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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-10 |
The Interaction Between Mitophagy Dysregulation and the Diabetic Bladder Microenvironment
2026-Mar, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.70199
PMID:41793088
|
综述 | 本文综述了线粒体自噬失调与糖尿病膀胱微环境之间的相互作用,提出了一个驱动糖尿病膀胱功能障碍进展的自我强化反馈环路 | 提出了一个连接高血糖、线粒体自噬失调、线粒体功能障碍和膀胱微环境损伤的自我强化反馈环路新模型,并探讨了针对该环路的多靶点联合治疗策略 | 该模型主要基于现有文献综述提出,其具体分子机制和临床转化仍需未来实验研究验证 | 阐明线粒体自噬在糖尿病膀胱功能障碍发病机制中的作用,并探索基于此的治疗策略 | 糖尿病膀胱功能障碍的分子与细胞病理机制 | 病理生理学 | 糖尿病并发症 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-03-10 |
Assessment of dispersion metrics for estimating single-cell transcriptional variability
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014030
PMID:41770747
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研究论文 | 本文系统评估了用于估计单细胞转录变异性的多种离散度指标,并应用方差均值比(Fano因子)揭示了单细胞数据中的生物学相关信息 | 通过模拟单细胞数据系统比较了Gini指数、方差均值比、方差、变异系数(CV)、CV2和Shannon熵等统计指标对转录噪声的响应性,发现方差均值比在离散度增加时近似线性缩放且独立于数据集大小,而Gini指数在离散度减小时表现出反常行为,Shannon熵则不具有尺度不变性 | 研究基于模拟数据进行方法比较,可能未完全覆盖真实单细胞数据的所有复杂性;且未探讨其他潜在统计指标或模型 | 评估和比较用于测量单细胞转录变异性的统计方法,以揭示超越平均表达的生物学信息 | 单细胞RNA测序数据中的基因特异性转录变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型(包括Gini指数、方差均值比、方差、CV、CV2、Shannon熵) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-03-10 |
Single-Atom Nanozyme Driven Lactate Reversal Fuels Oxidative Metabolism and Represses Lactylation to Heal Diabetic Wounds
2026-Feb-27, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c20192
PMID:41757688
|
研究论文 | 本研究开发了一种磷掺杂单原子铁纳米酶,用于高效催化乳酸氧化并清除活性氧,以治疗糖尿病伤口 | 通过磷掺杂调控铁活性中心的电子结构,首次实现了金属基纳米酶对乳酸的高效氧化,并建立了“逆转-再利用”代谢通路 | NA | 设计具有精确电子调控和治疗功能的单原子纳米酶,以调节炎症并促进糖尿病伤口愈合 | 糖尿病伤口愈合过程中的局部慢性炎症微环境 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-03-10 |
Hemp seed oil mediates injury mitigation and anti-inflammation in radiated splenic T cells
2026-Feb-26, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158004
PMID:41797188
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研究论文 | 本研究探讨了火麻籽油在急性辐射损伤中的保护作用,通过提高小鼠存活率、保护脾脏T细胞并利用单细胞RNA测序揭示其抗炎和免疫调节机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法,系统揭示了火麻籽油通过调节T细胞分化和炎症通路发挥辐射保护作用的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;火麻籽油的具体活性成分和作用靶点需进一步实验确认 | 探究火麻籽油对急性辐射损伤的保护作用及其分子机制 | 辐射暴露的小鼠模型,特别是脾脏中的T细胞 | 单细胞组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,HPLC分析,网络药理学,分子对接 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,化学分析数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠存活实验和脾脏细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-03-10 |
The protective up-regulation of metallothionein-2A in intervertebral disc degeneration inhibits nucleus pulposus cell ferroptosis through activation of the PI3K/AKT/mTOR pathway
2026-Feb-25, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02972-9
PMID:41741409
|
研究论文 | 本研究揭示了金属硫蛋白-2A(MT2A)在椎间盘退变中通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡,从而发挥保护作用 | 首次发现MT2A在椎间盘退变中保护性上调,并阐明其通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体中进行验证;铁死亡在椎间盘退变中的具体作用机制仍需进一步探索 | 阐明MT2A如何抑制椎间盘退变的进展 | 椎间盘退变、髓核细胞 | 分子生物学与细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序分析、细胞培养、动物模型 | NA | 测序数据、细胞表型数据、动物影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-03-10 |
WWP2 underlies ROS-induced granulosa cell apoptosis by promoting ubiquitination of BAK in polycystic ovary syndrome
2026-Feb-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08500-y
PMID:41730845
|
研究论文 | 本研究揭示了在PCOS中,氧化应激通过WWP2介导的BAK泛素化调控颗粒细胞线粒体凋亡的分子机制 | 首次发现E3泛素连接酶WWP2在PCOS颗粒细胞中表达显著降低,并阐明其通过调控BAK的泛素化修饰影响颗粒细胞凋亡的新机制 | 研究主要基于KGN细胞系和PCOS小鼠模型,在人类PCOS患者中的直接验证仍需进一步开展 | 阐明PCOS中活性氧诱导颗粒细胞凋亡的分子机制 | 颗粒细胞、KGN细胞系、PCOS小鼠模型 | 分子生物学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序、泛素化分析、基因敲除/敲低 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | 公共单细胞RNA-seq数据及临床GC样本验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-03-10 |
Advances in spatial omics for the analysis of prostate cancer
2026-Feb-21, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-026-06396-3
PMID:41723338
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在分析前列腺癌中的应用进展 | 整合了高维分子分析与保留的组织结构,揭示了前列腺癌进展中的关键特征,如基质重塑、免疫逃逸、脂质代谢重编程和治疗耐药性生态位 | NA | 探讨空间组学技术在前列腺癌研究中的最新进展、整合应用及临床转化挑战 | 前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 单细胞空间组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-03-10 |
A Multimodal Single-Cell Epigenomic and 3D Genome Atlas of the Human Basal Ganglia
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.12.705594
PMID:41726865
|
研究论文 | 本文构建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,揭示了细胞类型和区域特异性的表观遗传差异 | 首次创建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,整合了DNA甲基化、3D染色质构象、空间转录组学等多组学数据 | NA | 构建人类基底节的综合表观基因组图谱,以解析其细胞类型特异性的表观遗传调控机制 | 人类基底节的主要亚区和细胞类型 | 表观基因组学 | 神经精神疾病 | 多组学测序(snm3C-seq)、MERFISH空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 197,003个细胞核(来自八个基底节亚区),整合后总计261,331个细胞 | NA | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-03-10 |
Genome-wide single-cell perturbation screens with VIPerturb-seq
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.12.705613
PMID:41726924
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为VIPerturb-seq的新平台,旨在通过基于探针的检测工作流程,促进全基因组范围的Perturb-seq实验,以应对成本和高通量挑战 | VIPerturb-seq平台引入了分裂探针策略,用于在固定细胞中检测全基因组CRISPR文库,支持在单细胞分析前对重要扰动进行表型富集,并与组合索引工作流程兼容,将Perturb-seq通量提高50倍 | NA | 开发一个平台,以促进常规的全基因组Perturb-seq实验,解决现有方法在成本和通量方面的限制 | 全基因组CRISPRi文库(GuEST-List)以及相关的单细胞扰动筛选 | 单细胞测序技术 | NA | CRISPR-based screening, single-cell sequencing, probe-based detection, combinatorial indexing | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | Perturb-seq, single-cell RNA-seq | VIPerturb-seq | 基于探针的检测工作流程,支持全基因组CRISPR文库检测和表型富集 |
| 110 | 2026-03-10 |
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705411
PMID:41726934
|
研究论文 | 本研究评估了一种新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性 | ADT-030是一种新型PDE10抑制剂,能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖,并对抗KRAS抑制剂耐药细胞,同时重塑肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫 | NA | 评估ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤效果及机制 | 胰腺导管腺癌细胞系、同基因和患者来源异种移植模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-03-10 |
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705358
PMID:41727141
|
