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当前共找到 33643 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2025-12-05
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
研究论文 本文介绍了人类肿瘤图谱网络(HTAN)开发的基于云的基础设施,用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据集 引入了两个关键创新:1)基于来源的HTAN ID表,简化了队列构建和跨检测整合;2)新颖地适配了BigQuery的地理空间功能用于空间生物学,实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 未明确提及具体的技术或计算限制 开发一个云基础设施,以降低整合、探索和分析大规模多模态癌症数据集的技术和计算障碍 人类肿瘤图谱网络(HTAN)生成的数据集,包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 空间生物学 癌症 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 单细胞数据、空间数据、临床数据、元数据 NA Google 单细胞RNA-seq、空间转录组学 Google BigQuery 基于Google BigQuery的云基础设施,托管于系统生物学研究所癌症云网关(ISB-CGC)
102 2025-12-05
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与总体生存期的关联 首次在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短及肿瘤微环境中免疫抑制特征的关联 单中心队列研究,样本量有限,单细胞测序仅基于有限肿瘤样本,需要进一步机制研究验证 评估胃癌患者神经元自身抗体的临床预后意义及其与肿瘤微环境的关系 胃癌患者血清样本及肿瘤组织 数字病理学 胃癌 免疫荧光、细胞基础检测、单细胞测序 NA 血清样本、肿瘤组织样本 323例胃癌患者(TBA阳性144例,TBA阴性179例) NA 单细胞RNA测序 NA NA
103 2025-12-05
Base editing and nanoparticle transfection of airway cell types essential for treatment of cystic fibrosis
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文利用碱基编辑技术和纳米颗粒转染方法,纠正了囊性纤维化(CF)气道细胞中的致病剪接位点变异,并展示了功能恢复的潜力 首次使用聚合物纳米颗粒(PNPs)递送CRISPR碱基编辑器RNA,成功纠正CF气道细胞中的常见致病剪接位点变异,并在单细胞水平验证了CFTR转录本的增加 研究中未详细探讨长期安全性和体内递送效率的优化,且对纳米颗粒-蛋白冠形成的机制理解有限 开发一种可扩展的非病毒平台,用于治疗囊性纤维化及其他涉及呼吸道上皮细胞功能障碍的疾病 原发性CF气道细胞、永生化气道细胞及完全分化的气道培养物 基因编辑与纳米医学 囊性纤维化 碱基编辑、单细胞RNA测序、纳米颗粒转染 CRISPR碱基编辑器 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2025-12-05
Single-Cell Analysis Reveals a Critical Role for Macrophage Epsins in Regulating the Origin of Foam Cells in Atherosclerosis
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了巨噬细胞Epsins蛋白在调控动脉粥样硬化泡沫细胞起源中的关键作用 首次在单细胞水平上阐明了巨噬细胞特异性Epsins蛋白通过影响血管平滑肌细胞向巨噬细胞转分化来调控泡沫细胞形成的新机制 研究主要基于小鼠模型,人体内的验证尚需进一步研究 探究巨噬细胞Epsins蛋白在动脉粥样硬化泡沫细胞形成中的分子机制 Apoe-/-背景的野生型小鼠和髓系特异性Epsin 1/2双敲除小鼠 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫染色,代谢谱分析,共培养实验 NA 单细胞转录组数据 WT/Apoe-/-小鼠和LysM-DKO/Apoe-/-小鼠,高脂饮食喂养16周 NA 单细胞RNA测序 NA NA
105 2025-12-05
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫受体谱分析,揭示了肝移植排斥中克隆扩增、治疗抵抗性T细胞的转录景观和组织持久性 首次在单细胞水平上定义了肝移植排斥中CD8 T细胞的克隆扩增、基因表达谱及其在组织中的持久性,并揭示了Kupffer细胞与CD8 T细胞之间的差异互作机制 样本量相对较小(30例),且仅针对儿科患者,可能限制了结果的普适性 探究肝移植排斥中CD8 T细胞的克隆扩增、持久性及其在治疗抵抗中的作用 儿科肝移植患者的冷冻保存肝活检组织 数字病理学 肝移植排斥 单细胞RNA测序,免疫受体谱分析 MultiNicheNet分析 单细胞转录组数据 30例冷冻保存肝活检组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
106 2025-12-05
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法,用于整合基因表达谱与空间位置信息 首次在空间转录组学分析中系统性地整合了多尺度细胞-细胞相互作用,并结合了多尺度拓扑表示与前沿空间深度学习技术 NA 开发一种能够捕捉多尺度细胞-细胞相互作用的空间转录组学分析方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 空间深度学习技术 空间转录组学数据 37个基准空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
