单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-05-24	Microglial polarization pathways and therapeutic drugs targeting activated microglia in traumatic brain injury 2024-Dec-07, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00810 PMID:39665832	综述	本文综述了创伤性脑损伤中微胶质细胞的极化途径及靶向活化微胶质细胞的治疗药物	阐明了促炎和抗炎微胶质细胞涉及的信号通路，并综述了基于这些通路的药物和细胞替代治疗策略	药物和间充质干细胞治疗策略的应用仍面临许多挑战	探讨创伤性脑损伤中微胶质细胞的极化途径及治疗策略	微胶质细胞及其在创伤性脑损伤中的作用	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序、转录组分析	NA	NA	NA
102	2025-05-24	A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states 2024-Dec, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-024-01764-7 PMID:39406950	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析了来自74名捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞，揭示了小胶质细胞的异质性及其在不同神经系统疾病中的作用	首次大规模跨疾病分析人类小胶质细胞异质性，发现与神经退行性疾病相关的特定亚群，并验证了能够模拟这些亚群状态的化合物	研究主要基于转录组数据，可能未能完全捕捉小胶质细胞的功能状态	揭示人类小胶质细胞的异质性及其在神经系统疾病中的作用，为靶向治疗开发提供依据	人类小胶质细胞	神经科学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNAscope免疫荧光, MERFISH	NA	单细胞转录组数据	215,680个活体人类小胶质细胞，来自74名捐赠者
103	2025-05-24	SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies 2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-009983 PMID:39455096	研究论文	本研究探讨了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌转移中的作用及其作为生物标志物的潜力	首次揭示了SPI1+CD68+巨噬细胞亚群在胃癌中的特异性作用机制及其与抗血管生成和免疫治疗联合策略的相关性	研究主要基于实验室模型和小鼠腹膜转移模型，临床样本验证仍需进一步扩大	评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用及其临床意义	胃癌组织和相关巨噬细胞	肿瘤免疫学	胃癌	免疫组化、免疫荧光、流式细胞术、单细胞转录组分析、染色质免疫沉淀	小鼠腹膜转移模型	基因表达数据、蛋白质表达数据	未明确说明具体样本数量，包含体外实验、动物模型和临床组织样本
104	2025-05-24	scAI-SNP: a method for inferring ancestry from single-cell data 2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.05.14.594208 PMID:38798590	research paper	介绍了一种名为scAI-SNP的工具，用于直接从单细胞基因组数据推断供体的祖先信息	开发了一种新工具scAI-SNP，能够直接从单细胞数据中推断祖先信息，解决了自我报告种族和民族信息的偏差和缺失问题	未提及具体局限性	确保单细胞图谱能代表人类遗传多样性，通过推断供体祖先信息	单细胞基因组数据	基因组学	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq	NA	单细胞基因组数据	1000 Genomes Project数据集中的3201个个体，来自26个人群群体
105	2025-05-24	A phase 2 randomized trial with autologous polyclonal expanded regulatory T cells in children with new-onset type 1 diabetes 2024-05-08, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn2404 PMID:38718135	研究论文	该研究探讨了自体多克隆扩增调节性T细胞（expT）在新发1型糖尿病儿童中的安全性和有效性	首次在儿童和青少年中进行自体多克隆扩增调节性T细胞的随机二期临床试验，并评估其安全性和对β细胞功能的影响	单次剂量的expT未能显著阻止β细胞功能的下降，且治疗效果与T细胞的质量相关	评估自体多克隆扩增调节性T细胞在1型糖尿病治疗中的安全性和有效性	新发1型糖尿病的儿童和青少年	临床医学	1型糖尿病	流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序	NA	临床数据、RNA测序数据	110名儿童和青少年患者
106	2025-05-24	Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence 2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.29.591541 PMID:38746119	research paper	该研究通过单细胞测序技术，探索了不同细胞内信号域（ICD）结构如何影响CAR-T细胞的功能，特别是在分子水平上	首次系统性地研究了不同ICD结构如何通过信号传导影响CAR-T细胞的转录输出和功能，并发现了一种与持久性相关的独特信号特征	研究发现这种持久性信号特征仅适用于液体肿瘤，对实体瘤无效	解码CAR信号传导的设计原则，为下一代优化ICD结构的合理设计提供依据	表达嵌合抗原受体（CARs）的工程化T细胞	免疫治疗	肿瘤	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	NA
107	2025-05-24	Targeting of epigenetic co-dependencies enhances anti-AML efficacy of Menin inhibitor in AML with MLL1-r or mutant NPM1 2023-04-13, Blood cancer journal IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41408-023-00826-6 PMID:37055414	研究论文	本研究探讨了Menin抑制剂（MI）在携带MLL1-r或mtNPM1的AML患者中的抗白血病效果，并通过联合靶向表观遗传共依赖性增强其疗效	发现MI与BET、MOZ、LSD1或CBP/p300抑制剂联合使用可协同降低AML细胞的存活率，并在体内模型中显示出显著优越的疗效	研究主要基于临床前模型，尚未在临床试验中验证其效果	增强Menin抑制剂在AML治疗中的疗效，防止AML干细胞/祖细胞逃逸	携带MLL1-r或mtNPM1的AML细胞	肿瘤学	急性髓系白血病（AML）	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、染色质免疫沉淀测序（ChiP-Seq）、ATAC-Seq、RNA测序（RNA-Seq）、反向蛋白质阵列（RPPA）、质谱流式细胞术（CyTOF）	CRISPR-Cas9筛选	基因组数据、转录组数据、蛋白质数据	临床前研究中的AML细胞系和异种移植模型
108	2025-05-24	Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19 2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.) DOI:10.1097/FM9.0000000000000190 PMID:40406392	研究论文	通过单细胞转录组分析，研究一名康复的COVID-19孕妇的外周血单个核细胞的免疫反应	首次在单细胞水平上描绘了COVID-19康复孕妇的PBMCs免疫基因表达图谱，并发现CD16单核细胞和MAIT细胞在母体免疫反应中的关键作用	样本量有限，仅研究了一名患者，结果可能需要更大样本验证	探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制	孕妇外周血单个核细胞(PBMCs)	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	1名COVID-19康复孕妇的PBMCs样本，并与已发表的健康孕妇单细胞RNA测序数据集进行对比
109	2025-05-24	Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy 2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy DOI:10.2147/DMSO.S413569 PMID:37312900	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，结合多种机器学习方法，识别了糖尿病肾病中的新型免疫特征	首次从免疫学角度揭示了糖尿病肾病进展的关键免疫相关基因和潜在药物靶点	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证	探索糖尿病肾病中免疫调节的潜在治疗靶点和分子机制	糖尿病肾病患者的基因表达数据和免疫相关基因	生物信息学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序, 大块RNA测序, WGCNA, CIBERSORT算法	随机森林(RF), 支持向量机(SVM), AdaBoost, KNN	基因表达数据	来自GEO数据库的多个数据集，包括GSE142025等
110	2025-05-24	Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1 2022-Jan, Gland surgery IF:1.5Q3 DOI:10.21037/gs-21-908 PMID:35242686	研究论文	本文研究了赖氨酰氧化酶（LOX）和骨形态发生蛋白-1（BMP1）在促进未分化甲状腺癌（ATC）细胞增殖和转移中的作用	揭示了LOX/BMP1轴在ATC恶性进展中的关键作用，为基于该轴的靶向治疗提供了新思路	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证	探索ATC的新型治疗靶点	未分化甲状腺癌细胞	癌症研究	甲状腺癌	单细胞RNA测序、微阵列分析、定量实时PCR、Western blot、siRNA敲低、CCK-8实验、克隆形成实验、伤口愈合实验、Transwell实验	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	ATC组织和细胞系
111	2025-05-23	A multimorphic variant in ThPOK causes an inborn error of immunity with T cell defects and fibrosis 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20241174 PMID:40392549	研究论文	本文报道了由ThPOK基因变异引起的首例人类疾病，该变异导致CD4+ T细胞缺陷和纤维化等多种症状	首次发现ThPOK基因变异导致的人类疾病，揭示了ThPOK在CD4+ T细胞发育、TCR激活和纤维化调控中的新作用	研究仅基于一个患者案例，样本量较小	探究ThPOK基因变异对人类免疫系统和纤维化途径的影响	一名携带ThPOKK360N变异的患者及其细胞模型	免疫学	免疫缺陷病	单细胞RNA测序	NA	基因测序数据	1名患者
112	2025-05-23	Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy 2025-Jun-04, Neuroreport IF:1.6Q4 DOI:10.1097/WNR.0000000000002168 PMID:40298633	研究论文	结合孟德尔随机化和单细胞测序数据分析趋化因子及其受体在癫痫中的作用及分子机制	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别出与癫痫相关的关键基因和免疫细胞	研究结果需要进一步的实验验证，样本来源和数量未明确说明	探索趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制	趋化因子及其受体相关基因、癫痫	生物信息学	癫痫	孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
113	2025-05-23	Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033 PMID:39097088	review	本文全面综述了胶质瘤微环境中四种主要免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞）的异质性、亚型转化机制及其对化疗耐药和治疗策略的影响	系统总结了胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的确切机制，并探讨了单细胞测序技术在探索免疫细胞亚型中的应用	NA	深入理解胶质瘤微环境中免疫细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗中的作用	胶质瘤微环境中的免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等）	digital pathology	glioma	单细胞测序	NA	NA	NA
114	2025-05-23	Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028 PMID:39084404	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示牙龈组织中与NETs相关的中性粒细胞亚群及其在牙周免疫中的作用	首次构建了牙周微环境的单细胞图谱，并发现了与NETs相关的中性粒细胞亚群(NrNeu)，揭示了牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴激活NETs的具体调控关系	动物模型的结果可能无法完全反映人类牙周炎的复杂情况，NETs抑制剂的作用机制仍需进一步研究	阐明NETs在牙周免疫病理中的具体功能和机制	健康个体和牙周炎患者的牙龈组织	数字病理	牙周炎	单细胞RNA测序，高维加权基因共表达网络分析，伪时间分析	六种机器学习方法构建的预测模型	RNA测序数据	健康个体和牙周炎患者的牙龈组织样本
115	2025-05-23	RNA modification gene WDR4 facilitates tumor progression and immunotherapy resistance in breast cancer 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.06.029 PMID:38960276	研究论文	该研究基于RNA修饰相关基因开发了一种预测乳腺癌患者治疗反应和生存结果的策略	提出了一个包含九个基因的签名RMscore，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应，并发现WDR4通过m7G修饰调节细胞周期和mTORC1信号通路	缺乏对乳腺癌中各种RNA修饰临床价值的全面阐述	预测乳腺癌患者的治疗反应和生存结果	乳腺癌患者	癌症研究	乳腺癌	批量转录组、单细胞转录组和基因组学分析、流式细胞术、免疫组织化学和免疫荧光染色	NA	转录组数据、基因组数据	NA
116	2025-05-23	Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.029 PMID:39107200	research paper	本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶（HDACs）在自身免疫性葡萄膜炎（AU）中通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性的机制	揭示了HDACs通过CDK6/ID2轴调控Th17细胞分化和致病性的新机制，并提出了潜在的治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证仍需进一步扩大	探究HDACs在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用及其潜在治疗靶点	自身免疫性葡萄膜炎患者和小鼠模型中的免疫细胞	免疫学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、siRNA、特异性抑制剂和过继转移实验	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	自身免疫性葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和EAU小鼠模型的免疫细胞
117	2025-05-23	ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment 2025-Jun, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021 PMID:39111624	研究论文	研究ST6GALNAC1介导的子宫内膜上皮唾液酸化在胚胎着床中的作用	首次揭示了ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的关键作用，并鉴定了CD44作为sTn的载体	研究主要基于体外模型和小鼠实验，人类胚胎着床的复杂性可能未被完全涵盖	探讨ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的功能	人类和小鼠的子宫内膜上皮细胞及胚胎	生殖生物学	生殖系统疾病	免疫组织化学、免疫沉淀结合质谱分析、scRNA-seq、免疫荧光染色	体外植入模型和小鼠模型	蛋白质组学数据和RNA测序数据	人类子宫内膜样本和小鼠模型
118	2025-05-23	Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease 2025-Jun, Nature reviews. Cardiology DOI:10.1038/s41569-024-01109-8 PMID:39743564	review	本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病中的功能多样性，探讨了它们的发育起源、转录特征以及在心脏稳态和疾病中的不同作用	利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域	NA	探讨心脏巨噬细胞在心脏疾病发病机制中的作用，为新的治疗靶点和诊断工具的研发提供基础	心脏巨噬细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
119	2025-05-23	The molecular mechanism by which CTSB degrades FPN to disrupt macrophage iron homeostasis and promote the progression of atherosclerosis 2025-Jun, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05228-9 PMID:39960586	研究论文	本文研究了CTSB通过降解FPN破坏巨噬细胞铁稳态并促进动脉粥样硬化进展的分子机制	首次揭示了CTSB通过降解FPN调控巨噬细胞铁死亡进而影响动脉粥样硬化进展的分子机制	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限	阐明CTSB在动脉粥样硬化进展中的作用机制	巨噬细胞铁稳态和动脉粥样硬化斑块	分子病理学	心血管疾病	单细胞转录组分析、基因敲除、药理学抑制	ApoE敲除小鼠和高脂饮食SD大鼠模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	两种动物模型（数量未明确）和人类AS组织单细胞数据
120	2025-05-23	Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals that CD177+ Tregs enhance immunosuppression through apoptosis and resistance to immunotherapy in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03330-2 PMID:40055567	research paper	该研究通过单细胞和空间转录组分析，发现CD177+ Tregs通过凋亡和免疫治疗抵抗增强肝细胞癌的免疫抑制	首次鉴定CD177作为肿瘤浸润Treg细胞的生物标志物，并揭示其在肝细胞癌免疫抑制中的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝细胞癌中Treg细胞的免疫抑制机制并寻找新的治疗靶点	CD177+ Treg细胞	癌症免疫学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	CD177 Treg条件性敲除小鼠模型	转录组数据	NA