单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-11 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
|
综述 | 系统总结单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用，揭示脑细胞异质性与疾病发病机制 | 整合单细胞转录组、表观基因组和空间转录组数据，阐明疾病轨迹和细胞通讯网络 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-11 |
Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05201-z
PMID:40681826
|
研究论文 | 本研究探讨妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响，特别是对调节食欲和能量平衡的神经元群体形成的影响 | 首次揭示必需氨基酸减少通过mTOR信号通路和表观遗传机制选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元分化 | 仅研究了特定发育窗口期，需要进一步研究其他发育阶段 | 探究宫内生长受限与长期代谢紊乱风险的机制联系 | 妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑发育 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, EdU标记, 免疫组织化学, RNAscope, mTOR信号分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 甲基化数据 | 妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-11 |
Biology as vulnerability in follicular lymphoma: genetics, epigenetics, and immunogenetics
2025-Oct-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026020
PMID:40089999
|
综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤的遗传学、表观遗传学和免疫遗传学特征及其作为治疗脆弱性的生物学基础 | 整合了高通量测序、空间转录组学和成像技术的最新发现，系统阐述了滤泡性淋巴瘤的生物学脆弱性 | 主要基于现有研究综述，缺乏原始实验数据验证 | 探讨滤泡性淋巴瘤的生物学特征及其治疗脆弱性 | 滤泡性淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 高通量测序, 空间转录组学, 成像技术 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-11 |
Profiling the spatial architecture of multiple myeloma in human bone marrow trephine biopsy specimens with spatial transcriptomics
2025-Oct-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028896
PMID:40643106
|
研究论文 | 使用空间转录组学技术分析多发性骨髓瘤患者骨髓活检样本中的空间结构特征 | 首次应用亚细胞空间转录组学解析多发性骨髓瘤骨髓微环境的空间异质性，发现恶性浆细胞亚群形成不同的微环境 | 样本量相对有限（21例个体），需要更大规模研究验证发现 | 探索多发性骨髓瘤骨髓微环境的细胞和分子特征 | 人类骨髓环钻活检样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 21例个体（7例癌前病变，10例新诊断多发性骨髓瘤，4例健康） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-11 |
Epigenetic dynamics and molecular mechanisms in oncogenesis, tumor progression, and therapy resistance
2025-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04217-5
PMID:40358685
|
综述 | 本文综述了癌症发生发展过程中遗传、表观遗传和分子机制的动态相互作用，重点关注肿瘤发生、转移和治疗抵抗的关键分子通路 | 整合了分子、遗传和表观遗传多维度视角，强调肿瘤微环境在癌症进展中的作用，并探讨CRISPR-Cas9表观基因组编辑和单细胞RNA测序等前沿技术的应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献综合分析 | 阐明癌症发生发展、转移和治疗抵抗的分子机制，为开发创新靶向治疗方法提供理论基础 | 癌症细胞及其分子调控机制，包括肿瘤微环境 | 癌症生物学 | 癌症 | CRISPR-Cas9表观基因组编辑，单细胞RNA测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-11 |
Neutrophils predominate as IL1B-expressing cells in Schnitzler syndrome: Insights from the SCan study to evaluate the efficacy and safety of canakinumab in Japanese patients
2025-Oct, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.04.003
PMID:40393905
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，揭示了施尼茨勒综合征中IL1B表达细胞主要为中性粒细胞 | 首次在施尼茨勒综合征患者中鉴定出中性粒细胞是IL1B表达的主要细胞来源 | 样本量较小（仅5名日本患者），仅对2例患者进行了单细胞分析 | 评估卡那单抗在日本施尼茨勒综合征患者中的疗效和安全性，并探究疾病发病机制 | 5名日本施尼茨勒综合征患者 | 数字病理学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 细胞因子检测 | NA | RNA测序数据, 蛋白质检测数据, 临床数据 | 5名患者（2名进行了单细胞分析） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-11 |
Engineering CRISPR System-Based Bacterial Outer Membrane Vesicle Potentiates T Cell Immunity for Enhanced Cancer Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501565
PMID:40495695
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR系统的工程化细菌外膜囊泡，用于增强T细胞免疫以改善癌症免疫治疗 | 通过工程化改造大肠杆菌BL21来源的外膜囊泡，实现了多基因的高效包装和递送，显著增强了T细胞的趋化和活化能力 | 研究主要在小鼠模型中进行验证，在人类患者中的有效性和安全性仍需进一步评估 | 开发新型癌症免疫治疗策略，克服免疫检查点阻断治疗的局限性 | 细菌外膜囊泡(OMVs)、T细胞免疫、癌症免疫治疗 | 生物医学工程 | 膀胱癌、乳腺癌 | CRISPR系统、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | MB49和B16F10小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-11 |
Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases
2025-Oct-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006849
PMID:40698837
|
研究论文 | 本文提出了一种研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛存活和免疫调节作用的方法学框架 | 首次结合体外和体内模型系统研究lacritin肽在免疫调节和细胞再生中的双重作用 | 研究仍处于临床前阶段，需要进一步验证其在人类疾病治疗中的效果 | 开发针对免疫性和外科疾病的精准医疗策略 | 胰岛β细胞、免疫细胞、糖尿病小鼠模型 | 精准医疗 | 自身免疫疾病、糖尿病、克罗恩病、心力衰竭、肺纤维化、慢性肾病、神经损伤 | 质谱流式细胞术、成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、体外胰岛测试、体内移植 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据、影像数据 | 非肥胖糖尿病小鼠模型和糖尿病小鼠受体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-11 |
CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021
PMID:40534129
|
系统综述 | 本文系统综述了基于CRISPR的基因编辑技术在囊性纤维化治疗中的应用进展 | 通过跨研究比较分析27篇研究文章，系统评估了不同CRISPR技术对CFTR基因突变的编辑效率和功能恢复效果 | 缺乏编辑效率和功能恢复的标准化报告，需要更多单细胞RNA测序和体内研究来获得临床相关结论 | 为基于CRISPR的基因编辑方法在囊性纤维化治疗中的进一步探索提供技术见解 | 囊性纤维化致病突变和CFTR基因 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR基因编辑技术，包括同源定向修复、碱基编辑和引物编辑 | NA | 文献数据 | 27篇研究文章，涉及超过15种CF致病突变 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2025-10-11 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase protects from experimental acute kidney injury
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00138.2025
PMID:40602784
|
研究论文 | 本研究通过抑制甲基硫代腺苷磷酸化酶(MTAP)在小鼠急性肾损伤模型中展示保护作用 | 首次证明MTAP抑制在实验性急性肾损伤中的保护作用，并通过单细胞RNA测序在人类AKI活检中验证其表达特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅为观察性分析，缺乏临床干预验证 | 探索MTAP抑制对急性肾损伤的保护机制及治疗潜力 | 小鼠急性肾损伤模型和人类肾脏单细胞RNA测序数据 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织病理学数据 | 小鼠实验模型和人类肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-11 |
Kidney organoids demonstrate that PTH1R drives a cystogenic cAMP-pPKA-pCREB axis in developmental polycystic kidney disease
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00056.2025
PMID:40602764
|
研究论文 | 本研究利用肾脏类器官模型揭示了PTH1R在发育性多囊肾病中驱动囊肿形成的cAMP-pPKA-pCREB信号轴 | 首次发现PTH1R作为G蛋白偶联受体在发育性多囊肾病中启动囊肿形成信号级联反应 | 研究主要基于体外类器官模型，缺乏体内验证 | 探索发育性多囊肾病的囊肿形成机制和潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的ARPKD类器官、等基因野生型类器官、人类ARPKD组织 | 发育生物学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、靶向机制研究 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-11 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646238
PMID:40236180
|
研究论文 | 提出Lloki框架，实现跨平台空间转录组数据的统一整合 | 无需共享基因面板即可整合不同平台的空间转录组数据，通过最优传输引导的特征传播和批量对齐技术 | NA | 解决跨平台空间转录组数据整合的技术挑战 | 小鼠脑组织和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT，图神经网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 五个不同技术的小鼠脑样本和五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-11 |
Vispro improves imaging analysis for Visium spatial transcriptomics
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617088
PMID:39416029
|
研究论文 | 开发了针对10x Visium数据的全自动图像处理工具Vispro，用于改善空间转录组学图像分析 | 首个针对Visium数据的端到端全自动图像处理工具，集成了四个关键模块：基准标记检测、基准标记去除与图像修复、组织区域检测和分离组织区域分割 | 仅针对10x Visium平台数据开发，未验证在其他空间转录组技术上的适用性 | 解决空间转录组学图像分析中基准标记和背景区域带来的挑战 | 空间转录组学组织图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 114 | 2025-10-11 |
Altered AP-1, RUNX and EGR chromatin dynamics drive fibrotic lung disease
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619858
PMID:39554071
|
研究论文 | 通过多组学单核测序分析揭示转录因子AP-1、RUNX和EGR在纤维化肺病中的调控机制 | 首次使用ChromBPNet神经网络工具在单碱基分辨率推断转录因子结合，并开发新型算法HALO验证转录因子活性 | 研究样本来源于移植肺组织，可能无法完全代表疾病早期阶段 | 探究纤维化肺病中成纤维细胞和巨噬细胞的转录调控机制 | 系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）患者和供体对照肺组织 | 计算生物学 | 肺纤维化 | 单核ATAC-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 | ChromBPNet神经网络, HALO算法 | 基因组可及性数据, 转录组数据 | SSc-ILD和供体对照肺组织（具体样本数未明确说明） | NA | 单核多组学测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-11 |
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Aug-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02514-2
PMID:37635251
|
研究论文 | 比较BCi-NS1.1细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型在单细胞分辨率下的细胞异质性和基因表达差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较工程化基底细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型的基因表达和免疫功能差异 | 样本量较小（各3个独立分化/供体），未完全表征所有基因表达和免疫功能差异 | 评估BCi-NS1.1细胞系作为气液界面培养模型的适用性 | 人气道上皮细胞的气液界面培养模型 | 单细胞生物学 | 呼吸道感染疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | BCi-NS1.1来源培养物（3个独立分化），原代细胞来源培养物（3个不同供体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-10 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111394
PMID:39595571
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现DNMT3B和PFKFB4基因表达与肝母细胞瘤转移特性相关 | 首次将代谢酶表达谱与肝母细胞瘤转移风险相关联，并开发了基于DNMT3B和PFKFB4表达的代谢评分系统 | 研究基于公共数据集GSE131329，样本量有限，需要进一步实验验证 | 识别与肝母细胞瘤转移相关的代谢酶生物标志物 | 肝母细胞瘤肿瘤组织与非癌肝组织 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，机器学习 | ElasticNet，逻辑回归 | 转录组数据 | GSE131329数据集中的肝母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-10-10 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619529
PMID:39484491
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和谱系追踪技术，揭示了肺腺癌模型中肿瘤生长和转移的时空动态结构 | 首次将高分辨率空间转录组学与动态谱系追踪技术相结合，解析肿瘤细胞状态与微环境重塑的协同演化过程 | 研究基于小鼠肺腺癌模型，结果在人类肿瘤中的适用性需要进一步验证 | 阐明肿瘤细胞状态与微环境结构的连续变化如何协同促进肿瘤进展 | Kras驱动的肺腺癌小鼠模型 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学, 谱系追踪 | NA | 空间转录组数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-09 |
Multi-Omics Atlas-Assisted Discovery of Transcription Factors for Selective T Cell State Programming
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522354
PMID:36711632
|
研究论文 | 本研究通过构建多组学图谱系统鉴定调控CD8⁺ T细胞不同状态的转录因子，并发现选择性编程T细胞状态的关键调控因子 | 整合转录组和表观基因组数据构建T细胞状态图谱，结合CRISPR筛选和单细胞RNA测序技术发现新的T细胞状态特异性转录因子 | 研究主要聚焦于CD8⁺ T细胞，研究结果在其他T细胞亚群中的适用性需要进一步验证 | 系统定义驱动CD8⁺ T细胞不同分化状态的转录因子，为精准免疫治疗提供理论基础 | CD8⁺ T细胞的九个不同分化状态，特别是终末耗竭T细胞和组织驻留记忆T细胞 | 免疫学、计算生物学 | 癌症、病毒感染 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多组学整合分析 | 转录因子活性推断、网络分析 | 转录组数据、表观遗传数据 | 九个CD8⁺ T细胞状态 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-10-09 |
A Comprehensive Immune Cell Atlas of Cystic Kidney Disease Reveals the Involvement of Adaptive Immune Cells in Injury-Mediated Cyst Progression in Mice
2022-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021030278
PMID:35110364
|
研究论文 | 通过构建小鼠囊性肾病单细胞图谱，揭示适应性免疫细胞在损伤介导的囊肿进展中的关键作用 | 首次系统绘制囊性肾病免疫细胞图谱，发现适应性免疫细胞在损伤加速型囊肿进展中的特异性作用机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；样本数量相对有限 | 探究免疫细胞在囊性肾病进展中的作用机制 | 成年诱导性条件性Ift88基因敲除小鼠（纤毛突变小鼠） | 单细胞生物学 | 囊性肾病 | 单细胞RNA测序 | NicheNet | 单细胞转录组数据 | 79,355个细胞，来自对照组和纤毛突变小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-10-08 |
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
2025-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01488-6
PMID:40148468
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子LHX2在髓母细胞瘤中介导并增强致癌性BMP信号通路的分子机制 | 首次发现LHX2通过转录诱导BMP I型受体ACVR1表达，形成BMP信号的正反馈环路，并证实其在肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 探索BMP信号通路在髓母细胞瘤中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者来源的肿瘤样本和细胞模型 | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学、转录组分析、免疫组织化学、细胞移植 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 多个髓母细胞瘤亚组的患者来源肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |