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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-04 |
From noise to models to numbers: Evaluating negative binomial models and parameter estimations in single-cell RNA-seq
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014014
PMID:41838800
|
研究论文 | 本文通过计算高效的模型选择技术，评估了负二项分布模型在单细胞RNA测序数据中的适用性及其参数估计的准确性 | 揭示了负二项分布近似模拟数据的条件范围，并指出其在多种参数机制下适用，无需仅指示转录爆发 | 在稳态条件下，基因特异性参数估计即使经过技术噪声校正，仍可能显示较大的相对误差 | 评估负二项模型在单细胞RNA测序数据中的拟合效果及参数估计的可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的转录计数分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项分布、Beta-Poisson（Telegraph）、Poisson模型 | 模拟数据和scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-04-04 |
PBRM1 Deficiency Reshapes an Immune Suppressive Microenvironment Through Epigenetic Tuning of PBRM1-KDM5C-IL6 Axis in ccRCC
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512627
PMID:41514194
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研究论文 | 本研究揭示了PBRM1缺失通过调控PBRM1-KDM5C-IL6轴重塑ccRCC免疫抑制微环境的机制 | 首次建立了PBRM1敲除小鼠模型并结合单细胞RNA测序，揭示了PBRM1通过招募KDM5C调控IL-6表达，从而驱动肿瘤相关巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，尚未在人体中进行干预性临床试验验证 | 探究PBRM1缺失在透明细胞肾细胞癌免疫逃逸中的作用机制 | 透明细胞肾细胞癌、肿瘤相关巨噬细胞、CD8 T细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | PBRM1敲除小鼠模型、原位肾肿瘤小鼠模型、临床患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-04-04 |
CRISPLD2 Attenuates Intervertebral Disc Degeneration by Suppressing Oxidative Stress-Induced Ferroptosis through the miR-548I-IL17A Axis
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516477
PMID:41514293
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研究论文 | 本文揭示了CRISPLD2通过调控miR-548I-IL17A轴抑制氧化应激诱导的铁死亡，从而减轻椎间盘退变的作用机制 | 首次发现CRISPLD2在椎间盘退变中通过miR-548I-IL17A轴调控铁死亡的关键作用，并证实其作为治疗靶点的潜力 | 未明确CRISPLD2表达下调的具体上游调控机制，且体内模型的长期疗效和安全性需进一步验证 | 探究CRISPLD2在椎间盘退变中的作用机制及潜在治疗价值 | 髓核细胞（NPCs）及椎间盘退变动物模型 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），腺相关病毒（AAV）介导的基因过表达 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-04-04 |
Hepatocyte BPGM Induces RET Lactylation and Macrophage Reprogramming to Promote Tumorigenesis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518180
PMID:41514495
|
研究论文 | 本研究揭示了肝细胞中的糖酵解关键酶BPGM通过促进RET蛋白的乳酸化修饰和稳定，并诱导巨噬细胞M2极化，从而驱动肝细胞癌进展的新机制 | 首次发现BPGM通过P300介导的RET蛋白K549位点乳酸化修饰，竞争性抑制其泛素化降解，从而稳定RET蛋白并促进肝癌进展；同时阐明了BPGM通过分泌乳酸诱导巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，临床样本验证的深度和广度有待进一步扩展；BPGM作为治疗靶点的具体干预策略和体内疗效仍需后续研究验证 | 探究糖酵解关键酶BPGM在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌组织、小鼠DEN诱导肝癌模型、肝癌细胞系、肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱 | 基因敲除小鼠模型、细胞过表达模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、临床样本数据 | 临床肝癌组织样本、DEN诱导的肝细胞特异性Bpgm敲除小鼠模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-04-04 |
Conversion of Transplanted Mature Hepatocytes into Afp+ Reprogrammed Cells for Liver Regeneration After Injury
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517126
PMID:41609487
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研究论文 | 本研究揭示了移植的成熟肝细胞通过转化为甲胎蛋白阳性重编程肝细胞（Afp rHeps）来驱动肝脏再生的分子机制 | 首次通过整合单细胞多组学分析，揭示了移植肝细胞转化为Afp+重编程细胞的动态过程，并发现了PPARγ/AFP代谢轴和TNF-α/AP-1有丝分裂信号这两个可调控的再生治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类肝脏再生中的适用性仍需进一步验证 | 探究移植成熟肝细胞驱动肝脏再生的细胞与分子机制 | 移植的成熟肝细胞及其在损伤肝脏微环境中的命运转变 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序, 单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-04-04 |
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708613
PMID:41890091
|
研究论文 | 本研究探讨了女性诱导多能干细胞在CRISPR基因编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应 | 首次系统研究了CRISPR编辑和神经分化对女性iPSC中XCI侵蚀的影响，揭示了其对X连锁和常染色体基因表达的影响机制 | 研究仅基于有限供体细胞系（4个）和编辑基因（66个），可能无法完全代表所有情况 | 探究女性iPSC在CRISPR编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应及其对差异表达基因分析的混淆影响 | 女性诱导多能干细胞及其衍生的神经细胞 | 单细胞转录组学 | 神经发育障碍 | CRISPR基因编辑，RNA-seq | NA | 转录组数据 | 数百个CRISPR编辑的女性iPSC细胞系（来自4个供体，涉及66个基因），以及iPSC衍生神经细胞的单细胞RNA-seq数据（涉及42个编辑基因） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-04-04 |
Bayesian Hyperspherical Graph Mixture-of-Experts Deciphers Cell-Cell Interaction in Spatial Transcriptomics
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3660060
PMID:41628049
|
研究论文 | 本文提出了一种名为B-HGME的无监督贝叶斯框架，用于从空间转录组数据中联合推断空间域和细胞-细胞相互作用网络 | 提出了首个结合超球面嵌入和贝叶斯混合专家模型的框架，用于无监督地推断具有方向性和长程性的细胞-细胞相互作用，并提供了原则性的不确定性量化 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一种计算框架，以无监督和可解释的方式从空间转录组数据中准确推断细胞-细胞相互作用和空间域 | 空间转录组数据中的细胞及其相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯超球面图混合专家模型 | 空间转录组数据 | 来自六个主要空间转录组平台的多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-04-04 |
Molecular profiling of sacral chordomas through methylation, spatial transcriptomics and multiplexed immunofluorescence
2026-Mar, ESMO rare cancers
DOI:10.1016/j.esmorc.2025.100115
PMID:41924303
|
研究论文 | 本研究通过DNA甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术，对骶骨脊索瘤的分子异质性进行了综合分析 | 首次结合甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术，揭示了骶骨脊索瘤中与复发相关的独特表观遗传特征，并识别了免疫检查点标记物TIM3、CD47和PD-1的表达模式 | 研究为回顾性设计，样本量相对较小（29例患者），且缺乏功能验证实验 | 探究骶骨脊索瘤的分子异质性和肿瘤微环境特征 | 骶骨脊索瘤患者及其存档组织 | 数字病理学 | 脊索瘤 | DNA甲基化分析，空间转录组学，多重免疫荧光 | 无监督聚类，多元线性回归分析 | 甲基化数据，空间基因表达数据，免疫荧光图像数据 | 29例骶骨脊索瘤患者 | NA | 空间转录组学 | Digital Spatial Profiler (DSP) | NA |
| 109 | 2026-04-04 |
scDBic: a novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag095
PMID:41746287
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法，专门用于分析单细胞RNA测序数据，以改善细胞聚类性能并识别关键基因 | scDBic结合了深度自编码器进行细胞聚类、基因聚类以及使用反向策略识别关键基因簇，解决了传统聚类算法在捕获局部一致性和双聚类算法在细胞丢失、高维数据适应性及迭代选择方面的不足 | NA | 开发一种针对单细胞RNA测序数据的深度学习双聚类算法，以更有效地发现细胞群并识别其关键基因 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-04-04 |
Transient activation of potent progenitor cells is required for spinal cord regeneration
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703854
PMID:41924399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和遗传谱系追踪，揭示了成年斑马鱼脊髓损伤后表达特定基因的祖细胞的分子多样性和贡献，并发现Bach1转录因子作为双功能调控开关控制祖细胞的瞬时激活与静息恢复 | 首次系统鉴定斑马鱼脊髓再生中关键祖细胞的分子身份和命运贡献，并发现Bach1作为双功能转录因子调控损伤后祖细胞激活与再生后静息恢复的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，哺乳动物脊髓再生的机制可能不同；单细胞测序样本量有限，需进一步验证 | 探究脊髓损伤后神经再生的细胞与分子机制 | 成年斑马鱼脊髓中的祖细胞群体 | 发育生物学与再生医学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、遗传谱系追踪、转录因子筛选 | NA | 单细胞转录组数据、遗传谱系数据 | 未明确样本数量，但涉及稳态和再生脊髓组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-03-01 |
Single-cell RNA sequencing of adenoid cystic carcinoma of the breast reveals cellular heterogeneity and tumor microenvironment features
2026-Feb-27, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-026-02329-2
PMID:41761191
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2026-04-04 |
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07287-3
PMID:41761269
|
研究论文 | 本研究揭示了在疟疾感染中，TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 | 首次揭示了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中调控巨噬细胞功能的新机制，并证明Tim-3在巨噬细胞上的保护性作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中得到验证 | 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及其上游调控机制 | 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-02-28 |
Integrative analysis of single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, and proteomic data identified NOTCH3 as a hub gene contributing to human intervertebral disc fibrosis
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40696-z
PMID:41748750
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2026-04-04 |
Tumor-infiltrating lymphocytes demonstrate potent anti-tumor efficacy and synergize with PD-1 blockade in bladder cancer
2026-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07924-6
PMID:41749249
|
研究论文 | 本研究评估了从膀胱癌患者中分离并扩增的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的抗肿瘤功效，并探索了其与PD-1抑制剂Nivolumab联用的协同效应 | 首次在膀胱癌中系统评估TIL的扩增、表型特征及其与PD-1阻断的协同抗肿瘤作用，并利用患者来源类器官（PDO）作为功能评估平台 | 研究样本量有限（48例），且体内验证仅使用了细胞系来源的异种移植模型，缺乏患者来源的异种移植模型验证 | 评估TIL在膀胱癌中的抗肿瘤潜力及其与免疫检查点抑制剂联用的协同疗效 | 膀胱癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞、膀胱癌细胞系、患者来源的膀胱癌类器官 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、细胞活力检测、细胞因子释放测定、细胞凋亡检测 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、流式细胞术数据、体外功能测定数据 | 48例膀胱癌患者样本（其中33例成功扩增TIL） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-04-04 |
Single-cell hdWGCNA and experimental validation identify an innovative T-cell-associated prognostic model and immune microenvironment in lung adenocarcinoma with lymph node metastasis
2026-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15649-4
PMID:41742055
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，构建了一个基于T细胞相关基因（CD69、GOLGA8A、IL16）的预后模型，用于评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后 | 首次结合单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）构建T细胞相关预后模型，并整合临床变量提升模型可解释性 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量可能有限，且实验验证主要在细胞系中进行，需进一步临床验证 | 建立基于T细胞的预后模型，评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后并优化治疗策略 | 淋巴结转移性肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、差异表达分析、Cox/LASSO回归、qRT-PCR、免疫组化、多重免疫荧光 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-04-04 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195917
PMID:41433107
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后的再神经支配模型，揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了多种不同的施万细胞亚型，包括一个在去神经-再神经循环中起关键作用的终末施万细胞亚型，并确定了SPP1信号通路是调节神经肌肉接头动态、促进施万细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调控因子 | 未在摘要中明确说明 | 阐明肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞 | 单细胞组学 | 神经肌肉疾病、神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
|
研究论文 | 本研究构建了家蚕翅盘10个时间点的时空单细胞图谱，揭示了20-羟基蜕皮酮驱动的发育重编程过程 | 首次构建家蚕翅盘的高分辨率时空单细胞图谱，提出基因转换模型描述渐进性命运决定过程，并发现20-羟基蜕皮酮可在数小时内加速发育进程 | 研究主要基于家蚕模型，结论在其他昆虫中的普适性有待验证 | 解析昆虫翅发育的时空调控逻辑和激素驱动机制 | 家蚕翅盘细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞核RNA测序（snRNA-seq），空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 10个时间点的家蚕翅盘样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-04-04 |
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00657-8
PMID:41714655
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研究论文 | 本研究开发了一个计算流程，整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，用于校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 | 首次提出利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据校准组织水平机制模型的计算框架，结合了近似贝叶斯计算和梯度优化方法 | 仅使用两个开源人类皮肤数据集作为案例研究，尚未在其他组织或疾病模型中验证 | 开发一个整合现代转录组学数据的计算框架，用于校准组织水平的配体动力学机制模型 | 人类皮肤组织中的转化生长因子β配体动力学 | 计算生物学 | 组织修复与纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 偏微分方程模型, 近似贝叶斯计算, 梯度优化 | 转录组数据, 空间数据 | 两个开源人类皮肤数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-02-17 |
IL-8 positive cancer-associated fibroblasts drive breast cancer progression and immune evasion: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2026-Feb-16, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15716-w
PMID:41692739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2026-04-04 |
STING-induced blood-brain barrier opening combined with radiotherapy potentiates antitumor response in a high-grade glioma model
2026-Feb-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198843
PMID:41697735
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研究论文 | 本研究探讨了STING激动剂8803联合放疗在高级别胶质瘤模型中的抗肿瘤效果及其机制 | 首次揭示了8803通过改变内皮细胞中的Pecam和Cd147通路来重编程血脑屏障，并诱导双侧血脑屏障开放长达24小时，同时使用[18F]-FLT PET纵向可视化STING激活过程 | 研究仅在两种小鼠胶质瘤模型（CT-2A和QPP8v）中进行，其中辐射抵抗的QPP8v模型未显示长期生存获益，且机制研究部分发现Nos2敲除小鼠中治疗效果仍维持，提示可能存在其他未知机制 | 评估STING激动剂8803联合放疗在高级别胶质瘤治疗中的潜力，并阐明其治疗活性的潜在机制 | 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，PET成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | C57BL/6J小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |