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当前共找到 40543 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-17 |
Integrative single-cell analysis reveals immunogenic cell death-associated heterogeneity and identifies a robust prognostic signature in osteosarcoma with experimental validation
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1792174
PMID:41948724
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研究论文 | 通过整合单细胞分析揭示骨肉瘤中免疫原性细胞死亡相关的异质性，并构建具有实验验证的稳健预后特征 | 首次在单细胞分辨率下表征骨肉瘤中免疫原性细胞死亡特征的细胞类型特异性分布，并基于此构建预后模型，结合多种实验验证了关键基因NAP1L1的作用 | 需要进一步的前瞻性验证来确认该预后特征的临床应用价值 | 探索骨肉瘤中免疫原性细胞死亡相关的细胞异质性及其临床意义，并构建预后模型 | 骨肉瘤患者样本中的肿瘤细胞、巨噬细胞、免疫细胞及间质细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析、机器学习 | 加权基因共表达网络分析、集成机器学习 | 基因表达数据、临床随访数据 | 11例骨肉瘤样本（单细胞RNA测序）；训练集TCGA-TARGET、验证集GSE16091与GSE21257 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-06-17 |
Decoding the human PBMC isonome: isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1782221
PMID:42283034
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研究论文 | 利用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组（isonome） | 首次使用改良的微流控-free PIPseq流程与牛津纳米孔长读长测序技术，构建了迄今最大规模的单个供体人类外周血单核细胞长读长单细胞数据集，能够检测到巨核细胞；发现了126个来自已知和新基因的新型异构体，并揭示了它们在不同细胞类型中的特异性表达模式 | NA | 在异构体水平上研究人类免疫细胞的多样性和疾病机制，并定义细胞类型 | 人类外周血单核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞长读长RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个供体的PBMC样本 | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序 | Oxford Nanopore MinION/GridION | 改良的PIPseq工作流程结合牛津纳米孔长读长测序 |
| 103 | 2026-06-17 |
Optimized protocol for processing murine tumor-bearing lung tissue for flow cytometry and single cell RNA-sequencing
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.25.690629
PMID:41394615
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研究论文 | 提出一种从荷瘤小鼠肺组织中处理样本用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化流程 | 针对纤维化和异质性强的荷瘤肺组织，开发了减少处理应激并获取>85%活细胞的详细分步操作方案 | 未明确说明局限，但可能包括对特定小鼠模型（Kras; tdTomato）的依赖和需验证的通用性 | 优化从健康及荷瘤小鼠肺组织中分离高质量单细胞悬液的方法 | Kras; tdTomato报告基因小鼠的荷瘤肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，涉及健康及荷瘤小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-06-17 |
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.23.689776
PMID:41394637
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研究论文 | 本研究通过测序技术定义了小鼠前肢起始的四个不同阶段，识别了前肢特异性转录的基因特征并揭示了TBX5的早期转录靶点 | 首次利用高通量测序方法系统解析前肢起始的时序转录程序，发现神经投射和细胞粘附相关基因作为TBX5候选早期靶点的全新机制模型 | 未知（摘要未提供） | 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制和转录程序 | 小鼠胚胎的体壁侧板中胚层细胞 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | 小鼠胚胎样本（未提供具体数量） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 核糖体分析 | NA | NA |
| 105 | 2026-06-17 |
Multi-site Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single Cell RNA Sequencing
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684427
PMID:41279168
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研究论文 | 评估三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的性能和可重复性 | 首次跨平台、多站点比较10x Genomics FLEX、Parse Bioscience Evercode WT v2和Honeycomb Bio HIVE三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的表现，并证明保存方法能更好地保留脆弱粒细胞群体 | 检测的基因子集存在平台特异性差异，且研究仅针对同一位健康个体的白细胞，样本多样性有限 | 评估三种商业细胞保存平台在单细胞RNA测序中的性能和可重复性，为科研人员选择最佳保存工作流程提供参考 | 来自一位健康个体的总白细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、流式细胞术数据 | 1位健康个体的白细胞样本 | 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics FLEX, Parse Bioscience Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE | 10x Genomics FLEX固定保存法，Parse Bioscience Evercode WT v2固定保存法，Honeycomb Bio HIVE冷冻保存法 |
| 106 | 2026-06-17 |
Decoding the human PBMC isonome: Isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.16.682832
PMID:41279381
|
研究论文 | 使用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组，实现异构体水平分辨率 | 首次生成最大规模的人类外周血单核细胞（PBMC）长读长单细胞数据集，结合微流控自由PIPseq工作流程和Oxford Nanopore长读长测序，发现128种新型异构体并鉴定细胞类型特异性异构体表达模式 | NA | 利用单细胞长读长RNA测序在异构体水平研究人类免疫细胞的多样性和功能机制 | 人类外周血单核细胞（PBMC）中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞长读长RNA测序（ONT） | NA | RNA序列数据 | 人类PBMC样本 | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq | Oxford Nanopore测序平台 | PIPseq工作流程结合Oxford Nanopore长读长测序 |
| 107 | 2026-06-17 |
Repopulating Microglia Suppress Peripheral Immune Cell Infiltration to Promote Poststroke Recovery
2025-09, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70565
PMID:40931631
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研究论文 | 采用PLX5622介导的小胶质细胞耗竭再殖模型，发现再殖小胶质细胞通过抑制外周免疫细胞浸润和重塑免疫微环境促进脑卒中后神经功能恢复 | 首次揭示短暂小胶质细胞耗竭再殖可通过抑制外周T细胞耗竭和中性粒细胞终末分化、促进吞噬型巨噬细胞表型转化来改善卒中后修复 | 仅在小鼠模型中验证，且PLX5622给药方案（7天给药+7天停药）的时效性和安全性需进一步评估以转化至临床 | 研究小胶质细胞再殖对脑缺血后免疫微环境重塑及神经功能恢复的影响 | 小鼠脑缺血模型中小胶质细胞、T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞及血脑屏障 | 神经免疫学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞因子阵列、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠脑组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-17 |
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.22.660927
PMID:40667238
|
研究论文 | 本研究通过组织工程、遗传和药理学模型及多组学技术，揭示了微纤维相关蛋白2（Mfap2）在急性肾损伤后肾脏修复中通过感知基质刚度驱动代谢重启的关键作用 | 首次发现Mfap2作为细胞外基质力学传感器通过Esr2-Lats1非经典通路调控肾小管代谢重编程，将组织刚度与肾脏修复的代谢需求联系起来 | NA | 阐明急性肾损伤后细胞外基质驱动的肾脏修复机制，特别是Mfap2在机械信号转导和代谢调控中的作用 | 小鼠急性肾损伤模型中的肾脏细胞（成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞）及脱细胞基质 | 机器学习和多组学分析 | 急性肾损伤 | 蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程、遗传模型 | NA | 蛋白质组、磷酸化蛋白质组、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6797967/v1
PMID:40585209
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，比较早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞、基底板和绒毛膜板细胞滋养层细胞及滋养层干细胞间的差异 | 首次揭示不同妊娠周龄和胎盘区域（基底板与绒毛膜板）细胞滋养层细胞的转录多样性，并发现滋养层干细胞最类似绒毛外滋养层前体细胞 | 研究未涉及功能验证实验，且样本量有限，可能限制结果的普适性 | 探究早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞的转录差异，并明确后者的细胞起源 | 早期（6-8周）和晚期（12-14周）妊娠早期胎盘绒毛组织，基底板和绒毛膜板区域细胞滋养层细胞，以及三种滋养层干细胞系 | 单细胞转录组学 | 正常妊娠 | 单细胞RNA测序，空间转录组学（GeoMx） | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 多个胎盘组织样本（早期和晚期各阶段）及三种滋养层干细胞系，具体数量未说明 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, NanoString GeoMx | 10x Chromium单细胞3'测序，NanoString GeoMx空间转录组学 |
| 110 | 2026-06-17 |
Aberrant STAT signaling drives T cell dysregulation in a targetable pediatric sepsis endotype
2025-May-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.06.11.24308709
PMID:38946991
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研究论文 | 通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术，在88名危重症儿童的前瞻性队列中鉴定了儿童脓毒症的一个免疫亚型，其特征为IL-6/IFN-γ驱动的T细胞功能异常，并指出JAK/STAT轴作为潜在免疫调节治疗靶点 | 首次通过整合多组学方法在儿童脓毒症中定义了一个以IL-6/IFN-γ驱动T细胞功能障碍为特征的免疫亚型，并揭示STAT信号异常在其中的关键作用，为靶向治疗提供了新方向 | 样本量较小（88名儿童），且为单中心研究，可能限制结果的普适性；未对JAK/STAT抑制剂进行干预性验证 | 阐明儿童脓毒症中导致疾病异质性的免疫机制，并识别可靶向的免疫亚型 | 88名危重症儿童 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq, 血浆蛋白质组学, 磷酸流式细胞术 | 无监督聚类 | 血浆细胞因子数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 88名危重症儿童 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 111 | 2026-06-17 |
Spatially Resolved Panoramic in vivo CRISPR Screen via Perturb-DBiT
2025-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6481967/v1
PMID:40386382
|
研究论文 | 提出Perturb-DBiT方法，实现在同一组织切片上同时进行空间全转录组RNA和单导向RNA的共测序，用于全景式体内CRISPR筛选 | 首次实现空间分辨的体内CRISPR筛选，能够同时测序全转录组总RNA和sgRNA，并检测小RNA和长链非编码RNA的调控变化 | 当前方法仅能检测小规模扰动面板和少量蛋白编码RNA，本文虽有所突破但可能仍存在组织处理复杂度及适用性限制 | 开发一种可在天然组织环境中无偏检测基因扰动对RNA调控、细胞动力学及组织结构影响的空间全转录组CRISPR筛选方法 | 人类癌症转移定植模型和免疫健全同源小鼠模型中的肿瘤组织切片 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学、CRISPR筛选、全转录组测序 | NA | 空间转录组数据、总RNA测序数据、sgRNA测序数据 | 人类癌症转移定植模型中的肿瘤集落连续组织切片，以及免疫健全同源小鼠模型的肿瘤组织切片 | NA | 空间转录组学 | Perturb-DBiT | Perturb-DBiT方法用于空间全转录组总RNA和sgRNA的碱基层面共测序 |
| 112 | 2026-06-17 |
Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage
2025-05-07, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 探索OLR1介导的急性脑出血血肿微环境中的炎症机制 | 首次通过单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示了OLR1在急性脑出血血肿微环境中的上调及其与单核细胞和巨噬细胞活性的相关性，提出OLR1作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 未明确说明局限性 | 研究OLR1在急性脑出血血肿微环境中的免疫反应和疾病进展中的作用 | 急性脑出血患者的外周血、脑组织和血肿样本 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 来自GEO数据集的多个数据集，包括外周血、脑组织和血肿样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-06-17 |
Harnessing omics data for drug discovery and development in ovarian aging
2025-05-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmaf002
PMID:39977580
|
综述 | 本文综述了多组学数据在卵巢衰老药物发现与开发中的应用，包括基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和微生物组数据 | 综合了从组织水平和单细胞视角分析卵巢衰老相关的多组学数据，并探讨如何利用这些新兴数据集识别新药靶点以指导治疗策略 | 未提及具体限制，但可能包括现有数据源的不足或方法的局限性 | 综合卵巢衰老相关的多组学数据，探索如何利用这些数据发现新药靶点并指导治疗策略 | 卵巢衰老相关机制及潜在药物靶点 | 机器学习 | 卵巢衰老 | 多组学、单细胞技术、空间转录组学 | 深度学习、机器学习 | 多组学数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 单细胞多组学和空间转录组学平台用于组织分析 |
| 114 | 2026-06-17 |
Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review
2025-04-08, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-025-04103-5
PMID:40200175
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）在肾脏疾病研究中的应用与发展 | 创新点在于通过整合scRNA-seq与ST技术，以前所未有的分辨率揭示肾脏疾病中的细胞异质性、新型细胞亚群及其空间组织，为靶向治疗和精准医学提供新见解 | 文献本身未明确提及局限性，但综述类文章通常受限于当前技术的分辨率、样本量或整合分析的挑战 | 总结scRNA-seq结合ST在肾脏疾病中的应用，阐明其在理解肾脏发育、稳态和疾病进展中的细胞与分子机制 | 肾脏疾病中的细胞亚群及其在肾微环境中的动态相互作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-06-17 |
CellBouncer, A Unified Toolkit for Single-Cell Demultiplexing and Ambient RNA Analysis, Reveals Hominid Mitochondrial Incompatibilities
2025-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.23.644821
PMID:40166335
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研究论文 | CellBouncer是一个用于单细胞测序数据解复用和环境RNA分析的计算工具包，揭示了人类和黑猩猩线粒体之间的不相容性 | CellBouncer整合了多种功能，包括多物种和多个体细胞混合物的分离与量化、识别未知线粒体单倍型、从脂质结合条形码或CRISPR sgRNA分配处理以及推断池组成，并在这些任务上优于现有方法同时引入了量化每个细胞环境RNA污染、推断个体供体对环境RNA池的贡献以及确定跨数据类型一致的doublet率的新方法 | NA | 开发一个统一的计算工具包，用于处理来自混合实验的单细胞测序数据，解决解复用和环境RNA分析等关键问题 | 人类和黑猩猩细胞融合系中的四倍体复合细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个不同的细胞融合系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序平台 |
| 116 | 2026-06-17 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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research paper | 本研究探讨了TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 首次阐明YAP/TAZ作为机械敏感转录调控因子在TGF-β诱导的肌肉纤维化中决定纤维/脂肪祖细胞向肌成纤维细胞分化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养，其结论在人类肌肉纤维化疾病中的适用性尚需进一步验证 | 探究YAP/TAZ在TGF-β介导的骨骼肌纤维化中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 骨骼肌纤维/脂肪祖细胞、小鼠模型 | machine learning | 肌肉纤维化 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠模型样本 | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 117 | 2026-06-17 |
Endogenously generated Dutch-type Aβ nonfibrillar aggregates dysregulate presynaptic neurotransmission in the absence of detectable inflammation
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.25.639746
PMID:40060689
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研究论文 | 研究内源性生成的荷兰型Aβ非纤维聚集体在无检测到炎症情况下对突触前神经传递的失调作用 | 首次揭示荷兰型Aβ非纤维聚集体在无炎症条件下直接导致突触前神经传递异常和线粒体功能障碍 | 未明确非纤维聚集体如何具体引发突触功能异常的分子机制，且仅关注单一小鼠模型 | 探究荷兰型Aβ非纤维聚集体对突触前神经传递和线粒体功能的影响及其与炎症的关系 | 表达荷兰型Aβ突变的小鼠模型（Dutch mice） | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 电子传递链催化测量, 免疫组织化学, 荧光显微镜 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 代谢数据 | 多个时间点的小鼠脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析兴奋性神经元转录组 |
| 118 | 2026-06-17 |
Application of scRNA-seq in Dental Research: Seeking Regenerative Clues From the Structure of Tooth and Periodontium in Physical or Pathological States
2025-02-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL26200
PMID:40018926
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综述 | 全面概述了单细胞RNA测序在牙科研究中的应用，揭示了牙齿和牙周组织的复杂细胞组成、新细胞类型及谱系特征，并总结了组织形成、稳态和再生机制 | 系统整合了单细胞数据在牙齿和牙周组织稳态、损伤修复及疾病机制中的新发现，从单细胞视角揭示了细胞组成比例变化和细胞间通讯模式的改变 | 未提及具体局限性 | 综述单细胞RNA测序在牙齿和牙周组织研究中的应用进展 | 牙齿和牙周组织 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-06-17 |
Divergence in cellular markers observed in single-cell transcriptomics datasets between cultured primary trabecular meshwork cells and tissues
2025-Feb-14, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04528-5
PMID:39952952
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据集比较原代小梁网细胞培养物与组织之间的细胞标记差异 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较原代人小梁网（hTM）细胞培养物与hTM组织在细胞身份和可转化性方面的差异 | 未具体说明 | 揭示原代hTM细胞培养物与组织在单细胞水平上的转录组差异，评估体外研究的可转化性 | 原代人小梁网细胞培养物和小梁网组织 | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个原代hTM体外样本（包含4名青光眼患者样本），传代1-4代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-06-17 |
Regulation of fibroblast phenotype in osteoarthritis using CDKN1A-loaded copper sulfide nanoparticles delivered by mesenchymal stem cells
2025-02-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00573.2024
PMID:39819042
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研究论文 | 利用间充质干细胞递送载有CDKN1A质粒的硫化铜纳米颗粒调控骨关节炎中成纤维细胞表型并促进软骨修复 | 创新性地构建了MSCs@CuS@CDKN1A纳米工程化间充质干细胞平台，通过靶向成纤维细胞表型调控CDKN1A表达，不仅增强软骨修复，还能有效缓解成纤维细胞驱动的炎症，为骨关节炎治疗提供新的策略 | 研究未提及具体局限性 | 探讨间充质干细胞递送载有CDKN1A质粒的硫化铜纳米颗粒对骨关节炎中成纤维细胞表型的调控作用及软骨修复效果 | 骨关节炎中的成纤维细胞、软骨细胞及小鼠模型 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、伪时间分析、GO/KEGG富集分析、WGCNA、微CT扫描、组织学染色、免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 骨关节炎小鼠模型 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |