单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 32278 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2025-11-07
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术发现布氏锥虫在牛感染中即使低寄生虫血症下也存在具有传播适应性的隐秘血液形式 首次在自然宿主牛体内观察到兼具细长型和粗短型转录组的混合寄生虫群体,挑战了基于啮齿动物模型的密度依赖性分化假设 未观察到粗短型形态学特征或发育标志蛋白表达,寄生虫分化机制仍需进一步验证 研究布氏锥虫在自然宿主牛体内的发育分化和传播适应性机制 布氏锥虫在牛和鼠感染中的寄生虫群体 寄生虫学 非洲锥虫病 单细胞RNA测序,显微镜检查 NA 转录组数据,显微镜图像 牛和鼠感染样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
102 2025-11-07
Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung
2025-Nov-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学方法构建了健康与疾病人类肺部的空间单细胞图谱,揭示了细胞类型在组织拓扑结构中的定位和区域基因表达变异 首次在人类肺部应用多种空间转录组学方法,系统揭示了细胞类型在组织拓扑结构中的精确定位和区域特异性基因表达变异,并发现了慢性阻塞性肺病中上皮细胞类型组成的未知失衡 研究仅聚焦于人类肺部的三个代表性区域,可能未完全覆盖整个肺部的空间异质性 理解肺组织拓扑结构或外部因素对细胞类型内基因表达变异的影响 健康与疾病状态下的人类肺部细胞 空间转录组学 慢性阻塞性肺病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 数百万个细胞 NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
103 2025-11-07
CellSP enables module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Nov-05, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出CellSP计算框架,用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 引入'基因-细胞模块'概念,能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布模式的基因集 NA 开发能够识别和解释亚细胞空间转录分布功能模式的计算工具 小鼠脑组织、肾脏癌样本和阿尔茨海默病模型 空间转录组学 肾脏癌,阿尔茨海默病 空间转录组学 计算框架 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
104 2025-11-07
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2025-Nov-05, The EMBO journal
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了Notch信号在腺体干细胞自我更新和损伤后迁移修复中的核心调控作用 首次整合单细胞RNA测序和批量ATAC/RNA测序系统解析腺体器官干细胞的调控机制,并证实Notch信号在多种腺体组织再生中的保守功能 主要基于小鼠模型和类器官系统,人体验证数据有限 探索腺体器官干细胞的调控机制及其在组织再生中的作用 小鼠唾液腺类器官、唾液腺组织、鼠源及患者来源的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官 单细胞生物学 腺体疾病 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 类器官模型 基因表达数据, 表观遗传数据 多种腺体类器官模型和辐射损伤组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq NA NA
105 2025-11-07
Anti-progestin therapy targets hallmarks of breast cancer risk
2025-Nov-05, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究评估了抗孕激素药物醋酸乌利司他对乳腺癌风险的预防作用 首次发现胶原蛋白VI与SOX9阳性管腔祖细胞定位的空间关联,建立了胶原组织与管腔祖细胞活性之间的联系机制 样本量较小(24名绝经前女性),研究周期较短(12周) 评估孕激素受体拮抗剂降低乳腺癌风险标志物的效果 24名绝经前女性乳腺癌高风险人群 癌症预防研究 乳腺癌 单细胞RNA测序,蛋白质组学,组织学,原子力显微镜,磁共振成像 NA 分子特征数据,临床影像数据,组织微力学数据 24名绝经前女性 NA 单细胞RNA测序,蛋白质组学,空间转录组学 NA NA
106 2025-11-07
Research on the expression, prognostic value, and regulatory effects on immune microenvironment of NETO2 in oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-05, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨NETO2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 首次系统研究NETO2在OSCC中的表达特征,结合单细胞RNA测序分析其在免疫细胞中的表达模式,并验证其对肿瘤细胞侵袭、增殖和迁移的功能影响 研究主要基于公共数据库分析,实验验证部分可能样本量有限,需要进一步临床样本验证 阐明NETO2在口腔鳞状细胞癌中的生物学功能和临床意义 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 生物信息学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析, 分子对接, 细胞功能实验 诺莫图预测模型 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 TCGA和GEO数据库队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
107 2025-11-07
Bone marrow-derived emergency monopoiesis drives brain-lung axis injury after traumatic brain injury via IL-1
2025-Nov-05, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示创伤性脑损伤后骨髓源性紧急单核细胞生成通过IL-1驱动脑-肺轴损伤的机制 首次发现颅骨骨髓在创伤性脑损伤后24小时内发生的IL-1驱动紧急单核细胞生成是多重器官损伤的核心驱动因素 NA 阐明创伤性脑损伤导致外周器官损伤的机制基础 创伤性脑损伤患者和小鼠模型 NA 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 临床观察数据、单细胞RNA测序数据、临床前模型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
108 2025-11-07
Integrating genetics and transcriptome analyses identify potential biomarkers and immune interactions in metabolic syndrome-related sarcopenia
2025-Nov-05, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合遗传学和转录组学分析,识别代谢综合征相关肌少症的潜在生物标志物和免疫相互作用 首次从遗传学角度揭示代谢综合征与肌少症的共病机制,发现79个共享风险SNPs和9个多效性基因 研究结果需要在更大样本中进一步验证,动物模型验证的基因数量有限 探索代谢综合征与肌少症之间的潜在机制和生物标志物 代谢综合征和肌少症相关性状 生物信息学 代谢综合征, 肌少症 全基因组关联研究, 连锁不平衡评分回归, 孟德尔随机化, 转录组范围关联研究, 单细胞RNA测序 临床预测模型, 动物模型 遗传数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 训练数据AUC 0.75, 验证数据AUC 0.72 NA 单细胞RNA测序 NA NA
109 2025-11-07
MaskGraphene: an advanced framework for interpretable joint representation for multi-slice, multi-condition spatial transcriptomics
2025-Nov-05, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出MaskGraphene框架,用于多切片、多条件空间转录组数据的可解释联合表示学习 通过掩码自监督学习、三元组损失和聚类级局部对齐整合空间转录组数据,建立跨切片的间接“软链接”和直接“硬链接” NA 开发能够保持空间几何结构并校正批次效应的可解释嵌入方法 空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 图神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
110 2025-11-07
Harnessing multi-omics approaches to decipher tumor evolution and improve diagnosis and therapy in lung cancer
2025-Nov-05, Biomarker research IF:9.5Q1
综述 本文综述了多组学方法在解析肺癌肿瘤进化及改善诊疗中的应用潜力 强调整合多组学模型在阐明肺癌生态系统复杂相互作用方面的潜力 未提及具体研究数据或实验验证的局限性 探讨多组学方法在肺癌精准诊疗和生物标志物发现中的应用 肺癌肿瘤异质性、肿瘤微环境及生物标志物 生物信息学 肺癌 全基因组测序,单细胞测序,空间转录组学 整合多组学模型 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,全基因组测序 NA NA
111 2025-11-07
Ascorbic acid attenuates immunosenescence and cognitive decline via MYH9-Mediated CD8⁺ T cell differentiation
2025-Nov-05, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示抗坏血酸通过靶向MYH9调节CD8⁺ T细胞分化,改善免疫衰老和认知功能下降 首次发现抗坏血酸通过结合MYH9蛋白激活细胞骨架通路,特异性促进CD8⁺ T细胞分化,从而改善年龄相关的免疫衰老和认知功能下降 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验验证 探究抗坏血酸在改善免疫衰老和认知功能下降中的作用机制 16月龄C57BL/6老年小鼠、造血干细胞、外周血单个核细胞 免疫学 老年性疾病 单细胞RNA测序 动物模型 基因表达数据 老年C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
112 2025-11-07
Prognostic evaluation and experimental validation of cuproptosis-related hub genes identified through weighted gene co-expression network analysis in uveal melanoma
2025-Nov-05, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过加权基因共表达网络分析识别铜死亡相关基因,构建了葡萄膜黑色素瘤预后模型并验证其临床价值 首次系统研究铜死亡在葡萄膜黑色素瘤中的作用,构建了基于八个关键基因的预后模型CRG_score,并通过单细胞RNA测序和细胞实验验证 研究样本量相对有限(221例),需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 探索铜死亡相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后评估和治疗反应预测中的作用 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤细胞 生物信息学 葡萄膜黑色素瘤 加权基因共表达网络分析,LASSO Cox回归,单细胞RNA测序,转录组分析,细胞实验 CRG_score预后模型 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 221例葡萄膜黑色素瘤样本 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
113 2025-11-07
In vitro derivation of midbrain dopaminergic neurons from porcine embryonic stem cells in multi-dimensional conditions
2025-Nov-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究建立了从猪胚胎干细胞在二维和三维条件下高效分化中脑多巴胺能神经元的优化方案 首次建立了从猪干细胞生成功能验证的中脑多巴胺能神经元和中脑类器官的稳健平台,揭示了物种特异性信号动态 仅使用体外受精和孤雌生殖来源的猪胚胎干细胞,未与其他物种干细胞进行直接比较 建立猪特异性中脑多巴胺能神经元分化方案,为神经发育和疾病建模提供大型动物模型 猪胚胎干细胞及其分化的中脑多巴胺能神经元和中脑类器官 干细胞生物学 神经退行性疾病 免疫荧光、膜片钳电生理、微电极阵列记录、多巴胺ELISA、RNA测序 NA 图像、电生理信号、分子检测数据、基因表达数据 体外受精和孤雌生殖来源的猪胚胎干细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
114 2025-11-07
Macrophage-Targeted Magnesium Ion-Nourisher for NLRP3 Inflammasome Inhibition to Enhance Liver Inflammatory Disease Treatment
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种靶向巨噬细胞的镁离子营养剂,通过抑制NLRP3炎症小体激活来增强肝脏炎症疾病治疗 利用巨噬细胞的胞葬作用设计纳米级镁离子靶向递送系统,首次揭示细胞内镁离子对NLRP3炎症小体的抑制作用 镁离子的免疫调节机制尚未完全阐明,且对多种细胞具有广泛影响 开发靶向巨噬细胞的镁离子递送策略以治疗肝脏炎症疾病 巨噬细胞、Kupffer细胞、肠道屏障 生物医学工程 肝脏炎症疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
115 2025-11-07
Stress-Induced Activation of Prolactin-NR4A1-Midkine Axis Exacerbates Skin Inflammation
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了压力通过催乳素-NR4A1-中期因子轴加剧皮肤炎症的新机制 首次发现压力通过催乳素激活真皮上层APCDD1成纤维细胞中的NR4A1-中期因子轴,从而放大皮肤炎症反应 NA 阐明压力加剧皮肤炎症的分子机制 人类银屑病患者、小鼠皮肤炎症模型 单细胞转录组学 皮肤炎症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、血浆样本数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2025-11-07
HMGB3 promotes brain metastasis of lung adenocarcinoma by recruiting SSBP1 for nuclear translocation to remodel mitochondrial metabolism
2025-Nov-05, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了HMGB3通过招募SSBP1进行核转位重塑线粒体代谢,从而促进肺腺癌脑转移的分子机制 首次发现HMGB3通过招募SSBP1诱导其核转位,重编程线粒体代谢,激活PI3K-Akt信号通路促进肺腺癌脑转移的新机制 研究主要基于细胞模型和回顾性队列,需要更多前瞻性临床研究验证 探究HMGB3在调控肿瘤细胞代谢促进肺腺癌脑转移中的作用 肺腺癌细胞、临床肺腺癌患者组织样本 癌症生物学 肺腺癌 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫共沉淀, 质谱分析, Western blotting, 功能获得与缺失实验 NA 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 临床病理数据 两个回顾性队列:原发性肺腺癌队列和肺腺癌脑转移队列 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
117 2025-11-07
Circulating Cathepsin D Exacerbates Injury-Induced Brain Damage by Promoting Neutrophil Infiltration Into the Brain
2025-Nov-04, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究揭示循环中的组织蛋白酶D前体通过上调脑内皮VCAM-1表达促进中性粒细胞浸润,加剧脑损伤 首次发现循环中的非酶活性CTSD前体可通过激活脑内皮细胞促进中性粒细胞脑内浸润的新机制 研究主要基于转基因小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 探究循环CTSD对脑损伤后炎症反应的影响机制 转基因hCTSDhi小鼠和CTSD单核敲除小鼠的脑组织 神经科学 脑损伤 单细胞RNA测序 转基因小鼠模型 基因表达数据 多组转基因小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
118 2025-11-07
A Single-cell and Spatially Resolved Cell Atlas of Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术构建了人类食管鳞状细胞癌的单细胞和空间分辨率细胞图谱 首次系统揭示了COL17A1+上皮细胞和POSTN+成纤维细胞亚群在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用及其相互作用机制 NA 阐明食管鳞状细胞癌免疫抑制微环境的分子特征和机制 人类食管鳞状细胞癌及匹配的非肿瘤组织 数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学 NA 单细胞RNA序列数据,空间转录组数据,代谢组数据 一系列人类食管鳞状细胞癌及匹配非肿瘤组织 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
119 2025-11-07
Inhibition the MAP3K20-mediated ribotoxic stress response pathway downregulates M1 macrophage polarization in ulcerative colitis
2025-Nov-04, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过多模态方法揭示MAP3K20介导的核糖毒性应激反应通路在溃疡性结肠炎中驱动M1巨噬细胞极化的机制 首次鉴定MAP3K20作为协调RSR介导的M1巨噬细胞极化的关键激酶,并证明其抑制剂Vemurafenib的治疗潜力 研究主要基于DSS诱导的UC动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究核糖毒性应激反应通路在溃疡性结肠炎中驱动M1巨噬细胞极化的机制 溃疡性结肠炎肠道组织、M1巨噬细胞、DSS诱导的UC模型 生物医学研究 溃疡性结肠炎 基因集变异分析, 加权基因共表达网络分析, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
120 2025-11-07
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进肝细胞脂质积累和代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 首次发现脂肪细胞死亡通过S100A8+巨噬细胞-CCN3-CD36轴驱动肝脏脂肪变性的新机制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究脂肪细胞死亡如何促进肝脏脂肪积累和MASLD进展 基因修饰小鼠模型 分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
回到顶部