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当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-23 |
Neuroprotection following FLASH-RT may be mediated by sustained glutamate receptor AMPAR activation in CA3 neurons
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.725423
PMID:42239092
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了FLASH放疗后CA3神经元的AMPA受体持续激活介导神经保护作用的早期机制 | 首次发现FLASH放疗通过上调Gria基因表达导致AMPAR蛋白水平持续升高，提出钙离子内流和AMPAR持续激活介导长期认知保护的机制 | 未提供具体限制信息 | 阐明FLASH放疗对正常大脑长期神经保护作用的早期机制 | C57BL/6J小鼠脑部CA3和DG区域神经元及神经祖细胞 | 机器学习 | 中枢神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | C57BL/6J小鼠，接受全脑照射，包括1或3次10 Gy剂量，每组照射条件分别采用FLASH（5.6×10 Gy/s）或常规剂量率（0.1 Gy/s） | Nanostring | 空间转录组学 | Nanostring平台 | 空间转录组学分析（Nanostring） |
| 102 | 2026-06-23 |
High-quality acinar cell isolation enables single-cell analysis of healthy and injured pancreas
2026-May-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101415
PMID:42013858
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研究论文 | 开发了一种高效分离高质量腺泡细胞的方法，实现健康和损伤胰腺的单细胞分析 | 提出一种快速消化胰腺组织获得高质量单细胞的方案，克服了腺泡细胞分离困难，实现了对急性胰腺炎模型和胰腺导管腺癌模型中腺泡细胞的全面表征 | 未提及具体局限性 | 开发改善胰腺腺泡细胞分离的方法，以便进行单细胞RNA测序分析 | 小鼠胰腺腺泡细胞 | 数字病理学 | 急性胰腺炎, 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康小鼠胰腺和雨蛙素诱导的急性胰腺炎组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-06-23 |
SpatialArtifacts: a computational framework for tissue artifact detection in spatial transcriptomics data
2026-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.725260
PMID:42239246
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研究论文 | SpatialArtifacts是一个检测空间转录组数据中组织伪影的计算框架，结合MAD离群值检测和数学形态学操作来识别和分类空间连续的伪影区域 | 提出了一种结合MAD离群值检测与数学形态学操作的框架，并利用焦点操作（3×3填充、5×5轮廓和星形连接）保留真实生物域，同时进行边缘与内部伪影、大区域与小区域的层次分类 | NA | 开发用于空间转录组数据中组织伪影检测与分类的计算框架 | 人海马体、背外侧前额叶皮层和结直肠癌组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人海马体、背外侧前额叶皮层和结直肠癌组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x VisiumHD | 10x Visium和VisiumHD平台 |
| 104 | 2026-06-23 |
SOX9 and SEMA7A regulate cell plasticity in the postpartum mammary gland with implications for breast cancer
2026-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725155
PMID:42239249
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析产后乳腺退化过程中SOX9和SEMA7A的表达及其对乳腺癌发展的影响 | 首次发现SOX9和SEMA7A在正常乳腺上皮中的调控轴，并揭示其失调导致间质样去分化状态，且在三阴性乳腺癌中表达升高，增加了雌激素受体阴性和阳性乳腺癌的转移风险 | 研究主要基于小鼠模型和少量人类样本，缺乏大规模临床验证；机制研究仅通过体外细胞实验进行，未开展体内功能验证 | 探究SOX9在产后乳腺退化过程中的作用及其与SEMA7A的关系，并评估其对乳腺癌进展的影响 | 小鼠乳腺组织、正常人类供体乳腺组织样本、乳腺癌数据集 | 机器学习和数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠乳腺组织样本（具体数量未说明）和一组健康人类供体乳腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-06-23 |
Integration of Genome-Wide Association Studies With Single-Cell and Bulk Expression Quantitative Trait Locus to Identify Stroke Susceptibility Genes
2026-May-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.046208
PMID:42003665
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研究论文 | 整合全基因组关联研究与单细胞和批量表达数量性状位点数据，识别中风易感基因 | 首次将单细胞eQTL数据与中风亚型GWAS整合，发现许多新基因，并揭示细胞类型特异性的因果基因 | 未明确说明，但可能受限于单细胞eQTL数据的规模和同质性 | 识别中风易感基因，探索细胞类型特异性因果变异，确定潜在治疗靶点 | 7种脑细胞类型的eQTL数据、5种中风表型的GWAS数据、小鼠中风样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用、药物可及性分析、全表型组关联研究 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-06-23 |
CD163 and Tim-4 identify resident intestinal macrophages that are spatially regulated by TGF-β
2026-May-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240801
PMID:42012484
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，鉴定出CD163和Tim-4作为肠道常驻巨噬细胞的标志物，并发现TGF-β信号在维持其空间分布和特性中起关键作用 | 挑战了肠道巨噬细胞仅存在于肌肉层的传统观念，发现长寿巨噬细胞也存在于固有层，并揭示了TGF-β信号对固有层而非黏膜下/肌肉层巨噬细胞特性的差异化调控 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道巨噬细胞的适用性需进一步验证；实验未完全排除其他肠道微环境因子的潜在影响 | 探究肠道不同组织层中长寿巨噬细胞的表型特征及其调控机制 | 野生型和Ccr2基因敲除小鼠的肠道组织层细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Ccr2-/-小鼠肠道组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 107 | 2026-06-23 |
Single cell RNA sequencing reveals transitional states and signaling shifts in nephron progenitor cells of the late-gestation rhesus macaque kidney
2026-May-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12908-3
PMID:42071182
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析晚期妊娠恒河猴肾脏的肾单位祖细胞，揭示其过渡状态和信号变化 | 首次在晚期妊娠恒河猴肾脏中识别出晚期妊娠特异的肾单位祖细胞诱导分支，并发现WNT和SEMA信号成分的组成变化 | 这些变化是时间依赖还是物种依赖尚待确定 | 探究晚期妊娠中肾单位形成（侧支肾单位发生）的潜在机制 | 晚期妊娠（第二和第三孕期）恒河猴胎儿肾脏组织 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, RNAScope | NA | 基因表达数据 | 9个恒河猴肾脏样本（scRNA-seq）和8个人类肾脏样本（公开数据） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-23 |
Empowering multifaceted analysis of spatial transcriptomics data with RGAST
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag298
PMID:42302280
|
研究论文 | 提出RGAST框架，利用关系图注意力自编码器统一分析空间转录组数据，实现空间域识别、细胞相互作用重建等多种下游任务 | 通过引入关系图注意力自编码器联合建模空间邻近性和基因表达相似性，在单一框架内实现多种空间转录组分析任务，显著提升空间域识别准确率（调整兰德指数提高约10%）并捕捉远程信号通路 | 未提及局限性 | 开发一个统一框架以空间转录组数据进行多层面分析，解决当前分析方法分散的问题 | 空间转录组数据，包括小鼠下丘脑、人脑皮层等组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 关系图注意力自编码器 | 转录组数据 | 包含背外侧前额叶皮层数据集、小鼠下丘脑、人脑皮层等样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-06-23 |
STORM: spatial transcriptomics optimization by resolution via matrix factorization
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag324
PMID:42328842
|
研究论文 | 提出STORM，一种通过矩阵分解优化空间转录组学的机器学习框架，能在严重稀疏数据下提升数据保真度 | 将空间转录组恢复建模为低秩张量分解问题，并通过正则化策略整合多模态生物学先验，包括空间连续性、组织形态学和基因-基因相互作用结构 | NA（摘要未明确提及） | 改进空间转录组学数据在高度稀疏条件下的恢复精度，保留有生物学意义的空间结构 | 肺组织样本（包括健康和恶性样本）的空间转录组数据 | 机器学习 | 肺癌 | 空间转录组学 | 低秩张量分解模型 | 空间转录组数据、组织病理学图像 | 多种肺组织剖面（包括健康和恶性样本） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2026-06-23 |
ST2HE: enhancing spatial transcriptomics interpretability via virtual staining for histological annotation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag326
PMID:42328841
|
研究论文 | 提出ST2HE框架，通过虚拟染色从高分辨率空间转录组数据合成H&E图像，实现组织学注释 | 首次利用一步扩散模型将细胞核形态与空间转录坐标整合，实现跨平台、跨组织的虚拟H&E染色，支持已知和新颖组织背景的注释 | 需要更大上下文窗口、平衡损失函数和多色转录可视化的优化；可能受限于特定组织类型的泛化能力 | 增强高分辨率空间转录组数据的组织学注释可解释性和可扩展性 | 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌、非小细胞肺癌、卡波西肉瘤 | 空间转录组学 | 扩散模型 | 组织图像和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2026-06-23 |
ModelistsGCN: a multimodal graph convolutional network framework for single-cell spatial transcriptomic cell typing
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag340
PMID:42328843
|
研究论文 | 提出一种半监督多模态图卷积网络框架ModelistsGCN，整合基因表达、空间邻近性和细胞形态学特征，用于单细胞空间转录组学中的细胞类型鉴定 | 首次将基因表达、空间邻域结构和可解释的形态学特征三者整合到图卷积网络中，弥补单细胞空间转录组数据分子覆盖度有限的不足，提升细胞类型鉴别能力 | NA | 提高单细胞空间转录组数据中细胞类型推断的准确性，特别是在基因覆盖稀疏的条件下 | 小鼠视觉皮层数据集和转移性乳腺癌组织样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学，MERFISH，ExSeq | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | 小鼠视觉皮层数据集和转移性乳腺癌组织样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2026-06-23 |
Reconstructing cell-cell interaction network in single-cell spatial transcriptomics via directed heterogeneous graph autoencoder
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag130
PMID:41999209
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研究论文 | 提出基于有向异构图自编码器的DualCellChat方法，从单细胞空间转录组数据中重建完整且准确的细胞间相互作用网络 | 首次利用有向异构图自编码器框架直接建模细胞相互作用的方向性，并引入下游分析从重建网络中推断特征基因和显著配体-受体对 | 仅基于已知配体-受体对进行推断，可能遗漏未知的相互作用机制；未涉及多模态数据整合或大规模临床应用验证 | 开发一种能够从单细胞空间转录组数据中重建完整、准确且具有方向性的细胞间相互作用网络的深度学习方法 | 来自四种不同技术的五个单细胞空间数据集中的细胞相互作用关系 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | 图自编码器 | 空间转录组数据（基因表达与空间位置信息） | 五个单细胞空间数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-06-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals novel lncRNA macromolecules associated with PARP11, LMF1, and RRM2 regulatory axes in non-small cell lung cancer
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151932
PMID:41997320
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示非小细胞肺癌中与PARP11、LMF1和RRM2调控轴相关的新型lncRNA大分子 | 鉴定了三种新型lncRNA大分子（AC005842.1、AC009041.2、AC007240.1），并开发了开源Shiny应用lncScape，引入lncRNA动态评分（LDS）和TF-lncRNA动态评分（TLD）两种新策略 | 未在更大样本量或体内模型中验证，且lncRNA功能分析主要基于计算预测和体外实验 | 探索非小细胞肺癌中lncRNA大分子在肿瘤异质性和免疫微环境中的调控作用 | 非小细胞肺癌中的肿瘤细胞和免疫细胞群体 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR | 伪时间轨迹模型 | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌细胞系（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-06-23 |
Identification of tissue plasminogen activator (PLAT) as a potential target linking osteoarthritis and psoriasis: Integrated bioinformatics analysis and molecular dynamics simulation
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152038
PMID:41997321
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和分子动力学模拟，鉴定组织型纤溶酶原激活物（PLAT）作为骨关节炎与银屑病共病的潜在共同靶点 | 首次利用多组学整合策略（WGCNA、机器学习、单细胞RNA-seq等）结合分子模拟，发现PLAT是OA与PSO共病的共同分子靶点，并预测核黄素为潜在抑制剂 | 未在临床样本或更广泛的疾病模型中验证PLAT与共病的直接因果关系；分子模拟和体外实验的初步结果需进一步体内验证 | 探索骨关节炎与银屑病共同的分子机制并鉴定潜在治疗靶点 | 骨关节炎和银屑病相关的基因表达数据及分子互作网络 | 机器学习 | 骨关节炎，银屑病 | WGCNA，LASSO，随机森林，人工神经网络，单细胞RNA-seq，分子对接，分子动力学模拟，MM/PBSA计算，RT-qPCR，CCK-8实验 | LASSO，随机森林，人工神经网络 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-06-23 |
Advanced single-cell transcriptomics deciphers cellular complexity and MIF-orchestrated signaling networks in diabetes-induced myocardial disease
2026-May, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100420
PMID:41997558
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研究论文 | 该文章通过整合批量与单细胞转录组学方法，系统解析了糖尿病诱发心肌病中的细胞异质性和MIF介导的信号网络 | 首次通过单细胞转录组学在糖尿病心肌病中揭示21种成纤维细胞亚型并定位MIF信号通路的枢纽作用 | 未明确提及具体局限性，但靶向干预策略需进一步验证 | 阐明糖尿病相关心肌功能障碍的转录组构架和细胞间信号框架 | 糖尿病心肌病动物模型的心脏组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量，涉及糖尿病心肌病模型的心脏标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-06-23 |
Feature-preserving manifold approximation and projection to analyze single-cell data
2026-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-00970-6
PMID:41998372
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研究论文 | 本文介绍FeatureMAP，一种通过成对切空间嵌入增强流形学习的框架，用于可视化单细胞数据并保留聚类结构与基因水平信息 | 通过成对切空间嵌入将UMAP与主成分分析整合，提出基因贡献、基因变异轨迹、核心与过渡状态三个关键概念，并实现差异基因变异分析 | 未提及具体限制 | 改进单细胞数据可视化方法，保留聚类结构与基因水平信息 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 流形学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-06-23 |
Common potential drug targets for ischemic stroke and coronary heart disease: CYR61, IL2RB, and ST3GAL2 are identified as key regulatory proteins
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152034
PMID:41999825
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研究论文 | 通过整合基因组学方法，识别缺血性中风和冠心病共有的潜在药物靶点蛋白CYR61、IL2RB和ST3GAL2 | 首次通过双向孟德尔随机化结合共定位分析，从遗传和蛋白水平系统鉴定冠心病与缺血性中风的共享致病蛋白，并通过单细胞转录组学和分子动力学模拟进行多维度验证 | 分子动力学模拟仅提供结构假设，动物模型验证仅限于表达水平，缺乏功能验证实验 | 阐明冠心病与缺血性中风的双向遗传关系，并优先筛选共享候选蛋白作为潜在治疗靶点或生物标志物 | 冠心病和缺血性中风患者（基于GWAS汇总统计数据） | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组学、分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据、蛋白质组学数据 | 未明确说明样本量（基于公开GWAS汇总统计数据） | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2026-06-23 |
Therapy-driven clonal dynamics in chronic lymphocytic leukemia
2026-May, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.04.001
PMID:42002058
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综述 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）中治疗驱动的克隆动态变化及耐药机制 | 系统总结了CLL从化学免疫治疗到靶向治疗耐药机制转变，并讨论了新兴单细胞测序和多组学技术 | 主要基于现有文献回顾，缺乏原始实验数据验证 | 总结CLL中克隆演化与治疗耐药机制，并为未来个性化治疗策略提供方向 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者及其克隆演化 | NA | 慢性淋巴细胞白血病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序, 整合多组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-06-23 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveal CST6 + epithelial-SPP1+ macrophage crosstalk driving lung adenocarcinoma metastasis
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152105
PMID:42002169
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学分析揭示了CST6+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用驱动肺腺癌转移的机制 | 首次通过整合单细胞转录组、空间转录组和多重免疫组化数据，发现CST6+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞的物理邻近性促进转移微环境形成，并验证了CST6-SPP1相互作用通过分泌TGF-beta和MMP9增强肿瘤侵袭迁移 | 未提及具体样本量验证范围或动物模型验证，临床转化仍需进一步研究 | 探索肺腺癌转移过程中肿瘤微环境的关键驱动因素 | 肺腺癌原发灶及多部位转移灶（淋巴结、胸膜、脑）中的细胞亚群和微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、空间影像数据 | 原发肺腺癌及多个转移部位（淋巴结、胸膜、脑）的样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2026-06-23 |
Spatiotemporal Transcriptomics Characterizes Immune Microenvironment During Mouse Liver Aging
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70482
PMID:42010880
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研究论文 | 利用单细胞/核和空间转录组学分析小鼠肝脏衰老过程中的免疫微环境变化 | 首次系统揭示小鼠肝脏衰老中CD8 T细胞耗竭的空间分布特征及其与门静脉周围肝细胞的共定位关系 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类肝脏衰老中验证 | 阐明肝脏衰老过程中免疫细胞在时间和空间上的动态变化 | 年轻和老年小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 年轻和老年小鼠肝脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |