单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-07-06	A novel, rapid, and practical prognostic model for sepsis patients based on dysregulated immune cell lactylation 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1625311 PMID:40612938	研究论文	本研究基于免疫细胞乳酸化修饰失调，开发了一种新型、快速且实用的脓毒症患者预后模型	首次系统揭示了乳酸化修饰在脓毒症进展中的动态变化模式，并构建了首个基于乳酸化相关枢纽基因的预后预测模型	模型验证仅采用单中心前瞻性队列（N=51），需要更大规模多中心研究进一步验证	探索脓毒症进程中乳酸化修饰的动态变化并开发预后预测模型	脓毒症患者的血液转录组数据和单细胞RNA测序数据	生物信息学	脓毒症	单细胞RNA测序、机器学习算法、伪时间轨迹重建	基于k-means聚类和机器学习算法的预后模型	转录组数据	训练队列未明确样本量，验证队列包含51例脓毒症患者
102	2025-07-06	Applications and Prospects of Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Cervical Cancer 2025, BioMed research international IF:2.6Q3 DOI:10.1155/bmri/1532745 PMID:40612935	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）在宫颈癌研究中的最新进展及其应用前景	探讨了scRNA-seq和ST技术在揭示宫颈癌异质性、肿瘤微环境、肿瘤进化轨迹及治疗抗性机制方面的创新应用	未提及具体实验数据或样本量的限制	旨在通过scRNA-seq和ST技术更深入地理解宫颈癌的异质性和肿瘤微环境，以开发更有效的治疗和预防策略	宫颈癌（CC）及其肿瘤微环境（TME）	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）	NA	RNA测序数据、空间转录组数据	NA
103	2025-07-06	Bridging aging, immunity, and atherosclerosis: novel insights into senescence-related genes 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1557266 PMID:40612944	研究论文	该研究通过RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法，识别了与衰老相关的基因作为动脉粥样硬化的生物标志物，并探讨了这些基因在免疫细胞浸润和巨噬细胞分化中的作用	首次结合多种机器学习算法（LASSO、SVM和RF）筛选衰老相关基因，并通过单细胞RNA测序构建AS斑块的细胞图谱，揭示了衰老血管细胞与巨噬细胞的互作机制	研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型，人类样本的临床验证不足	探索衰老相关基因在动脉粥样硬化中的作用及其作为诊断标志物的潜力	人类组织RNA测序数据和小鼠主动脉斑块	生物信息学	心血管疾病	RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光	LASSO、SVM、RF	RNA测序数据、单细胞数据	未明确说明人类样本数量，使用ApoE-/- AS小鼠模型
104	2025-07-06	Single-cell atlas of human skin implicates APOE pro-inflammatory signaling in diabetic foot ulcers 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1591944 PMID:40612951	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究糖尿病足溃疡(DFU)患者皮肤组织中APOE+成纤维细胞的作用及其与疾病进展的关联	首次在DFU患者中鉴定出APOE过表达的成纤维细胞亚群，并揭示其在糖尿病发生和发展中的潜在作用	研究样本量未明确说明，且体外实验结果需要在体内进一步验证	探究糖尿病足溃疡的分子机制和潜在治疗靶点	人类皮肤组织中的成纤维细胞	数字病理学	糖尿病足溃疡	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组织化学染色, 体外实验	NA	RNA测序数据, 图像数据	NA
105	2025-07-06	Biallelic variants in POPDC2 cause a novel autosomal recessive syndrome presenting with cardiac conduction defects and variable hypertrophic cardiomyopathy 2024-Jul-05, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.07.04.24309755 PMID:39006410	研究论文	研究发现POPDC2基因的双等位基因变异会导致一种新型常染色体隐性遗传综合征，表现为心脏传导缺陷和可变性肥厚型心肌病	首次将POPDC2基因的双等位基因变异与人类心脏传导缺陷和肥厚型心肌病联系起来，并揭示了其分子机制	患者肌肉活检未显示明显的肌病，且样本量较小（4个家族）	探究POPDC2基因变异与心脏传导缺陷和肥厚型心肌病的关联	4个携带POPDC2双等位基因变异的家族	遗传学	心血管疾病	同源建模、电生理研究、单细胞RNA测序	NA	遗传数据、电生理数据、RNA测序数据	4个家族（具体人数未明确）和超过100万人的群体遗传数据
106	2025-07-06	Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis 2024-04-30, Clinical oral investigations IF:3.1Q1 DOI:10.1007/s00784-024-05659-6 PMID:38684576	研究论文	本研究通过全外显子测序等技术，鉴定了一个与Coffin-Siris综合征（CSS）患者牙齿发育不全相关的新SOX4突变，并探索了其潜在的调控机制	首次报告了SOX4错义突变导致综合征性牙齿发育不全，并验证了Sox4在小鼠牙齿发育过程中的高表达及其在牙齿发育通路中的核心作用	研究仅针对一名中国CSS患者，样本量较小，且未进行功能实验验证突变的具体机制	鉴定CSS患者牙齿发育不全的致病突变并探索其调控机制	Coffin-Siris综合征（CSS）患者和小鼠牙齿发育过程	遗传学	Coffin-Siris综合征	全外显子测序、Sanger验证、单细胞RNA测序、荧光原位杂交（FISH）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	基因组数据、RNA测序数据	一名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本
107	2025-07-05	Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166 PMID:39995094	综述	本文综述了小胶质细胞在缺血性卒中中的双重作用及其潜在干预策略	探讨了小胶质细胞动态激活和极化状态对卒中疾病进程的影响，并提出了多种实验性治疗方法和潜在治疗剂	NA	研究小胶质细胞在缺血性卒中中的作用及干预策略	小胶质细胞及其在缺血性卒中中的动态功能状态	神经科学	缺血性卒中	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	NA	NA
108	2025-07-05	Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269 PMID:40146000	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，研究心脏骤停猪模型中血脑屏障破坏和海马神经炎症的细胞和分子机制	首次使用单细胞转录组分析揭示心脏骤停后海马区的细胞亚群变化、细胞通讯网络及分子机制，特别是发现了一组表达S100A8的活化小胶质细胞亚群	研究仅关注心脏骤停后6和24小时的时间点，未涵盖更长的恢复期	探索心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制，为神经保护和修复提供新靶点	心室颤动诱导心脏骤停的猪模型海马组织	神经科学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光染色	猪心脏骤停模型	单细胞转录组数据	心脏骤停后6和24小时以及假手术对照猪的海马组织
109	2025-07-05	A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish 2026-Feb-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163 PMID:40326988	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了斑马鱼脊髓损伤后再生过程中的细胞和分子机制	首次在单细胞水平上解析了斑马鱼脊髓再生过程中不同细胞群体的动态变化和分子特征	研究仅聚焦于斑马鱼模型，结果向哺乳动物转化的适用性尚需进一步验证	探索斑马鱼脊髓再生的细胞和分子机制	斑马鱼脊髓损伤模型	再生医学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	不同损伤阶段的斑马鱼脊髓细胞群体
110	2025-07-05	Uncovering common transcriptional features shared by mature peripheral blood PMN-MDSCs and tumor-infiltrating neutrophils in humans 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2025.2521396 PMID:40590753	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类外周血中的成熟PMN-MDSCs与肿瘤浸润中性粒细胞在转录特征上的相似性	首次通过scRNA-seq技术鉴定了PMN-MDSCs和TANs共有的转录特征，揭示了它们在免疫抑制和促肿瘤特性上的相似性	研究样本主要来自非小细胞肺癌患者和G-CSF治疗供体，可能限制了结果的普适性	探索人类循环系统中的mPMN-MDSCs与肿瘤相关中性粒细胞之间的转录相似性	人类外周血中的成熟PMN-MDSCs和肿瘤相关中性粒细胞(TANs)	肿瘤免疫学	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	来自NSCLC患者和G-CSF治疗供体的mPMN-MDSCs样本