107 2025-12-05
Decipherment of disulfidptosis-related mutation profile, chemosensitivity, and prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Nov, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 本研究通过分析弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)及其他多种肿瘤的转录组、体细胞突变和单细胞RNA测序数据,探索了二硫键死亡相关基因(DRGs)的表达谱、突变特征及其与预后和化疗敏感性的关联,并构建了一个新的DRGs风险评分模型 首次在DLBCL中系统研究了二硫键死亡相关基因(DRGs)的表达、突变及其临床意义,并构建了一个新的DRGs风险评分模型,该模型在DLBCL及泛癌分析中显示出良好的预后预测和化疗敏感性评估价值 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证DRGs评分模型的临床应用价值 探索二硫键死亡相关基因(DRGs)在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的表达、突变特征及其与患者预后、化疗敏感性的关系 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者及其他30种肿瘤类型的转录组、体细胞突变和单细胞RNA测序数据 生物信息学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 转录组测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq),体细胞突变分析,分子对接分析 风险评分模型 转录组数据,突变数据,单细胞RNA测序数据 涉及DLBCL患者及30种肿瘤类型的转录组和突变数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
108 2025-12-05
Adenylate Uridylate- (AU-) Rich Element Gene-Based Prognostic Signature and Molecular Subtypes of Prostate Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Immune Microenvironment
2025-Nov, Archivos espanoles de urologia IF:0.6Q4
研究论文 本研究基于腺苷酸尿苷酸富集元件基因构建了一个前列腺腺癌的预后特征和分子亚型,用于预测预后和反映免疫微环境特征 首次利用AREGs基因(ACSM3、ACTG2、DES)构建前列腺腺癌的预后模型,并关联免疫微环境分析 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR,缺乏更深入的体内外功能验证 开发前列腺腺癌的预后预测模型并探索其与免疫微环境的关系 前列腺腺癌患者 生物信息学 前列腺癌 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO正则化、CIBERSORT免疫浸润分析、单细胞转录组学、qRT-PCR 预后风险模型 基因表达数据 基于公共PRAD数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞转录组学 NA NA
109 2025-12-05
Video - Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: A tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为VIDEO的基于网络的分析工具,用于整合和可视化果蝇增强子组织中染色质可及性、转录因子结合及基序出现情况 开发了一个交互式工具,允许研究人员在组织特异性背景下探索转录因子结合基序如何与转录活性和染色质可及性相交 NA 开发一个工具以促进对组织特异性差异表达基因调控机制的理解 果蝇增强子组织、组织特异性差异表达基因 生物信息学 NA RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, scRNA-seq NA 基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq NA NA
110 2025-12-05
BASIN: Bayesian mAtrix variate normal model with Spatial and sparsIty priors in Non-negative deconvolution
2025-Oct-24, ArXiv
PMID:41281239
研究论文 本文提出了一种名为BASIN的贝叶斯矩阵变量正态模型,用于空间转录组学中的细胞类型反卷积,通过结合空间和稀疏性先验来提高反卷积的准确性和效率 BASIN首次将矩阵变量贝叶斯非负矩阵分解方法应用于细胞类型反卷积,通过保持变量矩阵形式推导更高效的矩阵正态后验,并提供不确定性量化 未明确说明模型在复杂组织或高噪声数据中的泛化能力,以及计算效率在大规模数据集上的具体表现 开发一种新的细胞类型反卷积方法,以从空间转录组学数据中推断细胞组成 空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 贝叶斯非负矩阵分解(NMF) 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
111 2025-12-05
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单分子表观遗传学技术揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞(MDSCs)中与年龄和性别相关的染色质重塑机制 首次使用MAPit-FENGC单分子技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性,构建了脓毒症后MDSCs的高分辨率表观遗传图谱,并揭示了年龄和性别特异性的染色质动态变化 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;样本量相对有限 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制 骨髓源性抑制细胞(MDSCs) 表观遗传学 脓毒症 MAPit-FENGC(单分子DNA甲基化和染色质可及性分析),单细胞RNA测序 无监督聚类分析 表观遗传数据,转录组数据 年轻和年老成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs NA 单细胞RNA测序 NA NA
112 2025-12-05
A lifespan transcriptomic atlas of the human prefrontal cortex at single-cell resolution
2025-Oct-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究构建了人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)的首个跨生命周期的单细胞核转录组图谱,揭示了其细胞和分子程序随年龄变化的动态规律 首次构建了覆盖人类完整生命周期(0-97岁)的DLPFC单细胞核转录组图谱,识别了三个不同的转录组阶段和十种年龄相关轨迹,并发现了成年晚期神经元核心生物钟节律丧失与胶质细胞应激适应性节律出现的新现象 研究基于死后样本,可能无法完全反映活体组织的动态过程;样本量虽大但个体差异可能影响部分结论的普适性 绘制人类前额叶皮层跨生命周期的细胞和分子图谱,以理解大脑发育、衰老及疾病易感性的基础 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC) 数字病理学 老年性疾病 单细胞核RNA测序,空间转录组学 非线性建模,伪时间分析 转录组数据,空间基因表达数据 284例死后样本,超过130万个细胞核 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
113 2025-12-05
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
研究论文 本研究评估了一种小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的可行性和耐久性 首次在灵长类动物模型中评估小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的长期性能,并利用空间转录组学揭示了宿主细胞浸润对血管重塑的调控机制 研究样本量较小(n=5),仅评估了6个月的短期效果,未与传统自体血管进行直接比较 开发冠状动脉旁路移植术的替代血管移植物 成年狒狒的冠状动脉系统 组织工程 心血管疾病 空间转录组学,计算机断层扫描血管造影 NA 影像数据,基因表达数据,组织学数据 5只成年狒狒 NA NA NA NA
114 2025-12-05
Loss of Ribosomal Protein L22 (RPL22) Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1-Deficient Endometrial Cancers With Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2025-Sep-24, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过免疫组化检测和数字空间转录组学分析,发现RPL22表达缺失可识别MLH1缺陷子宫内膜癌中一个免疫低亚型,该亚型具有较少的肿瘤相关淋巴细胞 首次证明RPL22缺失是MLH1缺陷子宫内膜癌中免疫低亚型的易检测标志物,并揭示其与β-2微球蛋白表达降低及CD8+ T细胞浸润减少相关 未发现RPL22表达或肿瘤相关T淋巴细胞水平与肿瘤突变负荷或PD-L1表达相关,且样本队列规模未明确说明 探究RPL22在MLH1缺陷子宫内膜癌中的表达意义及其与肿瘤免疫微环境的关系 子宫内膜癌(EC)样本,特别是MLH1缺陷亚型 数字病理学 子宫内膜癌 免疫组化(IHC),数字空间转录组学 NA 组织图像,转录组数据 NA NA 数字空间转录组学 NA NA
115 2025-12-05
Airway Epithelial Heterogeneity and Mucus Plugging in Asthmatic Bronchioles
2025-Sep-23, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 本研究探讨了哮喘患者细支气管上皮异质性与黏液栓形成的关系,揭示了MUC5AC高表达细胞微环境在T2炎症驱动的上皮重塑中的作用 首次在哮喘细支气管中识别出MUC5AC高表达的异质性细胞微环境,并发现其独立于免疫细胞定位,为理解哮喘细支气管疾病的分子病理生理学提供了新视角 研究样本主要来自严重和致命性哮喘患者,可能无法代表所有哮喘亚型;体外培养模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 验证哮喘细支气管上皮生物学紊乱导致MUC5AC主导的黏液栓形成的假说 严重哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织,以及分离的细支气管和支气管基底细胞 空间转录组学 哮喘 组织学、RNA原位杂交、免疫组织化学、细胞培养、空间转录组学、多重免疫表型分析 NA 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 严重哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
116 2025-12-05
A multimodal atlas of COVID-19 severity identifies hallmarks of dysregulated immunity
2025-Sep-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析,构建了COVID-19严重程度的多模态图谱,揭示了失调免疫的关键特征 首次在单细胞分辨率下整合了多种数据类型,包括单细胞RNA-seq、CITE-seq、TCR/BCR测序等,全面解析了COVID-19严重程度的生物学特征,并明确了托珠单抗治疗对免疫细胞特征的影响 研究主要基于急性感染期和恢复期患者,对长期后遗症(如慢性COVID综合征)的免疫机制探索仍有限 研究COVID-19严重程度与宿主免疫反应的关系,特别是托珠单抗治疗对免疫特征的影响 428名COVID-19患者,涵盖急性感染、托珠单抗治疗试验和恢复期三个队列 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA-seq, CITE-seq, TCR/BCR测序, 病毒载量测量, 病毒中和试验, 自身抗体检测, HLA基因分型, 血清蛋白质组学 线性模型 单细胞多组学数据, 临床元数据 428名患者的840个PBMC样本,共250万个循环免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
117 2025-12-05
Linear Dimensionality Reduction Methods for Analyzing Structured Biomedical Data: Existing Research and Future Opportunities
2025-Sep, Wiley interdisciplinary reviews. Computational statistics
综述 本文综述了用于分析结构化生物医学数据的线性降维方法,包括监督和无监督分析,并基于低秩加噪声模型进行理论和数值比较 提出了一个基于低秩加噪声模型的统一框架,用于理论和数值比较现有线性降维方法,并指出了针对结构化生物医学数据未来研究的有前景方向 NA 综述现有线性降维方法,以帮助研究人员理解各种结构化降维技术的优缺点,并选择最适合其数据的方法 结构化生物医学数据,如单细胞RNA-seq数据、微生物组数据和空间转录组数据 机器学习 NA NA 线性降维方法 高维生物医学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
118 2025-12-05
Direct oHSV Infection Induces DC Maturation and a Tumor Therapeutic Response
2025-Aug-19, Viruses
研究论文 本文探讨了溶瘤性单纯疱疹病毒直接感染树突状细胞如何促进其成熟并增强抗肿瘤免疫反应 揭示了oHSV直接感染DC而非仅通过肿瘤细胞感染来激活抗肿瘤免疫的新机制,为癌症免疫治疗提供了新视角 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且oHSV感染DC为流产性感染,其长期效果和安全性需进一步评估 探究溶瘤性单纯疱疹病毒通过直接感染树突状细胞增强抗肿瘤免疫治疗的机制 溶瘤性单纯疱疹病毒、树突状细胞、CT-2A胶质瘤细胞、T细胞 免疫治疗 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
119 2025-12-05
Identification of Novel Lactylation-Related Biomarkers for COPD Diagnosis Through Machine Learning and Experimental Validation
2025-Aug-18, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过机器学习筛选和实验验证,鉴定出CBR1和PRDX1作为与乳酸化相关的慢性阻塞性肺疾病诊断生物标志物 首次将乳酸化修饰与COPD诊断生物标志物发现相结合,并采用多算法集成筛选与单细胞转录组学分析进行验证 研究主要基于公共数据集和体外CSE诱导模型,需要在更大临床队列和体内模型中进一步验证 鉴定COPD中临床相关的乳酸化相关生物标志物并探究其在疾病发病机制中的潜在作用 慢性阻塞性肺疾病患者基因表达数据、香烟烟雾提取物诱导的COPD细胞模型 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 转录组学分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光 LASSO回归、支持向量机递归特征消除、加权基因共表达网络分析 基因表达数据、单细胞转录组数据 来自GSE21359和GSE76925数据集的COPD患者样本,以及GSE173896单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
120 2025-12-05
Eed controls craniofacial osteoblast differentiation and mesenchymal proliferation from the neural crest
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了PRC2复合物核心亚基Eed在神经嵴诱导后对颅面成骨细胞分化和间充质细胞增殖的关键调控作用 首次结合小鼠遗传学、单细胞RNA测序和表观遗传分析,系统阐明了Eed在神经嵴细胞迁移后阶段通过表观遗传调控转录因子程序驱动颅面发育的分子机制 研究主要聚焦于胚胎发育阶段,对出生后颅面维持和成年疾病关联的探讨有限 探究PRC2复合物在神经嵴诱导后对颅面发育的调控机制 小鼠胚胎神经嵴细胞、颅面间充质细胞、原代颅面细胞培养物 发育生物学 先天性颅面畸形 单细胞RNA测序、表观遗传分析 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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