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当前共找到 41240 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-07-05
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种用于分析成分高通量测序数据的差异丰度检验方法cosmoDA 将α-β幂相互作用模型扩展以包含协变量信息,并结合广义分数匹配估计框架,开发出可减少相关特征导致的假阳性发现的差异丰度检验方案 未明确提及 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖性并降低相关特征假阳性率的差异丰度检验方法 成分高通量测序数据,包括单细胞RNA-Seq和扩增子测序数据 机器学习 NA RNA-seq, 扩增子测序 α-β幂相互作用模型 成分计数数据 模拟数据和真实数据 NA 单细胞RNA-seq, 扩增子测序 NA NA
102 2026-07-05
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq revealed key genes for bone metastasis and chemoresistance in prostate cancer
2024-12, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示前列腺癌骨转移和化疗耐药的关键基因LDHA 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,系统识别出LDHA作为前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的关键基因,并通过细胞实验验证其功能 未提及具体的样本量和多中心验证,可能缺乏临床样本的进一步验证 探究前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的分子机制 前列腺癌相关基因和细胞系,包括PCa细胞和破骨细胞分化相关基质 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, TRAP染色 Lasso回归模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
103 2026-07-05
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、显微成像和蛋白质组学分析,研究免疫检查点抑制剂相关心肌炎在心脏、血液和肿瘤中的免疫反应 揭示了免疫检查点抑制剂相关心肌炎(irMyocarditis)中细胞毒性T细胞、传统树突状细胞和炎症性成纤维细胞在心脏组织中的共定位及频率增加,并发现心脏扩增的TCR克隆不识别假定的心脏自身抗原,且与肿瘤组织中的TCR库重叠性低 样本量有限(28例患者和41例健康对照),且未深入探讨心脏扩增TCRs与致命性心肌炎病例之间的具体机制 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系,并识别潜在生物标志物 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体的心脏、肿瘤和血液样本 数字病理学 免疫相关心肌炎 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 多重显微成像, 蛋白质组学分析 NA 图像, 文本, 蛋白质组数据 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体(包括心脏细胞84,576个,血细胞366,066个) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA和TCR测序;Illumina NovaSeq用于测序
104 2026-07-05
Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells
2024-11-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 发现Egfl6通过与β3整合素结合并激活p38和SYK信号,作为趋化因子促进髓系细胞迁移并使其分化至免疫抑制状态,从而推动卵巢癌进展 首次鉴定Egfl6作为髓系细胞功能的调节因子,阐明其通过β3整合素-p38/SYK信号轴促进肿瘤免疫抑制的机制,并证明Egfl6中和抗体可恢复抗PD-L1疗法的疗效 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,需进一步验证Egfl6在其他癌症类型中的作用及临床转化潜力 研究Egfl6在卵巢癌中调节肿瘤相关髓系细胞免疫抑制功能的机制 卵巢癌小鼠模型及人类卵巢癌组织样本 机器学 卵巢癌 NA NA NA 人类卵巢癌组织样本(未明确数量)及小鼠模型(同基因型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
105 2026-07-05
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-10-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 在PTEN缺失的胶质母细胞瘤模型中,双重靶向巨噬细胞和小胶质细胞是一种治疗脆弱性 首次发现巨噬细胞与微胶质细胞在GBM肿瘤微环境中呈负相关,并揭示LOX抑制通过NF-κB-PATZ1通路上调OLFML3表达,导致微胶质细胞代偿性浸润 未在人类临床试验中验证,仅限于小鼠模型 探究PTEN缺失型胶质母细胞瘤中巨噬细胞和微胶质细胞的相互作用及双重靶向的治疗潜力 PTEN缺失的胶质母细胞瘤小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞和微胶质细胞 数字病理学 脑癌 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光 NA 转录组数据、免疫荧光图像 PTEN缺失型GBM小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
106 2026-07-05
Endothelial YAP/TAZ activation promotes atherosclerosis in a mouse model of Hutchinson-Gilford progeria syndrome
2024-10-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞YAP/TAZ激活促进HGPS小鼠动脉粥样硬化 首次阐明内皮YAP/TAZ信号通路在HGPS血管病理中的关键作用,为开发靶向YAP/TAZ药物治疗早衰症相关动脉粥样硬化开辟新途径 未介绍 探究HGPS血管病变的分子机制,特别是内皮细胞中YAP/TAZ通路的作用 表达早衰蛋白的LmnaG609G/G609G小鼠及野生型对照小鼠的主动脉样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA-seq,原子力显微镜,超声评估 NA 基因表达数据,力学数据,超声图像 未明确样本数量,涉及HGPS模型小鼠和野生型对照小鼠 未明确 单细胞RNA-seq 未明确 未明确
107 2026-07-05
UnTWISTing intestinal fibrosis: single-cell transcriptomics deciphers fibroblast heterogeneity, uncovers molecular pathways, and identifies therapeutic targets
2024-09-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示肠道纤维化中成纤维细胞异质性、分子通路并识别治疗靶点 首次鉴定出TWIST1+FAP+成纤维细胞亚群与CXCL9+巨噬细胞的相互作用,并发现TWIST1是纤维化微环境的关键调节因子 NA 解析肠道纤维化的细胞和分子机制 克罗恩病相关的肠道纤维化组织中的成纤维细胞和巨噬细胞 数字病理学 克罗恩病, 肠道纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
108 2026-07-05
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-09-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 PAC1通过促进ILC2中的CGRP信号传导来约束2型炎症 发现PAC1以细胞内在方式选择性促进ILC2对CGRP信号的响应,并揭示其在2型炎症相关疾病中的调控作用 NA 探究ILC2如何内在调控对神经信号的响应及其在2型炎症中的作用 小鼠和人体的2型先天淋巴样细胞(ILC2s) NA 哮喘、肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型和人体外周血ILC2样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
109 2026-07-05
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病肠道纤维化发病机制中TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 首次鉴定出FAP+成纤维细胞是纤维化肠道中ECM产生最多的关键亚型,并发现TWIST1作为潜在治疗靶点 未提及具体局限性 阐明克罗恩病肠道纤维化的细胞和分子机制 克罗恩病伴肠梗阻患者的纤维化和非纤维化回肠组织 数字病理学 克罗恩病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
110 2026-07-05
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-04, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析新鲜或冷冻组织中的细胞,发现冷冻会激活应激和活化相关基因表达 首次系统比较新鲜与冷冻组织单细胞RNA测序数据,揭示冷冻过程对细胞转录组的特异性影响模式 主要聚焦于T细胞、ILC和NK细胞亚群,其他免疫细胞类型可能具有不同冷冻敏感性 评估冷冻保存对单细胞RNA测序结果的影响 人类组织中的T细胞、固有淋巴细胞(ILC)和自然杀伤(NK)细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
111 2026-07-05
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 描述了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 首次在转录组水平上深入表征调节性B细胞,超越了表面标志物的传统方法 未提供实验结果的验证或大规模样本分析 建立调节性B细胞的分离方案以进行单细胞转录组分析,探究其在自身免疫和癌症免疫中的作用 从狼疮易感小鼠中分离的调节性B细胞 自然语言处理 自身免疫性疾病(狼疮) 单细胞RNA测序 NA 转录组数据(单细胞RNA测序) 狼疮易感MRL/lpr小鼠(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序
112 2026-07-05
Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了肥大细胞标志基因特征,用于肺腺癌的预后和免疫治疗反应预测 首次基于单细胞测序鉴定肥大细胞特异性标志基因,并构建了包含九种肥大细胞相关基因的预后特征,用于肺腺癌患者风险分层和免疫治疗反应预测 未提及外部验证队列中不同种族或地理区域的差异,且未对特征基因的生物学机制进行深入体内验证 评估肥大细胞在肺腺癌预后及免疫治疗反应预测中的作用 肺腺癌患者的肿瘤组织样本和公开数据集 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习预测模型(基于九种基因特征的预后评分模型) 单细胞转录组数据和批量转录组数据 涉及训练集和四个外部验证集,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
113 2026-07-04
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-Sep-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示昼夜节律紊乱通过TREM2+巨噬细胞介导的骨吸收加剧牙周炎的机制 首次发现TREM2+巨噬细胞亚群在昼夜节律紊乱条件下选择性扩增,并建立BMAL1-TREM2调控轴,揭示昼夜节律紊乱通过破坏该时间门控机制导致持续性TREM2过表达和骨吸收 研究主要基于小鼠模型,未在人体组织中验证该机制;CUT&Tag测序仅限于体外实验,体内直接证据不足 阐明昼夜节律紊乱如何感知并转化为局部炎症性骨丢失的分子机制 CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织及巨噬细胞亚群 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序、CUT&Tag测序 NA 单细胞转录组数据 CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织样本(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
114 2026-07-04
METTL3 depletion mitigates hypoxic pulmonary arterial smooth muscle cell over-proliferation via YTHDF2-dependent regulation of FOXO1 mRNA N6-methyladenosine modification: a potential mechanism of hypoxic pulmonary hypertension
2026-Sep-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本文探究了METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖的作用及其分子机制 首次发现METTL3-YTHDF2-FOXO1轴通过调控FOXO1 mRNA的m6A甲基化修饰驱动低氧性肺动脉平滑肌细胞增殖,为肺动脉高压治疗提供新靶点 NA 阐明METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖中的作用 人肺动脉高压组织、平滑肌特异性Mettl3敲除小鼠、低氧性肺动脉高压模型、人肺动脉平滑肌细胞 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序, MeRIP-qPCR, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
115 2026-07-04
Myeloid Piezo1 Drives Cardiac Repair Through Orai1-Rac1-Dependent Efferocytosis
2026-Jul-06, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究揭示了髓系Piezo1通过Orai1-Rac1依赖的胞葬作用驱动心肌修复的机制 首次发现Piezo1-Orai1-Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬作用和溶酶体成熟,改善心肌梗死后的心脏功能 未在人类样本中验证该信号轴,且未探讨其他细胞类型(如成纤维细胞)的潜在作用 阐明髓系Piezo1在心肌梗死后心脏修复中的功能及分子机制 髓系Piezo1特异性敲除小鼠及骨髓来源的巨噬细胞 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、实时PCR、膜片钳、Western blot 小鼠基因敲除模型(Piezo1ΔLysM) 基因表达数据、钙成像数据、蛋白质数据 未明确样本量,涉及小鼠(n未具体说明)及体外细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞胞葬相关基因表达
116 2026-07-04
Hypoxia Induces Adaptive Lymphangiogenesis via Cd74 and Vegfr3 to Modulate Pulmonary Hypertension
2026-Jul-06, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究发现缺氧通过Cd74和Vegfr3信号轴诱导适应性淋巴管生成,调节肺动脉高压,并揭示CD74-VEGFR3信号轴在淋巴内皮细胞中的新作用 首次发现淋巴管生成在肺动脉高压中起保护作用,并揭示CD74-VEGFR3信号轴在淋巴内皮细胞中的新功能 研究主要基于小鼠和大鼠模型,人类数据来自公开单细胞RNA测序数据集,可能需要更多验证 探究肺淋巴管在肺动脉高压病理和血管重塑中的作用 肺动脉高压患者和肺高压模型小鼠、大鼠的淋巴内皮细胞 计算机视觉 肺心血管疾病 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 基因编辑 NA 图像, 文本 小鼠和大鼠模型,以及人特发性肺动脉高压肺组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
117 2026-07-04
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
研究论文 开发了一个名为TranscriptFormer的生成式基础模型,该模型在跨越12个物种、涵盖15.3亿年进化的1.12亿个细胞上进行了训练,以实现跨物种的单细胞转录组比较 首次训练了一个覆盖1.53亿年进化历程的生成式基础模型,能够在无需明确训练的情况下自然涌现发育轨迹、系统发育关系和细胞层次结构,并实现了零样本疾病状态识别 未提及模型在更广泛物种或多样性较低的场景中的泛化能力,以及计算资源和训练数据的潜在偏差 建立跨物种单细胞转录组比较的通用框架,揭示细胞组织的普遍原则 12个物种的单细胞转录组数据,包括人类、小鼠等,覆盖15.3亿年进化 机器学习 NA 单细胞转录组测序 生成式基础模型(Transformer) 单细胞转录组数据 1.12亿个细胞,来自12个物种 NA 单细胞RNA测序 NA NA
118 2026-07-04
Evolving strategies for lineage tracing: Genetic markers, synthetic barcodes, and natural variants
2026-Jul-02, Cell stem cell IF:19.8Q1
综述 综述了谱系追踪从遗传标记、合成条形码到自然变异的方法演变及其与多组学和空间分析的整合 系统梳理了谱系追踪的三大方法支柱及其与多组学和空间分析整合的最新进展,并提供了实验设计的系统指南 未涉及具体技术细节或定量比较不同方法的性能,可能缺乏实际应用中的验证数据 综述谱系追踪策略的演变及其在细胞命运决定机制研究中的应用 谱系追踪方法及其在细胞命运分析中的实验设计 机器学习和计算生物学 不适用 单细胞测序、基因组编辑、合成条形码、自然变异分析 不适用 多组学数据、空间转录组学数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 不适用 不适用
119 2026-07-04
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2026-07, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 提出scMapNet方法,通过视觉迁移学习与表格到图像转换,实现基于标记基因的scRNA-seq数据细胞类型注释 采用掩码自编码器(MAE)和视觉变换器(ViT)结合树图变换,充分利用细胞标记知识和未标记数据信息进行自监督学习 未提及具体限制,可能涉及对大型未标记数据的预训练依赖或标记基因选择的敏感性 开发一种能有效学习细胞标记知识和未标记数据信息的深度学习细胞类型注释方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 掩码自编码器(MAE)和视觉变换器(ViT) 表格数据(单细胞基因表达矩阵) 多种数据集,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
120 2026-07-04
The constitutive 20S proteasome is required for the maintenance and differentiation of spermatogonia in mice
2026-07, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 研究表明组成型20S蛋白酶体对小鼠精原细胞的维持和分化至关重要 首次揭示组成型PSMA7蛋白酶体在精原细胞维持和分化中的关键作用,并发现PSMA8的过表达可补偿PSMA7缺失的功能 未明确说明 探究组成型20S蛋白酶体在精子发生过程中的功能 小鼠精原细胞 机器学习 不适用 条件性基因敲除 不适用 单细胞RNA测序数据 小鼠生殖细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
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