111	2025-07-05	Single-cell transcriptomic profiling of the whole colony of Botrylloides diegensis: insights into tissue specialization and blastogenesis 2025-Oct-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204265 PMID:40406997	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对Botrylloides diegensis整个群体进行了转录组分析，揭示了细胞异质性并鉴定了细胞和组织标记物	首次对Botrylloides diegensis整个群体进行单细胞转录组测序，鉴定了29个主要细胞簇，并揭示了组织特化和发育轨迹	研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的验证	理解Botrylloides diegensis的发育、组织功能和再生机制	Botrylloides diegensis群体的所有细胞（包括个体、芽体和血管被膜）	发育生物学	NA	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	一个完整的Botrylloides diegensis群体（包含多种细胞类型）
112	2025-07-05	Single-cell landscape of immunological responses in patients with juvenile idiopathic arthritis 2025-Sep, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101577 PMID:40605976	研究论文	通过单细胞转录组分析，研究青少年特发性关节炎（JIA）患者免疫细胞的异质性及其功能变化	揭示了JIA患者中干扰素和急性炎症反应的紊乱，特别是在系统性JIA（sJIA）患者中更为显著，并识别了sJIA中独特的配体-受体对	样本量较小（14名JIA患者和4名健康个体），可能影响结果的普遍性	理解JIA患者免疫系统的细胞异质性及其功能变化	青少年特发性关节炎（JIA）患者和健康个体的外周血免疫细胞	生物医学研究	青少年特发性关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	14名JIA患者和4名健康个体的外周血样本
113	2025-07-05	Blood and urine-based biomarkers in prostate cancer: Current advances, clinical applications, and future directions 2025-Sep, The journal of liquid biopsy DOI:10.1016/j.jlb.2025.100305 PMID:40606769	综述	本文全面概述了前列腺癌（PCa）当前和新兴的诊断、预后和预测生物标志物，强调了它们的临床应用和未来前景	介绍了新兴技术如机器学习和单细胞组学在生物标志物发现中的应用，以及人工智能驱动模型在预测复发和治疗反应中的潜力	尽管介绍了多种生物标志物，但部分新兴技术如单细胞RNA测序和空间转录组学在临床实践中的应用仍处于探索阶段	探索前列腺癌更准确的生物标志物，以提高早期检测、个性化治疗和监测的能力	前列腺癌（PCa）患者	数字病理学	前列腺癌	液体活检（ctDNA和CTCs）、单细胞RNA测序、空间转录组学	人工智能驱动模型（如复制压力特征RSS）	血液和尿液样本	NA
114	2025-07-05	Scalable inference of transcriptional variability with BASiCS 2025-Aug-21, Journal of theoretical biology IF:1.9Q3 DOI:10.1016/j.jtbi.2025.112157 PMID:40479909	研究论文	本文介绍了一种扩展的BASiCS模型，用于单细胞RNA测序数据的可扩展贝叶斯推断	提出了一种分治推理方案，使BASiCS能够处理大规模数据集，并在准确性和可扩展性上优于标准MCMC和变分推理方法	未提及该方法在特定生物场景或复杂细胞类型中的适用性限制	开发可扩展的贝叶斯推断方法用于单细胞RNA测序数据分析	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	BASiCS（贝叶斯层次模型）	基因表达数据	未明确提及具体样本量，但针对大规模数据集
115	2025-07-05	Cellular Landscape of Synovial Chondromatosis Synovium Revealed by Single-Cell RNA Sequencing 2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202500034RR PMID:40600952	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示滑膜软骨瘤病滑膜的细胞景观	首次使用单细胞RNA测序技术全面描绘了滑膜软骨瘤病（SC）的细胞组成和转录特征，发现了新的成纤维细胞亚群和巨噬细胞表型转变，以及增殖性免疫细胞群体的动态变化	研究样本量可能有限，且功能验证实验尚未进行	解析滑膜软骨瘤病的细胞基础和病理机制	健康个体和滑膜软骨瘤病患者的滑膜组织	单细胞测序	滑膜软骨瘤病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康个体和SC患者的滑膜组织（具体数量未明确说明）
116	2025-07-05	Single-cell analysis of the decidua unveils the mechanism of anti-inflammatory exosomes for chorioamnionitis in nonhuman primates 2025-Jul-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adp0467 PMID:40601753	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示了携带超抑制IκB的工程化外泌体在非人灵长类动物绒毛膜羊膜炎中的抗炎机制	首次在非人灵长类动物模型中验证了携带srIκB的外泌体对绒毛膜羊膜炎的治疗潜力及其作用机制	研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未进行人体试验	探索工程化外泌体对绒毛膜羊膜炎的治疗潜力及其分子机制	怀孕的非人灵长类动物及其胎盘组织	生殖医学	绒毛膜羊膜炎	单细胞RNA测序、批量RNA测序	LPS诱导的绒毛膜羊膜炎动物模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但使用了两种给药途径（羊膜内和静脉内）
117	2025-07-05	Advances in Single-Cell Sequencing for Infectious Diseases: Progress and Perspectives 2025-Jul-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415678 PMID:40613694	综述	本文综述了单细胞测序技术在传染病研究中的最新进展和应用	总结了真核、原核（如MATQ-seq和BacDrop）和双（如PatH-Cap）单细胞测序技术的进展，及其在揭示宿主-病原体相互作用中的应用	未提及具体的技术限制或样本量限制	促进强大诊断或治疗策略的开发，推动精准医学的发展	传染病中的宿主-病原体相互作用	基因组学	传染病	单细胞测序技术（如MATQ-seq、BacDrop、PatH-Cap）	NA	基因组数据	NA
118	2025-07-05	M694I variant of MEFV drives pathogenesis of familial Mediterranean fever through enhanced Th17 cell differentiation 2025-Jul-04, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/keaf336 PMID:40613718	研究论文	本研究探讨了MEFV基因M694I变异如何通过增强Th17细胞分化促进家族性地中海热(FMF)的病理生理学	首次使用CRISPR/Cas9技术构建M694I敲入小鼠模型，全面解析该变异通过Th17细胞分化促进FMF发病的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证相关发现	阐明MEFV基因M694I变异导致家族性地中海热的发病机制	MEFV M694I/M694I基因敲入小鼠模型	分子病理学	家族性地中海热	CRISPR/Cas9基因编辑、scRNA-seq、流式细胞术、25-plex细胞因子磁珠阵列分析	基因敲入小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据、细胞因子数据	未明确说明小鼠数量，但包含多组学数据分析
119	2025-07-05	High-precision immune-related plasma proteomics profiling predicts response to immunotherapy in patients with triple-negative breast cancer 2025-Jul-04, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1 DOI:10.20892/j.issn.2095-3941.2025.0038 PMID:40613791	研究论文	本研究通过高精度血浆蛋白质组学分析，预测三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的响应	识别了与免疫治疗响应显著相关的血浆蛋白（ARG1、NOS3和CD28），并开发了血浆免疫预测评分系统	研究为回顾性设计，样本量有限（195例患者）	探索非侵入性生物标志物以预测三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的响应	195例接受抗PD-1免疫治疗的三阴性乳腺癌患者	数字病理学	三阴性乳腺癌	高精度蛋白质组学分析、单细胞RNA测序	NA	血浆样本	195例三阴性乳腺癌患者的配对基线、治疗中和治疗后血浆样本
120	2025-07-05	Single-cell transcriptomics reveals hypoxia-driven iCAF_PLAU is associated with stemness and immunosuppression in anorectal malignant melanoma 2025-Jul-04, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1 DOI:10.1007/s00535-025-02273-5 PMID:40613916	研究论文	通过单细胞转录组学揭示了缺氧驱动的iCAF_PLAU在肛门直肠恶性黑色素瘤(ARMM)中与干性和免疫抑制相关	首次在ARMM中鉴定出独特的PLAU+成纤维细胞群(iCAF_PLAU)，并揭示了其通过WNT5A_FZD3_LRP6和NRG1_ERBB3配体-受体对增强癌细胞干性和侵袭性的机制	样本量较小(仅3例ARMM患者)，需要更大规模的研究验证发现	探究肛门直肠恶性黑色素瘤(ARMM)的肿瘤微环境特征及其治疗抵抗机制	肛门直肠恶性黑色素瘤(ARMM)患者肿瘤组织和血液样本	数字病理学	肛门直肠恶性黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	3例ARMM患者样本，结合GEO数据库皮肤黑色素瘤数据集