单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-05-04	Chronic intermittent fasting impairs β cell maturation and function in adolescent mice 2025-02-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115225 PMID:39827461	research paper	研究间歇性禁食对不同年龄小鼠β细胞功能和系统代谢的影响	揭示了慢性间歇性禁食对年轻小鼠β细胞成熟和功能的负面影响，并通过scRNA-seq技术进行了验证	研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自T1D和T2D患者胰岛	探讨间歇性禁食对β细胞功能的影响及其年龄依赖性	老年、中年和年轻小鼠以及人类胰岛	代谢研究	糖尿病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	不同年龄组的小鼠和人类胰岛样本
102	2025-05-04	Early precursor-derived pituitary gland tissue-resident macrophages play a pivotal role in modulating hormonal balance 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115227 PMID:39841599	research paper	本研究通过单细胞转录组学、命运图谱和成像技术，揭示了垂体驻留巨噬细胞的异质性和空间特异性，并探讨了它们在调节垂体激素平衡中的作用	首次描述了垂体驻留巨噬细胞的异质性、空间分布及其对激素平衡的调节机制，特别是通过细胞外ATP介导的细胞间信号传导	研究未涉及垂体驻留巨噬细胞与其他免疫细胞的相互作用，以及这些巨噬细胞在疾病状态下的变化	探索垂体驻留巨噬细胞的特性及其在调节内分泌系统中的作用	垂体驻留巨噬细胞（pitMØs）及其与激素分泌细胞的相互作用	免疫学	NA	单细胞转录组学、命运图谱、成像技术	NA	单细胞RNA测序数据、成像数据	NA
103	2025-05-04	Single-cell analysis of neoplastic plasma cells identifies myeloma pathobiology mediators and potential targets 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101925 PMID:39855192	研究论文	通过单细胞RNA测序和B细胞受体测序技术，研究多发性骨髓瘤的病理生物学介质和潜在治疗靶点	首次结合scRNA-seq和scBCR-seq技术区分单克隆/肿瘤性浆细胞与多克隆/正常浆细胞，并发现更多失调基因，特别是在前体患者中	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证	探索多发性骨髓瘤的病理生物学机制并识别潜在治疗靶点	多发性骨髓瘤患者的浆细胞	数字病理学	多发性骨髓瘤	scRNA-seq, scBCR-seq	NA	单细胞RNA测序数据	未明确说明样本数量
104	2025-05-04	Combining T cell receptor sequencing and transcriptomics to characterize tissue-resident T cells from human gut biopsies 2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151353 PMID:39837221	研究论文	本研究结合T细胞受体测序和转录组学技术，对人类肠道活检组织中的组织驻留T细胞进行表征	首次将流式细胞术、TCR测序和转录组学结合，分析来自批量分选的T细胞和单细胞的T细胞库	研究样本量有限，且为概念验证研究	深入了解胃肠道T细胞在健康和疾病状态下的特异性与功能	胃、结肠活检样本及血液样本，来自有或无炎症性糜烂性胃炎的患者	免疫学	胃炎	NGS, 流式细胞术, 单细胞测序	NA	测序数据, 基因表达数据	来自胃、结肠活检及血液的T细胞样本
105	2025-05-04	Everything everywhere all at once: Unraveling the waves of aging 2025-Feb-11, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2025.01.015 PMID:39938481	research paper	该研究通过单细胞转录组学揭示了衰老过程中多个器官内细胞群体的动态变化，并识别出四种不同的动态波动，其中免疫细胞是受影响最大的群体	首次在多个器官中系统性地揭示了衰老过程中的细胞动态变化，并识别出四种独特的动态波动模式	仅研究了13个器官，可能无法完全代表整个生物体的衰老过程	探索衰老过程中细胞群体的动态变化	13个器官中的多个细胞群体	生物信息学	衰老相关疾病	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序数据	多个器官的细胞群体（具体数量未提及）
