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当前共找到 31938 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-30 |
ChromoPattern: characterizing chromosomal rearrangement patterns of copy number alteration in heterogeneous tumor cell populations at single-cell resolution
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf563
PMID:41148222
|
研究论文 | 开发了ChromoPattern计算框架，用于在单细胞分辨率下量化染色体重排模式与拷贝数变异的关系 | 首次开发能够系统量化四种不同染色体重排模式的计算方法，揭示了振荡模式在肿瘤异质性和进化中的关键作用 | 方法验证主要基于模拟数据和有限的实际样本，需要更广泛的应用验证 | 研究染色体重排模式在肿瘤异质性和进化中的作用机制 | 肝癌细胞系和乳腺癌患者的肿瘤细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞DNA测序，单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因组拷贝数数据，基因表达数据 | 肝癌细胞系和乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞DNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-30 |
Hi-C3: a statistical inference-based model for reconstructing higher-order cell-cell communication networks
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf568
PMID:41159728
|
研究论文 | 提出一种基于统计推断的模型Hi-C3，用于从单细胞RNA测序数据重建高阶细胞-细胞通讯网络 | 首次将网络扩散和流行病动力学原理应用于细胞通讯建模，能够推断传统成对通讯和新的高阶通讯模式 | NA | 开发统计推断框架以揭示超越成对互作的高阶细胞通讯网络 | 拟南芥和结直肠癌数据集中的细胞类型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 基于似然的EM算法，改进的PageRank算法 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-30 |
Single-cell multi-omics and machine learning for dissecting stemness in cancer
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf566
PMID:41159730
|
综述 | 探讨单细胞多组学与机器学习在解析癌症干细胞特性中的应用与进展 | 提出从静态标记定义转向动态功能视角的癌症干细胞研究范式转变，整合轨迹推断、空间转录组学和人工智能预测模型 | NA | 解析癌症干细胞的特性并开发精准医疗策略 | 癌症干细胞(CSCs) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 多组学整合, CRISPR筛选 | 人工智能预测模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-30 |
Integrated multi-omics analysis reveals diagnostic biomarkers and therapeutic targets for systemic lupus erythematosus
2025-Aug-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042290
PMID:40826785
|
研究论文 | 通过整合多组学分析鉴定系统性红斑狼疮的诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次通过孟德尔随机化分析确定血浆蛋白与SLE的因果关系，并构建高精度诊断列线图模型 | 分子机制仍需进一步实验验证 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制和潜在治疗策略 | 系统性红斑狼疮相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 分子对接模拟 | 列线图模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-30 |
GTestimate: improving relative gene expression estimation in scRNA-seq using the Good-Turing estimator
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf084
PMID:41159548
|
研究论文 | 提出了一种基于Good-Turing估计器的新型单细胞RNA测序归一化方法GTestimate | 使用Good-Turing估计器考虑未观察基因，改进了传统归一化方法的最大似然估计器选择 | 未明确说明方法在特定细胞类型或条件下的局限性 | 改进单细胞RNA测序中的相对基因表达估计 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞靶向PCR扩增方法(cta-seq) | Good-Turing估计器 | 基因表达数据 | 4个示例数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-30 |
Research overview and hotspots in the field of recurrent miscarriage: A literature-mining study
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1605088
PMID:41140654
|
文献挖掘研究 | 通过文献计量学分析复发性流产领域的研究概况和热点 | 首次对2015-2024年复发性流产领域进行系统的文献计量分析，识别关键研究方向和热点 | 仅基于Web of Science数据库的3114篇文献，可能存在文献收录不全的局限性 | 分析复发性流产领域的研究现状、发展趋势和研究热点 | 复发性流产相关研究文献 | 文献计量学 | 复发性流产 | 文献计量分析、共现分析、共被引分析 | NA | 文献数据 | 3114篇文献 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2025-10-30 |
The role of the nervous system in the occurrence, development, and immune response of renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681503
PMID:41142779
|
综述 | 系统探讨神经系统在肾细胞癌发生发展及免疫应答中的作用机制 | 首次系统阐述神经免疫系统在肾癌中的作用机制，提出靶向神经免疫轴的新型治疗策略 | 主要基于临床前研究数据，缺乏大规模临床验证 | 阐明神经系统在肾癌发生发展和免疫应答中的调控作用 | 肾细胞癌及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-30 |
Prognostic genes related to mitochondrial dynamics and mitophagy in diffuse large B-cell lymphoma are identified and validated using an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1686948
PMID:41142795
|
研究论文 | 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别并验证了与弥漫性大B细胞淋巴瘤线粒体动力学和线粒体自噬相关的预后基因 | 首次将线粒体动力学相关基因与DLBCL预后联系起来，建立了整合风险评分和临床参数的复合预测模型，并在单细胞水平验证了基因表达与B细胞分化的关联 | 研究主要基于公共数据库和有限临床样本验证，需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 | 探讨线粒体动力学相关基因在DLBCL患者预后中的作用 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, WGCNA, LASSO-Cox回归 | 风险评分模型, nomogram模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共RNA-seq数据库和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-30 |
Elevated SerpinB2 regulates MUC5AC expression via STAT6 signaling in nasal epithelial cells in allergic rhinitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1669777
PMID:41142810
|
研究论文 | 本研究探讨了在过敏性鼻炎中SerpinB2通过STAT6信号通路调控MUC5AC表达的机制 | 首次揭示SerpinB2在过敏性鼻炎中通过STAT6信号通路调控MUC5AC表达的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步的体内实验验证 | 评估SerpinB2在过敏性鼻炎中的表达及其通过STAT6信号通路调控MUC5AC的机制 | 过敏性鼻炎患者和健康对照者的鼻上皮细胞 | 分子生物学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Western blot，免疫荧光，ELISA | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 间歇性和持续性过敏性鼻炎患者及健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-30 |
Effects of hormone-primed oviduct epithelial cell co-culture system on swine SCNT embryo development
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1692877
PMID:41142920
|
研究论文 | 本研究建立了激素预处理的猪输卵管上皮细胞共培养系统，显著提高了猪体细胞核移植胚胎的囊胚形成率 | 首次使用雌二醇和孕酮预处理的输卵管上皮细胞建立共培养系统，更好地模拟输卵管生理环境 | 囊胚总细胞数未增加，具体分子机制仍需进一步验证 | 提高猪体细胞核移植胚胎的发育效率 | 猪体细胞核移植胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序(SMART-seq2) | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-30 |
Identification and Validation of the Key Genes of Diabetic Vasculopathy: Evidence Based on Bioinformatics Analysis and Animal Study
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7850852
PMID:41143005
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和动物实验识别并验证糖尿病血管病变的关键基因 | 整合三种不同算法确定关键基因，结合调控网络分析、免疫浸润分析和单细胞RNA测序，并通过动物实验进行验证 | 研究样本量有限，动物模型验证仅为初步实验 | 探索糖尿病血管病变的分子机制并识别关键致病基因 | 2型糖尿病患者动脉样本和糖尿病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病血管病变 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，动物实验 | 蛋白-蛋白相互作用网络，调控网络分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | GSE13760数据集中的T2DM和对照动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-30 |
Identification and characterization of senescent macrophages in renal allograft rejection: a cross-species MultiOmics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623124
PMID:41142786
|
研究论文 | 通过跨物种多组学研究识别和表征肾移植排斥中的衰老巨噬细胞 | 首次鉴定出肾移植排斥中的新型衰老浸润巨噬细胞(SnIMs)，并揭示其跨物种保守的NF-κB/Cebpb驱动转录特征 | 研究主要基于动物模型和回顾性临床数据，需要进一步功能验证 | 探究免疫细胞衰老在肾移植排斥中的作用机制 | 肾移植患者活检样本和年龄匹配的大鼠同种异体移植模型 | 数字病理学 | 肾移植排斥 | 单细胞转录组学, 微阵列, 免疫细胞浸润算法, 组织病理学 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 病理图像 | 肾移植活检队列和大鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-30 |
Multi-scale data reveal a CD24(+) MUCL1(+) tumor subgroup associated with unfavorable prognosis in ER+ breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1695689
PMID:41142825
|
研究论文 | 通过多组学方法识别ER+乳腺癌中与不良预后相关的CD24(+) MUCL1(+)肿瘤亚群 | 首次系统揭示MUCL1+CD24+细胞在乳腺癌中的生物学特性和临床意义，并开发可临床转化的影像组学方法 | NA | 识别ER+乳腺癌患者中预后不良的肿瘤亚群以进行预后分层 | ER+乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学, bulk RNA测序, 多重免疫组化, 影像组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 基因组数据, 医学影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-30 |
Human axillary lymph node T follicular helper (Tfh) and Precursor-Tfh cells exhibit functional flexibility following seasonal influenza vaccination
2025, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70056
PMID:41143063
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类腋窝淋巴结中T滤泡辅助细胞及其前体细胞在季节性流感疫苗接种后的功能可塑性 | 首次在人体淋巴结中揭示Tfh细胞谱系具有功能可塑性，能够分化为不同命运谱系 | 样本量较小（仅5名个体），且仅观察疫苗接种后5天的时间点 | 评估疫苗接种后免疫反应中CD4+T细胞亚群的适应性和可塑性潜力 | 人类腋窝淋巴结中的T滤泡辅助细胞和Pre-Tfh细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，基因表达分析 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 5名个体的疫苗引流和对侧腋窝淋巴结 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-10-30 |
Exercise induced immune regulation and drug efficacy in rhinitis nasopharyngeal carcinoma implications for tumor microenvironment single cell immune signal transduction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1673383
PMID:41159023
|
综述 | 探讨运动通过调节免疫信号增强免疫疗法在过敏性鼻炎和鼻咽癌治疗中疗效的机制 | 首次系统阐述运动通过单细胞技术调控肿瘤微环境免疫信号转导以增强免疫治疗效果的协同机制 | 尚未建立标准化的个体化运动方案，缺乏大规模临床验证 | 研究运动与免疫疗法联合治疗对肿瘤微环境的调控作用 | 过敏性鼻炎和鼻咽癌患者 | 单细胞生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-30 |
Fibroblast heterogeneity and FN1-mediated signaling in endometriosis revealed by single-cell and spatial transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680849
PMID:41159025
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示子宫内膜异位症中成纤维细胞异质性和FN1介导的信号传导机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析子宫内膜异位症中成纤维细胞亚群的异质性及其在纤维化和免疫调节中的关键作用 | 样本量有限（15例患者），空间转录组数据仅来自两个异位病灶 | 探究子宫内膜异位症中成纤维细胞异质性及其在疾病进展中的分子机制 | 子宫内膜异位症患者的病灶组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 功能富集分析, 轨迹推断 | CellChat | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 15例子宫内膜异位症患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-30 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.08.607264
PMID:39149388
|
研究论文 | 开发了一种无需超参数调优的广义对比主成分分析方法，用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了超参数自由的广义对比PCA方法，解决了传统对比PCA需要手动调参且无法对称比较两个实验条件的问题 | 论文未明确说明方法在极端高维情况下的计算效率限制或对特定数据分布的适用性限制 | 开发一种能够对称比较两个高维数据集的降维方法，提取条件特异性模式 | 高维生物数据，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序，神经生理记录分析 | 广义对比PCA | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-30 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术准确读取单细胞RNA-seq文库中同聚物区域的能力 | 首次利用亲和碱基化学测序技术直接准确读取单细胞RNA-seq文库中的同聚T区域，实现配对末端比对和独立的多聚腺苷酸化位点分配 | 与单端比对相比，配对末端比对并未持续提高读段映射率，且存在低水平人工产物 | 改进单细胞RNA-seq文库的特征分析，特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | Element Aviti亲和测序平台 |
| 119 | 2025-10-29 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺髓系细胞的异质性并鉴定出一种新型过渡性树突状细胞群 | 发现传统认知的DC2实际上包含四个不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞这一新型细胞群 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺髓系细胞的异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的谱系身份、发育和成熟机制 | 胸腺髓系细胞（包括树突状细胞和巨噬细胞） | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序，谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-29 |
Pan-cancer neural regulation pattern with implications for patient stratification and immunotherapy
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102732
PMID:41147013
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研究论文 | 通过整合多组学数据系统描绘了泛癌神经调控模式及其对患者分层和免疫治疗的意义 | 首次系统描绘泛癌神经-肿瘤相互作用全景图，构建神经癌症亚型分类并揭示神经信号作为免疫治疗预测生物标志物 | 基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证神经调控机制 | 探究神经系统与癌症相互作用的调控模式及其临床意义 | TCGA数据库的10,000+个批量样本和239个泛癌空间转录组样本 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 批量转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | >10,000个TCGA批量样本, 239个空间转录组样本, 115个批量治疗转录组, >120,000个单细胞治疗转录组 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |