单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-05-13	Identification of potential drug targets for pelvic organ prolapse using a proteome-wide Mendelian randomization approach 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92800-4 PMID:40064973	research paper	通过蛋白质组范围的孟德尔随机化方法识别盆腔器官脱垂的潜在药物靶点	首次使用蛋白质组范围的孟德尔随机化方法识别EFEMP1和MFAP4作为盆腔器官脱垂的潜在药物靶点	研究基于FinnGen队列数据，可能受限于该队列的样本多样性和代表性	探索盆腔器官脱垂的新治疗靶点	盆腔器官脱垂患者	生物医学研究	盆腔器官脱垂	蛋白质组范围的孟德尔随机化分析(PW-MR)、贝叶斯共定位分析、单细胞RNA测序、分子对接分析	NA	蛋白质组数据、RNA测序数据	FinnGen队列数据
102	2025-05-13	Transcriptome combined with single-cell sequencing explored prognostic markers associated with T cell exhaustion characteristics in head and neck squamous carcinoma 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91299-z PMID:40065044	研究论文	本研究通过转录组和单细胞测序技术，探索了头颈部鳞状细胞癌中与T细胞耗竭特征相关的预后标志物	构建了头颈部鳞状细胞癌的单细胞图谱，深入分析了T细胞的异质性，并鉴定了与T细胞耗竭相关的五个特征，开发了临床预后模型	虽然绘制了T细胞异质性和分化轨迹，但这些亚群之间的相互关系仍不清楚，需要进一步研究阐明具体的生物过程和分子进化机制	增强头颈部鳞状细胞癌免疫治疗方法的疗效，改善患者预后	头颈部鳞状细胞癌中的T细胞	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	转录组测序, 单细胞测序	临床预后模型	基因表达数据	NA
103	2025-05-13	Imbalance of bladder neurohomeostasis by Myosin 5a aggravates diabetic cystopathy 2025-Mar-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-025-01140-6 PMID:40065210	研究论文	本研究探讨了Myosin 5a在糖尿病性膀胱病变(DCP)中的潜在调控作用	首次揭示了Myosin 5a在糖尿病性膀胱病变中的调控作用及其与膀胱过度活动的关联	研究主要基于动物模型，结果在人体中的适用性尚需验证	探究Myosin 5a是否在糖尿病性膀胱病变中发挥潜在调控作用	糖尿病大鼠的膀胱组织和Myosin 5a缺陷型DBA小鼠	神经生物学	糖尿病性膀胱病变	单细胞RNA测序、尿动力学评估、免疫组织化学	动物模型(糖尿病大鼠和DBA小鼠)	基因表达数据、生理功能数据	未明确说明具体样本数量，使用了糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷型DBA小鼠
104	2025-05-13	Prognostic implications and characterization of tumor-associated tertiary lymphoid structures genes in pancreatic cancer 2025-Mar-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06152-8 PMID:40065365	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤相关三级淋巴结构(TA-TLS)基因的表达特征及其预后意义，并构建了一个基于TLS基因的风险评估模型	首次在PDAC中整合转录组和临床数据，通过共识聚类识别了三种分子亚型，并开发了基于TLS基因的评分系统和风险模型，同时探索了关键基因DNASE1L3的抗肿瘤机制	研究主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床适用性	增强PDAC免疫治疗的有效性	胰腺导管腺癌(PDAC)患者	数字病理学	胰腺癌	转录组分析、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、LASSO回归、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化(IHC)、基因集富集分析(GSEA)	风险评估模型	转录组数据、临床数据	310名PDAC患者
105	2025-05-13	Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in the aortas of Takayasu arteritis 2025-Mar-10, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-025-03523-w PMID:40065428	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示大动脉炎患者主动脉中的细胞异质性	首次在大动脉炎患者主动脉组织中鉴定出11种主要细胞类型，并揭示了T细胞、B细胞、巨噬细胞等细胞亚型特异性基因表达特征及其在疾病发病机制中的活跃参与	样本量较小（仅3例TAK患者），且对照数据来自公开数据库	揭示大动脉炎的发病机制并发现潜在治疗靶点	大动脉炎患者的主动脉组织和外周血T细胞	数字病理学	大动脉炎	单细胞转录组分析、批量RNA测序	NA	转录组数据	3例TAK患者的主动脉标本，8例TAK患者和8例健康志愿者的外周血T细胞
106	2025-05-13	Exploring the "chemo" in chemoimmunotherapy for triple-negative breast cancer 2025-Mar-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.02.016 PMID:40068590	research paper	本文通过单细胞RNA测序比较了三阴性乳腺癌在PD-L1抑制剂atezolizumab联合紫杉醇或白蛋白结合型紫杉醇治疗下的免疫细胞动态变化	发现了独特的T细胞激活模式，并突出了白蛋白结合型紫杉醇组合中肥大细胞在免疫激活中的独特作用	NA	探索三阴性乳腺癌化学免疫治疗中的'化学'作用机制	三阴性乳腺癌患者	digital pathology	triple-negative breast cancer	single-cell RNA sequencing	NA	RNA-seq数据	NA
107	2025-05-13	PRMT5 highly expressed on CD16 + CD56- natural killer cells is correlated with NK cells exhaustion in colorectal cancer mesenchyme 2025-Mar-08, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-03981-w PMID:40056169	研究论文	研究结直肠癌微环境中自然杀伤细胞（NK细胞）表型变化与重要免疫检查点表达的关系	首次发现PRMT5和SIGIRR在CD16+CD56- NK细胞中的高表达与NK细胞功能衰竭相关	样本量有限（194例患者），且未涉及其他癌症类型的验证	探究结直肠癌微环境中NK细胞表型变化与免疫检查点表达的关联	结直肠癌患者的肿瘤微环境中的NK细胞	肿瘤免疫学	结直肠癌	免疫组化染色、多重免疫组化、单细胞测序	NA	蛋白质表达数据、单细胞测序数据	194例确诊为结直肠癌的患者
108	2025-05-13	Individualized therapy guided by single-cell sequencing in anti-GABAAR encephalitis 2025-Mar-08, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-025-03300-y PMID:40057475	研究论文	本研究通过单细胞测序技术指导抗GABAAR脑炎的个体化治疗	首次在抗GABAAR脑炎患者中发现单克隆CD8 T细胞群和异常的JAK-STAT信号通路，并鉴定出LMO5蛋白在激活特定CD8 T细胞中的作用	研究仅基于单个病例，结果需要更大样本验证	探索抗GABAAR脑炎的发病机制并开发个体化治疗方案	抗GABAAR脑炎患者和健康志愿者的外周血单个核细胞(PBMCs)和脑脊液细胞	数字病理学	脑炎	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	1名患者和4名健康志愿者的PBMCs样本
109	2025-05-13	Microbial metabolites control self-renewal and precancerous progression of human cervical stem cells 2025-Mar-08, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57323-6 PMID:40057497	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序和器官培养系统，揭示了人类宫颈干细胞的自我更新和早期肿瘤发生的调控机制	发现了乳酸杆菌衍生的乳酸通过PI3K-AKT通路和YAP1调控宫颈干细胞的自我更新和早期肿瘤发生	研究主要关注宫颈干细胞的体外模型，未涉及完整的体内环境	探索宫颈干细胞的调控机制及其在宫颈健康和疾病中的作用	人类和小鼠的宫颈干细胞	细胞生物学	宫颈癌	单细胞RNA测序、器官培养系统	NA	RNA测序数据、器官培养数据	未明确说明样本数量，但涉及人类和小鼠的宫颈干细胞
110	2025-05-13	IL-19 as a promising theranostic target to reprogram the glioblastoma immunosuppressive microenvironment 2025-Mar-08, Journal of biomedical science IF:9.0Q1 DOI:10.1186/s12929-025-01126-w PMID:40057744	研究论文	该研究探讨了IL-19作为胶质母细胞瘤免疫抑制微环境的重编程靶点的潜力	发现IL-19是一种预测的免疫抑制细胞因子，并通过新型纳米颗粒CHOL-PEG-SPIO-IL-19实现了诊断和治疗的一体化	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证	改善胶质母细胞瘤的临床治疗效果，逆转免疫抑制和限制肿瘤细胞的侵袭性	胶质母细胞瘤患者样本、小鼠模型和体外培养的肿瘤细胞	数字病理学	胶质母细胞瘤	RNA测序、基因集富集分析(GSEA)、单细胞RNA测序、CRISPR基因编辑、动态光散射、透射电子显微镜、傅里叶变换红外光谱、普鲁士蓝检测、磁共振成像(MRI)	CRISPR Il-19-/-细胞系、Il-19-/-小鼠模型	基因组数据、RNA测序数据、影像数据	来自台湾胶质母细胞瘤队列和TCGA的患者肿瘤样本，以及小鼠模型
111	2025-05-13	Extraction of a stromal metastatic gene signature in breast cancer via spatial profiling 2025-Mar-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-025-03353-3 PMID:40065328	研究论文	通过空间转录组学分析乳腺癌原发灶和转移灶的转录特征，识别出一个基质转移特征	首次利用空间转录组学技术研究乳腺癌转移灶的基质特征，并验证了其作为预后工具的潜力	研究样本量有限，需要在更大规模数据集中进一步验证	识别乳腺癌转移的分子特征	乳腺癌原发灶和转移灶	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	NA	转录组数据	代表性微区域样本集（具体数量未说明）
112	2025-05-13	Immunomodulatory role of the stem cell circadian clock in muscle repair 2025-Mar-07, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adq8538 PMID:40043110	research paper	本研究探讨了肌肉干细胞中生物钟如何调控免疫微环境以促进肌肉再生	揭示了肌肉干细胞生物钟通过NAD代谢调控炎症基因的昼夜节律性表达，并发现CCL2介导的干细胞-中性粒细胞互作具有时间依赖性	未明确说明实验所用动物模型的具体种类和数量	探究昼夜节律如何通过干细胞代谢调控肌肉再生过程中的免疫微环境	肌肉干细胞及其免疫调控功能	细胞生物学	肌肉损伤修复	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA
113	2025-05-13	Transcriptomic profiling reveals mechanism, therapeutic potential, and prognostic value of cancer stemness characteristic in nasopharyngeal carcinoma 2025-Mar-07, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-025-01561-w PMID:40053129	研究论文	通过转录组分析揭示鼻咽癌中癌症干性特征的作用机制、治疗潜力及预后价值	首次结合单细胞RNA-seq和大规模转录组数据集，利用生物信息学和机器学习技术，识别并验证了与鼻咽癌干性相关的特征（STEM-signature），并发现了四种增强鼻咽癌细胞干性特征的miRNA	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分较少，且样本量可能不足以代表所有鼻咽癌患者	探究鼻咽癌干性特征的机制及其在治疗和预后中的潜在价值	鼻咽癌细胞及其干性特征	生物信息学	鼻咽癌	单细胞RNA-seq, 转录组分析, LASSO Cox回归模型	LASSO Cox回归模型	RNA-seq数据, 转录组数据	未明确说明具体样本数量，但涉及单细胞和批量转录组数据集
114	2025-05-13	Engineered mesenchymal stromal cells with bispecific polyvalent peptides suppress excessive neutrophil infiltration and boost therapy 2025-Mar-07, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adt7387 PMID:40053594	研究论文	该研究通过工程化改造间充质基质细胞（MSCs），使其携带双特异性多价肽，有效抑制中性粒细胞过度浸润并增强治疗效果	利用DNA自组装技术构建双特异性多价肽修饰的MSCs，提高其归巢效率并抑制中性粒细胞浸润	研究仅在小鼠急性肝衰竭模型中验证，尚未在人类疾病中进行测试	提高MSCs在治疗炎症性疾病中的治疗效果	间充质基质细胞（MSCs）和中性粒细胞	细胞治疗	肝病	DNA自组装技术、单细胞RNA测序	小鼠急性肝衰竭模型	基因表达数据	NA
115	2025-05-13	Genetically encoded tension heterogeneity sculpts cardiac trabeculation 2025-Mar-07, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.ads2998 PMID:40053597	research paper	研究心肌细胞命运决定机制及其在心肌模式形成中的作用	揭示了心肌细胞命运决定的遗传和细胞相互作用机制，特别是通过单细胞RNA测序和活体成像技术观察到表达变异与心肌小梁命运的关联	未提及具体样本数量，可能影响结果的普遍性	探究心肌细胞命运决定的机制及其在心肌模式形成中的作用	心肌细胞	分子生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序、基因编码生物传感器、活体成像	NA	基因表达数据、影像数据	NA
116	2025-05-13	Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing to predict prognosis and therapeutic response for colorectal cancer 2025-Mar-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91761-y PMID:40055390	研究论文	通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一个预测结直肠癌预后和治疗反应的新模型	结合单细胞和批量RNA测序数据构建预后模型，并识别出与免疫相关的关键基因和通路	研究依赖于公开数据库的数据，未进行实验验证	理解结直肠癌的分子机制，识别有效的预后标志物和潜在治疗靶点	结直肠癌患者	生物信息学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序	LASSO回归模型	RNA测序数据	来自GEO（GSE221575）和TCGA数据库的数据
117	2025-05-13	CTSO and HLA-DQA1 as biomarkers in sepsis-associated ARDS: insights from RNA sequencing and immune infiltration analysis 2025-Mar-07, BMC infectious diseases IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12879-025-10726-8 PMID:40055592	研究论文	本研究通过RNA测序和免疫浸润分析，探讨了溶酶体相关基因与脓毒症免疫微环境中溶酶体变化之间的关联	首次从生物信息学角度深入研究了溶酶体相关基因与脓毒症免疫微环境变化的关系，并鉴定了CTSO和HLA-DQA1作为脓毒症相关ARDS的生物标志物	脓毒症的病因复杂多样，且ARDS的病因也相当复杂，可能影响研究结果的普适性	探讨脓毒症中溶酶体相关基因与免疫微环境变化的关系，寻找新的临床诊断和治疗靶点	脓毒症患者及其免疫微环境	生物信息学	脓毒症	RNA测序、单细胞测序、GSEA、WGCNA	免疫浸润模型	基因表达数据	NA
118	2025-05-13	Extracellular vesicular delivery of ceramides from pulmonary macrophages to endothelial cells facilitates chronic obstructive pulmonary disease 2025-Mar-07, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02125-y PMID:40055817	研究论文	本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中，肺巨噬细胞通过细胞外囊泡(EVs)传递神经酰胺至内皮细胞(ECs)的新机制	首次发现神经酰胺通过EVs介导的巨噬细胞-内皮细胞间通讯在COPD发病中的作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证有限	探究神经酰胺作为细胞间信号分子在COPD发展中的作用	肺巨噬细胞和内皮细胞	呼吸系统疾病研究	慢性阻塞性肺疾病(COPD)	单细胞RNA测序、质谱脂质组学、透射电镜、纳米颗粒追踪分析	小鼠COPD模型	RNA测序数据、脂质组学数据、显微镜图像	人类肺组织样本、CS暴露小鼠模型
119	2025-05-13	Immunosuppressive microenvironment of liver restrains chemotherapeutic efficacy in triple-negative breast cancer 2025-Mar-06, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010871 PMID:40050043	research paper	该研究探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）肝转移与原发性肿瘤在化疗疗效上的差异及其免疫微环境机制	揭示了肝转移瘤中CD8+T细胞浸润受阻和巨噬细胞活化降低是化疗疗效差的关键机制，并提出通过靶向NETs或激活巨噬细胞来增强化疗效果的新策略	研究主要基于小鼠模型和公共数据库的单细胞RNA测序数据，需要在临床样本中进一步验证	探究TNBC肝转移与原发性肿瘤化疗疗效差异的免疫微环境机制	三阴性乳腺癌（TNBC）的肝转移瘤和原发性肿瘤	肿瘤免疫学	三阴性乳腺癌	单细胞RNA测序、免疫组化、伤口愈合实验、集落形成实验、流式细胞术	小鼠模型	RNA测序数据、图像数据	公共数据库的单细胞RNA测序数据和小鼠模型
120	2025-05-13	Exploring the active ingredients and potential mechanisms of Pingchan granules in Parkinson's disease treatment through network pharmacology and transcriptomics 2025-Mar-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91344-x PMID:40050654	research paper	本研究通过网络药理学和转录组学探讨了平颤颗粒在帕金森病治疗中的活性成分及潜在机制	首次利用网络药理学和转录组学方法揭示了平颤颗粒的多靶点作用机制，并验证了其主要活性成分蝙蝠葛碱对SLC6A3和SRC的强结合能力	研究主要基于计算和体外数据，缺乏体内实验验证	探索平颤颗粒治疗帕金森病的分子机制	平颤颗粒及其活性成分蝙蝠葛碱	网络药理学	帕金森病	网络药理学分析、转录组学分析、分子对接、单细胞测序	随机森林模型	转录组数据、蛋白质相互作用网络数据	NA