106	2025-05-04	Engineered Extracellular Vesicles Modified by Angiopep-2 Peptide Promote Targeted Repair of Spinal Cord Injury and Brain Inflammation 2025-Feb-04, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c14675 PMID:39853366	research paper	研究通过生物修饰M2小胶质细胞，制备Ang2-EVs和M-Ang2-EVs，以促进脊髓损伤和脑炎症的靶向修复	应用Angiopep-2肽增强脊髓损伤细胞的靶向性，成功构建能靶向脊髓损伤部位和大脑的工程化细胞外囊泡	NA	开发更有效的工程化细胞外囊泡以治疗脊髓损伤和脑炎症	脊髓损伤和脑炎症	生物医学工程	脊髓损伤	单细胞测序、免疫荧光实验、单核测序	NA	测序数据、免疫荧光图像	小鼠脊髓
107	2025-05-04	Single-cell and Spatial Transcriptomics Illuminate Bat Immunity and Barrier Tissue Evolution 2025-Feb-03, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1 DOI:10.1093/molbev/msaf017 PMID:39836373	研究论文	通过单细胞和空间转录组学技术，研究埃及果蝠的免疫系统及屏障组织进化，揭示其补体系统基因的独特表达模式	首次在埃及果蝠中通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了补体系统基因在肺和肠道上皮关键区域的高表达及其与抗病性的潜在关联	研究仅聚焦于埃及果蝠，未涵盖其他蝙蝠物种，且机制性实验验证不足	探究埃及果蝠免疫系统的转录特征及其与抗病性的关系	埃及果蝠的肠道、肺和血细胞，并与小鼠和人类进行比较	比较免疫学	NA	单细胞转录组学、空间转录组学	NA	转录组数据	埃及果蝠、小鼠和人类的组织样本（具体数量未明确说明）
108	2025-05-04	Cotton2035: From genomics research to optimized breeding 2025-Feb-03, Molecular plant IF:17.1Q1 DOI:10.1016/j.molp.2025.01.010 PMID:39844464	research paper	本文探讨了棉花基因组学研究及其在优化育种中的应用	提出了棉花ENCODE项目，以系统解码棉花基因组中的功能元件和调控网络，并强调了单细胞测序和高分辨率时空组学技术的重要性	未提及具体的技术实施细节或实验验证结果	实现从棉花基因组学到育种（G2B）的目标，推动棉花育种策略的发展	棉花（Gossypium）的野生和栽培品种	植物基因组学	NA	单细胞测序、高分辨率时空组学、基因组编辑、人工智能	NA	基因组数据、多组学数据	多种野生和栽培棉花种群的重测序数据
109	2025-05-04	Development of BACE2-IN-1/tranylcypromine-based compounds to induce steroidogenesis-dependent neuroprotection 2025-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2025.117851 PMID:39837213	研究论文	开发基于BACE2-IN-1/tranylcypromine的化合物以诱导类固醇生成依赖性神经保护	通过将tranylcypromine（LSD1抑制剂）插入BACE2抑制模板（BACE2-IN-1）并进行结构修饰，开发出新型神经保护剂，有效缓解氧化应激后的线粒体损伤并恢复胆固醇生物合成途径	研究主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验	开发新型神经保护剂以治疗创伤性脑损伤（TBI）	创伤性脑损伤（TBI）患者及小鼠模型	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Neuro-2a细胞和小鼠模型	基因表达数据和行为学数据	未明确提及具体样本数量
110	2025-05-04	Attractor Landscape Analysis Reveals a Reversion Switch in the Transition of Colorectal Tumorigenesis 2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202412503 PMID:39840939	研究论文	本文介绍了一个名为REVERT的系统框架，用于重建核心分子调控网络模型，并基于单细胞转录组数据在肿瘤发生过程中识别逆转开关	提出了REVERT系统框架，能够重建核心分子调控网络模型并识别肿瘤发生过程中的逆转开关	未明确提及具体局限性	研究肿瘤发生过程中的细胞命运转变机制，并寻找逆转这种转变的分子开关	结肠癌患者来源的匹配类器官和正常结肠的单细胞转录组数据	系统生物学	结肠癌	单细胞转录组测序	核心分子调控网络模型	单细胞转录组数据	未明确提及具体样本数量
111	2025-05-04	IFN-γ reprograms cardiac microvascular endothelial cells to mediate doxorubicin transport and influences the sensitivity of mice to doxorubicin-induced cardiotoxicity 2025-Feb, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-024-01389-7 PMID:39843977	研究论文	本研究探讨了IFN-γ通过重编程心脏微血管内皮细胞影响多柔比星（DOX）转运的机制，并揭示了其对小鼠多柔比星诱导心脏毒性（DIC）敏感性的影响	首次揭示了IFN-γ通过上调P-糖蛋白表达增加DOX外排，从而降低DIC敏感性的机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	探究多柔比星诱导心脏毒性（DIC）敏感性差异的分子机制	小鼠心脏微血管内皮细胞	心血管疾病研究	心血管疾病	表面增强拉曼光谱（SERS）、单细胞RNA测序	小鼠DIC模型	基因表达数据、药物分布数据	未明确说明小鼠数量
112	2025-05-04	Mapping the topography of spatial gene expression with interpretable deep learning 2025-Feb, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02503-3 PMID:39849132	研究论文	本文提出了一种名为GASTON的深度学习算法，用于解析空间转录组数据中的基因表达模式	开发了GASTON算法，一种无监督且可解释的深度学习方法，用于学习等深度、空间梯度和分段线性表达函数，以模拟基因表达的连续梯度和不连续变化	未明确提及具体局限性	解决空间转录组数据稀疏性问题，解析基因表达的空间模式	空间转录组数据	空间转录组学	NA	空间转录组技术	深度学习	基因表达数据	多个组织样本（具体数量未明确提及）
113	2025-05-04	Integrative proteogenomic analysis identifies COL6A3-derived endotrophin as a mediator of the effect of obesity on coronary artery disease 2025-Feb, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-02052-7 PMID:39856218	研究论文	通过整合蛋白质组学和基因组学分析，研究肥胖如何通过循环蛋白质影响冠状动脉疾病，并确定COL6A3衍生的内啡肽作为关键介质	首次将两步蛋白质组范围的孟德尔随机化、共定位、表观基因组学和单细胞RNA测序整合，识别出COL6A3衍生的内啡肽作为肥胖影响冠状动脉疾病的关键介质	研究未涉及其他可能影响冠状动脉疾病的肥胖相关因素	探究肥胖如何通过循环蛋白质影响冠状动脉疾病、中风和2型糖尿病	循环蛋白质，特别是COL6A3及其衍生的内啡肽	蛋白质组学与基因组学	冠状动脉疾病	两步蛋白质组范围的孟德尔随机化、共定位、表观基因组学、单细胞RNA测序	NA	蛋白质组数据、基因组数据、表观基因组数据、单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
114	2025-05-04	Single cell approaches define neural stem cell niches and identify microglial ligands that can enhance precursor-mediated oligodendrogenesis 2025-01-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115194 PMID:39823226	研究论文	利用单细胞RNA测序和单细胞空间转录组学技术，研究稳态和损伤条件下前脑神经干细胞（NSC）微环境，并鉴定出促进少突胶质细胞生成的微胶质细胞配体	首次定义了背侧和外侧脑室-室下区（V-SVZ）为两个不同的微环境区域，并发现损伤后微胶质细胞释放的特定配体可促进少突胶质细胞生成	研究主要基于小鼠模型，人类相关性的验证尚不明确	探索神经干细胞微环境在稳态和损伤条件下的动态变化及其对少突胶质细胞生成的影响	前脑神经干细胞（NSC）及其微环境	神经科学	神经系统损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞空间转录组学	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据	未明确说明具体样本数量，但涉及稳态和损伤条件下的神经干细胞及其微环境分析
115	2025-05-04	Adenosine diphosphate stimulates VEGF-independent choroidal endothelial cell proliferation: A potential escape from anti-VEGF therapy 2025-Jan-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2418752122 PMID:39835893	研究论文	研究腺苷二磷酸（ADP）对脉络膜内皮细胞（EC）增殖的刺激作用及其在抗VEGF治疗中的潜在逃逸机制	首次发现ADP能够通过P2Y1受体而非VEGF途径刺激脉络膜内皮细胞增殖，揭示了抗VEGF治疗可能的逃逸机制	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	探究组织特异性内皮细胞对普遍代谢物的血管功能反应	牛脉络膜内皮细胞（BCEC）及其他牛或人眼来源的内皮细胞	细胞生物学	脉络膜新生血管疾病	生化纯化、单细胞转录组学	小鼠脉络膜新生血管模型	实验数据、转录组数据	未明确说明具体样本数量，涉及小鼠EL4淋巴瘤提取物、牛和人眼来源的内皮细胞
116	2025-05-04	WWC proteins-mediated compensatory mechanism restricts schwannomatosis driven by NF2 loss of function 2025-Jan-24, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adp4765 PMID:39841844	research paper	该研究揭示了WWC蛋白介导的补偿机制如何限制由NF2功能缺失引发的神经鞘瘤病，并开发了一种高渗透性和短潜伏期的小鼠模型	发现了NF2通过招募E3泛素连接酶β-TrCP1/2促进WWC1-3泛素化和降解的机制，并创建了一种模拟患者病症的小鼠模型	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证	研究NF2相关神经鞘瘤病的发病机制并开发有效的临床前模型	NF2相关神经鞘瘤病的发病机制和小鼠模型	分子生物学	神经鞘瘤病	单细胞转录组分析	小鼠模型	基因表达数据	NA
117	2025-05-04	Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria 2025-Jan-24, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adr0932 PMID:39847624	research paper	该研究开发了一种名为bacterial-MERFISH的高通量、空间分辨的转录组分析方法，用于研究细菌在复杂环境中的单细胞决策	结合1000倍体积扩展与多重误差稳健荧光原位杂交（MERFISH）技术，创建了bacterial-MERFISH方法，实现了对单个细菌内数千个操纵子的空间分辨分析	NA	研究细菌在复杂环境中的单细胞异质性	细菌的转录组	digital pathology	NA	multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization (MERFISH)	NA	image	NA
118	2025-05-04	Single-cell sequencing of human Langerhans cells identifies altered gene expression profiles in patients with atopic dermatitis 2025-Jan-24, ImmunoHorizons DOI:10.1093/immhor/vlae009 PMID:39849992	research paper	通过单细胞RNA测序分析特应性皮炎患者和健康对照者的Langerhans细胞和皮肤T细胞，揭示AD皮肤中LCs的基因表达变化及其在炎症循环中的作用	首次在单细胞水平上识别出AD患者皮肤中LCs的四个亚群，并发现其中两个促炎/成熟亚群在AD皮肤中富集	研究样本量有限，且未深入探讨LCs与S. aureus互作的具体分子机制	探究Langerhans细胞在特应性皮炎发病机制中的作用	特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤Langerhans细胞和T细胞	digital pathology	atopic dermatitis	single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing	NA	RNA-seq数据	来自AD患者和健康对照者的皮肤活检样本
119	2025-05-04	Tremor in the Age of Omics: An Overview of the Transcriptomic Landscape of Essential Tremor 2025-Jan-24, Cerebellum (London, England) DOI:10.1007/s12311-025-01793-3 PMID:39853640	综述	本文综述了原发性震颤（ET）的转录组学研究现状，旨在揭示其生物学通路并探索进一步研究的可能方向	强调了单细胞和单核RNA测序技术（scRNA-seq和snRNA-seq）在揭示ET分子和细胞事件中的潜力，并指出多个研究中共享的生物学通路，特别是轴突导向和钙信号传导	样本量不足可能限制了揭示ET临床和病理异质性的细微差别	探讨ET的病理机制和潜在治疗方法	原发性震颤（ET）	转录组学	运动障碍	scRNA-seq, snRNA-seq	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本量，但指出增加样本量对研究的重要性
120	2025-05-04	Specific types of male infertility are correlated with T cell exhaustion or senescence signatures 2025-Jan-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-56193-2 PMID:39856063	research paper	该研究通过结合多参数表型分析和单细胞RNA测序，揭示了不育男性在精液和全身水平的免疫状态	首次发现年轻不育男性具有类似健康老年男性的促炎环境，并鉴定了两种不育状况下T细胞衰竭和衰老的特定特征	研究样本量未明确说明，且机制研究尚不深入	探究男性不育与免疫状态之间的关联	不育男性的精液和血液样本	生殖医学	男性不育症	scRNA-seq, 多参数表型分析	NA	单细胞转录组数据, 表型数据	未明确说明