癌症细胞系基准测试和系统识别遗传脆弱性 来自499个样本的135,424个高质量恶性细胞,涵盖36种成人和儿童癌症 数字病理学 泛癌(包括成人和儿童癌症) 单细胞RNA测序 ElasticNet 单细胞转录组数据 499个样本,135,424个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 基于马氏距离的批次校正潜在空间选择
120 2026-05-29
Pixel2Gene enables histology-guided reconstruction and prediction of spatial gene expression
2026-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 Pixel2Gene是一个深度学习框架,通过整合组织学图像和空间转录组数据,实现基于组织学引导的空间基因表达重建和预测 首次利用共配准的组织学图像与空间转录组数据,通过深度学习实现高分辨率空间基因表达的重建和预测,无需直接转录组分析即可扩展至新样本 当前高分辨率空间转录组平台仍存在高成本、有限组织覆盖和技术伪影,导致数据噪声高、稀疏且不完整,可能影响分析准确性和生物学解释 开发一种成本效益高、可扩展的空间基因表达分析方法,通过常规组织学图像实现全组织尺度转录组分析 多种组织类型和疾病背景下的临床样本 计算机视觉, 机器学习 NA 空间转录组学 深度学习框架 图像, 基因表达数据 多个高分辨率空间转录组平台(Visium HD、Xenium、CosMx)上的临床样本 NA 空间转录组学 Visium HD, Xenium, CosMx NA
回到顶部