研究论文 | 本文比较了基于参数化表示的单细胞基础模型与简单线性方法在下游任务中的性能 | 研究发现,无需复杂深度学习表示,通过简单、可解释的线性方法即可在多个基准测试中达到或接近最先进性能,甚至在涉及新细胞类型和生物体的分布外任务中超越基础模型 | 未明确提及具体局限性,但暗示需要更严格的基准测试来评估模型 | 评估单细胞RNA测序数据表示方法的性能,特别是比较基础模型与简单线性方法在下游任务中的表现 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 线性方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-03-10 |
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01419-8
PMID:41665703
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、机器学习和实验验证,识别了TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 | 首次探索血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用单细胞RNA测序、机器学习等方法识别了关键的衰老相关基因 | TGFB1和SERPINE1的具体作用机制需要进一步研究和验证 | 研究颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的病理机制,并识别相关的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠弹性蛋白酶诱导的颅内动脉瘤模型以及人类颅内动脉瘤组织 | 机器学习 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列, 免疫组织化学分析 | 机器学习 | RNA测序数据, 微阵列数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量,涉及小鼠模型和人类组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-02-06 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq finds gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with cytoskeleton protein in epithelial-mesenchymal transition in ovarian cancer
2026-Feb-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04580-6
PMID:41639334
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2026-03-10 |
HCMV infection disrupts barrier functions and promotes epithelial-mesenchymal transition in a cholangiocyte organoid model
2026-Feb-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68962-8
PMID:41634045
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研究论文 | 本研究建立了一个人iPSC来源的胆管样细胞类器官模型,用于探究人巨细胞病毒感染如何破坏屏障功能并诱导上皮-间质转化 | 首次利用人iPSC来源的胆管样细胞类器官模型,证明HCMV可直接感染胆管上皮并诱导EMT,揭示了TGF-β信号通路在此过程中的关键作用 | 类器官模型可能无法完全模拟体内胆管微环境,且研究主要基于体外实验,需要进一步在体验证 | 探究HCMV感染是否直接导致胆管上皮细胞功能障碍及EMT,以解释其与胆管疾病的临床关联 | 人iPSC来源的胆管样细胞类器官及胆道闭锁患者肝组织 | 数字病理学 | 胆道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, HCMV-DNA检测 | 类器官模型 | 基因表达数据, 组织样本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-03-10 |
Butyrate modifies epigenetic and immune pathways in peripheral mononuclear cells from children with neurodevelopmental disorders associated with chromatin dysregulation
2026-Jan, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00792
PMID:41260988
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研究论文 | 本研究探讨了丁酸盐对染色质相关神经发育障碍儿童外周血单核细胞表观遗传和免疫通路的调节作用 | 首次在染色质相关神经发育障碍中识别出共同的核糖体-免疫RNA特征,并证明丁酸盐能逆转这些通路异常,为跨多种神经发育障碍的潜在治疗策略提供证据 | 样本量较小(特别是单细胞测序部分仅涉及4名患者和2名对照),且未进行长期疗效评估 | 研究丁酸盐作为组蛋白去乙酰化酶抑制剂,对染色质失调相关神经发育障碍的治疗潜力 | 患有染色质相关神经发育障碍(Kabuki综合征、CHARGE综合征、Rett综合征)及非单基因诊断神经发育障碍的儿童,以及健康对照儿童 | 表观遗传学 | 神经发育障碍 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 21名儿童(包括患者和对照),其中单细胞测序涉及6名个体(4名患者和2名对照)的101,539个外周免疫细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-03-10 |
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2026, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2025.2597464
PMID:41457935
|
研究论文 | 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴,促进巨噬细胞M1极化与成纤维细胞功能,从而加速肛瘘愈合的分子机制 | 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴调控巨噬细胞-成纤维细胞互作促进肛瘘愈合的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其结论在人体中的适用性及临床转化效果仍需进一步验证 | 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 肛瘘愈合过程、巨噬细胞、成纤维细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 肛瘘 | 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞实验数据、体内动物模型数据 | 使用了公开数据集GSE28914和GSE203244,并建立了小鼠肛瘘模型进行体内验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-03-10 |
Medicinal cannabis plant extract (NTI164) modifies epigenetic, ribosomal, and immune pathways in paediatric acute-onset neuropsychiatric syndrome
2026-Jan, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00828
PMID:41513541
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研究论文 | 本研究是一项开放标签试验,评估了富含大麻素、低四氢大麻酚的药用大麻提取物NTI164在14名慢性复发性儿童急性发作性神经精神综合征患者中的安全性、有效性及其对表观遗传、核糖体和免疫通路的影响 | 首次将多组学方法(包括单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学和DNA甲基化分析)应用于PANS研究,并揭示了NTI164作为一种疾病修饰疗法,能够显著调节患者白细胞中失调的表观遗传、核糖体和免疫通路 | 研究为开放标签试验,样本量较小(14名患者),缺乏安慰剂对照组,且随访时间较短(12周) | 评估药用大麻提取物NTI164在儿童急性发作性神经精神综合征中的安全性、临床疗效及其生物学作用机制 | 14名慢性复发性儿童急性发作性神经精神综合征患者(平均年龄12.1岁,范围4-17岁,71%为男性) | 神经精神疾病研究 | 儿童急性发作性神经精神综合征 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,DNA甲基化分析 | NA | 临床评估数据,血液样本的多组学数据(转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组、甲基化组) | 14名患者 | NA | 单细胞转录组学,bulk转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-03-10 |
Cochlear neural functional competence: an integrative transcriptomic module analysis of excitability, plasticity and microenvironmental support programs
2026, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2026.1776907
PMID:41797834
|
研究论文 | 本研究通过整合分析多个耳蜗转录组数据集,构建了一个用于评估螺旋神经元功能状态的综合评分框架(CNFC) | 提出了一个整合神经元兴奋性、可塑性、营养/代谢支持和损伤/炎症等转录程序的模块化分析框架,并开发了可量化的CNFC评分,超越了传统的神经元存活率预测 | MSC治疗的功能性后果尚未明确建立,部分结论仍需进一步机制验证 | 开发一个从转录组数据中总结耳蜗神经元功能状态的透明、可生成假设的分析框架,以补充传统的存活率指标 | 螺旋神经元、毛细胞及耳蜗组织 | 转录组学 | 听力损失 | RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 | 模块化基因评分框架 | 转录组数据 | 多个公开数据集(涵盖发育期、成年期及损伤/退化期样本) | NA | RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-03-10 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2025-12-31, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxaf024
PMID:40795862
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGBM的新方法,用于基于模型的单细胞RNA-seq数据降维,通过泊松双线性模型改进标准降维方法 | 开发了scGBM方法,使用泊松双线性模型直接建模计数数据,引入快速估计算法以扩展到百万细胞数据集,并量化细胞潜在位置的不确定性 | NA | 解决单细胞RNA-seq数据降维中标准方法可能诱导虚假异质性和掩盖真实生物变异性的问题 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 泊松双线性模型 | 计数矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-03-10 |
Diverse infections transcriptionally reprogram the intestinal epithelium and epithelial-immune cell interactions
2025-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695505
PMID:41497582
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研究论文 | 本文介绍了GutPath图谱,一个包含超过50万个单细胞的RNA和蛋白质表达谱的资源,用于研究不同感染类型下回肠的细胞状态和细胞间通讯 | 开发了GutPath图谱,首次系统性地揭示了回肠在多种感染下的细胞转录组多样性和上皮-免疫细胞相互作用,并识别了一种与细菌负荷和组织病理学空间相关的新型肠上皮细胞状态 | 研究主要关注回肠,可能未全面覆盖整个小肠或其他肠道区域,且依赖于单细胞和空间转录组学技术,可能存在技术偏差 | 研究回肠在感染期间的细胞响应和细胞间通讯复杂性,以增进对肠道免疫和病理机制的理解 | 回肠中的细胞状态,包括肠上皮细胞和免疫细胞,涉及多种感染类型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA表达谱, 蛋白质表达谱 | 超过500,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |