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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-04 |
Single-Cell Mitochondrial Lineage Tracing Decodes Fate Decision and Spatial Clonal Architecture in Human Hematopoietic Organoids
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518084
PMID:41560697
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研究论文 | 本研究开发了一种利用单细胞RNA测序中的线粒体转录本自然突变作为内源性遗传条形码的方法，以追踪人类多能干细胞在早期胚胎发生中的造血谱系命运决策和空间克隆结构 | 创新点包括利用线粒体突变作为非侵入性内源性条形码进行单细胞谱系追踪，整合线粒体条形码与合成谱系追踪以建模胚胎组织发育，以及扩展至空间转录组学以揭示NOTCH介导的基质细胞与造血祖细胞间交互作用驱动的空间分区 | NA | 研究目的是解码人类造血类器官中的命运决策和空间克隆结构，以理解组织自组织机制 | 研究对象是人类多能干细胞（hPSCs）及其衍生的造血类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | 动态系统模型 | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-04-04 |
Identification of a Force-Induced Sox9+Acan+ Transitional Subpopulation Linked to FGF2-FGFR2-ERK Signaling in Orthodontic Bone Remodeling
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519330
PMID:41572365
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在小鼠模型中识别了一个力诱导的Sox9+Acan+过渡亚群，揭示了其在正畸骨重塑中通过FGF2-FGFR2-ERK信号通路调控破骨细胞分化和骨吸收的作用 | 首次在正畸骨重塑中识别并功能验证了一个新的力敏感过渡细胞亚群Sox9Acan细胞，并阐明了其与Mmp14巨噬细胞相互作用激活FGF2-FGFR2-ERK信号通路的机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证，且单细胞测序可能受样本量和技术限制 | 探究正畸力诱导的骨重塑机制，特别是间充质谱系细胞的异质性及其在正畸性炎症性牙根吸收中的作用 | 小鼠正畸牙移动模型中的间充质谱系细胞、免疫细胞及其他相关细胞类型 | 单细胞组学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序, RNAscope, 多重免疫组化, 机械刺激实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-04-04 |
PARPi Combining Nanoparticle LIN28B siRNA for the Management of Malignant Ascites
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510547
PMID:41572432
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向递送LIN28B siRNA的纳米颗粒联合PARP抑制剂BMN673的协同疗法，用于治疗恶性腹水，并在临床前卵巢癌模型中验证了其疗效 | 首次发现LIN28B高表达和DNA修复通路失调是恶性浆液性积液的关键特征，并创新性地提出了PARP抑制剂与靶向LIN28B的siRNA纳米递送系统联合治疗的协同策略 | 研究主要在临床前卵巢癌模型中进行，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性 | 开发一种针对恶性腹水（恶性浆液性积液的一种）的新型治疗策略 | 恶性腹水（MA），特别是卵巢癌模型中的恶性腹水 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 患者和临床前样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-04-04 |
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512597
PMID:41580978
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研究论文 | 本文整合全外显子组测序、成像质谱流式细胞术和空间转录组学，研究了两种小鼠肺腺癌模型中分子演化和免疫反应的差异 | 首次在空间维度上比较了遗传工程和致癌物诱导的肺腺癌前病变的分子与免疫演化，揭示了吸烟相关与非吸烟相关肺癌的相似性 | 研究基于小鼠模型，结果向人类肺癌的转化需进一步验证 | 探究肺腺癌前病变在有无致癌物暴露下的分子与免疫演化差异 | 129S4/Sv-Kras遗传工程小鼠模型和129S4 U致癌物诱导的小鼠肺腺癌前病变模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 全外显子组测序, 成像质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 基因组序列, 蛋白质成像, 空间转录组数据 | 141只小鼠中的156个病变区域 | NA | 空间转录组学, 单细胞蛋白质成像 | NA | NA |
| 105 | 2026-04-04 |
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3658320
PMID:41591852
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研究论文 | 本文提出了一种名为HFFST的分层特征融合算法，用于从H&E染色的病理图像预测空间基因表达 | 该方法首次充分利用病理图像中的分层信息，采用从粗到细的回归框架和多层次特征提取与融合技术来预测空间转录组图谱 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种从H&E染色病理图像预测空间基因表达的计算方法，以降低空间转录组技术的成本和复杂性 | H&E染色的全切片病理图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 分层特征融合算法（HFFST） | 图像 | 五个公共数据集和高分辨率Visium数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 高分辨率Visium数据 |
| 106 | 2026-04-04 |
SiCmiR Atlas: Single-Cell miRNA Landscape Reveals Hub-miRNA and Network Signatures in Human Cancers
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514446
PMID:41691474
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SiCmiR的两层神经网络，用于从单细胞RNA测序数据预测miRNA表达谱，并构建了首个单细胞成熟miRNA表达数据库SiCmiR Atlas | 开发了SiCmiR神经网络，仅需977个LINCS L1000标志基因即可预测miRNA表达，降低了scRNA-seq数据中dropout的敏感性，并创建了首个单细胞miRNA表达数据库 | 未明确提及具体限制，但可能依赖于训练数据的质量和覆盖范围 | 研究单细胞水平miRNA的表达模式及其在癌症中的作用 | 人类癌症中的miRNA，包括肝细胞癌、胰腺导管癌、垂体腺瘤和胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 两层神经网络 | RNA-seq数据 | 6,462个TCGA配对miRNA-mRNA样本，涵盖362个公共数据集和936万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-04-04 |
Dual-Target ROS-Driven Spatiotemporal Senolysis for Vascular Repair and Immune Microenvironment Reprogramming in the Treatment of Ocular Fundus Neovascularization
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523495
PMID:41698122
|
研究论文 | 本文开发了一种ROS响应性衰老细胞清除水凝胶，用于治疗眼底新生血管，通过选择性清除衰老内皮细胞和小胶质细胞，改善血管修复和免疫微环境 | 开发了一种可注射的ROS响应性衰老细胞清除水凝胶，实现病灶激活的持续药物释放，选择性清除两种致病性衰老细胞亚群，打破血管与免疫衰老的恶性循环 | NA | 开发一种精准治疗眼底新生血管的多功能时空控制治疗策略 | 眼底新生血管（OFN） | 数字病理学 | 眼底新生血管 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-04-04 |
From noise to models to numbers: Evaluating negative binomial models and parameter estimations in single-cell RNA-seq
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014014
PMID:41838800
|
研究论文 | 本文通过计算高效的模型选择技术，评估了负二项分布模型在单细胞RNA测序数据中的适用性及其参数估计的准确性 | 揭示了负二项分布近似模拟数据的条件范围，并指出其在多种参数机制下适用，无需仅指示转录爆发 | 在稳态条件下，基因特异性参数估计即使经过技术噪声校正，仍可能显示较大的相对误差 | 评估负二项模型在单细胞RNA测序数据中的拟合效果及参数估计的可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的转录计数分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项分布、Beta-Poisson（Telegraph）、Poisson模型 | 模拟数据和scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-04-04 |
PBRM1 Deficiency Reshapes an Immune Suppressive Microenvironment Through Epigenetic Tuning of PBRM1-KDM5C-IL6 Axis in ccRCC
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512627
PMID:41514194
|
研究论文 | 本研究揭示了PBRM1缺失通过调控PBRM1-KDM5C-IL6轴重塑ccRCC免疫抑制微环境的机制 | 首次建立了PBRM1敲除小鼠模型并结合单细胞RNA测序，揭示了PBRM1通过招募KDM5C调控IL-6表达，从而驱动肿瘤相关巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，尚未在人体中进行干预性临床试验验证 | 探究PBRM1缺失在透明细胞肾细胞癌免疫逃逸中的作用机制 | 透明细胞肾细胞癌、肿瘤相关巨噬细胞、CD8 T细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | PBRM1敲除小鼠模型、原位肾肿瘤小鼠模型、临床患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-04-04 |
CRISPLD2 Attenuates Intervertebral Disc Degeneration by Suppressing Oxidative Stress-Induced Ferroptosis through the miR-548I-IL17A Axis
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516477
PMID:41514293
|
研究论文 | 本文揭示了CRISPLD2通过调控miR-548I-IL17A轴抑制氧化应激诱导的铁死亡，从而减轻椎间盘退变的作用机制 | 首次发现CRISPLD2在椎间盘退变中通过miR-548I-IL17A轴调控铁死亡的关键作用，并证实其作为治疗靶点的潜力 | 未明确CRISPLD2表达下调的具体上游调控机制，且体内模型的长期疗效和安全性需进一步验证 | 探究CRISPLD2在椎间盘退变中的作用机制及潜在治疗价值 | 髓核细胞（NPCs）及椎间盘退变动物模型 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），腺相关病毒（AAV）介导的基因过表达 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-04-04 |
Hepatocyte BPGM Induces RET Lactylation and Macrophage Reprogramming to Promote Tumorigenesis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518180
PMID:41514495
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞中的糖酵解关键酶BPGM通过促进RET蛋白的乳酸化修饰和稳定，并诱导巨噬细胞M2极化，从而驱动肝细胞癌进展的新机制 | 首次发现BPGM通过P300介导的RET蛋白K549位点乳酸化修饰，竞争性抑制其泛素化降解，从而稳定RET蛋白并促进肝癌进展；同时阐明了BPGM通过分泌乳酸诱导巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，临床样本验证的深度和广度有待进一步扩展；BPGM作为治疗靶点的具体干预策略和体内疗效仍需后续研究验证 | 探究糖酵解关键酶BPGM在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌组织、小鼠DEN诱导肝癌模型、肝癌细胞系、肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱 | 基因敲除小鼠模型、细胞过表达模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、临床样本数据 | 临床肝癌组织样本、DEN诱导的肝细胞特异性Bpgm敲除小鼠模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-04-04 |
Conversion of Transplanted Mature Hepatocytes into Afp+ Reprogrammed Cells for Liver Regeneration After Injury
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517126
PMID:41609487
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研究论文 | 本研究揭示了移植的成熟肝细胞通过转化为甲胎蛋白阳性重编程肝细胞（Afp rHeps）来驱动肝脏再生的分子机制 | 首次通过整合单细胞多组学分析，揭示了移植肝细胞转化为Afp+重编程细胞的动态过程，并发现了PPARγ/AFP代谢轴和TNF-α/AP-1有丝分裂信号这两个可调控的再生治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类肝脏再生中的适用性仍需进一步验证 | 探究移植成熟肝细胞驱动肝脏再生的细胞与分子机制 | 移植的成熟肝细胞及其在损伤肝脏微环境中的命运转变 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序, 单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-04-04 |
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708613
PMID:41890091
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研究论文 | 本研究探讨了女性诱导多能干细胞在CRISPR基因编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应 | 首次系统研究了CRISPR编辑和神经分化对女性iPSC中XCI侵蚀的影响，揭示了其对X连锁和常染色体基因表达的影响机制 | 研究仅基于有限供体细胞系（4个）和编辑基因（66个），可能无法完全代表所有情况 | 探究女性iPSC在CRISPR编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应及其对差异表达基因分析的混淆影响 | 女性诱导多能干细胞及其衍生的神经细胞 | 单细胞转录组学 | 神经发育障碍 | CRISPR基因编辑，RNA-seq | NA | 转录组数据 | 数百个CRISPR编辑的女性iPSC细胞系（来自4个供体，涉及66个基因），以及iPSC衍生神经细胞的单细胞RNA-seq数据（涉及42个编辑基因） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-04-04 |
Bayesian Hyperspherical Graph Mixture-of-Experts Deciphers Cell-Cell Interaction in Spatial Transcriptomics
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3660060
PMID:41628049
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研究论文 | 本文提出了一种名为B-HGME的无监督贝叶斯框架，用于从空间转录组数据中联合推断空间域和细胞-细胞相互作用网络 | 提出了首个结合超球面嵌入和贝叶斯混合专家模型的框架，用于无监督地推断具有方向性和长程性的细胞-细胞相互作用，并提供了原则性的不确定性量化 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一种计算框架，以无监督和可解释的方式从空间转录组数据中准确推断细胞-细胞相互作用和空间域 | 空间转录组数据中的细胞及其相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯超球面图混合专家模型 | 空间转录组数据 | 来自六个主要空间转录组平台的多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-04-04 |
Molecular profiling of sacral chordomas through methylation, spatial transcriptomics and multiplexed immunofluorescence
2026-Mar, ESMO rare cancers
DOI:10.1016/j.esmorc.2025.100115
PMID:41924303
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研究论文 | 本研究通过DNA甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术，对骶骨脊索瘤的分子异质性进行了综合分析 | 首次结合甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术，揭示了骶骨脊索瘤中与复发相关的独特表观遗传特征，并识别了免疫检查点标记物TIM3、CD47和PD-1的表达模式 | 研究为回顾性设计，样本量相对较小（29例患者），且缺乏功能验证实验 | 探究骶骨脊索瘤的分子异质性和肿瘤微环境特征 | 骶骨脊索瘤患者及其存档组织 | 数字病理学 | 脊索瘤 | DNA甲基化分析，空间转录组学，多重免疫荧光 | 无监督聚类，多元线性回归分析 | 甲基化数据，空间基因表达数据，免疫荧光图像数据 | 29例骶骨脊索瘤患者 | NA | 空间转录组学 | Digital Spatial Profiler (DSP) | NA |
| 116 | 2026-04-04 |
scDBic: a novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag095
PMID:41746287
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法，专门用于分析单细胞RNA测序数据，以改善细胞聚类性能并识别关键基因 | scDBic结合了深度自编码器进行细胞聚类、基因聚类以及使用反向策略识别关键基因簇，解决了传统聚类算法在捕获局部一致性和双聚类算法在细胞丢失、高维数据适应性及迭代选择方面的不足 | NA | 开发一种针对单细胞RNA测序数据的深度学习双聚类算法，以更有效地发现细胞群并识别其关键基因 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-04 |
Transient activation of potent progenitor cells is required for spinal cord regeneration
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703854
PMID:41924399
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和遗传谱系追踪，揭示了成年斑马鱼脊髓损伤后表达特定基因的祖细胞的分子多样性和贡献，并发现Bach1转录因子作为双功能调控开关控制祖细胞的瞬时激活与静息恢复 | 首次系统鉴定斑马鱼脊髓再生中关键祖细胞的分子身份和命运贡献，并发现Bach1作为双功能转录因子调控损伤后祖细胞激活与再生后静息恢复的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，哺乳动物脊髓再生的机制可能不同；单细胞测序样本量有限，需进一步验证 | 探究脊髓损伤后神经再生的细胞与分子机制 | 成年斑马鱼脊髓中的祖细胞群体 | 发育生物学与再生医学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、遗传谱系追踪、转录因子筛选 | NA | 单细胞转录组数据、遗传谱系数据 | 未明确样本数量，但涉及稳态和再生脊髓组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-03-01 |
Single-cell RNA sequencing of adenoid cystic carcinoma of the breast reveals cellular heterogeneity and tumor microenvironment features
2026-Feb-27, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-026-02329-2
PMID:41761191
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2026-04-04 |
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07287-3
PMID:41761269
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研究论文 | 本研究揭示了在疟疾感染中，TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 | 首次揭示了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中调控巨噬细胞功能的新机制，并证明Tim-3在巨噬细胞上的保护性作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中得到验证 | 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及其上游调控机制 | 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-02-28 |
Integrative analysis of single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, and proteomic data identified NOTCH3 as a hub gene contributing to human intervertebral disc fibrosis
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40696-z
PMID:41748750
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |